These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6121#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1592 fasta sequence [TCTGCAGTGCAGTGCCCACGCGAGCCGAGACGAGACGATGGCATCATCTCCCGCTCCAAGCCCCGCCGCGCCGCCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCGCGGCGCTCGCCGTGGTCGCGTCCGCCTCCGCCGCCGCGTGCTCCGCGGGCGACCGGGACGCGCTGCTGGCGATCCGGGCGGCGCTGTCGGAGGCGCACCTCGGGGTGTTCTCGTCGTGGACGGGCACCGACTGCTGCACCAGCTGGTACGGCGTGAGCTGCGATCCCACCACCGGCCGCGTCGCCGACCTCACCCTCCGCGGCGAGGCCGACGACCCCGTCATGGCGCCCGCCGGCCGCCCGGCCTCCGGCGTCATGTCCGGCTACATCTCCGACGCGGTGTGCCGCCTCGGCCGCCTCTCCTCCCTCATCCTCGCCGACTGGAAGCAGATCTCCGGGCCCATCCCGCCGTGCGTCGCCACCGCCCTCCCTTACCTCCGCATCCTCGAGCTCCCCGGCAACCGCCTCACCGGCGAGATCCCGCGCTCCATCGGCAGCCTCTCCCGCCTCACCGTGCTCAACCTCGCCGACAACCTCATCGCCGGCGAAATCCCAAGCTCCATCACCTCGCTCGCGTCGCTGAAGCACCTCGACCTCACCAACAACCAGCTCACCGGCGGGATCCCGGACGACGTGGGCGACCTCACCATGCTCAGCCGCGCGCTGCTCGGCCGGAACAAGCTCACCGGCGCCATCCCAACGTCGGTCGGCTCCCTGACCCGGCTCGCCGACCTCGACCTCGCCGAGAACGGCCTCACCGGCGGGATCCCGGACAGCCTGGGCGGCGCCCACGTGCTCACCTCCCTGTACCTCGGCGGCAACCGGGTCTCCGGCCGGATCCCGGCGAGCCTGCTGCAGAACAAGGGGCTGGGCATCCTGAACCTGAGCCGGAACGCCGTCGAGGGCGCCATCCCCGACGTGTTCACCGCCGAGTCCTACTTCATGGTGCTCGACCTGTCCCGGAACAGGCTCACCGGCGCCGTGCCGAGGTCGCTGTCGGCGGCAGCGTACGTCGGCCACCTCGACCTCAGCCACAACCGGCTGTGCGGCTCCATCCCCGCCGGCCCGCCGTTCGACCACCTCGACGCCGCCTCCTTCGCCAGCAACAGCTGCCTCTGCGGCGGCCCGCTCGGCAAGTGCACGTGACGTGCCCCAACCAGAGCCGTCCGATCGATCGGGAGAGCCTGATCGAACGTGTGGTGTGCGATGTACCGTGTACGATGCAACGAACTTACGTGTTCGTATATATGGTTAATTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAAGAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAGAATGTTTTCTCTTTCCTGCCTTTCTCTTCTTTATACTTTTAACCTTTTTTGCTAGTGATTTACTTGATAGTTCTACTTTAAAGTTTGTATTGTACAAGTGACAAAAGCATAAGAAATGCTAAAGATCTTGTATGAGAGGTTGTGGTTTCATATTTGTGCGCTTGGGCCCTTGGC] [+] EMBL AK120866 [TCTGCAGTGCAGTGCCCACGCGAGCCGAGACGAGACGATGGCATCATCTCCCGCTCCAAGCCCCGCCGCGCCGCCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCGCGGCGCTCGCCGTGGTCGCGTCCGCCTCCGCCGCCGCGTGCTCCGCGGGCGACCGGGACGCGCTGCTGGCGATCCGGGCGGCGCTGTCGGAGGCGCACCTCGGGGTGTTCTCGTCGTGGACGGGCACCGACTGCTGCACCAGCTGGTACGGCGTGAGCTGCGATCCCACCACCGGCCGCGTCGCCGACCTCACCCTCCGCGGCGAGGCCGACGACCCCGTCATGGCGCCCGCCGGCCGCCCGGCCTCCGGCGTCATGTCCGGCTACATCTCCGACGCGGTGTGCCGCCTCGGCCGCCTCTCCTCCCTCATCCTCGCCGACTGGAAGCAGATCTCCGGGCCCATCCCGCCGTGCGTCGCCACGGCCCTCCCTTACCTCCGCATCCTCGAGCTCCCCGGCAACCGCCTCACCGGCGAGATCCCGCGCTCCATCGGCAGCCTCTCCCGCCTCACCGTGCTCAACCTCGCCGACAACCTCATCGCCGGCGAAATCCCAAGCTCCATCACCTCGCTCGCGTCGCTGAAGCACCTCGACCTCACCAACAACCAGCTCACCGGCGGGATCCCGGACGACGTGGGCGACCTCACCATGCTCAGCCGCGCGCTGCTCGGCCGGAACAAGCTCACCGGCGCCATCCCAACGTCGGTCGGCTCCCTGACCCGGCTCGCCGACCTCGACCTCGCCGAGAACGGCCTCACCGGCGGGATCCCGGACAGCCTGGGCGGCGCCCACGTGCTCACCTCCCTGTACCTCGGCGGCAACCGGGTCTCCGGCCGGATCCCGGCGAGCCTGCTGCAGAACAAGGGGCTGGGCATCCTGAACCTGAGCCGGAACGCCGTCGAGGGCGCCATCCCCGACGTGTTCACCGCCGAGTCCTACTTCATGGTGCTCGACCTGTCCCGGAACAGGCTCACCGGCGCCGTGCCGAGGTCGCTGTCGGCGGCAGCGTACGTCGGCCACCTCGACCTCAGCCACAACCGGCTGTGCGGCTCCATCCCCGCCGGCCCGCCGTTCGACCACCTCGACGCCGCCTCCTTCGCCAGCAACAGCTGCCTCTGCGGCGGCCCGCTCGGCAAGTGCACGTGACGTGCCCCAACCAGAGCCGTCCGATCGATCGGGAGAGCCTGATCGAACGTGTGGTGTGCGATGTACCGTGTACGATGCAACGAACTTACGTGTTCGTATATATGGTTAATTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAAGAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAGAA 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CTGCAGTGCAGTGCCCACGCGAGCCGAGACGAGACGATGGCATCATCTCCCGCTCCAAGCCCCGCCGCGCCGCCGCTCCTCCTCGCCGCGCTCGCGGCGCTCGCCGTGGTCGCGTCCGCCTCCGCCGCCGCGTGCTCCGCGGGCGACCGGGACGCGCTGCTGGCGATCCGGGCGGCGCTGTCGGAGGCGCACCTCGGGGTGTTCTCGTCGTGGACGGGCACCGACTGCTGCACCAGCTGGTACGGCGTGAGCTGCGATCCCACCACCGGCCGCGTCGCCGACCTCACCCTCCGCGGCGAGGCCGACGACCCCGTCATGGCGCCCGCCGGCCGCCCGGCCTCCGGCGTCATGTCCGGCTACATCTCCGACGCGGTGTGCCGCCTCGGCCGCCTCTCCTCCCTCATCCTCGCCGACTGGAAGCAGATCTCCGGGCCCATCCCGCCGTGCGTCGCCACCGCCCTCCCTTACCTCCGCATCCTCGAGCTCCCCGGCAACCGCCTCACCGGCGAGATCCCGCGCTCCATCGGCAGCCTCTCCCGCCTCACCGTGCTCAACCTCGCCGACAACCTCATCGCCGGCGAAATCCCAAGCTCCATCACCTCGCTCGCGTCGCTGAAGCACCTCGACCTCACCAACAACCAGCTCACCGGCGGGATCCCGGACGACGTGGGCGACCTCACCATGCTCAGCCGCGCGCTGCTCGGCCGGAACAAGCTCACCGGCGCCATCCCAACGTCGGTCGGCTCCCTGACCCGGCTCGCCGACCTCGACCTCGCCGAGAACGGCCTCACCGGCGGGATCCCGGACAGCCTGGGCGGCGCCCACGTGCTCACCTCCCTGTACCTCGGCGGCAACCGGGTCTCCGGCCGGATCCCGGCGAGCCTGCTGCAGAACAAGGGGCTGGGCATCCTGAACCTGAGCCGGAACGCCGTCGAGGGCGCCATCCCCGACGTGTTCACCGCCGAGTCCTACTTCATGGTGCTCGACCTGTCCCGGAACAGGCTCACCGGCGCCGTGCCGAGGTCGCTGTCGGCGGCAGCGTACGTCGGCCACCTCGACCTCAGCCACAACCGGCTGTGCGGCTCCATCCCCGCCGGCCCGCCGTTCGACCACCTCGACGCCGCCTCCTTCGCCAGCAACAGCTGCCTCTGCGGCGGCCCGCTCGGCAAGTGCACGTGACGTGCCCCAACCAGAGCCGTCCGATCGATCGGGAGAGCCTGATCGAACGTGTGGTGTGCGATGTACCGTGTACGATGCAACGAACTTACGTGTTCGTATATATGGTTAATTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAAAGAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAGAATGTTTTCTCTTTCCTGCCTTTCTCTTCTTTATACTTTTAACCTTTTTTGCTAGTGATTTACTTGATAGTTCTACTTTAAAGTTTGTATTGTACAAGTGACAAAAGCATAAGAAATGCTAAAGAT ] [+] EMBL AK120908 [ 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] [-] EMBL CB000556 [ TTAGTTGCTGCTTAAGTATTAACTCACTTGGGCTATAGTTTTGGGCTTGGGTACATATAGAACAAGATGAGAATTTGTGCCTAGCGCCTGTGTGCGTGAGAGAAAAAGGAAGTGGTTAAGGAAAAGAAAAATGTTTTCTCTTTCCTGCCTTTCTCTTCTTTATACTTTTAACCTTTTTTGCTAGTGATTTACTTGATAGTTCTAGTTTAAAGTTGGTATTGTACAAGTGACAAAAGCATAAGAAATGCTAAAGATCTTGTATGAGAGGTTGTGGTTTCATATTTGTGCGCTTGGGCCCTTGGC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||