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Oryza sativa
cluster # 6234 cluster # 6234       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6234#0 length = 1395 sequences # 4  

consensusID : consensus_6234#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1395
fasta sequence
                              [AGAGAACGCGTGGACGGACGCGTGGACNCGCCGCCGCCGCCGCGATGACCACGCTCCTGCGCCGCCTCCTCTTGGGCGCCACCCCGGCCGACGCGTTGCTCACCGGCCGCCTCCCCTTCTCCACCTCCTCCCGCCGCACGCCGCACCGCTTCCGCCGCAGCCGCCGCTCCCCGAACCCTGCGCCGCCCTCCCCTGAAGCCGTCTCCGCGGCCATCGCCACCCTCCCGTCCCGTCTCACCCCGCCTCTCCTCTCCTACTCCCTCTCCTCCGTCTCCGACGCCCGCCTACTCCTTCCGGTCCTCACCCACTCCCTTCGTCTCGCCACCTTCCGCCCTGACCCGGGCCCCTTCCTCGTCGCGATCAAGCGCCTCGCCGCCGCCGATCTCTACGCCGATTTCGACCGCACCTGCGCCCTCGCCTTCTCCCTCCTCCCCTCTCTCCCGTCCCCCGGGCCCTTCCTCCGCACCGCGCTCTACTTCTACTGCCAGTTCCGCAAGATCGGCAAGGCGTTCCACGTCTACACCCTCATGCGCGCCTCCGCCGACCCCGCCGCGCGCCCCTCCGCCGACACCTACCACGCGCTCTTCACCGCGCTCTTGTCCCGCGGCGGCGGCGACACCATGGTGCACTACATGTACATGGACACCGTCTCCGCTCTGTTCCGGCAGATGCTGGAGGAGGGTGTCCCGCCGGACACGCGCGCGCTCAACGTGCTCGTCAAGGGCTACGCGCAGTCGCTGCACCTCAACGACGCGCTGCGCGTGTTCCACCAGATGCGGCCCGTCTACGGTTGCGAACCGGACGCCCTCACGTACAGCTACCTGGTGCACGGGCTGAGCGAGCAGGGCCGGACGAGGAACGCCCGTGAGGTGTTCGATGAAATGCTGGCCAAGGGGCTGGCCCCTACGGAGCCGGCGTGCAACACGTTCGTCAGTGCGCTGGCCATGGCAGGGGAGGCTGGGGAGGCGGAGCGTGTGATGTGGGACATGGCTCGGGCGGGAAGGGTGGTCGACGACGTCACGAGGAGGGCGGTGGTGGAGGAGCTGTGGAGATCGGGGAGGAGGGACGACGCCGAAAGGGTGGTGAGGGAGATGGAGGAGCGAGGCATCGTGGGTGGCGCTGAGCGGAGAGCCTTGCTACGTTCGCTGCACGATGAGTTCGGTGACGACGATTTGGATGTTGATGATAGATGGCGGAACACAAGGTGATTGTCTGACAGATGGAGAGTTGAGAAGCACTCATAATCCATCCGGCCATCCATGTCCCAAAAACATGGCAATCAACATTGAACACTACTAAATGCCATGAGATGTAACAGAAAATTTTGTGATAAAGTATCAGTAAAATTCATTTGCAATGATATAAGGGTTAACTGCAAGATTGATATTTAAAAAA]

[+] EMBL C91778               [AGAGAACGCGTGGACGGACGCGTGGACNCGCCGCCGCCGCCGCGATGACCACGCTCCTGCGCCGCCTCCTCTTGGGCGCCACCCCGGCCGACGCGTTGCTCACCGGCCGCCTCCCCTTCTCCACCTCCTCCCGCCGCACGCCGCACCGCTTCCGCCGCAGCCGCNGCTCCCCGAACCCTGCGCCGCCCTCCCCTGAAGCCGTCTCCGCGGCCATCGCCACCCTCCCGTCCCGTCTCAACCCGCCTCTNCTCTCCTACTCCCTCTCCTCCGTCTCCGANGCCCGCATACNCCTTCCGGTCCTCAACCANTCCCTTCGTCTCGGCAACTTCCGCNCTGAACCGGG CCCTTCCTCGTCGCGATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AK073826             [                               