cluster # 5646

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 5646 cluster # 5646 Sequences # 3 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5646#0 length = 1463 sequences # 3
consensusID : consensus_5646#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1463
fasta sequence
                              [GAAATTCCTTTTTTATGCGGAACGGGGAACAGAGCAGTTGTAGCAACCATTGGAAGTGTCAATGAAGCGAAAACTGCTGCAGTCTTGGAAGGCCTTTCTGTTGACTCAGCTATGGATCTGCAGAAAGTTCTTAGAATAAGTACATTTACCTCAAGGAAGGATGCATTCAACAGTCTTATAGCAAACATTTCTTTGTTTGAAAGTCGATTAGGAGCCATGCTATTCCTTATATCTGCTCTTCTCTCTCGAGGATTGGAACGTATTCAAGCGGATAGGGATGATCCAAGCCTACCATTGGTCACTGCCCCATTTGGGCATGCTTCACAGGAAGTTGTGAATTTATTGCTATGTGGAGAGGCTGTGTCAAATGTATTTGATGGCAAGGTGGACTTTGGTGGTGGCATGTTCCTGAATGGGATACCAAATGATGTTGAAGTTGGTTTCCTTACCCTTCTGGAATCACTAAACTTCTGCAAGGTTGGTCAATACTTAAAGTGCCCGAAATGGCCAATATGGGTGGTAGGAAGTGAAAGTCACTACTCCGTCCTTTTTGCCCTAAATCCCAATGTTCAAGAAGAGAATGAGCTGGAAGAGCGGGAATCTAAAATAAGGAGGGCATTTGATGCACAAGATCAAAGTGGAGGTGGAGGCTTTATTAGCGTTGAGGGGTTCCAACAAGTTCTGAGGGACACTGACATAAATTTTCCTTCTGATAAGCTTGAGGACCTCTGTAATGCTGGCATTATAGTATGGAGTGAATTCTGGCAGG-GCTGCTACAATTGGATAAAAGGGCTGGAGGCATGAAGGATCCTACAGGCCTTATGGGCAAGAAGCAATTCACTATCTACCATTTCAATGGAATCGCGAAGTCCGTGCTTAATGGGAATGCTAACATTGGAGGTTCAACAATACAGAGACCCAGACTGTGCAAGTTAAATGTCAGTGTCCCGCCAAGGTGGACTCAAGATGAGTATCTAGCTGATGTTGTAAGCGCGTCCACCAGCGGGAGCAAGGATGACAGTGTTCTTTCACTTGCTCCACCTGTTCAAACTTCTCAGCATGCACCGTTGGTGGACTGCATTAGAACCCGATGGCCACGGGCAGTTTGTAGCTGGGTTGGAGATATGCCTAGTATTGTCTGATGCCATGCCGCGTGCTAGTCTGATTTTAAAGTGGCTATTGCAGAGCAGGCTGCTTGAGCTTCAAGGCCATGAGGGAAGGAAGCCGCGAAAGTGACAGCTGCTACTGGACTCCTGGTGTTATCACTGTTCCAGCTGATGAATATATGATTTTTCTTGGTTGCGTGAATGATCCTTTGATGTAATTTTATCAGGGACCCGAACATTCTTTTTCCTATAATGACATTAGCTGTATACTCCATTTTATGAATATGTTTTCAGTTCAAGATACATTC-TTTTTGTACACACACACCTTGTGGTTCTATTTTAAATCTGATAGAGAGT]

[+] EMBL CB651744             [GAAATTCCTTTTTTATGCGGAACGGGGAACAGAGCAGTTGTAGCAACCATTGGAAGTGTCAATGAAGCGAAAACTGCTGCAGTCTTGGAAGGCCTTTCTGTTGACTCAGCTATGGATCTGCAGAAAGTTCTTAGAATAAGTACATTTACCTCAAGGAAGGATGCATTCAACAGTCTTATAGCAAACATTTCTTTGTTTGAAAGTCGATTAGGAGCCATGCTATTCCTTATATCTGCTCTTCTCTCTCGAGGATTGGAACGTATTCAAGCGGATAGGGATGATCCAAGCCTACCATTGGTCACTGCCCCATTTGGGCATGCTTCACAGGAAGTTGTGAATTTATTGCTATGTGGAGAGGCTGTGTCAAATGTATTTGATGGCAAGGTGGACTTTGGTGGTGGCATGTTCCTGAATGGGATACCAAATGATGTTGAAGTTGGTTTCCTTACCCTTCTGGAATCACTAAACTTCTGCAAGGTTGGTCAATACTTAAAGTGCCCGAAATGGCCAATATGGGTGGTAGGAAGTGAAAGTCACTACTCCGTCCTTTTTGCCCTAAATCCCAATGTTCAAGAAGAGAATGAGCTGGAAGAGCGGGAATCTAAAATAAGGAGGGCATTTGATGCACAAGATCAAAGTGGAGGTGGAGGCTTTATTAGCGTTGAGGGGTTCCAACAAGTTCTGAGGGACACTGACATAAATTTTCCTTCTGATAAGCTTGAGGACCTCTGTAATGCTGGCATTATAGTATGGAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AK068951             [                                                                                                                                                                                                                                                                   GTATTCAAGCGGATAGGGATGATCCAAGCCTACCATTGGTCACTGCCCCATTTGGGCATGCTTCACAGGAAGTTGTGAATTTATTGCTATGTGGAGAGGCTGTGTCAAATGTATTTGATGGCAAGGTGGACTTTGGTGGTGGCATGTTCCTGAATGGGATACCAAATGATGTTGAAGTTGGTTTCCTTACCCTTCTGGAATCACTAAACTTCTGCAAGGTTGGTCAATACTTAAAGTGCCCGAAATGGCCAATATGGGTGGTAGGAAGTGAAAGTCACTACTCCGTCCTTTTTGCCCTAAATCCAAATGTTCAAGAAGAGAATGAGCTGGAAGAGCGGGAATCTAAAATAAGGAGGGCATTTGATGCACAAGATCAAAGTGGAGGTGGAGGCTTTATTAGCGTTGAGGGGTTCCAACAAGTTCTGAGGGACACTGACATAAATTTTCCTTCTGATAAGCTTGAGGACCTCTGTAATGCTGGCATTATAGTATGGAGTGAATTCTGGCAGG GCTGCTACAATTGGATAAAAGGGCTGGAGGCATGAAGGATCCTACAGGCCTTATGGGCAAGAAGCAATTCACTATCTACCATTTCAATGGAATCGCGAAGTCCGTGCTTAATGGGAATGCTAACATTGGAGGTTCAACAATACAGAGACCCAGACTGTGCAAGTTAAATGTCAGTGTCCCGCCAAGGTGGACTCAAGATGAGTATCTAGCTGATGTTGTAAGCGCGTCCACCAGCGGGAGCAAGGATGACAGTGTTCTTTCACTTGCTCCACCTGTTCAAACTTCTCAGCATGCACCGTTGGTGGACTGCATTAGAACCCGATGGCCACGGGCAGTTTGTAGCTGGGTTGGAGATATGCCTAGTATTGTCTGATGCCATGCCGCGTGCTAGTCTGATTTTAAAGTGGCTATTGCAGAGCAGGCTGCTTGAGCTTCAAGGCCATGAGGGAAGGAAGCCGCGAAAGTGACAGCTGCTACTGGACTCCTGGTGTTATCACTGTTCCAGCTGATGAATATATGATTTTTCTTGGTTGCGTGAATGATCCTTTGATGTAATTTTATCAGGGACCCGAACATTCTTTTTCCTATAATGACATTAGCTGTATACTCCATTTTATGAATATGTTTTCAGTTCAAGATACATTC TTTTTGTACACACACACCTTGTGGTTCTATTTTAAATCTGATAGAGAG ]
