These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6571#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1129 fasta sequence [CAGTAACCAAATCAAACCCTAGCTAGCTAGCTAGCTAAGCTAGCACGCACCCATGGCGTCGTCTTCCACCTCGAGCTCGCTCGCCGCGGCAGCGAT-GGTGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTGGGTGCCACCGCCACGTCCACCCAGGCGGCGCGCCTCCTCGACGAAGAACTCCCCACCGCCGCCATCCCGGCGATCCCCGGCGTCCCCGGAGTGCCGGCGGTCGGCCCC-GGGATCCCGGTGATCCCCGGCGTGCCCGGAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGGATCCCGTTCGTGCCGGTGATCCCCGGCGTGCCGGTG-ATCGTGCCGATCATCCCCGGCGTGCCGATGATCGCCGGCATGACAACCCTGCCAGTGCCGCCATTTGTGCCGCCGATTGATCCCGGCGCCGGCGCCGGATTCCCAGGCGTGCCGCCGGCGTCGTCGACCACCGTGCAGGAAGACCCACAGCCGCCGATGCCGTCCGTCGTTCCACCCGTGCCATAGGTGTTAATCAACTCCGGCGAGCCACCATGCCGTCGTTAAGTTATACCGTTGCTCACGCCGCCGCGATGTGTGTACTCCGGCGGCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAATCGTGTGTGTATGATGTGCACTGTGCAGTGCAGACCAGGTACGTACGTGTGGGTCGCGTCACCCAATCTCTGAGTGCTCGCAAAATTTAATGTGCTTAATGCACGAATTAATTATACGTCGAATATTATAGGTTTTAATTTAATCTTGTGTAACCCACTATTTTATCACTGTTTGAACTTTGAATCATACGTGTCTATTTTTGTTGGGATATTAGTCTTGCTAAGGTGCATAGGAATGAAAATCATATTAGTCATGTTTTAGTTAGTAAAGGCCGAGTTGAGGAACTACTCATTTCTGGCCGGACAATAGCTGTACTGCTATCGCACAACTTTGTTTGTGTCGATGCTTTGATTGAATAAAGTGGTCCC] [+] EMBL AK070713 [CAGTAACCAAATCAAACCCTAGCTAGCTAGCTAGCTAAGCTAGCACGCACCCATGGCGTCGTCTTCCACCTCGAGCTCGCTCGCCGCGGCAGCGAT GGTGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTGGGTGCCACCGCCACGTCCACCCAGGCGGCGCGCCTCCTCGACGAAGAACTCCCCACCGCCGCCATCCCGGCGATCCCCGGCGTCCCCGGAGTGCCGGCGGTCGGCCCC GGGATCCCGGTGATCCCCGGCGTGCCCGGAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGGATCCCGTTCGTGCCGGTGATCCCCGGCGTGCCGGTG ATCGTGCCGATCATCCCCGGCGTGCCGATGATCGCCGGCATGACAACCCTGCCAGTGCCGCCATTTGTGCCGCCGATTGATCCCGGCGCCGGCGCCGGATTCCCAGGCGTGCCGCCGGCGTCGTCGACCACCGTGCAGGAAGACCCACAGCCGCCGATGCCGTCCGTCGTTCCACCCGTGCCATAGGTGTTAATCAACTCCGGCGAGCCACCATGCCGTCGTTAAGTTATACCGTTGCTCACGCCGCCGCGATGTGTGTACTCCGGCGGCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAATCGTGTGTGTATGATGTGCACTGTGCAGTGCAGACCAGGTACGTACGTGTGGGTCGCGTCACCCAATCTCTGAGTGCTCGCAAAATTTAATGTGCTTAATGCACGAATTAATTATACGTCGAATATTATAGGTTTTAATTTAATCTTGTGTAACCCACTATTTTATCACTGTTTGAACTTTGAATCATACGTGTCTATTTTTGTTGGGATATTAGTCTTGCTAAGGTGCATAGGAATGAAAATCATATTAGTCATGTTTTAGTTAGTAAAGGCCGAGTTGAGGAACTACTCATTTCTGGCCGGACAATAGCTGTACTGCTATCGCACAACTTTGTTTGTGTCGATGCTTTGATTGAATAAAGTGGTCCC] [+] EMBL C93674 [ TAGCTAGCTAGCTAGCTAAGCTAGCACGCACCCATGGCGTCGTCTTCCACCTCGAGCTCGCTCGCNGCGGCAG AATNGGTGGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTGGGTGCNACCGCNACGTCCACCCAGGCGGCGCGCCTCCTCGACGAAGAACTCCCCACCGCCGCCATCCCGGCNATCCCCGGCGTCCCCGGAGTGCCGGCGGTCGGCCCC GGAATCCCGGTNATCCCCGGCGTGCCCGGAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGAATCCCGTTCGTNCCGGTAATCCNCGGCGTGCCGGTGAATCGTGCCGA ] [+] EMBL AU091308 [ GGCCCCGGGGATCCCGGTGATCCCCGGCGTGCCCGAAGTGCCGGTGGTTGGCCCCGGGATCCCGTTCGTGCCGGTGATCCCCGGCGTGCCGGTG ATCGTGCCGATCATCCCCGGCGTGCCGATGATCGCCGGCATGACAACCCTGCCAGTGCCGCCATTTGTGCCGCCGATTGATCCCGGCGCCGGCGCCGGATTCCCCGGCGTGCCGCCGGCGTCGTCGACCACCGTGCAGGAAGACCCACAGCCGCCGATGCCGTCCGTCGTTCCACCCGTGCCATAGGTGTTAATCAACTCCGGCGAGCCACCATGCCGTCGTTAAGTTATACCGTTGCTCACGCCGCCGCGATGTGTGTACTCCGGCGGCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAATCGTGTGTGTATGATGTGCACTGTGCAGTGCAGACCAGGTACGTACGTGTGGGTCGCGTCACCCAATCTCTGAGTGCTCGCAAAATTTAATGTGCTTAATGCACGAATTAATTATACGTCGAATATTATAGGTTTTAATTTAAaaa ] [-] EMBL AU225753 [ ccgctCTTAATATAACGTGCCTCCTTACTGTGTGTTAATTAAGTACTCCTCCTGTCTAAAAAAAATTAACTTCTCTATGAATTTATAGACGTAGTTAGAAGTTGATTTTTTCTTGGATGGTAAGAGTACATGTGTTACCGTGTGTTGTTACGTTAAGTTGGTAATTTGTGTACTGATGAgcggc ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||