CGCCGCCGCCGCGATGACCACGCTCCTGCGCCGCCTCCTCTTGGGCGCCACCCCGGCCGACGCGTTGCTCACCGGCCGCCTCCCCTTCTCCACCTCCTCCCGCCGCACGCCGCACCGCTTCCGCCGCAGCCGCCGCTCCCCGAACCCTGCGCCGCCCTCCCCTGAAGCCGTCTCCGCGGCCATCGCCACCCTCCCGTCCCGTCTCACCCCGCCTCTCCTCTCCTACTCCCTCTCCTCCGTCTCCGACGCCCGCCTACTCCTTCCGGTCCTCACCCACTCCCTTCGTCTCGCCACCTTCCGCCCTGACCCGGGCCCCTTCCTCGTCGCGATCAAGCGCCTCGCCGCCGCCGATCTCTACGCCGATTTCGACCGCACCTGCGCCCTCGCCTTCTCCCTCCTCCCCTCTCTCCCGTCCCCCGGGCCCTTCCTCCGCACCGCGCTCTACTTCTACTGCCAGTTCCGCAAGATCGGCAAGGCGTTCCACGTCTACACCCTCATGCGCGCCTCCGCCGACCCCGCCGCGCGCCCCTCCGCCGACACCTACCACGCGCTCTTCACCGCGCTCTTGTCCCGCGGCGGCGGCGACACCATGGTGCACTACATGTACATGGACACCGTCTCCGCTCTGTTCCGGCAGATGCTGGAGGAGGGTGTCCCGCCGGACACGCGCGCGCTCAACGTGCTCGTCAAGGGCTACGCGCAGTCGCTGCACCTCAACGACGCGCTGCGCGTGTTCCACCAGATGCGGCCCGTCTACGGTTGCGAACCGGACGCCCTCACGTACAGCTACCTGGTGCACGGGCTGAGCGAGCAGGGCCGGACGAGGAACGCCCGTGAGGTGTTCGATGAAATGCTGGCCAAGGGGCTGGCCCCTACGGAGCCGGCGTGCAACACGTTCGTCAGTGCGCTGGCCATGGCAGGGGAGGCTGGGGAGGCGGAGCGTGTGATGTGGGACATGGCTCGGGCGGGAAGGGTGGTCGACGACGTCACGAGGAGGGCGGTGGTGGAGGAGCTGTGGAGATCGGGGAGGAGGGACGACGCCGAAAGGGTGGTGAGGGAGATGGAGGAGCGAGGCATCGTGGGTGGCGCTGAGCGGAGAGCCTTGCTACGTTCGCTGCACGATGAGTTCGGTGACGACGATTTGGATGTTGATGATAGATGGCGGAACACAAGGTGATTGTCTGACAGATGGAGAGTTGAGAAGCACTCATAATCCATCCGGCCATCCATGTCCCAAAAACATGGCAATCAACATTGAACACTACTAAATGCCATGAGATGTAACAGAAAATTTTGTGATAAAGTATCAGTAAA                                                  ]
[+] EMBL AK122148             [                               CGCCGCCGCCGCGATGACCACGCTCCTGCGCCGCCTCCTCTTGGGCGCCACCCCGGCCGACGCGTTGCTCACCGGCCGCCTCCCCTTCTCCACCTCCTCCCGCCGCACGCCGCACCGCTTCCGCCGCAGCCGCCGCTCCCCGAACCCTGCGCCGCCCTCCCCTGAAGCCGTCTCCGCGGCCATCGCCACCCTCCCGTCCCGTCTCACCCCGCCTCTCCTCTCCTACTCCCTCTCCTCCGTCTCCGACGCCCGCCTACTCCTTCCGGTCCTCACCCACTCCCTTCGTCTCGCCACCTTCCGCCCTGACCCGGGCCCCTTCCTCGTCGCGATCAAGCGCCTCGCCGCCGCCGATCTCTACGCCGATTTCGACCGCACCTGCGCCCTCGCCTTCTCCCTCCTCCCCTCTCTCCCGTCCCCCGGGCCCTTCCTCCGCACCGCGCTCTACTTCTACTGCCAGTTCCGCAAGATCGGCAAGGCGTTCCACGTCTACACCCTCATGCGCGCCTCCGCCGACCCCGCCGCGCGCCCCTCCGCCGACACCTACCACGCGCTCTTCACCGCGCTCTTGTCCCGCGGCGGCGGCGACACCATGGTGCACTACATGTACATGGACACCGTCTCCGCTCTGTTCCGGCAGATGCTGGAGGAGGGTGTCCCGCCGGACACGCGCGCGCTCAACGTGCTCGTCAAGGGCTACGCGCAGTCGCTGCACCTCAACGACGCGCTGCGCGTGTTCCACCAGATGCGGCCCGTCTACGGTTGCGAACCGGACGCCCTCACGTACAGCTACCTGGTGCACGGGCTGAGCGAGCAGGGCCGGACGAGGAACGCCCGTGAGGTGTTCGATGAAATGCTGGCCAAGGGGCTGGCCCCTACGGAGCCGGCGTGCAACACGTTCGTCAGTGCGCTGGCCATGGCAGGGGAGGCTGGGGAGGCGGAGCGTGTGATGTGGGACATGGCTCGGGCGGGAAGGGTGGTCGACGACGTCACGAGGAGGGCGGTGGTGGAGGAGCTGTGGAGATCGGGGAGGAGGGACGACGCCGAAAGGGTGGTGAGGGAGATGGAGGAGCGAGGCATCGTGGGTGGCGCTGAGCGGAGAGCCTTGCTACGTTCGCTGCACGATGAGTTCGGTGACGACGATTTGGATGTTGATGATAGATGGCGGAACACAAGGTGATTGTCTGACAGATGGAGAGTTGAGAAGCACTCATAATCCATCCGGCCATCCATGTCCCAAAGACATGGCAATCAACATTGAACACTACTAAATGCCATGAGATGTAACAGAAAATTTTGTGATAAAGTATCAGTAAA                                                  ]
