cluster # 6241

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 6241 cluster # 6241 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6241#0 length = 1748 sequences # 4
consensusID : consensus_6241#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1748
fasta sequence
                              [CCTTTGAACACGGATTCTCGGACATGTGAAGATGTTATCACTGAGCTTGGGTACCCTTTTGAGGCTATAAAAGTTGTTACTTCAGATGGATATGCCCTACTGCTGGAGAGAATTCCAAGGCGTGATTCACAGAAGGTGGTATTGCTGCAACATGGAATACTGGACTCATCAATGGGTTGGGTATCGAATGGTGTTGTTGGCTCACCTGCATTTGCAGCATATGATCAAGGTTATGATGTTTTTCTTGGAAATCTGCGTGGTTTAGTCTCCAGGGAGCATGTTGATAAAAATATTTCTTCCTACAAGTACTGGAAATATTCTGTTAATGAACATGGAACCAAAGATATGCCAGCAATTGTTGAAGAAATTCACAAGATTAAAACTTCAGAACTTGGCAAAAGTAGACCTCACATAAGTGAGGAAACAGAAGATCAAAACGATAAGATAAAAAATTTGGAAGTGCAGGCTTCACAGGACGATGAAAGAGACAATCAACCATACAAGCTTTGTGCTGTCTGCCACAGCTTGGGTGGTGCGGTGATGTTAATGTATGTGGTGACATCAAGGATTGCGCAGAAGCCCCACAGGTTATCAAGATTGGTCTTGCTATCTCCTGCTGGCTTTCATGAGGATTCTAATGTGGTGTTCAGCATGGTAGAAAAGCTCATTTTGTTTGTTGGACCAGTACTAGCTCCATTTATACCTGGCCTTTACATACCAACACGTTTCTTCCGGATGCTACTGAACAAATTGGCCAGGGATTTCAACAACTATCCAGCTTTGGGCGGCCTTGTCCAAACTCTTATGGGCTATGTAGTTGGCGGTGACAGTTCAAATTGGGTGGGAGTGCTCGGCTTGCCACACTACAACATGGATGACATGCCTGGTGTATCATTCCATGTTGCACTTCACCTTGCACAAATAAAGAGGGCAAAAAGGTTCCAAATGTATGACTATGGAAGTCCAGTAGCAAATATGGAAGCATATGGAACACCAGAACCCTTGGACCTGGGAGCTCATTATGGTCTGATTGACATCCCAGTAGATTTAGTCGCTGGGCAAAGAGACAGAGTTATCTCACCATCCATGGTAAAGAAGCACTATAAGCTGATGCGCAAGGCTGGTGTAGAGGTTTCCTACAATGAATTCGAGTACGCCCACTTGGATTTCACATTCTCCCATAGGGAGGAGCTTTTGTCCTATGTTATGTCCCGCCTGCTCTTAGTGTCTGACCCAGGTAAAGGCCGCATCAAGCAGACTAGTGTCCGCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAAATTGAGAATGACTCTGACAGCAAGGAGCACAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC-GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA-TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACTGACAGGGAGAAGCTACCGGTGTTAAGGATGTAGATTTTTGCACTTAACGCGTGCTTTCGTGTGTTCGCGTTTTGTTTTTGCTCTTCCTGTGAAGAGGTGATCGAAATGCAGTTTCTTAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK064554             [CCTTTGAACACGGATTCTCGGACATGTGAAGATGTTATCACTGAGCTTGGGTACCCTTTTGAGGCTATAAAAGTTGTTACTTCAGATGGATATGCCCTACTGCTGGAGAGAATTCCAAGGCGTGATTCACAGAAGGTGGTATTGCTGCAACATGGAATACTGGACTCATCAATGGGTTGGGTATCGAATGGTGTTGTTGGCTCACCTGCATTTGCAGCATATGATCAAGGTTATGATGTTTTTCTTGGAAATCTGCGTGGTTTAGTCTCCAGGGAGCATGTTGATAAAAATATTTCTTCCTACAAGTACTGGAAATATTCTGTTAATGAACATGGAACCAAAGATATGCCAGCAATTGTTGAAGAAATTCACAAGATTAAAACTTCAGAACTTGGCAAAAGTAGACCTCACATAAGTGAGGAAACAGAAGATCAAAACGATAAGATAAAAAATTTGGAAGTGCAGGCTTCACAGGACGATGAAAGAGACAATCAACCATACAAGCTTTGTGCTGTCTGCCACAGCTTGGGTGGTGCGGTGATGTTAATGTATGTGGTGACATCAAGGATTGCGCAGAAGCCCCACAGGTTATCAAGATTGGTCTTGCTATCTCCTGCTGGCTTTCATGAGGATTCTAATGTGGTGTTCAGCATGGTAGAAAAGCTCATTTTGTTTGTTGGACCAGTACTAGCTCCATTTATACCTGGCCTTTACATACCAACACGTTTCTTCCGGATGCTACTGAACAAATTGGCCAGGGATTTCAACAACTATCCAGCTTTGGGCGGCCTTGTCCAAACTCTTATGGGCTATGTAGTTGGCGGTGACAGTTCAAATTGGGTGGGAGTGCTCGGCTTGCCACACTACAACATGGATGACATGCCTGGTGTATCATTCCATGTTGCACTTCACCTTGCACAAATAAAGAGGGCAAAAAGGTTCCAAATGTATGACTATGGAAGTCCAGTAGCAAATATGGAAGCATATGGAACACCAGAACCCTTGGACCTGGGAGCTCATTATGGTCTGATTGACATCCCAGTAGATTTAGTCGCTGGGCAAAGAGACAGAGTTATCTCACCATCCATGGTAAAGAAGCACTATAAGCTGATGCGCAAGGCTGGTGTAGAGGTTTCCTACAATGAATTCGAGTACGCCCACTTGGATTTCACATTCTCCCATAGGGAGGAGCTTTTGTCCTATGTTATGTCCCGCCTGCTCTTAGTGTCTGACCCAGGTAAAGGCCGCATCAAGCAGACTAGTGTCCGCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAAATTGAGAATGACTCTGACAGCAAGGAGCACAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAAC                                                                                                                               ]
[-] EMBL CB673674             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCATATGGAACACCAGAACCCTTGGACCTGGGAGCTCATTATGGTTTGATTGACATCCCAGTAGATTTAGTCGCTGGGCAAAGAGACAGAGTTATTTCCCCATCCATGGTAAAGAAGCCCTATAAGCTGATGCGCAAGGCTGGTGTAGAGGTTTCCTACAATGAATTTGAGTTCGCCCCCTTGGATTTCACATTTTCCCATAGGGGGGAGGTTTTGTCCTATGTTATGTCCCGCCTGCTTTTAGTGTTTGACCCAGGTAAAGGCCGCATCAAGCAGACTAGTGTCCCCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAAATTGAGAATGATTTTGACAGCAAGGAGCCCAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACCCGTGCTGCCTTTGGCATATCCCTTTTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTTTTTTTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGGTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACT                                                                                                                              ]
[+] EMBL OSA417533            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            AGTGTCCGCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAGATTGAGAATGACTCTGACAGCAAGGAGCACAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCTGC GTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACA TTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACTGACAGGGAGAAGCTACCGGTGTTAAGGATGTAGATTTTTGCACTTA                                                                                ]
