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Oryza sativa
cluster # 5628 cluster # 5628       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5628#0 length = 855 sequences # 3  

consensusID : consensus_5628#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 855
fasta sequence
                              [CGTACCGCTCGTGAAGGCGGCTGGGACACGTTCATTAATTTCTTTGGCCTGAAATACGATCCCTCCGATCGTGTCATCTTCCTCTACCTGGTGGCGTTGCTGCTGGTGGTGCTAAGCCTGTTTGTCATTAACCGCCTGCTGCGGATGCCGCTGGGGCGTGCGTGGGAAGCGTTGCGTGAAGATGAAATCGCCTGCCGTTCGCTGGGCTTAAGCCCGCGTC-GTATCAAGCTGACTGCCTTTACCATAAGTGCCGCGTTTGCCGGTTTTGCCGGAACGCTGTTTGCGGCGCGTCAGGGCTTTGTCAGCCCGGAATCCTTCACCTTTGCCGAATCGGCGTTTGTGCTGGCGATAGTGGTGCTCGGCGGTATGGGCTCGCAATTTGCGGTGATTCTGGCGGCAATTTTGCTGGTGGTGTCGCGCGAGTTGATGCGTGATTTCAACGAATACAGCATGTTAATGCTCGGTGGTTTGATGGTGCTGATGATGATCTGGCGTCCGCAGGGCTTGCTGCCCATGACGCGCCCGCAACTGAAGCTGAAAAACGGCGCAGCGAAAGGAGAGCAGGCATGAGTCAGCCATTATTATCTGTTAACGGCCTGATGATGCGCTTCGGCGGCCTGCTGGCGGTGAACAACGTCAATCTTGAACTGTACCCGCAGGAGATCGTCTCGTTAATCGGCCCTAACGGTGCCGGAAAAACCACGGTTTTTAACTGTCTGACCGGATTCTACAAACCCACCGGCGGCACCATTTTACTGCGCGATCAGCACCTGGAAGGTTTACCGGGGCAGCAAATTGCCCGCATGGGCGTGGTGCGCACCTTCCAGCATGTGCGTCTGTTCCGTGAAATGACGG]

