These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6480#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 698 fasta sequence [NATAGTCGGTAAGTGAAGGTNAAAGCCCCCCGAGAGTCCCTGGAAGAGGTCCCAANCCTTGAAATCTGNCATGGAACGAAGAAAAGTTCAATGGNCTGATACGTNTGGAAAAGAGCTTTTTGAGATAAGGGAATTTGAAGCTAGTGATGAAGGTTTGTCAGACGATGATATGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT-GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA-TT-GCGGCA-ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCA-TGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACA-TGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATTCCCCACTGTACCATATCAAGATCTTAACTGCTCAATTTCTTGTTTTCGCCTTTCTTTCCCTTCACTTTGGTGCTCTCAAGTTCCAATGTACTATTTCCGTACAAGTCTGTCCAGTTAGTGTTGTAAGGGATGTTGGATCTCTACTATATTGTTTTGCTTCT---CTCACATGTTAATTGATGGATTTGTTGAAAAAATTTGTTCAAGTTGTTATGTTAATGCCTTGATGGCTGAGTGATGCCCTTGTAAAGAAAAAAAAAA] [+] EMBL AU101194 [NATAGTCGGTAAGTGAAGGTNAAAGCCCCCCGAGAGTCCCTGGAAGAGGTCCCAANCCTTGAAATCTGNCATGGAACGAAGAAAAGTTCAATGGNCTGATACGTNTGGAAAAGAGCTTTTTGAGATAAGGGAATTTGAAGCTAGTGATGAAGGTTTGTCAGNCGATGATACGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA TT GCGGCA ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCA TGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACA TGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATTCCCCACTGTACCATATCAAGATCTTAACTGCTCAATTTCTTGTTTTCGCCTTTCTTTCCCTTCACTTTGGTGCTCTCAAGTTCCAATGTACTATTTCCGTACAAGTCTGTCCAGTTAGTGTTGTAAGGGATGTTGGATCTCTACTATATTGTTTTGCTTCT CTCACATGTTAATTGATGGATTTGTTGAAAAAA ] [+] EMBL CA998171 [ TGGCATGGAACGAAGAAAAGTTCAATGGACTGATACGTGTGGAAAAGAGCTTTTTGAGATAAGGGAATTTGAAGCTAGTGATGAAGGTTTGTCAGACGATGATATGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA TT GCGGCA ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCA TGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACA TGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATT ] [+] EMBL CA766538 [ TGATGAAGGTTTGTCAGACGATGATATGGAAAATGAGGGTTTCAGGAAATGTGAGT GTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACA TT GCGGCA ATGGAATCGATGCTTCTCGTGTAGCTGAAGTTTTGCTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTNATCGATCAGGGTAANATTNTTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCG TGGTT ] [+] EMBL BI796568 [ TGAGTGGTGTGATTCAGTAGGTTTAATGCCTGTACACTTGGCGGCACATGGAATCGATGCTTCTCGTGTA CTGAAGTTTT CTGGCTAGATATGCTTGCGCTGGTGATTTCTCATCGATCAGGGTAAGATACCTGTGGATTCAAGACAAGGAGTCACTGGTTGATCTTATGCCTTTTGCTGAATTATTTGCTGGTGACACTGGTGGTTGTGTTTAGCTAATCTGCACACGTTAGGGTTACAGTTTTGATTCCCCACTGTACCATATCAAGATCTTAACTGCTCAATTTCTTGTTTTCGCCTTTCTTTCCCTTCACTTTGGTGCTCTCAAGTTCC ATGTACTATTTCCGTACAAGTCTGTCCAGTTAGTGTTGTAAGGGATGTTGGATCTCTACTATATTGTTTTGCTTCTCTCCTCACATGTTAATTGATGGATTTGTTGACATTTTTTGTTCAAGTTGTTATGTTAATGCCTTGATGGCTGAGTGATGCCCTTGTAAAGAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||