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Oryza sativa
cluster # 5541 cluster # 5541       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5541#0 length = 441 sequences # 3  

consensusID : consensus_5541#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 441
fasta sequence
                              [ACCCCTTCATACAATGAGGGGCCTATTATTTCACGGGATAAAGTTAAGGAAGCCCTCCTGAGNCTTGTTCAGAATGACCAGTTCATCGATTTAGTCTATCGGGAGTTGCAGAATGCACA-TATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAA-GGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCACCGCGGTGTCGGGGTTTTC--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AU092201             [ACCCCTTCATACAATGAGGGGCCTATTATTTCACGGGATAAAGTTAAGGAAGCCCTCCTGAGNCTTGTTCAGAATGACCAGTTCATCGATTTAGTCTATCGGGAGTTGCAGAATGCACA TATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAA GGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCACCGCGGTGTCGGGGTTTTC  AAAAA               ]
[+] EMBL AU175208             [                                                                                                             AGAAT CACAGTATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAAGGGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAG                                                  ]
[+] EMBL AU172467             [                                                                                                                                                                           TTGTGTTCTTTGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTNTGTATAGCTGTNTTCATTGTGGTGATGTAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCAATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAA GGGTGTTAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCCCCCCGGTGTCGGGGTTTTCNTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_5541#0 ACCCCTTCATACAATGAGGGGCCTATTATTTCACGGGATAAAGTTAAGGAAGCCCTCCTG AGNCTTGTTCAGAATGACCAGTTCATCGATTTAGTCTATCGGGAGTTGCAGAATGCACAT ATGTAGACTAATTATTAAGCTGTATGGAGTTGTGGCCGCCACAAGAGTGCTTGTGTTCTT TGTGAGTTTTGTATGCTTTAGTGCTTGGACTTCTGTATAGCTGTCTTCATTGTGGTGATG TAGAGTCCTTATAGCAGTGGTTGGCAGTATTTATAATATTCCTTATTTCACGTACTGTCA ATGTCATAGTATATTTATGTAACAAAAAACGGAAGTAAAACAGGACTTGTGTAAGGGTGT TAAATATCATAATTTTTCGTGTGATTTACTGAGCAATGACCACCGCGGTGTCGGGGTTTT CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)