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Oryza sativa
cluster # 6233 cluster # 6233       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6233#0 length = 2567 sequences # 4  

consensusID : consensus_6233#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2567
fasta sequence
                              [CTACCCACCCGCTACCAATCCCCTTCGCTCCGCTCCACTCCTCCGGATCTCCGCCCCGCCCCTTCCATCTCCGGCGCCGGCGAGAATGGAGCTGCTCTGCATCGGGACGGCGGACACCAAGCTGGACGAGCTGCTCTTCCTCGCCGCCCGCCTCCGCTCCACCCTCGCCGCCACCTCCTCCGCGCAGGTTCAAGTAAGCCTTGTGGATGTCTCCACAACTAAGAAGGTGACATCACAAGATTTTAAGGGCACCACATTTATCTCAAGAGATGCAGTTCTTTCGTGTCATTTAGGTGTCGATCAACATGAACTTCCTAGTGACAGAGGTGAAGCAATCACACTCATGTCAGAGGCTCTCCAGAGCTTTCTAAAAAGAAGATATGAAAGTGGTACTCTGCTAGGTGCTGTTGGATTAGGAGGCAGTGGAGGAACTGCCCTAATTGCTCCTGCTCTAAGATCCCTGCCACTCGGAGTGCCTAAGC-TATTGTATCTACTGTTGCTAGTGGCCAAACGGCACCATATGTTGGAACATCGGACTTGGTGTTGTTTCCTTCAGTTGTTGACATATGTGGCATAAACAGTGTCAGCCGTGTTATATTATCTAATGCTGCTGCAGCTGTTGCTGGAATGGTGCACGGAATATTAATGGAATCCAATGAATCTGATGAAACTGCCACAAAACCAACTATTGGTATTACAATGTTTGGTGTGACAACAACATGTGTAAATATGGTCAAAGAAAGACTGAGCAAAGAAGGTTATGAGACACTTGTATTCCATGCCACAGGTGTAGGAGGAAAAGCGATGGAAGAACTAGTTAAGGGAGGTTTCATACAGGGTGTATTAGATATAACGACAACAGAAGTTGCAGACCACATTGTTGGCGGTGTTATGGCATGTGATGATACAAGGTTTGATGCAATTATCGACAACAAAATCCCTCTTGTTCTCAGTGTTGGAGCCTTGGATATGGTCAACTTTGGAGCTCGAGATACGATACCTCCTGATTTCACAGGAAGAAAGATACATGTGCATAATGAGCAGGTTTCACTGATGCGAACTACAGTAGAAGAGAACAAAAAAAATTGCTGAGTTTATAGCTGATAAAATAAACAAATCTTCATCGAAGGTTATTGTTTGCCTGCCACAAAAGGGCATCTCTGCAATAGATGCACCTAAAATGCCATTTTACGATCTGGAGGCTACATCTACGCTGCTGGATGAATTATGTAGCCGTATAGAGAAAACTGACAACAGAGAGGTCAAGATGCTTCCATATCATATAAATGATCCGGAATTTGCTAATGTTTTGGTGGACGCATTCTTGAGTATGGATGTAAAGGCATCTAATACAATAAGTCCAGAAAACAGCATGGTCCAAACTAATCAAGATGTAAATACAAAAGAATATTGTTCAACACAGAGAACTTCAGATAGTTCTATCATATGGAGATCTCCAGTAGATTTTCCTGATGCAAGACCAGAAACTTTGC-AAAGACAAAGTCAGTATTACATAAACTAAAGCAACAAATTGTTGAGGGTACTCCTGTCATTGGAGCTGGTGCTGGCACTGGCATATCAGCCAAGTTTGAAGAAGCTGGTGGAGTTGATCTTATAGTTCTGTACAACTCCGGGCGGTTTCGCATGGCTGGGAGGGGTTCATTGGCAGGACTATTGCCATTTGCAGATGCAAACGCTATTGTACTTGAGATGGCCAATGAAGTGTTGCCTGTGGTTAAAGGAGTTCCGGTTCTTGCTGGGGTTTGCGCTACTGATCCATTCCGTAGAATGGAGTACTTCCTTAAACAACTAGAAGCTATTGGATTTTGTGGTGTCCAAAATTTCCCCACTGTTGGTCTTTTTGATGGCAATTTTCGACAGAACTTGGAAGAAACTGGAATGGGCTACAGCTTGGAAGTGGAGATGATCTCAAGAGCTCACAGCATGGGTTTTTTGACGACTCCATATGCTTTCAATCCTGAAGAAGCTGCTGCCATGGCCAAGGCTGGAGCTCATATAATAGTGGCACATATGGGTCTAACAACAGCTGGGTCTATTGGGGCAAAGACTGCTGTCACTTTAGATGACAGTGTCAAACGTGTTCAAGCCATTGCTGATGCAGCACTTGGGATTAATCCTGACATTATTGTTCTGTGTCATGGAGGTCCCATATCAGGGCCGCAGGAGGCAGAGTTTATCCTAAAGCGCACTAACAGGGTCCATGGATTCTATGGTGCATCAAGCATGGAGCGGCTACCAGTTGAGCAAGCTATCACAAACACCATGAGGGAGTATAAACGGATTTCCATAAAATAAGAATGATAGTTCAGACTTCAAATATGTCCTTTGCTCTACATGGTACTGATCTTCATACTGATTCAAAGAACAATAATGGAAGAGGAAGCCAGGTGTTTGTGCATTGTTGTACCATATGCGGCACATGTACTCGTGTATTTCAGTCGGAATAAAGAATGATAAGCGAATGATTTCGTGCTTACTTAATAACTATCCATACTAAGACGATAAGTTACTGTAACCATGACAAAATCTGTGATAAAGACCGAAAT]

[+] EMBL AK067008             [CTACCCACCCGCTACCAATCCCCTTCGCTCCGCTCCACTCCTCCGGATCTCCGCCCCGCCCCTTCCATCTCCGGCGCCGGCGAGAATGGAGCTGCTCTGCATCGGGACGGCGGACACCAAGCTGGACGAGCTGCTCTTCCTCGCCGCCCGCCTCCGCTCCACCCTCGCCGCCACCTCCTCCGCGCAGGTTCAAGTAAGCCTTGTGGATGTCTCCACAACTAAGAAGGTGACATCACAAGATTTTAAGGGCACCACATTTATCTCAAGAGATGCAGTTCTTTCGTGTCATTTAGGTGTCGATCAACATGAACTTCCTAGTGACAGAGGTGAAGCAATCACACTCATGTCAGAGGCTCTCCAGAGCTTTCTAAAAAGAAGATATGAAAGTGGTACTCTGCTAGGTGCTGTTGGATTAGGAGGCAGTGGAGGAACTGCCCTAATTGCTCCTGCTCTAAGATCCCTGCCACTCGGAGTGCCTAAGC TATTGTATCTACTGTTGCTAGTGGCCAAACGGCACCATATGTTGGAACATCGGACTTGGTGTTGTTTCCTTCAGTTGTTGACATATGTGGCATAAACAGTGTCAGCCGTGTTATATTATCTAATGCTGCTGCAGCTGTTGCTGGAATGGTGCACGGAATATTAATGGAATCCAATGAATCTGATGAAACTGCCACAAAACCAACTATTGGTATTACAATGTTTGGTGTGACAACAACATGTGTAAATATGGTCAAAGAAAGACTGAGCAAAGAAGGTTATGAGACACTTGTATTCCATGCCACAGGTGTAGGAGGAAAAGCGATGGAAGAACTAGTTAAGGGAGGTTTCATACAGGGTGTATTAGATATAACGACAACAGAAGTTGCAGACCACATTGTTGGCGGTGTTATGGCATGTGATGATACAAGGTTTGATGCAATTATCGACAACAAAATCCCTCTTGTTCTCAGTGTTGGAGCCTTGGATATGGTCAACTTTGGAGCTCGAGATACGATACCTCCTGATTTCACAGGAAGAAAGATACATGTGCATAATGAGCAGGTTTCACTGATGCGAACTACAGTAGAAGAGAACAAAAAAAATTGCTGAGTTTATAGCTGATAAAATAAACAAATCTTCATCGAAGGTTATTGTTTGCCTGCCACAAAAGGGCATCTCTGCAATAGATGCACCTAAAATGCCATTTTACGATCTGGAGGCTACATCTACGCTGCTGGATGAATTATGTAGCCGTATAGAGAAAACTGACAACAGAGAGGTCAAGATGCTTCCATATCATATAAATGATCCGGAATTTGCTAATGTTTTGGTGGACGCATTCTTGAGTATGGATGTAAAGGCATCTAATACAATAAGTCCAGAAAACAGCATGGTCCAAACTAATCAAGATGTAAATACAAAAGAATATTGTTCAACACAGAGAACTTCAGATAGTTCTATCATATGGAGATCTCCAGTAGATTTTCCTGATGCAAGACCAGAAACTTTGC