These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6651#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 3213 fasta sequence [TCCTCGAGCAGAGCAGAGCAGCGGCGTCGCCGGCGTTGCTGCTCCCGCGCCGCCGCATCCTCGCTCGCCGGTGACGATCCGGAAGATTCTCTCTCTGTGCCTTGAATAAACCCTCTTAAACCCCCCATGTCACGCGAGCCTGCGGCAGCGGCGGAGGCGGAGGACGTCGTGGCCCGTCTCGGCACCGACGAGGCGACTGGGCTGACGGAGGAGGAGGCGGCGCGCCGCCTCAAGCTGTACGGGCCTAACCTCGTGGTCGCCCATCACCCCCAGGTGGGTGGCAAGCTTCTTGCTACACTAAAGTGCATCGTCCTGCTCTGGGGATGGGATCACTCCTTCACCGAGTACATTAAATACGAGATTGGATGGGAGTCATGGGAGCATCTTATCTTCCCCTGCTCCAGGGAGATGTTATGTGTCATGTTCATCAATTTCTCGTCATGGGCGGCATTGGCGGCTGCACTTGTGTCCCTTGCCCTTAACTCAGCTGGTCAGACAACCTATGAACTGATCGTTATCGTCTCCTTACTTGTGGGAAGCCTGTGTGCATGCTGTGTTGCCAAGCTCCTTGCCAATCGTGCTAAGGCACCGCTGGAAGCTAAAGCTTTTGCGCGAAGGACCAAGGTTCTGAGGGATGGAATATGGAAACATGAGGATGCGACCAATCTTGTCCCTGGGGATATCATATATCTCAAGTGTGGTGATATTGTGCCAGCCAATGCTTTTGTCCTCAACATGGCACAGATCGACACCAAAACCATCCGTCATGAAAGGAGTGTTAACTATGTGATGGGCTCCCTTATATACTATGGCTGGGCTGTCTCCTGTGGCGAAGGGACTGCTGTTGTTACTGTGACAGGCAATAACATCCCCATGAGCACTCTGAAACAGCTTTATCCAAAACGATTCTCTCGGCCTGGGCAGCTTAGGAAGGGTGTCATGGCTGCTGCCACTTTTTGCTTCTGCTTAGTACTTGTTGGCATCACAAGTGAGGCTCTTGTTAAATTCTTTTTCCATCAAAGCATAGGCACGCTGCACAGTGGCCACTTTATGCCACTTATTGGTCTAATACCAATGTCGATTCCTGCTGTGCTCTACCTGGCATTGGCATTGGACTCTCAGAGGCTTTCCAAATTGGGGGTTGCCAGCCGGGGAACTTTTGCTCTTGAAGACTTGGCTAGCATGGATGCTATGCTCTTCAACATGACTGGCACTTTGACATGCAACAAGCCCTATTTTGACAAGGACAAGATTGAAGTGCTTACAGAAGGTATTGATAAAGATCATGCTGTCCTGTTGGCTGCGCGGGCTTCCAAAGCACACAATGAACTGTATAAAGAACCGATTGATGCAGCCATTCTAGGCCTTATGGATGATCCAGAACAGGCACGAGTTGGCATTAATGTTATAGAGCACCGCTCCCGTATGTTTGTTGCAATGACATTGATGTACATGACTACTTACATCGATGAAAATGGCTCCAAGTGTTCTGTGCTCAAAGGTGACCCTGCATTGATGCTTCGTGACTGCAGTTGTAGCGAAGAAGTCAGAGAGCATATACGCAAACGTATTGATAAGCTCGGTCTTGATGGATATCAATGTATTGCTGTTGGACGTATTGTTAACTCTCGGTTGGACATCATTATTCTTCTACCTTTCATAGATGATCTCAGAAGCGATAGTGCAGAAGCTGTTGATAATCTTACTGATATGGGTCTGAGTGTAATAGTACTTACAGAAAGCCCAATGACAATTACAAAGCACGTATGTGGAAGACTTGGAAAACTGGGCTTAAATGTGTTACATGCTGACTCTATGCGGGAGTTGGTAAGCAGCAAAAATGAGCTTTTCTTGAATATCAATGGGATTTCTGATCTCTTTGTAGAATATAACCGTTATGTTATATCAAATCTGAGAACTTATTTTGGTCGTCGTAGTGCAATGGTTGGATATGAATTTTCGGATGTTGATTCTATCCGTGAAAGCGATATTGGAATCGCAGTTGCCGATGCCACTGATAGCACCAAAAGTGAATCTGATATTGTTTTGACTGAGCATGCCTTGCTGTCTGTTTCTTCTGCTGTTCAAGCCAGTAGGGAAATTTGTCAGATCATGAAAGGATGCATGGTTTATGCTGTTTCATCAACTGTCCATGCTTTTGCTGTCCGTCTTATTTTACTCCTATGGAGACTCGAGCTACCCTGTTTCCCGATGCTGGTGATTGCTGCTTGCAACTACTGCACATCAACTGCAATGTTATTTGAAAGGGTGAAACCATCCCAGTCACCAGATAGTTTGAAAGCAAACAAGATTATCGCAACTGGTGCTGCTTTTGGAAGCTATATTGCCCTGAGTACAGTCGTTTTTTTCATAATGACTACTAGGACTGACTTCATATCTCACATAATCAAAGCTAGATTGCTTGTTGGCCATGATGAGGAGATTAAATCTGCCTTATTCCTTCAAATGAGCATTGTTAACCATGCTATTGGACTTTTCGCACATTCACGCGATGGCCACTGCTCTGGGCCTATTGTTACAATTTCTTCTGTTCTATCTCAACTGGTGGCAACCGTCATTGCTGTTTATGGTGACGTGAACTCTCCTCTACCAAAGGGCATTGGCTGGGGCTGGGCAGGATTTATCTGGCTCTACAACTTTGTCTTGCTTTTGAGCCTCATGTTGATCTGTGACCTGTGTAACCTTGCAAAGTTCAACATATTTGGGATAACCTGCAGGAGGCTGTTCACTGGTTGGACCGAGTGGATGGAGAGGTGCAGGAGGCTGCTCAACAGGGGTAAAACGTGGATGGAGATGTTGACCTTAACTGCTATCTCAGGCTTGATTCTTGTCTGGTCGATATATGCATATCATGTCATGAAGGTCCCGCAGCAGTAGGGTGGCACTTGACAGGTAGCCTTGACATTAACATATAGCTTTAGGTCGCAAATTAGTGACTAAGCAATGTAGCAATGTATATTATTAACCCGTGTAAAGTAAATGTCATCGACATGGTTTTGTTTCTGTCTTTTTCTTTTTTCTTTTCTTGGGTCCGGGCTTCTACTGCCGTATAATTTTGATAAGAGGGAAGTATATGGGTGGTCAACTTGTGCGGATGTGTCATTCGAATCTGAACTCTCAAAATATATTTTGGGTATCAAACTTGTTTTGGGTGTCATGTAGGCCCAAACGAGCTCTGACCTGTTTTATGCA] [+] EMBL AK068468 [TCCTCGAGCAGAGCAGAGCAGCGGCGTCGCCGGCGTTGCTGCTCCCGCGCCGCCGCATCCTCGCTCGCCGGTGACGATCCGGAAGATTCTCTCTCTGTGCCTTGAATAAACCCTCTTAAACCCCCCATGTCACGCGAGCCTGCGGCAGCGGCGGAGGCGGAGGACGTCGTGGCCCGTCTCGGCACCGACGAGGCGACTGGGCTGACGGAGGAGGAGGCGGCGCGCCGCCTCAAGCTGTACGGGCCTAACCTCGTGGTCGCCCATCACCCCCAGGTGGGTGGCAAGCTTCTTGCTACACTAAAGTGCATCGTCCTGCTCTGGGGATGGGATCACTCCTTCACCGAGTACATTAAATACGAGATTGGATGGGAGTCATGGGAGCATCTTATCTTCCCCTGCTCCAGGGAGATGTTATGTGTCATGTTCATCAATTTCTCGTCATGGGCGGCATTGGCGGCTGCACTTGTGTCCCTTGCCCTTAACTCAGCTGGTCAGACAACCTATGAACTGATCGTTATCGTCTCCTTACTTGTGGGAAGCCTGTGTGCATGCTGTGTTGCCAAGCTCCTTGCCAATCGTGCTAAGGCACCGCTGGAAGCTAAAGCTTTTGCGCGAAGGACCAAGGTTCTGAGGGATGGAATATGGAAACATGAGGATGCGACCAATCTTGTCCCTGGGGATATCATATATCTCAAGTGTGGTGATATTGTGCCAGCCAATGCTTTTGTCCTCAACATGGCACAGATCGACACCAAAACCATCCGTCATGAAAGGAGTGTTAACTATGTGATGGGCTCCCTTATATACTATGGCTGGGCTGTCTCCTGTGGCGAAGGGACTGCTGTTGTTACTGTGACAGGCAATAACATCCCCATGAGCACTCTGAAACAGCTTTATCCAAAACGATTCTCTCGGCCTGGGCAGCTTAGGAAGGGTGTCATGGCTGCTGCCACTTTTTGCTTCTGCTTAGTACTTGTTGGCATCACAAGTGAGGCTCTTGTTAAATTCTTTTTCCATCAAAGCATAGGCACGCTGCACAGTGGCCACTTTATGCCACTTATTGGTCTAATACCAATGTCGATTCCTGCTGTGCTCTACCTGGCATTGGCATTGGACTCTCAGAGGCTTTCCAAATTGGGGGTTGCCAGCCGGGGAACTTTTGCTCTTGAAGACTTGGCTAGCATGGATGCTATGCTCTTCAACATGACTGGCACTTTGACATGCAACAAGCCCTATTTTGACAAGGACAAGATTGAAGTGCTTACAGAAGGTATTGATAAAGATCATGCTGTCCTGTTGGCTGCGCGGGCTTCCAAAGCACACAATGAACTGTATAAAGAACCGATTGATGCAGCCATTCTAGGCCTTATGGATGATCCAGAACAGGCACGAGTTGGCATTAATGTTATAGAGCACCGCTCCCGTATGTTTGTTGCAATGACATTGATGTACATGACTACTTACATCGATGAAAATGGCTCCAAGTGTTCTGTGCTCAAAGGTGACCCTGCATTGATGCTTCGTGACTGCAGTTGTAGCGAAGAAGTCAGAGAGCATATACGCAAACGTATTGATAAGCTCGGTCTTGATGGATATCAATGTATTGCTGTTGGACGTATTGTTAACTCTCGGTTGGACATCATTATTCTTCTACCTTTCATAGATGATCTCAGAAGCGATAGTGCAGAAGCTGTTGATAATCTTACTGATATGGGTCTGAGTGTAATAGTACTTACAGAAAGCCCAATGACAATTACAAAGCACGTATGTGGAAGACTTGGAAAACTGGGCTTAAATGTGTTACATGCTGACTCTATGCGGGAGTTGGTAAGCAGCAAAAATGAGCTTTTCTTGAATATCAATGGGATTTCTGATCTCTTTGTAGAATATAACCGTTATGTTATATCAAATCTGAGAACTTATTTTGGTCGTCGTAGTGCAATGGTTGGATATGAATTTTCGGATGTTGATTCTATCCGTGAAAGCGATATTGGAATCGCAGTTGCCGATGCCACTGATAGCACCAAAAGTGAATCTGATATTGTTTTGACTGAGCATGCCTTGCTGTCTGTTTCTTCTGCTGTTCAAGCCAGTAGGGAAATTTGTCAGATCATGAAAGGATGCATGGTTTATGCTGTTTCATCAACTGTCCATGCTTTTGCTGTCCGTCTTATTTTACTCCTATGGAGACTCGAGCTACCCTGTTTCCCGATGCTGGTGATTGCTGCTTGCAACTACTGCACATCAACTGCAATGTTATTTGAAAGGGTGAAACCATCCCAGTCACCAGATAGTTTGAAAGCAAACAAGATTATCGCAACTGGTGCTGCTTTTGGAAGCTATATTGCCCTGAGTACAGTCGTTTTTTTCATAATGACTACTAGGACTGACTTCATATCTCACATAATCAAAGCTAGATTGCTTGTTGGCCATGATGAGGAGATTAAATCTGCCTTATTCCTTCAAATGAGCATTGTTAACCATGCTATTGGACTTTTCGCACATTCACGCGATGGCCACTGCTCTGGGCCTATTGTTACAATTTCTTCTGTTCTATCTCAACTGGTGGCAACCGTCATTGCTGTTTATGGTGACGTGAACTCTCCTCTACCAAAGGGCATTGGCTGGGGCTGGGCAGGATTTATCTGGCTCTACAACTTTGTCTTGCTTTTGAGCCTCATGTTGATCTGTGACCTGTGTAACCTTGCAAAGTTCAACATATTTGGGATAACCTGCAGGAGGCTGTTCACTGGTTGGACCGAGTGGATGGAGAGGTGCAGGAGGCTGCTCAACAGGGGTAAAACGTGGATGGAGATGTTGACCTTAACTGCTATCTCAGGCTTGATTCTTGTCTGGTCGATATATGCATATCATGTCATGAAGGTCCCGCAGCAGTAGGGTGGCACTTGACAGGTAGCCTTGACATTAACATATAGCTTTAGGTCGCAAATTAGTGACTAAGCAATGTAGCAATGTATATTATTAACCCGTGTAAAGTAAATGTCATCGACATGGTTTTGTTTCTGTCTTTTTCTTTTTTCTTTTCTTGGGTCCGGGCTTCTACTGCCGTATAATTTTGATAAGAGGGAAGTATATGGGTGGTCAACTTGTGCGGATGTGTCATTCGAATCTGAACTCTCAAAATATATTTTGGGTATCAAACTTGTTTTGGGTGTCATGTAGGCCCAAACGAGCTCTGACCTGTTTTATGCA] [+] EMBL