[+] EMBL AU172848             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGCTGGGGAGGCGGAGCGTGTTATGTGGGACATGGCTCGGGCGGGAAGGGTGGTCGACGACGTCACGAGGAGGGCGGTGGTGGAGGAGCTGTGGAGATCGGGGAGGAGGGACGACGCCGAAAGGGTGGTGAGGGAGATGGAGGAGCGAGGCATCGTGGGTGGCGCTGAGCGGAGAGCCTTGCTACGTTCGCTGCACGATGAGTTCGGTGACGACGATTTGGATGTTGATGATAGATGGCGGAACACAAGGTGATTGTCTGACAGATGGAGAGTTGAGAAGCACTCATAATCCATCCGGCCATCCATGTCCCAAAAACATGGCAATCAACATTGAACACTACTAAATGCCATGAGATGTAACAGAAAATTTTGTGATAAAGTATCAGTAAAATTCATTTGCAATGATATAAGGGTTAACTGCAAGATTGATATTTAAAAAA]


>consensus_6234#0 AGAGAACGCGTGGACGGACGCGTGGACNCGCCGCCGCCGCCGCGATGACCACGCTCCTGC GCCGCCTCCTCTTGGGCGCCACCCCGGCCGACGCGTTGCTCACCGGCCGCCTCCCCTTCT CCACCTCCTCCCGCCGCACGCCGCACCGCTTCCGCCGCAGCCGCCGCTCCCCGAACCCTG CGCCGCCCTCCCCTGAAGCCGTCTCCGCGGCCATCGCCACCCTCCCGTCCCGTCTCACCC CGCCTCTCCTCTCCTACTCCCTCTCCTCCGTCTCCGACGCCCGCCTACTCCTTCCGGTCC TCACCCACTCCCTTCGTCTCGCCACCTTCCGCCCTGACCCGGGCCCCTTCCTCGTCGCGA TCAAGCGCCTCGCCGCCGCCGATCTCTACGCCGATTTCGACCGCACCTGCGCCCTCGCCT TCTCCCTCCTCCCCTCTCTCCCGTCCCCCGGGCCCTTCCTCCGCACCGCGCTCTACTTCT ACTGCCAGTTCCGCAAGATCGGCAAGGCGTTCCACGTCTACACCCTCATGCGCGCCTCCG CCGACCCCGCCGCGCGCCCCTCCGCCGACACCTACCACGCGCTCTTCACCGCGCTCTTGT CCCGCGGCGGCGGCGACACCATGGTGCACTACATGTACATGGACACCGTCTCCGCTCTGT TCCGGCAGATGCTGGAGGAGGGTGTCCCGCCGGACACGCGCGCGCTCAACGTGCTCGTCA AGGGCTACGCGCAGTCGCTGCACCTCAACGACGCGCTGCGCGTGTTCCACCAGATGCGGC CCGTCTACGGTTGCGAACCGGACGCCCTCACGTACAGCTACCTGGTGCACGGGCTGAGCG AGCAGGGCCGGACGAGGAACGCCCGTGAGGTGTTCGATGAAATGCTGGCCAAGGGGCTGG CCCCTACGGAGCCGGCGTGCAACACGTTCGTCAGTGCGCTGGCCATGGCAGGGGAGGCTG GGGAGGCGGAGCGTGTGATGTGGGACATGGCTCGGGCGGGAAGGGTGGTCGACGACGTCA CGAGGAGGGCGGTGGTGGAGGAGCTGTGGAGATCGGGGAGGAGGGACGACGCCGAAAGGG TGGTGAGGGAGATGGAGGAGCGAGGCATCGTGGGTGGCGCTGAGCGGAGAGCCTTGCTAC GTTCGCTGCACGATGAGTTCGGTGACGACGATTTGGATGTTGATGATAGATGGCGGAACA CAAGGTGATTGTCTGACAGATGGAGAGTTGAGAAGCACTCATAATCCATCCGGCCATCCA TGTCCCAAAAACATGGCAATCAACATTGAACACTACTAAATGCCATGAGATGTAACAGAA AATTTTGTGATAAAGTATCAGTAAAATTCATTTGCAATGATATAAGGGTTAACTGCAAGA TTGATATTTAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)