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Oryza sativa
cluster # 5776 cluster # 5776       Sequences # 3       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_5776#0 length = 1131 sequences # 3  
consensusID : consensus_5776#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1131
fasta sequence 
                              [ACTCTCACTCCACCCCACTGGGGAAAGCCAATGCCGCGGGCCGAAGCCAACGCGGCAAAAGCCCAACCCCCCGAGATCCCTCCCCGCCGCGCCGGCGGAATCCCCGGGCCTCGTCGTCGTCGGCGGCGGCGATGGGGTCGGTGTCCCTCAACGTGCCGGCACCCCGCCGCGGCGGCGGCCGGCGCATCTCCTGCCACTGCACACCGTCGCTGCTCAACCTGCTCATGTTCCTCGCCCTCCTCTCCACCAACGCCCTCGCCCTCCTCGCCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCGCCGCCTCCGCCGCCACCGCGGCGGCCTCGACGATCTCCGACCACGTCGCGGCCATCGCCCGCGAGATCGACACCTCCTCCTCCTCCCACCTGCCGTACCGCGCGGACGGCCTGCCACCGGAGCTCCTCCTCTTCCTCTCCCCGCACGCGCTCCCGCTGGGCCGCGACGCCCGCACGGGGCTCACCCACATGCCGGCCTCCGTCGCGCACTCCTGCTTCAGGTCGCCCGCCACGCTCTCCCTCCTAGCCGCCTTCATGTCCTACGACCCGCACGCCGCCTGCCCGCGCAACGCCACCCTGCAGCAGCACCGCCTCCTCTCCAAGGCCTGCGAGCCGCTGCCTCGCCGCCGCTGCCTCTCCGGGGGGCCCCGCGCGGCGCTCCCGGCCTCCAACATGGGCGTCGACGGCCGCCGCTGGGTCAGGCCGCGCCACGACTACGAGTTCCTCCTCGACGACGTGCTGCGCCTCGGCGCCACCAGGATCCGGATTGGCCTCGACGTCGCCGGCGGCGCCG-CCAATTTCGCCGCGCGGATGAGGGACCGCGGTGTCACCGTCGTCACCACGGTGCTCGACAACGCCGGGAAGCCCATGAACGAGTTCGTGGCGGCGAGGGGGCTGTTCCCCCTCCTCCTCTCGCCGGCGCACCGGTTCCCCTTCTACGACGGGGTGTTCGACCTGGTGCACGTCGGCACCAATGCGCTGGACGAAGGTGGCGCGCCATCAATGGGGAATTCCGGCACGGAGGAGGCGCTGGAATTCTTCATGTTCGATGTCGACCGCGTGCTCCGCGTCGGCGGGCTGCTCTGGATTGATAGCTACCTGTGCC]

[+] EMBL AK066485             [ACTCTCACTCCACCCCACTGGGGAAAGCCAATGCCGCGGGCCGAAGCCAACGCGGCAAAAGCCCAACCCCCCGAGATCCCTCCCCGCCGCGCCGGCGGAATCCCCGGGCCTCGTCGTCGTCGGCGGCGGCGATGGGGTCGGTGTCCCTCAACGTGCCGGCACCCCGCCGCGGCGGCGGCCGGCGCATCTCCTGCCACTGCACACCGTCGCTGCTCAACCTGCTCATGTTCCTCGCCCTCCTCTCCACCAACGCCCTCGCCCTCCTCGCCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCGCCGCCTCCGCCGCCACCGCGGCGGCCTCGACGATCTCCGACCACGTCGCGGCCATCGCCCGCGAGATCGACACCTCCTCCTCCTCCCACCTGCCGTACCGCGCGGACGGCCTGCCACCGGAGCTCCTCCTCTTCCTCTCCCCGCACGCGCTCCCGCTGGGCCGCGACGCCCGCACGGGGCTCACCCACATGCCGGCCTCCGTCGCGCACTCCTGCTTCAGGTCGCCCGCCACGCTCTCCCTCCTAGCCGCCTTCATGTCCTACGACCCGCACGCCGCCTGCCCGCGCAACGCCACCCTGCAGCAGCACCGCCTCCTCTCCAAGGCCTGCGAGCCGCTGCCTCGCCGCCGCTGCCTCTCCGGGGGGCCCCGCGCGGCGCTCCCGGCCTCCAACATGGGCGTCGACGGCCGCCGCTGGGTCAGGCCGCGCCACGACTACGAGTTCCTCCTCGACGACGTGCTGCGCCTCGGCGCCACCAGGATCCGGATTGGCCTCGACGTCGCCGGCGGCGCCG CCAATTTCGCCGCGCGGATGAGGGACCGCGGTGTCACCGTCGTCACCACGGTGCTCGACAACGCCGGGAAGCCCATGAACGAGTTCGTGGCGGCGAGGGGGCTGTTCCCCCTCCTCCTCTCGCCGGCGCACCGGTTCCCCTTCTACGACGGGGTGTTCGACCTGGTGCACGTCGGCACCAATGCGCTGGACGAAGGTGGCGCGCCATCAATGGGGAATTCCGGCACGGAGGAGGCGCTGGAATTCTTCATGTTCGATGTCGACCGCGTGCTCCGCGTCGGCGGGCTGCTCTGGATTGATAGCTACCTGTGCC]
