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consensusID : consensus_5678#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 2714 fasta sequence
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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_5678#0 CATCCCGAGGGAGAGCATCCCGAGGTACTGGGCGTTCATGTACTACGTGTCCATGTACAG 1845
consensus_5678#1 CATCCCGAGGGAGAGCATCCCGAGGTACTGGGCGTTCATGTACTACGTGTCCATGTACAG 1980
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consensus_5678#0 GTACCCGCTGGACCTGCTGCTGATCAACGAGTACGGCGGCAGCAGCAGCGGCAGGTGCGT 1905
consensus_5678#1 GTACCCGCTGGACCTGCTGCTGATCAACGAGTACGGCGGCAGCAGCAGCGGCAGGTGCGT 2040
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consensus_5678#0 GGCGTGGGCGGGAGGCGTGTGCTTGAGGAAGGGGGGTGATGTGCTGAGGGGGAGAGGGAT 1965
consensus_5678#1 GGCGTGGGCGGGAGGCGTGTGCTTGAGGAAGGGGGGTGATGTGCTGAGGGGGAGAGGGAT 2100
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consensus_5678#0 CGACGAGGGGATGAGCCGCCGTGGGTGGAGGTGGAACGGCAGTGGCCATGTGGATGACGG 2025
consensus_5678#1 CGACGAGGGGATGAG-----GTGGGTCAATGTCGGG-----GTCATGCTAGGGTTCTTCG 2150
*************** ****** * ** * ** * ** * *
consensus_5678#0 TTGCTGTGGGGGGAAGTCGGAGATGGCACGGTGGTGCGAGAGGCACTGGAGCTCGGCGTG 2085
consensus_5678#1 TC-TTGTACAGGGTCATGTGCTGGGCTGTGCTGGTCAGGAGGGCAGCCAAGACCACGCTG 2209
* *** *** * * * * **** * **** ** * **
consensus_5678#0 TCGGTCGGCGGCCATGCGCATGACAAGCTCGAGGTGCGCTTAGTGGCAGCGGATCTAGAG 2145
consensus_5678#1 TGATTTTTCACATAAGTGTGTGTTGTAAGTAGTACTCGTATATGGGAAATGG-----GAC 2264
* * * * * * ** ** ** ** * ** **
consensus_5678#0 GCGGGCGTG-GTCAGGGGGCAGGTCATCATTGTGGTCGAGGTCCCGTGCGGCCATGTGGA 2204
consensus_5678#1 GTGACTACGCGTCGGACGTCCGATCCACTAGAGAGCTGAGATATACTGTTCCTA-GCAGT 2323
* * * *** * * * * ** * * *** * ** * * * *
consensus_5678#0 CCTAGTCGTGCAAGATCTAGGCGTG-GTCGTTGGGCCAGCAGCGGGCAACGTAGCA--GA 2261
consensus_5678#1 CTTGTTTGT-TGAAATCCAAAGATGTGTAGCTCCCCTATTTTCTGTTCACGTGTCCTTAA 2382
* * * ** * *** * ** ** * * * * * * **** * *
consensus_5678#0 CGATAGAGGCAGAGATGGGGTCGAGGAGCCCTTGCGGCTGGATCCATCCCAGTCCTAGTC 2321
consensus_5678#1 CATTTTTAAAAAAGGCAAAATTT------------------------------------- 2405
* * * ** *
consensus_5678#0 GCTGTCGCTTTGGCGGCGGGCTAGGCGGGGTCGTCGGGCCAACAGAGTGGCAGCCGCGGG 2381
consensus_5678#1 ------------------------------------------------------------
consensus_5678#0 AGGTCGCCCATTGCCGGCCGAGGAGATGAGGCACGGGCTCAGGTTCATGGTTGGATCCAT 2441
consensus_5678#1 ------------------------------------------------------------
consensus_5678#0 CCCAGTCCTAGTCGCTGTCGCTTTGGCGGTGGGCTGGGCAAGGACGATGACGACGGCAAC 2501
consensus_5678#1 ------------------------------------------------------------
consensus_5678#0 GATGGGATTGGGTTGGAAGAATTTGATAAAAGAAGAGCCAATGCCCTCCGATGACGACAA 2561
consensus_5678#1 ------------------------------------------------------------
consensus_5678#0 GAAGGAGGATTGTGATCAATGGAGTTCCTCAGCTTGCCACTCACTAGAAGGGTGGATTGT 2621
consensus_5678#1 ------------------------------------------------------------
consensus_5678#0 GAATTTGTGATGTATGGATAGTGCCAGATTCTTACTTTTGTTGTTGTTTCTCTCTCTGTT 2681
consensus_5678#1 ------------------------------------------------------------
consensus_5678#0 TTCACCAGATATAATAAAATAATGCGGCGGGTG 2714
consensus_5678#1 ---------------------------------
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| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||