CB669951 [ GCTCTTGAAGACTTGGCTAGCATGGATGCTATGCTCTTCAACATGACTGGCACTTTGACATGCAACAAGCCCTATTTTGACAAGGACAAGATTGAAGTGCTTACAGAAGGTATTGATAAAGATCATGCTGTCCTGTTGGCTGCGCGGGCTTCCAAAGCACACAATGAACTGTATAAAGAACCGATTGATGCAGCCATTCTAGGCCTTATGGATGATCCAGAACAGGCACGAGTTGGCATTAATGTTATAGAGCACCGCTCCCGTATGTTTGTTGCAATGACATTGATGTACATGACTACTTACATCGATGAAAATGGCTCCAAGTGTTCTGTGCTCAAAGGTGACCCTGCATTGATGCTTCGTGACTGCAGTTGTAGCGAAGAAGTCAGAGAGCATATACGCAAACGTATTGATAAGCTCGGTCTTGATGGATATCAATGTATTGCTGTTGGACGTATTGTTAACTCTCGGTTGGACATCATTATTCTTCTACCTTTCATAGATGATCTCAGAAGCGATAGTGCAGAAGCTGTTGATAATCTTACTGATATGGGTCTGAGTGTAATAGTACTTACAGAAAGCCCAATGACAATTACAAAGCACGTATGTGGAAGACTTGGAAAACTGGGCTTAAATGTGTTACATGCTGACTCTATGCGGGAGTTGGTAAGCAGCAAAAATGAGCTTTTCTTGAATATCAATGGGATTTCTGATCTCTTTGTAGAATATAACCGTTATGTTATATCAAATCTGAGAACTTA ] [-] EMBL CA882874 [ TTACATCGATGAAAATGGCTCCAAGTGTTCTGTGCTCAAAGGTGACCCTGCATTGATGCTTCGTGACTGCAGTTGTAGCGAAGAAGTCAGAGAGCATATACGCAAACGTATTGATAAGCTCGGTCTTGATGGATATCAATGTATTGCTGTTGGACGTATTGTTAACTCTCGGTTGGACATCATTATTCTTCTACCTTTCATAGATGATCTCAGAAGCGATAGTGCAGAAGCTGTTGATAATCTTACTGATATGGGTCTGAG ] [-] EMBL CB669950 [ ATTGCTTGTTGGCCATGATGAGGAGATTAAATCTGCCTTATTCCTTCAAATGAGCATTGTTAACCATGCTATTGGACTTTTCGCACATTCACGCGATGGCCACTGCTCTGGGCCTATTGTTACAATTTCTTCTGTTCTATCTCAACTGGTGGCAACCGTCATTGCTGTTTATGGTGACGTGAACTCTCCTCTACCAAAGGGCATTGGCTGGGGCTGGGCAGGATTTATCTGGCTCTACAACTTTGTCTTGCTTTTGAGCCTCATGTTGATCTGTGACCTGTGTACCCTTGCAAAGTTCAACATATTTGGGATAACCTGCAGGAGGCTGTTCACTGGTTGGACCGAGTGGATGGAGAGGTGCAGGAGGCTGCTCAACAGGGGTAAAACGTGGATGGAGATGTTGCCCTTAACTGCTATCTCAGGCTTGATTCTTGTCTGGTCGATATATGCATATCATGTCATGAAGGTCCCGCAGCAGTAGGGTGGCACTTGACAGGTACCCTTGACATTAACATATAGCTTTAGGTCGCAAATTAGTGACTAAGCAATGTAGCAATGTATATTATTAACCCGTGTAAAGTAAATGTCATCGACATGGTTTTGTTTCTGTCTTTTTCTTTTTTCTTTTCTTGGGTCCGGGCTTCTACTGCCGTATAATTTTGATAAGAGGGAAGTATATGGGTGGTCAACTTGTGCGGATGTGTCATTCGAATCTGAAATCTCAAAATATATT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||