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Oryza sativa
cluster # 6025 cluster # 6025       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6025#0 length = 3481 sequences # 3  

consensusID : consensus_6025#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 3481
fasta sequence
                              [GAGGAGGAGGAGGAGGGCAAAAGCTTGCAGGAGAAGGCATCCGCATCCGCATCTGCCGCCGTCGGTGGGGGCGGAGACCGGAGCATGGCGGAGGCGGAGGAGAAGCGGGTGGGGGTGGGGGAGGCGCGGGCGCCGCTCGCCGTGGAGGCGCTCCGGGGGAAGATCGTGGAGAAGGTGAAGGGGAACCGCGTCACTCTCATCGTGGGGGACACCGGATGCGGAAAGAGTTCTATGGTTCCACAGTTCCTCCTGGAAGAAAACATGGAACCCATTCTATGCACGCAGCCAAGGAGGTTTGCAGTAGTAGCCATTGCTCAAATGATTGCCGAATCTCGCAATTGTCAGGTAGGAGAAGAGGTCGGATATCACATAGGACACTCGAATGTGTCCAATCTCAATTCAAAAAGGTCAAGAATTGTTTTCAAAACAGCTGGTGTTGTATTGGAGCAAATGCGTGACAAGGGCATTGCTGCATTGAACTATAAGGTTATTATTCTCGATGAAATACATGAAAGGTCAGTGGAATCTGACCTTGTCCTCGCCTGTGTCAAGCAGTTTATGATGAAAAAGAATGACTTGAGGTTGATTTTGATGTCTGCGACTGCTGATATCACAAGATATAAGGATTACTTCAGAGATCTTGGAAGGGGTGAAAGGGTTGAGGTGATTGCCATTCCTAGCAGTCCACGCAGTAGCATTTTTCAGAGAAAAGTCCTATACCTTGAGCAGATTGTTGATATTCTCAAGATGGACTCGGAATCACTATCAACAAAATACTGCTCTGGACCCAACACTGCAGCTGATGCTGGTCTAAAACCAGATGTGTATGAACTTATTCATAGGTTATTGTTGCATATACACCAAAATGAGCCAGACATTGGGAAGAGTATTTTGGTGTTCCTTCCTACATACTATGCTTTGGAGCAGCAATGGATTCGTCTGCTATCTGCTAGTTCAATGTTCAAAGTACACATTCTCCATCGCAGCATTGACACCGATGAAGCTCTTCAAACTATGAAGGTCTCAAAGTCCTGTCGTAAGGTTATACTGGCAACAAACATTGCAGAATCATCAGTCACTATTCCAGGAGTTGCTTATGTTATTGACTCCTGTAGATCACTGCAAGTTTATTGGGATCCAATCAGGAAAACAGACTCAGCTGAGCTTGTATGGGTTTCCAAATCTCAGGCTGAACAGCGGAAAGGCAGGACAGGGCGAACCTGTGATGGTCAAATTTATCGCTTGGTAACTGGGCCATTTTATAACAGTTTAACTGATCATGAGTATCCTGCCATTTTAAGATTGTCATTAAGAGAGCAAGTACTCATGATTTGTTGTGCAGAGTCCAGAGCTATGAACGATCCTCATGTCCTGCTGCAAAAAGTTCTTGACCCGCCAGATTCGGATGTTGTTGAAGATGCATTGGAATCTCTTGTTCAAATTCGTGCTTTAGATAAGCCAACCTCTCCTAGAGGGCGCCATGAACCAACCTTTTATGGATGTTTGCTTAATAGTTTGCCACTCTCATTTGACGCTTCTGTTCTAGCCCTTAAATTTGGTGATACTGGCTCCATCTGTGAAGGAATTCTGATAAGCATCATGCTGGACATCCAACCCCTGCCTATCGTCCAACCTTTTGGTCACCAACAATTGTGCAAAATGTATAGAAACAATTACTTTGAGGAGGAGGGTATCGACCTGCAAACTGGCAAGAAGGAAGCTGCACTTGTTGGAAATCTTTGTGCATTTCAATTCTGGCAGCGTATGTTTAAGGACAAGTATCGTCTGGATTGTCTGATAAATGTGGTGAACACTCATGAACCGAAGGCATCTAATGGTTTTGTTGCTAAACCTGAAGATGAGTGGTGTGCATTTCATAACCTTGTGCCAACAGCACTTAACTACATCTCTGAAATTTATGATGATATTATGGGCACACTTCACCGATTTAGACCTAGTTTTCTTGTGAAAATAAATCCTCCAATGTACCTTCAGCCTTCCGAATTCCACCACATGTGTCTTCGCCATGAAGTGCTGGAACTAGAGAATGTGAATTCACTTCCATTAGAAGCTGAGAATTCTCACTTGGATTCACATCGCAGGTGTGCTGCAACCCCTTATGTTTCTCCAGCTGATTTTGGAACCACTACTGTTGTTAAAACACTGAAGACACTTATCAAGGAGATGAAGACACAATCTGCGGCAGACAGGGTAACTTATAGAGAACTAGTTCATGGTTATGTTCAACCAGCGTTGGAAAATGTGATGTGTGTGTTCTTTCTTAATGGATCTTGTAATCGAGGTGATACATGCCATTTTTCTCATTCTTCTCGTGCTCCAAGACCAATATGCAAGTTCTTCCTCACATTACAGGGTTGTCGAAATGGTAACTCGTGTTCATTTTCACATGACTCTGGCTCTTTGGTTTCTTCATCTATCACATCTGGAATCTGCTCTCAGGAAAACAGAGCTACTTCAGTATGTTGTAAAAGGTTGCTGCCTGCTGCTGGTGATGGGCATATTCTTGTCATGAATGATAAAAGTTTACAGTTCGCTTGTAAACTTTGTAACTATTATGACCCCACTAAGATTATTGCCTGTACACCTGGTCCTCATTCATTCGAGTCTGATTCAGTGACTAAGGGCCTCAAGATTCTACAGAATTTGGCTGATCCCTCTTATCTATTCATTGGAGGTGAACATAAACTATCAGTTCCATGGACAAAATTGAGTCGAGTATTTTGGTTTGCTGATATTGATTCCAACGAATCAATTAGCGAGCAAGTTGTCTTGCAGAAGTTTTTCCAGCATATTGCCATCAAGACCTTGTCAGAAAAGATGTCAGATTTGCAGGTCATCGTGATCATGAATAACGCAAAATTTGTTCAGTTACAGGTCGAAAGATTGGCAAGAGAGTGCTTCTTATTTCTGGGTGAATCATTTATGTTTGATGAAGCAACTCTTGGATGGTTCTCGGATACCCCTAATTACCCGAGAGGGATGCAAGTATCAGCACCAGTTGCTTACATCTTTAGCATGCATCCTCCTACTGGCATTCAGTTTGGTGATTACGCATCAGAACTGCGCAAAGTTTTATACAGCAACTAGTTAGACCATTATAGGTTATTTCCACATGTGAATAGCTTTGGTCAAGCCATTTTGCGAACTGTAATTTTTTGGTCAGTTCAGCTTTTACAGAAGTGTAAGGCTTACTTGAGTGCTATCTGAATTAGAATTCACTAGGGAACTTTAACTGAAGGGATGCTGTTTTAAATGTTGGTTCCGAACTTAAATTGATGCCAAATTTCCTGAACTGAAAGCTTGTTATGTTAATGTGCAATCCCTTATCATTCCGTAACATCAGTAACTTAACTTTTTTTCATCCTCAACTGTATCATCAAACGTGGCACTGATGTGGATATGTTTCTTTGACCTCATGGATTTGGTTTATTGACCTCATGGTCATATTCTAATGAGAAAA]

