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Oryza sativa
cluster # 5638 cluster # 5638       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5638#0 length = 2301 sequences # 3  
consensusID : consensus_5638#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 2301
fasta sequence 
                              [ATCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAACTTCTCAGCTAAGCTAAGCCAAGCTAGAGCCATCTAGCTACTTTTGCTGCTTTCTCTCTCCTCCTGCAACACACGACCTAGCTGAGAGCTGAGCTGAGTTGCGCCGGCCATGGCAGCATCGCAGAGGAGCAGGAGCACGGCGGCGCAGCTCGACGTCGACGACCAGGCGGCGGCCGATCAGCTGATGACGATGATGCGGCGGCCAGCGGCGGTACTACAGGATGAGGCCGCCGCCGAGGAGGAGGCCTCCGCGGCGGCAGCGGACCTGCAGCTGGAGCTCCGGCGAGGGCCGTGGACCGTCGACGAGGACCTCACCCTCGTCAACTACATCGCCGACCACGGCGAGGGACGCTGGAACTCCCTCGCCCGCGCCGCCGGTAATCTAATCAAATCAAGTTGTAGTCAATCGATTCGATGTCGATTTGATTCGAATTATATATGGAATCGATGAAAATCGATTTGATGTTTGTGATCGATCGATCGATGAAGGGTTGAAGAGGACGGGGAAGAGCTGCAGGCTGCGGTGGCTGAACTACCTCCGGCCCGACGTGAAGCGCGGCAACTTCACCGCCGACGAGCAGCTGCTCATCCTCGACCTCCACTCCCGATGGGGCAACCGGTAATTAATTAATTATTAACTCACCCATTATTCCGCTCGCTAGTTAATTATTACCCGCTTCGCTCATAAATATTTGACGTTTAGGACATGATCTGTTGAACCAATTCGAAACCTTTTATGGTTCGATTGACACAACAAAAAAAACCCTCCAAATAAATTGGAGGAAATTAAATTAGGAGGCTTGGAAAAGAGGCATGTAATTATAATTGATTAATTAAAATAGTTTATTTGTGGGCATGTAAATCACTATATCAGGTGTAATTTAATTTGTAGGCTCATTAGCTAGCTCTTGATGGTATATATATGGCCATCAATTGTGGACCATACATGGTATGTGTGCACACGTCGCATGTCACGTGCTGTATTTAATATGTACACATATACATGTGGCCACACACACTTGGATGCCACACAAAAACATACTTTGACAATATTAGCTTTAGATATGACACAATAGTTCAAGATACTAGCACAGTTCATATTGTACAAGTCTTCTATCGCTACAGAGGAATATTAATTATTATGCATGCATTATTGGTTTTAATTAATTGATTTGCAAACATATATATGGAGAAAAAGATAGATACAATGATATATACATCAAGCTAAAGCTTCTAGCTAGGCCGGCTAGCTAAGCATGTACAACCAAGATGCCTCTCACTTTCACATAAACAGAGTGCATGAAAGCTGCACGGGTTTTAAAGCTGCACGTCTCTCTTCCTTCCCTCCCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTACATATATCTCCACTAGTCTAGTGCCACACAACTTAGCTTATATTGTACTCTTTTTCTTGTGTGTTCCCTACCATCAATTTTTTTCTAATTACATTTCGATCCCATTGGGGGTGTGTTGATTATCTGCAGGTGGTCAAAGATAGCGCAGCATTTGCCAGGGAGGACCGACAACGAGATCAAGAACTACTGGAGGACCCGAGTGCAAAAGCATGCCAAGCAGCTGAACTGCGATGCCAACAGTGCTAGGTTCAAGGATGCTATGAGATATCTATGGATGCCTCGCCTCGCCGATGCAAGCCAGCTCGGTGATCACCATGGGTATAATAGTACCACTGCCATGGGCGATGCTCATGGGATGCCAGTGATGACATCGTCGTCGTCGGACTCGTTCGCGACATCAGAGTCATACGATGGGGGCCTTTATGCAAATGTGCAGGACAATGAGATGGTGAATGGTGGGGACTACTGGATGCAGGGAGCAAATAAAGGGTTTTGTAGTAATTATGAGTCAGAGCAACTTCATCCTCATGAGCATAGCCAGTTTCAGGATCCAGATCTTGTTGGTTGGGTTCAGGGCTTTTCTGAGGGCATTTCCGAGAATTTTTGGAGCTTGGAGGACATTTGGAAGATGTAGTGAATTTTGCATTAATTTGTATTGTGGCTATATATACACATACGTACAGGAGTATACATTTTATAATATTGATTGATAACTCGTGGAACAAAGATTAGAGTCAGCTTATTCTAACTTCAAAAGTTACTACGAGAG-AAAAAAAGTAAATTTCTTCTTTGATTTTCCTTTTTTTTTGTATGGATGTCGATTGACACATATGTATATGTTGTCCCAACAATGTAAAACATATAAGAAGACGTGATTGTTTNTAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK072403             [ATCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAACTTCTCAGCTAAGCTAAGCCAAGCTAGAGCCATCTAGCTACTTTTGCTGCTTTCTCTCTCCTCCTGCAACACACGACCTAGCTGAGAGCTGAGCTGAGTTGCGCCGGCCATGGCAGCATCGCAGAGGAGCAGGAGCACGGCGGCGCAGCTCGACGTCGACGACCAGGCGGCGGCCGATCAGCTGATGACGATGATGCGGCGGCCAGCGGCGGTACTACAGGATGAGGCCGCCGCCGAGGAGGAGGCCTCCGCGGCGGCAGCGGACCTGCAGCTGGAGCTCCGGCGAGGGCCGTGGACCGTCGACGAGGACCTCACCCTCGTCAACTACATCGCCGACCACGGCGAGGGACGCTGGAACTCCCTCGCCCGCGCCGCCGGTAATCTAATCAAATCAAGTTGTAGTCAATCGATTCGATGTCGATTTGATTCGAATTATATATGGAATCGATGAAAATCGATTTGATGTTTGTGATCGATCGATCGATGAAGGGTTGAAGAGGACGGGGAAGAGCTGCAGGCTGCGGTGGCTGAACTACCTCCGGCCCGACGTGAAGCGCGGCAACTTCACCGCCGACGAGCAGCTGCTCATCCTCGACCTCCACTCCCGATGGGGCAACCGGTAATTAATTAATTATTAACTCACCCATTATTCCGCTCGCTAGTTAATTATTACCCGCTTCGCTCATAAATATTTGACGTTTAGGACATGATCTGTTGAACCAATTCGAAACCTTTTATGGTTCGATTGACACAACAAAAAAAACCCTCCAAATAAATTGGAGGAAATTAAATTAGGAGGCTTGGAAAAGAGGCATGTAATTATAATTGATTAATTAAAATAGTTTATTTGTGGGCATGTAAATCACTATATCAGGTGTAATTTAATTTGTAGGCTCATTAGCTAGCTCTTGATGGTATATATATGGCCATCAATTGTGGACCATACATGGTATGTGTGCACACGTCGCATGTCACGTGCTGTATTTAATATGTACACATATACATGTGGCCACACACACTTGGATGCCACACAAAAACATACTTTGACAATATTAGCTTTAGATATGACACAATAGTTCAAGATACTAGCACAGTTCATATTGTACAAGTCTTCTATCGCTACAGAGGAATATTAATTATTATGCATGCATTATTGGTTTTAATTAATTGATTTGCAAACATATATATGGAGAAAAAGATAGATACAATGATATATACATCAAGCTAAAGCTTCTAGCTAGGCCGGCTAGCTAAGCATGTACAACCAAGATGCCTCTCACTTTCACATAAACAGAGTGCATGAAAGCTGCACGGGTTTTAAAGCTGCACGTCTCTCTTCCTTCCCTCCCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTACATATATCTCCACTAGTCTAGTGCCACACAACTTAGCTTATATTGTACTCTTTTTCTTGTGTGTTCCCTACCATCAATTTTTTTCTAATTACATTTCGATCCCATTGGGGGTGTGTTGATTATCTGCAGGTGGTCAAAGATAGCGCAGCATTTGCCAGGGAGGACCGACAACGAGATCAAGAACTACTGGAGGACCCGAGTGCAAAAGCATGCCAAGCAGCTGAACTGCGATGCCAACAGTGCTAGGTTCAAGGATGCTATGAGATATCTATGGATGCCTCGCCTCGCCGATGCAAGCCAGCTCGGTGATCACCATGGGTATAATAGTACCACTGCCATGGGCGATGCTCATGGGATGCCAGTGATGACATCGTCGTCGTCGGACTCGTTCGCGACATCAGAGTCATACGATGGGGGCCTTTATGCAAATGTGCAGGACAATGAGATGGTGAATGGTGGGGACTACTGGATGCAGGGAGCAAATAAAGGGTTTTGTAGTAATTATGAGTCAGAGCAACTTCATCCTCATGAGCATAGCCAGTTTCAGGATCCAGATCTTGTTGGTTGGGTTCAAGGCTTTTCTGAGGGCATTTCCGAGAATTTTTGGAGCTTGGAGGACATTTGGAAGATGTAGTGAATTTTGCATTAATTTGTATTGTGGCTATATATACACATACGTACAGGAGTATACATTTTATAATATTGATTGATAACTCGTGGAACAAAGATTAGAGTCAGCTTATTCTAACTTCAAAAGTTACTACGAGAG AAAAAAAGTAAATTTCTTCTTTGATTTTCCTTTTTTTTTGTATGGATGTCGATTGACACATATGTATATGTTGTCCCAACAATGTAAAACATATAAGAAGACGT                          ]
[+] EMBL OSA417530            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tAACGAGATCAAGAACTACTGGAGGACCCGAGTGCAAAAGCATGCCAAGCAGCTGAACTGCGATGCCAACAGTGCTAGGTTCAAGGATGCTATGAGATATCTATGGATGCCTCGCCTCGCCGATGCAAGCCAGCTCGGTGATCACCATGGGTATAATAGTACCACTGCCATGGGCGATGCTCATGGGATGCCAGTGATGACATCGTCGTCGTCGGACTCGTTCGCGACATCAGAGTCATACGATGGGGGCCTTTATGCAAATGTGCAGGACAATGAGATGGTGAATGGTGGGGACTACTGGATGCAGGGAGCAAATAAAGGGTTTTGTAGTAATTATGAGTCAGAGCAACTTCATCCTCATGAGCATAGCCAGTTTCAGGATCCAGATCTTGTTGGTTGGGTTCAGGGCTTTTCTGAGGGCATTTCCGAGAATTTTTGGAGCTTGGAGGACATTTGGAAGATGTAGTGAATTTTGCATTAATTTGTATTGTGGCTATATATACACATACGTACAGGAGTATACATTTTATAATATTGATTGATAACTCGTGGAACAAAGATTAGAGTCAGCTTATTCTAACTTCAAAAGTTACTACGAGAGAAAAAAAAGTAAATTTCTTTTTTGATTTTCCTTTTTTT                                                                                             ]
[+] EMBL AT003578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGGCCAATAAAATGGTGAA GGGGGGGNNTNNNGGATGCAGGGAGCAAATAAAGGGTTTTGTAGTAATTATNAGTCANAGCAACTTCNTCCTCATGAGCATAGCCAGTTTCAGGATCCAGATCTTGTTGGTTGGGTTCAGGGCTTTTNTGAGGGCATTTCCGAGAATTTTTGGAGCTTGGAGGACATTTGGAAGATGTAGTGAATTTTGCATTAATTTGTATTGNGGCTATATATACNCATACGTNCAGGAGTATNCATTTTATAATATTGATTGATAACTCGTGGAACAAAGATTAGAGTCAGCTTATTCTAACTTCAAAAGTTACTACGAGAG AAAAAAAGTAAATTTCTTCTTTGATTTTCCTTTTTTTTTGTATGGATGTCGATTGNCACATATGTATATGTTGTCCCNCCCATGTAAAACATATAAGAAGACGTGATTGTTTNTAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_5638#0
ATCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAACTTCTCAGCTAAGCTAAGCCAAGCTAGAG
CCATCTAGCTACTTTTGCTGCTTTCTCTCTCCTCCTGCAACACACGACCTAGCTGAGAGC
TGAGCTGAGTTGCGCCGGCCATGGCAGCATCGCAGAGGAGCAGGAGCACGGCGGCGCAGC