AAAGACAAAGTCAGTATTACATAAACTAAAGCAACAAATTGTTGAGGGTACTCCTGTCATTGGAGCTGGTGCTGGCACTGGCATATCAGCCAAGTTTGAAGAAGCTGGTGGAGTTGATCTTATAGTTCTGTACAACTCCGGGCGGTTTCGCATGGCTGGGAGGGGTTCATTGGCAGGACTATTGCCATTTGCAGATGCAAACGCTATTGTACTTGAGATGGCCAATGAAGTGTTGCCTGTGGTTAAAGGAGTTCCGGTTCTTGCTGGGGTTTGCGCTACTGATCCATTCCGTAGAATGGAGTACTTCCTTAAACAACTAGAAGCTATTGGATTTTGTGGTGTCCAAAATTTCCCCACTGTTGGTCTTTTTGATGGCAATTTTCGACAGAACTTGGAAGAAACTGGAATGGGCTACAGCTTGGAAGTGGAGATGATCTCAAGAGCTCACAGCATGGGTTTTTTGACGACTCCATATGCTTTCAATCCTGAAGAAGCTGCTGCCATGGCCAAGGCTGGAGCTCATATAATAGTGGCACATATGGGTCTAACAACAGCTGGGTCTATTGGGGCAAAGACTGCTGTCACTTTAGATGACAGTGTCAAACGTGTTCAAGCCATTGCTGATGCAGCACTTGGGATTAATCCTGACATTATTGTTCTGTGTCATGGAGGTCCCATATCAGGGCCGCAGGAGGCAGAGTTTATCCTAAAGCGCACTAACAGGGTCCATGGATTCTATGGTGCATCAAGCATGGAGCGGCTACCAGTTGAGCAAGCTATCACAAACACCATGAGGGAGTATAAACGGATTTCCATAAAATAAGAATGATAGTTCAGACTTCAAATATGTCCTTTGCTCTACATGGTACTGATCTTCATACTGATTCAAAGAACAATAATGGAAGAGGAAGCCAGGTGTTTGTGCATTGTTGTACCATATGCGGCACATGTACTCGTGTATTTCAGTCGGAATAAAGAATGATAAGCGAATGATTTCGTGCTTACTTAATAACTATCCATACTAAGACGATAAGTTACTGTAACCATGACAAAATCTGTGATAAAGACCGAAAT]
[+] EMBL AK063108             [                                                    GCCCCGCCCCTTCCATCTCCGGCGCCGGCGAGAATGGAGCTGCTCTGCATCGGGACGGCGGACACCAAGCTGGACGAGCTGCTCTTCCTCGCCGCCCGCCTCCGCTCCACCCTCGCCGCCACCTCCTCCGCGCAGGTTCAAGTAAGCCTTGTGGATGTCTCCACAACTAAGAAGGTGACATCACAAGATTTTAAGGGCACCACATTTATCTCAAGAGATGCAGTTCTTTCGTGTCATTTAGGTGTCGATCAACATGAACTTCCTAGTGACAGAGGTGAAGCAATCACACTCATGTCAGAGGCTCTCCAGAGCTTTCTAAAAAGAAGATATGAAAGTGGTACTCTGCTAGGTGCTGTTGGATTAGGAGGCAGTGGAGGAACTGCCCTAATTGCTCCTGCTCTAAGATCCCTGCCACTCGGAGTGCCTAAGCTTATTGTATCTACTGTTGCTAGTGGCCAAACGGCACCATATGTTGGAACATCGGACTTGGTGTTGTTTCCTTCAGTTGTTGACATATGTGGCATAAACAGTGTCAGCCGTGTTATATTATCTAATGCTGCTGCAGCTGTTGCTGGAATGGTGCACGGAATATTAATGGAATCCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CB670506             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTTATGGCATTTGATGATACAAGGTTTGATGCAATTATCGACAACAAAATCCCTCTTGTTCTCAGTGTTGGAGCCTTGGATCCGGACAACTTTGGAGCTCGAGATACGATACCTCCTGATTTCACAGGAAGAAAGATACATGTGCATAATGAGCAGGTTTCACTGATGCGAACTACAGTAGAAGAGAAC AAAAAAATTGCTGAGTTTATAGCTGATAAAATAAACAAATCTTCATCGAAGGTTATTGTTTGCCTGCCACAAAAGGGCATCTCTGCAATAGATGCACCTAAAATGCCATTTTACGATCTGGAGGCTACATCTACGCTGCTGGATGAATTATGTAGCCGTATAGAGAAAACTGACAACAGAGAGGTCAAGATGCTTCCATATCATATAAATGATCCGGAATTTGCTAATGTTTTGGTGGACGCATTCTTGAGTATGGATGTAAAGGCATCTAATACAATAAGTCCAGAAAACAGCATGGTCCAAACTAATCAAGATGTAAATACAAAAGAATATTGTTCAACACAGAGAACTTCAGATAGTTCTATCATATGGAGATCTCCAGTAGATTTTCCTGATGCAAGACCAGAAACTTTGCAAAAGACAAAGTCAGTATTACATAAACTAAAGCAACAAATTGTTGAGGGTACTCCTGTCATTGGAGCTGGTGCTGGCACTGGCATATCAGCCAAGTTTGAAGAAGCTGGTGGAGTTGATCTTATAGTTCTGTACAACTCCGGGCGGTTTCGCATGGCTGGGAGGGGTTCATTGGCAGGACTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CB670507             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ACTAGAAGCTATTGGATTTTGTGGTGTCCAAAATTTCCCCACT TTGGTCTTTTTGATGGCAATTTTTGACAGAACTTGGAAGAAACTGGAATGGGCTACAGCTTGGAAGTGGAGATGATCTCAAGAGCTCACAGCATGGGTTTTTTGACGACTCCATATGCTTTCAATCCTGAAGAAGCTGCTGCCATGGCCAAGGGTGGAGCTCATATAATAGTGGCACATATGGGTTTAACAACAGCTGGGTTTATTGGGGCAAAGACTGCTGTCCCTTTAGATGACAGTGTCAAACGTGTTCAAGCCATTGGTGATGCAGCACTTGGGATTAATCCTGACATTATTGTTTTGTGTCATGGAGGTCCCATATCAGGGCCGCAGGAGGCAGAGTTTTTCCTAAAGCGCACTAACAGGGTCCATGGATTTTATGGTGCATCAAGCATGGAGCGGGTTCCAGTTGAGCAAGCTATCACAAACCCCATGAGGGAGTATAAACGGATTTCCATAAAATAAGAATGATAGTTCAGACTTCAAATATGTCCTTTGCTTTACATGGTTCTGATTTTCATTCTGATTCAAAGAACAATAATGGAAGAGGAAGCCAGGTGTTTGTGCATTGTTGTTCCATATGCGGCCCATGTACTGGTGTATTTCAGTCGGAATAAAGAATGATAAGCGAATGATTTCGTGCTTACTTAATAACTATCCATAGTAAGACGATA                                          ]


>consensus_6233#0 CTACCCACCCGCTACCAATCCCCTTCGCTCCGCTCCACTCCTCCGGATCTCCGCCCCGCC CCTTCCATCTCCGGCGCCGGCGAGAATGGAGCTGCTCTGCATCGGGACGGCGGACACCAA GCTGGACGAGCTGCTCTTCCTCGCCGCCCGCCTCCGCTCCACCCTCGCCGCCACCTCCTC CGCGCAGGTTCAAGTAAGCCTTGTGGATGTCTCCACAACTAAGAAGGTGACATCACAAGA TTTTAAGGGCACCACATTTATCTCAAGAGATGCAGTTCTTTCGTGTCATTTAGGTGTCGA TCAACATGAACTTCCTAGTGACAGAGGTGAAGCAATCACACTCATGTCAGAGGCTCTCCA GAGCTTTCTAAAAAGAAGATATGAAAGTGGTACTCTGCTAGGTGCTGTTGGATTAGGAGG CAGTGGAGGAACTGCCCTAATTGCTCCTGCTCTAAGATCCCTGCCACTCGGAGTGCCTAA GCTATTGTATCTACTGTTGCTAGTGGCCAAACGGCACCATATGTTGGAACATCGGACTTG