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[+] EMBL AK111789             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTGCTTAATAGTTTGCCACTCTCATTTGACGCTTCTGTTCTAGCCCTTAAATTTGGTGATACTGGCTCCATCTGTGAAGGAATTCTGATAAGCATCATGCTGGACATCCAACCCCTGCCTATCGTCCAACCTTTTGGTCACCAACAATTGTGCAAAATGTATAGAAACAATTACTTTGAGGAGGAGGGTATCGACCTGCAAACTGGCAAGAAGGAAGCTGCACTTGTTGGAAATCTTTGTGCATTTCAATTCTGGCAGCGTATGTTTAAGGACAAGTATCGTCTGGATTGTCTGATAAATGTGGTGAACACTCATGAACCGAAGGCATCTAATGGTTTTGTTGCTAAACCTGAAGATGAGTGGTGTGCATTTCATAACCTTGTGCCAACAGCACTTAACTACATCTCTGAAATTTATGATGATATTATGGGCACACTTCACCGATTTAGACCTAGTTTTCTTGTGAAAATAAATCCTCCAATGTACCTTCAGCCTTCCGAATTCCACCACATGTGTCTTCGCCATGAAGTGCTGGAACTAGAGAATGTGAATTCACTTCCATTAGAAGCTGAGAATTCTCACTTGGATTCACATCGCAGGTGTGCTGCAACCCCTTATGTTTCTCCAGCTGATTTTGGAACCACTACTGTTGTTAAAACACTGAAGACACTTATCAAGGAGATGAAGACACAATCTGCGGCAGACAGGGTAACTTATAGAGAACTAGTTCATGGTTATGTTCAACCAGCGTTGGAAAATGAGATGTGTGTGTTCTTTCTTAATGGATCTTGTAATCGAGGTGATACATGCCATTTTTCTCATTCTTCTCGTGCTCCAAGACCAATATGCAAGTTCTTCCTCACATTACAGGGTTGTCGAAATGGTAACTCGTGTTCATTTTCACATGACTCTGGCTCTTTGGTTTCTTCATCTATCACATCTGGAATCTGCTCTCAGGAAAACAGAGCTACTTCAGTATGTTGTAAAAGGTTGCTGCCTGCTGCTGGTGATGGGCATATTCTTGTCATGAATGATAAAAGTTTACAGTTCGCTTGTAAACTTTGTAACTATTATGACCCCACTAAGATTATTGCCTGTACACCTGGTCCTCATTCATTCGAGTCTGATTCAGTGACTAAGGGCCTCAAGATTCTACAGAATTTGGCTGATCCCTCTTATCTATTCATTGGAGGTGAACATAAACTATCAGTTCCATGGACAAAATTGAGTCGAGTATTTTGGTTTGCTGATATTGATTCCAACGAATCAATTAGCGAGCAAGTTGTCTTGCAGAAGTTTTTCCAGCATATTGCCATCAAGACCTTGTCAGAAAAGATGTCAGATTTGCAGGTCATCGTGATCATGAATAACGCAAAATTTGTTCAGTTACAGGTCGAAAGATTGGCAAGAGAGTGCTTCTTATTTCTGGGTGAATCATTTATGTTTGATGAAGCAACTCTTGGATGGTTCTCGGATACCCCTAATTACCCGAGAGGGATGCAAGTATCAGCACCAGTTGCTTACATCTTTAGCATGCATCCTCCTACTGGCATTCAGTTTGGTGATTACGCATCAGAACTGCGCAAAGTTTTATACAGCAACTAGTTAGACCATTATAGGTTATTTCCACATGTGAATAGCTTTGGTCAAGCCATTTTGCGAACTGTAATTTTTTGGTCAGTTCAGCTTTTACAGAAGTGTAAGGCTTACTTGAGTGCTATCTGAATTAGAATTCACTAGGGAACTTTAACTGAAGGGATGCTGTTTTAAATGTTGGTTCCGAACTTAAATTGATGC                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CA766115             