[-] EMBL CB651745             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GGAGTGAATTCTGGCAGGCGCTGCTACAATTGGATAAAAGGGCTGGAGGCATGAAGGATCCTACAGGCCTTATGGGCAAGAAGCAATTCACTATCTACCATTTCAATGGAATCGCGAAGTCCGTGCTTAATGGGAATGCTAACATTGGAGGTTCAACAATACAGAGACCCAGACTGTGCAAGTTAAATGTCAGTGTCCCGCCAAGGTGGACTCAAGATGAGTATTTAGCTGATGTTGTAAGCGCGTCCACCAGCGGGAGCAAGGATGACAGTGTTTTTTCACTTGCTCCACCTGTTCAAACTTTTCAGCATGCACCGTTGGTGGACTGCATTAGAACCCGATGGCCACGGGCAGTTTGTAGCTGGGTTGGAGATATGCCTAGTATTGTTTGATGCCATGCCGCGTGCTAGTTTGATTTTAAAGTGGCTATTGCAGAGCAGGCTGCTTGAGCTTCAAGGCCATGAGGGAAGGAAGCCGCGAAAGTGACAGCTGCTCCTGGACTCCTGGTGTTATCACTGTTCCAGCTGATGAATATATGATTTTTTTTGGTTGGGGGAATGATCCTTTGATGTAATTTTATCAGGGACCCGAACATTTTTTTTCCTATAATGACATTAGCTGTATACTCCATTTTATGAATATGTTTTCAGTTCAAGATACATTCTTTTTTGTACACACACACCTTGTGGTTTTATTTTAAATTTGATAGAGAGT]




>consensus_5646#0
GAAATTCCTTTTTTATGCGGAACGGGGAACAGAGCAGTTGTAGCAACCATTGGAAGTGTC
AATGAAGCGAAAACTGCTGCAGTCTTGGAAGGCCTTTCTGTTGACTCAGCTATGGATCTG
CAGAAAGTTCTTAGAATAAGTACATTTACCTCAAGGAAGGATGCATTCAACAGTCTTATA
GCAAACATTTCTTTGTTTGAAAGTCGATTAGGAGCCATGCTATTCCTTATATCTGCTCTT
CTCTCTCGAGGATTGGAACGTATTCAAGCGGATAGGGATGATCCAAGCCTACCATTGGTC
ACTGCCCCATTTGGGCATGCTTCACAGGAAGTTGTGAATTTATTGCTATGTGGAGAGGCT
GTGTCAAATGTATTTGATGGCAAGGTGGACTTTGGTGGTGGCATGTTCCTGAATGGGATA
CCAAATGATGTTGAAGTTGGTTTCCTTACCCTTCTGGAATCACTAAACTTCTGCAAGGTT
GGTCAATACTTAAAGTGCCCGAAATGGCCAATATGGGTGGTAGGAAGTGAAAGTCACTAC
TCCGTCCTTTTTGCCCTAAATCCCAATGTTCAAGAAGAGAATGAGCTGGAAGAGCGGGAA
TCTAAAATAAGGAGGGCATTTGATGCACAAGATCAAAGTGGAGGTGGAGGCTTTATTAGC
GTTGAGGGGTTCCAACAAGTTCTGAGGGACACTGACATAAATTTTCCTTCTGATAAGCTT
GAGGACCTCTGTAATGCTGGCATTATAGTATGGAGTGAATTCTGGCAGGGCTGCTACAAT
TGGATAAAAGGGCTGGAGGCATGAAGGATCCTACAGGCCTTATGGGCAAGAAGCAATTCA
CTATCTACCATTTCAATGGAATCGCGAAGTCCGTGCTTAATGGGAATGCTAACATTGGAG
GTTCAACAATACAGAGACCCAGACTGTGCAAGTTAAATGTCAGTGTCCCGCCAAGGTGGA
CTCAAGATGAGTATCTAGCTGATGTTGTAAGCGCGTCCACCAGCGGGAGCAAGGATGACA
GTGTTCTTTCACTTGCTCCACCTGTTCAAACTTCTCAGCATGCACCGTTGGTGGACTGCA
TTAGAACCCGATGGCCACGGGCAGTTTGTAGCTGGGTTGGAGATATGCCTAGTATTGTCT
GATGCCATGCCGCGTGCTAGTCTGATTTTAAAGTGGCTATTGCAGAGCAGGCTGCTTGAG
CTTCAAGGCCATGAGGGAAGGAAGCCGCGAAAGTGACAGCTGCTACTGGACTCCTGGTGT
TATCACTGTTCCAGCTGATGAATATATGATTTTTCTTGGTTGCGTGAATGATCCTTTGAT
GTAATTTTATCAGGGACCCGAACATTCTTTTTCCTATAATGACATTAGCTGTATACTCCA
TTTTATGAATATGTTTTCAGTTCAAGATACATTCTTTTTGTACACACACACCTTGTGGTT
CTATTTTAAATCTGATAGAGAGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case