[+] EMBL CB653041             [CGTACCGCTCGTGAAGGCGGCTGGGACACGTTCATTAATTTCTTTGGCCTGAAATACGATCCCTCCGATCGTGTCATCTTCCTCTACCTGGTGGAGTTGCTGCTGGTGGAGCTAAGCCTGTTTGTCATTAACCGCCTGCTGCGGATGCCGCTGGGGCGTGCGTGGGAAGCGTTGCGTGAAGATGAAATCGCCTGCCGTTCGCTGGGCTTAAGCCCGCGTCTGTATCAATCTGACTGCCTTTACCATAAGTGCCGCGTTTGCCGGTTTTGCCGGAACGCTGTTTGCCGCGCGTCAGGGCTTTGTCAGCCCGGAATCCTTCACCTTTGCCGAATCGGCGTTTGTGCTGGCGATAGTGGTGCTCGGCGGTATGGGCTCGCAATTTGCGGTGATTCTGGCGGCAATTTTGCTGGTGGTGTCGCGCGAGTTGATGCGTGATTTCAACAAATACATCATGTTAATGCTCGGTGGTTTGATGGTGCTGATGATGATCTGGCGTCCGCAGGGCTTGCTGCCCATGACGCGCCCGCAACTGAAGCTGATAAACGGCGCta                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CB625744             [  tccctttaaTGAAGGCGGCTGGGACACGTTCAGTAATTTCTTCGGTCTGAAATACGATCCCTCCGATCGTGTCATCTTCCTCTACCTGGTGGCGTTGCTGCTGGTGGTGCTAAGCCTGTTTGTCATTAACCGCCTGCTGCGGATGCCGCTGGGGCGTGCGTGGGAAGCGTTGCGTGAAGATGAAATCGCCTGCCGTTCGCTGGGCTTAAGCCCGCGTC GTATCAAGCTGACTGCCTTTACCATAAGTGCCGCGTTTGCCGGTTTTGCCGGAACGCTGTTTGCGGCGCGTCAGGGCTTTGTCAGCCCGGAATCCTTCACCTTTGCCGAATCGGCGTTTGTGCTGGCGATAGTGGTGCTCGGCGGTATGGGCTCGCAATTTGCGGTGATTCTGGCGGCAATTTTGCTGGTGGTGTCGCGCGAGTTGATGCGTGATTTCAACGAATACAGCATGTTAATGCTCGGTGGTTTGATGGTGCTGATGATGATCTGGCGTCCGCAGGGCTTGCTGCCCATGACGCGCCCGCAACTGAAGCTGAAAAACGGCGCAGCGAAAGGAGAGCAGGCATGAGTCAGCCATTATTATCTGTTAACGGCCTGATGATGCGCTTCGGCGGCCTGCTGGCGGTGAACAACGTCAATCTTGAACTGTACCCGCAGGAGATCGTCTCGTTAATCGGCCCTAACGGTGCCGGAAAAACCACGGTTTTTAACTGTCTGACCGGATTCTACAAACCCACCGGCGGCACCATTTTACTGCGCGATCAGCACCTGGAAGGTTTACCGGGGCAGCAAATTGCCCGCATGGGCGTGGTGCGCACCTTCCAGCATGTGCGTCTGTTCCGTGAAATGACGG]
[+] EMBL CB625742             [                                                                                CCTCTACCTGGTGGCGTTGCTGCTGGTGGTGCTAAGCCTGTTTGTCATTAACCGCCTGCTGCGGATGCCGCTGGGGCGTGCGTGGGAAGCGTTGCGTGAAGATGAAATCGCCTGCCGTTCGCTGGGCTTAAGCCCGCGTC GTATCAAGCTGACTGCCTTTACCATAAGTGCCGCGTTTGCCGGTTTTGCCGGAACGCTGTTTGCGGCGCGTCAGGGCTTTGTCAGCCCGGAATCCTTCACCTTTGCCGAATCGGCGTTTGTGCTGGCGATAGTGGTGCTCGGCGGTATGGGCTCGCAATTTGCGGTGATTCTGGCGGCAATTTTGCTGGTGGTGTCGCGCGAGTTGATGCGTGATTTCAACGAATACAGCATGTTAATGCTCGGTGGTTTGATGGTGCTGATGATGATCTGGCGTCCGCAGGGCTTGCTGCCCATGACGCGCCCGCAACTGAAGCTGAAAAACGGCGCAGCGAAAGGAGAGCAGGCATGAGTCAGCCATTATTATCTGTTAACGGCCTGATGATGCGCTTCGGCGGCCTGCTGGCGGTGAACAACGTCAATCTTGAACTGTACCCGCAGGAGATCGTCTCGTTAATCGGCCCTAACGGTGCCGGAAAAACCACGGTTTTTAACTGTCTGACCGGATTCTACAAACCCACCGGCGGCACCATTTTACTG                                                                                                 ]


>consensus_5628#0 CGTACCGCTCGTGAAGGCGGCTGGGACACGTTCATTAATTTCTTTGGCCTGAAATACGAT CCCTCCGATCGTGTCATCTTCCTCTACCTGGTGGCGTTGCTGCTGGTGGTGCTAAGCCTG TTTGTCATTAACCGCCTGCTGCGGATGCCGCTGGGGCGTGCGTGGGAAGCGTTGCGTGAA GATGAAATCGCCTGCCGTTCGCTGGGCTTAAGCCCGCGTCGTATCAAGCTGACTGCCTTT ACCATAAGTGCCGCGTTTGCCGGTTTTGCCGGAACGCTGTTTGCGGCGCGTCAGGGCTTT GTCAGCCCGGAATCCTTCACCTTTGCCGAATCGGCGTTTGTGCTGGCGATAGTGGTGCTC GGCGGTATGGGCTCGCAATTTGCGGTGATTCTGGCGGCAATTTTGCTGGTGGTGTCGCGC GAGTTGATGCGTGATTTCAACGAATACAGCATGTTAATGCTCGGTGGTTTGATGGTGCTG ATGATGATCTGGCGTCCGCAGGGCTTGCTGCCCATGACGCGCCCGCAACTGAAGCTGAAA AACGGCGCAGCGAAAGGAGAGCAGGCATGAGTCAGCCATTATTATCTGTTAACGGCCTGA TGATGCGCTTCGGCGGCCTGCTGGCGGTGAACAACGTCAATCTTGAACTGTACCCGCAGG AGATCGTCTCGTTAATCGGCCCTAACGGTGCCGGAAAAACCACGGTTTTTAACTGTCTGA CCGGATTCTACAAACCCACCGGCGGCACCATTTTACTGCGCGATCAGCACCTGGAAGGTT TACCGGGGCAGCAAATTGCCCGCATGGGCGTGGTGCGCACCTTCCAGCATGTGCGTCTGT TCCGTGAAATGACGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)