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AGAATTTGGCTGATCCCTCTTATCTATTCATTGGAGGTGAACATAAACTATCAGTTCCATGGACAAAATTGAGTCGAGTATTTTGGTTTGCTGATATTGATTCCAACGAATCAATTAGCGAGCAAGTTGTCTTGCAGAAGTTTTTCCAGCATATTGCCATCAAGACCTTGTCAGAAAAGATGTCAGATTTGCAGGTCATCGTGATCATGAATAACGCAAAATTTGTTCAGTTACAGGTCGAAAGATTGGCAAGAGAGTGCTTCTTATTTCTGGGTGAATCATTTATGTTTGATGAAGCAACTCTTGGATGGTTCTCGGATACCCCTAATTACCCGAGAGGGATGCAAGTATCAGCACCAGTTGCTTACATCTTTAGCATGCATCCTCCTACTGGCATTCAGTTTGGTGATTACGCATCAGAACTGCGCAAAGTTTTATACAGCAACTAGTTAGACCATTATAGGTTATTTCCACATGTGAACAGCTTTGGTCAAGCCATTTTGCGAACTGTAATTTTTTGGTCAGTTCAGCTTTTACAGAAGTGTAAGGCTTACTTGAGTGCTATCTGAATTAGAATTCACTAGGGAACTTTAACTGAAGGGATGCTGTTTTAAATGTTGGTTCCGAACTTAAATTGATG                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_6025#0 GAGGAGGAGGAGGAGGGCAAAAGCTTGCAGGAGAAGGCATCCGCATCCGCATCTGCCGCC GTCGGTGGGGGCGGAGACCGGAGCATGGCGGAGGCGGAGGAGAAGCGGGTGGGGGTGGGG GAGGCGCGGGCGCCGCTCGCCGTGGAGGCGCTCCGGGGGAAGATCGTGGAGAAGGTGAAG GGGAACCGCGTCACTCTCATCGTGGGGGACACCGGATGCGGAAAGAGTTCTATGGTTCCA CAGTTCCTCCTGGAAGAAAACATGGAACCCATTCTATGCACGCAGCCAAGGAGGTTTGCA GTAGTAGCCATTGCTCAAATGATTGCCGAATCTCGCAATTGTCAGGTAGGAGAAGAGGTC GGATATCACATAGGACACTCGAATGTGTCCAATCTCAATTCAAAAAGGTCAAGAATTGTT TTCAAAACAGCTGGTGTTGTATTGGAGCAAATGCGTGACAAGGGCATTGCTGCATTGAAC TATAAGGTTATTATTCTCGATGAAATACATGAAAGGTCAGTGGAATCTGACCTTGTCCTC GCCTGTGTCAAGCAGTTTATGATGAAAAAGAATGACTTGAGGTTGATTTTGATGTCTGCG ACTGCTGATATCACAAGATATAAGGATTACTTCAGAGATCTTGGAAGGGGTGAAAGGGTT GAGGTGATTGCCATTCCTAGCAGTCCACGCAGTAGCATTTTTCAGAGAAAAGTCCTATAC CTTGAGCAGATTGTTGATATTCTCAAGATGGACTCGGAATCACTATCAACAAAATACTGC TCTGGACCCAACACTGCAGCTGATGCTGGTCTAAAACCAGATGTGTATGAACTTATTCAT AGGTTATTGTTGCATATACACCAAAATGAGCCAGACATTGGGAAGAGTATTTTGGTGTTC CTTCCTACATACTATGCTTTGGAGCAGCAATGGATTCGTCTGCTATCTGCTAGTTCAATG TTCAAAGTACACATTCTCCATCGCAGCATTGACACCGATGAAGCTCTTCAAACTATGAAG GTCTCAAAGTCCTGTCGTAAGGTTATACTGGCAACAAACATTGCAGAATCATCAGTCACT ATTCCAGGAGTTGCTTATGTTATTGACTCCTGTAGATCACTGCAAGTTTATTGGGATCCA ATCAGGAAAACAGACTCAGCTGAGCTTGTATGGGTTTCCAAATCTCAGGCTGAACAGCGG AAAGGCAGGACAGGGCGAACCTGTGATGGTCAAATTTATCGCTTGGTAACTGGGCCATTT TATAACAGTTTAACTGATCATGAGTATCCTGCCATTTTAAGATTGTCATTAAGAGAGCAA GTACTCATGATTTGTTGTGCAGAGTCCAGAGCTATGAACGATCCTCATGTCCTGCTGCAA AAAGTTCTTGACCCGCCAGATTCGGATGTTGTTGAAGATGCATTGGAATCTCTTGTTCAA ATTCGTGCTTTAGATAAGCCAACCTCTCCTAGAGGGCGCCATGAACCAACCTTTTATGGA TGTTTGCTTAATAGTTTGCCACTCTCATTTGACGCTTCTGTTCTAGCCCTTAAATTTGGT