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Oryza sativa
cluster # 634 cluster # 634       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_634#0 length = 532 sequences # 2  

consensusID : consensus_634#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 532
fasta sequence
                              [ATTCACCGGCGGCGGCACTGCGACGGCCAACGAGATCGGATTGTCTAGGGTTTGGATTTTGGGGGTTATGGCTCCGTCTGAGTGCCCGCCGTGGTAAGGCACAAATCCCATCCTTTATTTCCATTGTATTTTTTCTATGGTTTCTTAGTATTGCTAGGGCATGTACATGCATGGTATACGCATACGGCAAGTCTGTCCACAACATACATTGATCGGTACACGCATACGGCAAGAGTGCAGCACACGTGCATGCACTAGTCCACATGCTGATTCATCAAGGTCACAAGTTGGTGCATAATGTGAGGATCAGTAATTCATCTGTTTGGATTAATAATAAAGGTCACATGCTGCTTGGTCCCCATTGATCATCAAGGTCACAAGTTTTGGTCACAAAGACATCACTGATAATACCAGTATGCAAATGACTATTTTTATGTATGTGTACCGGTTTGACCATGCTGCGTATTAGTATTAAATTTTTCATTGATTAATTATTTGGTATGTTCACATTAAATTCATATATACTACTAAT]

[+] EMBL CF305809             [ATTCACCGGCGGCGGCACTGCGACGGCCAACGAGATCGGATTGTCTAGGGTTTGGATTTTGGGGGTTATGGCTCCGTCTGAGTGCCCGCCGTGGTAAGGCACAAATCCCATCCTTTATTTCCATTGTATTTTTTCTATGGTTTCTTAGTATTGCTAGGGCATGTACATGCATGGTATACGCATACGGCAAGTCTGTCCACAACATACATTGATCGGTACACGCATACGGCAAGAGTGCAGCACACGTGCATGCACTAGTCCACATGCTGATTCATCAAGGTCACAAGTTGGTGCATAATGTGAGGATCAGTAATTCATCTGTTTGGATTAATAATAAAGGTCACATGCTGCTTGGTCCCCATTGATCATCAAGGTCACAAGTTTTGGTCACAAAGACATCACTGATAATACCAGTATGCAAATGACTATTTTTATGTATGTGTACCGGTTTGACCATGCTGCGTATTAGTATTAAATTTTTCATTGATTAATTATTTGGTATGTTCACATTAAATTCATATATACTACTAAT]
[+] EMBL CF333251             [                                                       ATTTTGGGGGTTATGGCTCCGTCTGAGTGCCCGCCGTGGTAAGGCACAAATCCCATCCTTTATTTCCATTGTATTTTTTCTATGGCTTCCTAGTATTGCTAGGGCATGTACATGCATGGTATACGCATACGGCAAGTCTGTCCACAACATACATTGATCGGTACACGCATACGGCAAGAGTGCAGCACACGTGCATGCACTAGTCCACATGCTGATTCATCAAGGTCACAAGTTGGTGCATAATGTGAGGATCAGTAATTCATCTGTTTGGATTAATAATAAAGGTCACATGCTGCTTGGTCCCC                                                                                                                                                                            ]


>consensus_634#0 ATTCACCGGCGGCGGCACTGCGACGGCCAACGAGATCGGATTGTCTAGGGTTTGGATTTT GGGGGTTATGGCTCCGTCTGAGTGCCCGCCGTGGTAAGGCACAAATCCCATCCTTTATTT CCATTGTATTTTTTCTATGGTTTCTTAGTATTGCTAGGGCATGTACATGCATGGTATACG CATACGGCAAGTCTGTCCACAACATACATTGATCGGTACACGCATACGGCAAGAGTGCAG CACACGTGCATGCACTAGTCCACATGCTGATTCATCAAGGTCACAAGTTGGTGCATAATG TGAGGATCAGTAATTCATCTGTTTGGATTAATAATAAAGGTCACATGCTGCTTGGTCCCC ATTGATCATCAAGGTCACAAGTTTTGGTCACAAAGACATCACTGATAATACCAGTATGCA AATGACTATTTTTATGTATGTGTACCGGTTTGACCATGCTGCGTATTAGTATTAAATTTT TCATTGATTAATTATTTGGTATGTTCACATTAAATTCATATATACTACTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)