GTGTTGTTTCCTTCAGTTGTTGACATATGTGGCATAAACAGTGTCAGCCGTGTTATATTA TCTAATGCTGCTGCAGCTGTTGCTGGAATGGTGCACGGAATATTAATGGAATCCAATGAA TCTGATGAAACTGCCACAAAACCAACTATTGGTATTACAATGTTTGGTGTGACAACAACA TGTGTAAATATGGTCAAAGAAAGACTGAGCAAAGAAGGTTATGAGACACTTGTATTCCAT GCCACAGGTGTAGGAGGAAAAGCGATGGAAGAACTAGTTAAGGGAGGTTTCATACAGGGT GTATTAGATATAACGACAACAGAAGTTGCAGACCACATTGTTGGCGGTGTTATGGCATGT GATGATACAAGGTTTGATGCAATTATCGACAACAAAATCCCTCTTGTTCTCAGTGTTGGA GCCTTGGATATGGTCAACTTTGGAGCTCGAGATACGATACCTCCTGATTTCACAGGAAGA AAGATACATGTGCATAATGAGCAGGTTTCACTGATGCGAACTACAGTAGAAGAGAACAAA AAAAATTGCTGAGTTTATAGCTGATAAAATAAACAAATCTTCATCGAAGGTTATTGTTTG CCTGCCACAAAAGGGCATCTCTGCAATAGATGCACCTAAAATGCCATTTTACGATCTGGA GGCTACATCTACGCTGCTGGATGAATTATGTAGCCGTATAGAGAAAACTGACAACAGAGA GGTCAAGATGCTTCCATATCATATAAATGATCCGGAATTTGCTAATGTTTTGGTGGACGC ATTCTTGAGTATGGATGTAAAGGCATCTAATACAATAAGTCCAGAAAACAGCATGGTCCA AACTAATCAAGATGTAAATACAAAAGAATATTGTTCAACACAGAGAACTTCAGATAGTTC TATCATATGGAGATCTCCAGTAGATTTTCCTGATGCAAGACCAGAAACTTTGCAAAGACA AAGTCAGTATTACATAAACTAAAGCAACAAATTGTTGAGGGTACTCCTGTCATTGGAGCT GGTGCTGGCACTGGCATATCAGCCAAGTTTGAAGAAGCTGGTGGAGTTGATCTTATAGTT CTGTACAACTCCGGGCGGTTTCGCATGGCTGGGAGGGGTTCATTGGCAGGACTATTGCCA TTTGCAGATGCAAACGCTATTGTACTTGAGATGGCCAATGAAGTGTTGCCTGTGGTTAAA GGAGTTCCGGTTCTTGCTGGGGTTTGCGCTACTGATCCATTCCGTAGAATGGAGTACTTC CTTAAACAACTAGAAGCTATTGGATTTTGTGGTGTCCAAAATTTCCCCACTGTTGGTCTT TTTGATGGCAATTTTCGACAGAACTTGGAAGAAACTGGAATGGGCTACAGCTTGGAAGTG GAGATGATCTCAAGAGCTCACAGCATGGGTTTTTTGACGACTCCATATGCTTTCAATCCT GAAGAAGCTGCTGCCATGGCCAAGGCTGGAGCTCATATAATAGTGGCACATATGGGTCTA ACAACAGCTGGGTCTATTGGGGCAAAGACTGCTGTCACTTTAGATGACAGTGTCAAACGT GTTCAAGCCATTGCTGATGCAGCACTTGGGATTAATCCTGACATTATTGTTCTGTGTCAT GGAGGTCCCATATCAGGGCCGCAGGAGGCAGAGTTTATCCTAAAGCGCACTAACAGGGTC CATGGATTCTATGGTGCATCAAGCATGGAGCGGCTACCAGTTGAGCAAGCTATCACAAAC ACCATGAGGGAGTATAAACGGATTTCCATAAAATAAGAATGATAGTTCAGACTTCAAATA TGTCCTTTGCTCTACATGGTACTGATCTTCATACTGATTCAAAGAACAATAATGGAAGAG GAAGCCAGGTGTTTGTGCATTGTTGTACCATATGCGGCACATGTACTCGTGTATTTCAGT CGGAATAAAGAATGATAAGCGAATGATTTCGTGCTTACTTAATAACTATCCATACTAAGA CGATAAGTTACTGTAACCATGACAAAATCTGTGATAAAGACCGAAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)