GATACTGGCTCCATCTGTGAAGGAATTCTGATAAGCATCATGCTGGACATCCAACCCCTG CCTATCGTCCAACCTTTTGGTCACCAACAATTGTGCAAAATGTATAGAAACAATTACTTT GAGGAGGAGGGTATCGACCTGCAAACTGGCAAGAAGGAAGCTGCACTTGTTGGAAATCTT TGTGCATTTCAATTCTGGCAGCGTATGTTTAAGGACAAGTATCGTCTGGATTGTCTGATA AATGTGGTGAACACTCATGAACCGAAGGCATCTAATGGTTTTGTTGCTAAACCTGAAGAT GAGTGGTGTGCATTTCATAACCTTGTGCCAACAGCACTTAACTACATCTCTGAAATTTAT GATGATATTATGGGCACACTTCACCGATTTAGACCTAGTTTTCTTGTGAAAATAAATCCT CCAATGTACCTTCAGCCTTCCGAATTCCACCACATGTGTCTTCGCCATGAAGTGCTGGAA CTAGAGAATGTGAATTCACTTCCATTAGAAGCTGAGAATTCTCACTTGGATTCACATCGC AGGTGTGCTGCAACCCCTTATGTTTCTCCAGCTGATTTTGGAACCACTACTGTTGTTAAA ACACTGAAGACACTTATCAAGGAGATGAAGACACAATCTGCGGCAGACAGGGTAACTTAT AGAGAACTAGTTCATGGTTATGTTCAACCAGCGTTGGAAAATGTGATGTGTGTGTTCTTT CTTAATGGATCTTGTAATCGAGGTGATACATGCCATTTTTCTCATTCTTCTCGTGCTCCA AGACCAATATGCAAGTTCTTCCTCACATTACAGGGTTGTCGAAATGGTAACTCGTGTTCA TTTTCACATGACTCTGGCTCTTTGGTTTCTTCATCTATCACATCTGGAATCTGCTCTCAG GAAAACAGAGCTACTTCAGTATGTTGTAAAAGGTTGCTGCCTGCTGCTGGTGATGGGCAT ATTCTTGTCATGAATGATAAAAGTTTACAGTTCGCTTGTAAACTTTGTAACTATTATGAC CCCACTAAGATTATTGCCTGTACACCTGGTCCTCATTCATTCGAGTCTGATTCAGTGACT AAGGGCCTCAAGATTCTACAGAATTTGGCTGATCCCTCTTATCTATTCATTGGAGGTGAA CATAAACTATCAGTTCCATGGACAAAATTGAGTCGAGTATTTTGGTTTGCTGATATTGAT TCCAACGAATCAATTAGCGAGCAAGTTGTCTTGCAGAAGTTTTTCCAGCATATTGCCATC AAGACCTTGTCAGAAAAGATGTCAGATTTGCAGGTCATCGTGATCATGAATAACGCAAAA TTTGTTCAGTTACAGGTCGAAAGATTGGCAAGAGAGTGCTTCTTATTTCTGGGTGAATCA TTTATGTTTGATGAAGCAACTCTTGGATGGTTCTCGGATACCCCTAATTACCCGAGAGGG ATGCAAGTATCAGCACCAGTTGCTTACATCTTTAGCATGCATCCTCCTACTGGCATTCAG TTTGGTGATTACGCATCAGAACTGCGCAAAGTTTTATACAGCAACTAGTTAGACCATTAT AGGTTATTTCCACATGTGAATAGCTTTGGTCAAGCCATTTTGCGAACTGTAATTTTTTGG TCAGTTCAGCTTTTACAGAAGTGTAAGGCTTACTTGAGTGCTATCTGAATTAGAATTCAC TAGGGAACTTTAACTGAAGGGATGCTGTTTTAAATGTTGGTTCCGAACTTAAATTGATGC CAAATTTCCTGAACTGAAAGCTTGTTATGTTAATGTGCAATCCCTTATCATTCCGTAACA TCAGTAACTTAACTTTTTTTCATCCTCAACTGTATCATCAAACGTGGCACTGATGTGGAT ATGTTTCTTTGACCTCATGGATTTGGTTTATTGACCTCATGGTCATATTCTAATGAGAAA A



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)