TCGACGTCGACGACCAGGCGGCGGCCGATCAGCTGATGACGATGATGCGGCGGCCAGCGG
CGGTACTACAGGATGAGGCCGCCGCCGAGGAGGAGGCCTCCGCGGCGGCAGCGGACCTGC
AGCTGGAGCTCCGGCGAGGGCCGTGGACCGTCGACGAGGACCTCACCCTCGTCAACTACA
TCGCCGACCACGGCGAGGGACGCTGGAACTCCCTCGCCCGCGCCGCCGGTAATCTAATCA
AATCAAGTTGTAGTCAATCGATTCGATGTCGATTTGATTCGAATTATATATGGAATCGAT
GAAAATCGATTTGATGTTTGTGATCGATCGATCGATGAAGGGTTGAAGAGGACGGGGAAG
AGCTGCAGGCTGCGGTGGCTGAACTACCTCCGGCCCGACGTGAAGCGCGGCAACTTCACC
GCCGACGAGCAGCTGCTCATCCTCGACCTCCACTCCCGATGGGGCAACCGGTAATTAATT
AATTATTAACTCACCCATTATTCCGCTCGCTAGTTAATTATTACCCGCTTCGCTCATAAA
TATTTGACGTTTAGGACATGATCTGTTGAACCAATTCGAAACCTTTTATGGTTCGATTGA
CACAACAAAAAAAACCCTCCAAATAAATTGGAGGAAATTAAATTAGGAGGCTTGGAAAAG
AGGCATGTAATTATAATTGATTAATTAAAATAGTTTATTTGTGGGCATGTAAATCACTAT
ATCAGGTGTAATTTAATTTGTAGGCTCATTAGCTAGCTCTTGATGGTATATATATGGCCA
TCAATTGTGGACCATACATGGTATGTGTGCACACGTCGCATGTCACGTGCTGTATTTAAT
ATGTACACATATACATGTGGCCACACACACTTGGATGCCACACAAAAACATACTTTGACA
ATATTAGCTTTAGATATGACACAATAGTTCAAGATACTAGCACAGTTCATATTGTACAAG
TCTTCTATCGCTACAGAGGAATATTAATTATTATGCATGCATTATTGGTTTTAATTAATT
GATTTGCAAACATATATATGGAGAAAAAGATAGATACAATGATATATACATCAAGCTAAA
GCTTCTAGCTAGGCCGGCTAGCTAAGCATGTACAACCAAGATGCCTCTCACTTTCACATA
AACAGAGTGCATGAAAGCTGCACGGGTTTTAAAGCTGCACGTCTCTCTTCCTTCCCTCCC
TCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTACATATATCTCCACTAGTCTAGTGCCACACAACTTAGCT
TATATTGTACTCTTTTTCTTGTGTGTTCCCTACCATCAATTTTTTTCTAATTACATTTCG
ATCCCATTGGGGGTGTGTTGATTATCTGCAGGTGGTCAAAGATAGCGCAGCATTTGCCAG
GGAGGACCGACAACGAGATCAAGAACTACTGGAGGACCCGAGTGCAAAAGCATGCCAAGC
AGCTGAACTGCGATGCCAACAGTGCTAGGTTCAAGGATGCTATGAGATATCTATGGATGC
CTCGCCTCGCCGATGCAAGCCAGCTCGGTGATCACCATGGGTATAATAGTACCACTGCCA
TGGGCGATGCTCATGGGATGCCAGTGATGACATCGTCGTCGTCGGACTCGTTCGCGACAT
CAGAGTCATACGATGGGGGCCTTTATGCAAATGTGCAGGACAATGAGATGGTGAATGGTG
GGGACTACTGGATGCAGGGAGCAAATAAAGGGTTTTGTAGTAATTATGAGTCAGAGCAAC
TTCATCCTCATGAGCATAGCCAGTTTCAGGATCCAGATCTTGTTGGTTGGGTTCAGGGCT
TTTCTGAGGGCATTTCCGAGAATTTTTGGAGCTTGGAGGACATTTGGAAGATGTAGTGAA
TTTTGCATTAATTTGTATTGTGGCTATATATACACATACGTACAGGAGTATACATTTTAT
AATATTGATTGATAACTCGTGGAACAAAGATTAGAGTCAGCTTATTCTAACTTCAAAAGT
TACTACGAGAGAAAAAAAGTAAATTTCTTCTTTGATTTTCCTTTTTTTTTGTATGGATGT
CGATTGACACATATGTATATGTTGTCCCAACAATGTAAAACATATAAGAAGACGTGATTG
TTTNTAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)