cluster # 545

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Oryza sativa
cluster # 545 cluster # 545 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_545#0 length = 769 sequences # 2

consensusID : consensus_545#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 769
fasta sequence

                              [GCTCCGCCCCTCGCTCCCCGTCGCCTCCTCGCTCCGCACATCGCTCCCCGCGCGCATCCTCGCTCTGCACCTCCTCTCCTCGCGACGATCCACCGCCGGACCAGCGACCTCGCCTCCTCGCTCCGCCGCAACGTCGGACCTCCCTCTTCCTCGCAACGGTTCAGCGACGGCGCACCACCGCACCGCCATACCAGCGCCGAGGCTGCCGCCGCCCACGCCTATCCGCCGGCGCCGGCGCCGAGGAAGGCCCCTTCCGCCGCCGCCGCCACCACCATCGCCACCGTGCACTCGAGGTCGTCCCTCTTCCCCATCGGCTGCAGCCTGAGCCGACGTCCTCCCCATCCGCCACCGCCGCTGCCGCCGACGGAGCCGAGGTCGTCCCCAGCCACCGACGCCAACGGAGCCGAGGTCGTCTCCAGCCGATGCCGCCGTTTTCCTGCTCTGCTACTGGTTGAAGAAATCATTCCTGGCAAGCAGTTGTGGATCCCTAATTCTGGAGTTCTTTCTCCTTCACCCATGCTTACATGCTGCCATCCTCGATTACTACCACCATGGCTGCGTTGCAAGGTTGCAACACGGTGGTGGATGTGGACTTGACAGAGCAGTAGCTTCACATAAGTGCTTTGTTATGTTATCCTCATGAGGAAGAGATTGAATGGATTGAGGGGGATTAATTTCAGGCTCAATAGATTTGGAATAAGTACCTTCCAAATTCCCCTCAATCCACATGGGGATGGATGAACTCAACAAGGCCGAATGCATCTCAAAT]

[+] EMBL CB652138             [GCTCCGCCCCTCGCTCCCCGTCGCCTCCTCGCTCCGCACATCGCTCCCCGCGCGCATCCTCGCTCTGCACCTCCTCTCCTCGCGACGATCCACCGCCGGACCAGCGACCTCGCCTCCTCGCTCCGCCGCAACGTCGGACCTCCCTCTTCCTCGCAACGGTTCAGCGACGGCGCACCACCGCACCGCCATACCAGCGCCGAGGCTGCCGCCGCCCACGCCTATCCGCCGGCGCCGGCGCCGAGGAAGGCCCCTTCCGCCGCCGCCGCCACCACCATCGCCACCGTGCACTCGAGGTCGTCCCTCTTCCCCATCGGCTGCAGCCTGAGCCGACGTCCTCCCCATCCGCCACCGCCGCTGCCGCCGACGGAGCCGAGGTCGTCCCCAGCCACCGACGCCAACGGAGCCGAGGTCGTCTCCAGCCGATGCCGCCGTTTTCCTGCTCTGCTACTGGTTGAAGAAATCATTCCTGGCAAGCAGTTGTGGATCCCTAATTCTGGAGTTCTTTCTCCTTCACCCATGCTTACATGCTGCCATCCTCGATTACTACCACCATGGCTGCGTTGCAAGGTTGCAACACGGTGGTGGATGTGGACTTGACAGAGCAGTAGCTTCACATAAGTGCTTTGTTATGTTATCCTCATGAGGAAGAGATTGAATGGATTGAGGGGGATTAATTTCAGGCTCAATAGATTTGGAATAAGTACCTTCCAAATTCCCCTCAATCCACATGGGGATGGATGAACTCAACAAGGCCGAATGCATCTCAAAT]
[+] EMBL AU069980             [                                      CATCGCTCCCCGCGCGCATCCTCGCTCTGCACCTCCTCTCCTCGCGACGATCCACCGCCGGACCAGCGACNTCGCCTCCTCGCTCCGCCGCAACGTCGGACCTCCCTCTTCCTCGCAACGGTTCAGCGACGGCGCACCACCGCACCGCCATACCAGCGCCGAGGCTGCCGCCGCCCACGCCTATNCGCCGGCGCCGGCGCCGAGGAAGGCCCCTTCCGCCGCCGCCGCCACCACCATCGCCACCGTGCACTCGAGGTCGTCCCTCTTCCCCATNGGCTGCAGCCTGAGCCGACGTCCTCNCCATCCGCCAACGCCGCTGCCGCNGACGGAGCCGAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]




>consensus_545#0
GCTCCGCCCCTCGCTCCCCGTCGCCTCCTCGCTCCGCACATCGCTCCCCGCGCGCATCCT
CGCTCTGCACCTCCTCTCCTCGCGACGATCCACCGCCGGACCAGCGACCTCGCCTCCTCG
CTCCGCCGCAACGTCGGACCTCCCTCTTCCTCGCAACGGTTCAGCGACGGCGCACCACCG
CACCGCCATACCAGCGCCGAGGCTGCCGCCGCCCACGCCTATCCGCCGGCGCCGGCGCCG
AGGAAGGCCCCTTCCGCCGCCGCCGCCACCACCATCGCCACCGTGCACTCGAGGTCGTCC
CTCTTCCCCATCGGCTGCAGCCTGAGCCGACGTCCTCCCCATCCGCCACCGCCGCTGCCG
CCGACGGAGCCGAGGTCGTCCCCAGCCACCGACGCCAACGGAGCCGAGGTCGTCTCCAGC
CGATGCCGCCGTTTTCCTGCTCTGCTACTGGTTGAAGAAATCATTCCTGGCAAGCAGTTG
TGGATCCCTAATTCTGGAGTTCTTTCTCCTTCACCCATGCTTACATGCTGCCATCCTCGA
TTACTACCACCATGGCTGCGTTGCAAGGTTGCAACACGGTGGTGGATGTGGACTTGACAG
AGCAGTAGCTTCACATAAGTGCTTTGTTATGTTATCCTCATGAGGAAGAGATTGAATGGA
TTGAGGGGGATTAATTTCAGGCTCAATAGATTTGGAATAAGTACCTTCCAAATTCCCCTC
AATCCACATGGGGATGGATGAACTCAACAAGGCCGAATGCATCTCAAAT

clustalw multiple alignements is not computed in this case