[+] EMBL BI813567             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGAGAATGACTCTGACACCAAGGAGCAC ATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGA CCAAATGGGCATGTGCGTGCTGCTGTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACACTTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACGTGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCAGTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAACAGGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAACTGACAGGGAGAAGCTACCGGTGTTAAGGATGTAGATTTTTGCACTTAACGCGTGCTTTCGTGTGTTCGCGTTTTGTTTTTGCTCTTCCTGTGAAGAGGTGATCGAAATGCAGTTTCTTAAAAAAAAA]




>consensus_6241#0
CCTTTGAACACGGATTCTCGGACATGTGAAGATGTTATCACTGAGCTTGGGTACCCTTTT
GAGGCTATAAAAGTTGTTACTTCAGATGGATATGCCCTACTGCTGGAGAGAATTCCAAGG
CGTGATTCACAGAAGGTGGTATTGCTGCAACATGGAATACTGGACTCATCAATGGGTTGG
GTATCGAATGGTGTTGTTGGCTCACCTGCATTTGCAGCATATGATCAAGGTTATGATGTT
TTTCTTGGAAATCTGCGTGGTTTAGTCTCCAGGGAGCATGTTGATAAAAATATTTCTTCC
TACAAGTACTGGAAATATTCTGTTAATGAACATGGAACCAAAGATATGCCAGCAATTGTT
GAAGAAATTCACAAGATTAAAACTTCAGAACTTGGCAAAAGTAGACCTCACATAAGTGAG
GAAACAGAAGATCAAAACGATAAGATAAAAAATTTGGAAGTGCAGGCTTCACAGGACGAT
GAAAGAGACAATCAACCATACAAGCTTTGTGCTGTCTGCCACAGCTTGGGTGGTGCGGTG
ATGTTAATGTATGTGGTGACATCAAGGATTGCGCAGAAGCCCCACAGGTTATCAAGATTG
GTCTTGCTATCTCCTGCTGGCTTTCATGAGGATTCTAATGTGGTGTTCAGCATGGTAGAA
AAGCTCATTTTGTTTGTTGGACCAGTACTAGCTCCATTTATACCTGGCCTTTACATACCA
ACACGTTTCTTCCGGATGCTACTGAACAAATTGGCCAGGGATTTCAACAACTATCCAGCT
TTGGGCGGCCTTGTCCAAACTCTTATGGGCTATGTAGTTGGCGGTGACAGTTCAAATTGG
GTGGGAGTGCTCGGCTTGCCACACTACAACATGGATGACATGCCTGGTGTATCATTCCAT
GTTGCACTTCACCTTGCACAAATAAAGAGGGCAAAAAGGTTCCAAATGTATGACTATGGA
AGTCCAGTAGCAAATATGGAAGCATATGGAACACCAGAACCCTTGGACCTGGGAGCTCAT
TATGGTCTGATTGACATCCCAGTAGATTTAGTCGCTGGGCAAAGAGACAGAGTTATCTCA
CCATCCATGGTAAAGAAGCACTATAAGCTGATGCGCAAGGCTGGTGTAGAGGTTTCCTAC
AATGAATTCGAGTACGCCCACTTGGATTTCACATTCTCCCATAGGGAGGAGCTTTTGTCC
TATGTTATGTCCCGCCTGCTCTTAGTGTCTGACCCAGGTAAAGGCCGCATCAAGCAGACT
AGTGTCCGCCTTAGAAAGCTGAAGAAAGCTCAGTCAGAAATTGAGAATGACTCTGACAGC
AAGGAGCACAATGGCATAGATAATGTGGTTACAGATGAGCAAAATGGGCATGTGCATGCT
GCGTGATGTGATCATGTGGAATATGCTGAACATTTGTTGTTAGTTTGTGAATAGAACACG
TGCTGCCTCTGGCATATACCTTCTGCAACATGTAGAAGATGTGAGGATGGATAGAGCCCA
GTTCTTTCTAGCAGTAGTTGTGTTGATGGGGATTGTTTTTTATGTATCCCTGTAGGAGAA
CAAGACAAGTATATGTAATACATGAATAGTGGCTATAGTGTTGTTCATATATATCAAGAA
CTGACAGGGAGAAGCTACCGGTGTTAAGGATGTAGATTTTTGCACTTAACGCGTGCTTTC
GTGTGTTCGCGTTTTGTTTTTGCTCTTCCTGTGAAGAGGTGATCGAAATGCAGTTTCTTA
AAAAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case