[+] EMBL AK069536             [                                                                                             GGCGGAATCCCCGGGCCTCGTCGTCGTCGGCGGCGGCGATGGGGTCGGTGTCCCTCAACGTGCCGGCACCCCGCCGCGGCGGCGGCCGGCGCATCTCCTGCCACTGCACACCGTCGCTGCTCAACCTGCTCATGTTCCTCGCCCTCCTCTCCACCAACGCCCTCGCCCTCCTCGCCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCGCCGCCTCCGCCGCCACCGCGGCGGCCTCGACGATCTCCGACCACGTCGCGGCCATCGCCCGCGAGATCGACACCTCCTCCTCCTCCCACCTGCCGTACCGCGCGGACGGCCTGCCACCGGAGCTCCTCCTCTTCCTCTCCCCGCACGCGCTCCCGCTGGGCCGCGACGCCCGCACGGGGCTCACCCACATGCCGGCCTCCGTCGCGCACTCCTGCTTCAGGTCGCCCGCCACGCTCTCCCTCCTAGCCGCCTTCATGTCCTACGACCCGCACGCCGCCTGCCCGCGCAACGCCACCCTGCAGCAGCACCGCCTCCTCTCCAAGGCCTGCGAGCCGCTGCCTCGCCGCCGCTGCCTCTCCGGGGGGCCCCGCGCGGCGCTCCCGGCCTCCAACATGGGCGTCGACGGCCGCCGCTGGGTCAGGCCGCGCCACGACTACGAGTTCCTCCTCGACGACGTGCTGCGCCTCGGCGCCACCAGGATCCGGATTGGCCTCGACGTCGCCGGCGGCGCCG CCAATTTCGCCGCGCGGATGAGGGACCGCGGTGTCACCGTCGTCACCACGGTGCTCGACAACGCCGGGAAGCCCATGAACGAGTTCGTGGCGGCGAGGGGGCTGTTCCCCCTCCTCCTCTCGCCGGCGCACCGGTTCCCCTTCTACGACGGGGTGTTCGACCTGGTGCACGTCGGCACCAATGCGCTGGACGAAGGTGGCGCGCCATCAATGGGGAATTCCGGCACGGAGGAGGCGCTGGAATTCTTCATGTTCGATGTCGACCGCGTGCTCCGCGTCGGCGGGCTGCTCTGGATTGATAGCTACCTGTGCC]
[+] EMBL OS1321801            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GCAGCAGCACCGCCTCCTCTCCAAGGCCTGCNAGCCGCTGCCTCGCCGCCGCTGCCTNTCCGGGGGGCCCCGCGCGGCGCTCCCGGCCTCCAACATGGGCGTCGACGGCCGCCGCTGGGTCAGGCCGCGCCACGACTACNATTTCCTCCTGGACGACGTGCTGCGCCTCGGCGNCACCAGGTTCCGGATTGGCCTCGACGTCGNCGGCGG GCCGNCAAATTTNGCCGCGCGGATGAGGGACCGCGGTGTCAACGTNGTCAACACGGTGCTCGACAACGCCGNGAAGCCCAT                                                                                                                                                                                                                                            ]




>consensus_5776#0
ACTCTCACTCCACCCCACTGGGGAAAGCCAATGCCGCGGGCCGAAGCCAACGCGGCAAAA
GCCCAACCCCCCGAGATCCCTCCCCGCCGCGCCGGCGGAATCCCCGGGCCTCGTCGTCGT
CGGCGGCGGCGATGGGGTCGGTGTCCCTCAACGTGCCGGCACCCCGCCGCGGCGGCGGCC
GGCGCATCTCCTGCCACTGCACACCGTCGCTGCTCAACCTGCTCATGTTCCTCGCCCTCC
TCTCCACCAACGCCCTCGCCCTCCTCGCCTTCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT
CCCCCGCCGCCTCCGCCGCCACCGCGGCGGCCTCGACGATCTCCGACCACGTCGCGGCCA
TCGCCCGCGAGATCGACACCTCCTCCTCCTCCCACCTGCCGTACCGCGCGGACGGCCTGC
CACCGGAGCTCCTCCTCTTCCTCTCCCCGCACGCGCTCCCGCTGGGCCGCGACGCCCGCA
CGGGGCTCACCCACATGCCGGCCTCCGTCGCGCACTCCTGCTTCAGGTCGCCCGCCACGC
TCTCCCTCCTAGCCGCCTTCATGTCCTACGACCCGCACGCCGCCTGCCCGCGCAACGCCA
CCCTGCAGCAGCACCGCCTCCTCTCCAAGGCCTGCGAGCCGCTGCCTCGCCGCCGCTGCC
TCTCCGGGGGGCCCCGCGCGGCGCTCCCGGCCTCCAACATGGGCGTCGACGGCCGCCGCT
GGGTCAGGCCGCGCCACGACTACGAGTTCCTCCTCGACGACGTGCTGCGCCTCGGCGCCA
CCAGGATCCGGATTGGCCTCGACGTCGCCGGCGGCGCCGCCAATTTCGCCGCGCGGATGA
GGGACCGCGGTGTCACCGTCGTCACCACGGTGCTCGACAACGCCGGGAAGCCCATGAACG
AGTTCGTGGCGGCGAGGGGGCTGTTCCCCCTCCTCCTCTCGCCGGCGCACCGGTTCCCCT
TCTACGACGGGGTGTTCGACCTGGTGCACGTCGGCACCAATGCGCTGGACGAAGGTGGCG
CGCCATCAATGGGGAATTCCGGCACGGAGGAGGCGCTGGAATTCTTCATGTTCGATGTCG
ACCGCGTGCTCCGCGTCGGCGGGCTGCTCTGGATTGATAGCTACCTGTGCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)