cluster # 6691

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 6691 cluster # 6691 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6691#0 length = 1706 sequences # 4
consensusID : consensus_6691#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1706
fasta sequence
                              [CTCGCGGCGGAGGAGGAAGAAGGAAGAAGAAGGCGAGGCGATGCCGCGGGAGGGGACGCGGATGGCGGGGCTGTGGGAGCGCGAGGTCGGCTGCCTCCCGCCCAAGCTCTTCGCCAACTCCGTCATGGCCTCCCAGGACTTTGTGCGGTCTCTCGGTGTCCAGAAGAGGCTGCGGAAGCACAGGGGCTGTGTGAATACCATCAGCTTTAACGAGGATGGGAGCTTGCTCCTGTCCGGTTCGGACGATCGGGCCGCTGTACTGTGGAATTGGCAAGAGGGGACGCCTACCTTCGCGTTCCACACTGGCCACAGCGACAATGTGTTCCATGCTCTGTTCATGCCCTTCTCAGGTGACCGGAGCATCATCACATGCGCTGCTGATGGACAGGTGAGGCATTCGCAAATACAAGAAGGTGGTCGTGTAATTACAAATGAGCTAGTTGATACAGAGGTAGCAGTGCACAAACTAGCTATTGAGCCTGGAAATCCTCACACATTCTTTAGCTGCGGAGATAATGGCTCCGTTTTTCTTTTTGACCTAAGGGAGAAATATGTTGCTGAACTCTTTAAATGCGCAGAAGTTGATCATTTTGGTGGTGATACCATTGAACTCTATGCTATTGCCATAGACCCGAGAAAGCCTAGTTGTTTTGCAGTTGCTGGATCTGATGAGTATGTGAGAATATATGATAGCCGCAAGATTGATGTGAATGGGAATTCTAGTTTTGGTCGGCCAATTGAATACTTTTGCCCTCCACATATGATGGGCGAAAACAAAGATGGAATATCTGGTTTGGCATTCTCGCAGACCAGCGAACTATTGGCATCCTATAGTTATGATAACATCTACCTTTTCTCGAGAGAACATGGCTTACACTTCAACAATATTGAGGTAGGAAAACGACTCCTGATGGATGAGATTGAAGGAGACTGCCATATAAATACAGCTCCATTACCCTTTTGTAGAGATAAGTTGCCTACACCTCAAATATTCAAGGGACATCGTAACAAGCACACCATGAAGGGTGTTAATTTCCTTGGGCCCAACTGTGACTATGTTACCACTGGATCAGACTGTGGCCGTGTATTTATTTGGAGGAAGAAGGATGGGGAGCTTATGCGGGTTATGAAAGGGGATAAACAGATTGTGAACTGTGTTGAGCAGCACCCTTATGGGATTGTTATTGCAAACTGTGGCATTGATAAAGATATCAAGATTTGGGCTCCTGGTGGAAGTGAGAACCCTGACGAGGTTGAGAC-AGATTCTTGTTGCTCTGATATCA-GTGAGTCCTATGACTCGGTTTACTTTGATGATTACATATTTTCCTCGGATTTTGATTCATCTGAAGAGGACGACGAAGACGACGACGACGATGATGATGATGATGACGATGACGAAGAAGATGGCCTTAGTGTTAGTATCAACGAAGACATGAGCTATGAAGAGAAAGATGCAGCCAGCGACCATGACAGCGATGTTTAAAGGTTGCATTCAGCTATTATGAGACCGTAGGATGGTTCAGTCTTAGAACATGGTCAGTTAGGGGATCATCGACAGTTTTGTATGATGTATGCCTTAGGTTGTTTTATCATGTGTTCCTTTCTCAGTCCTCGGCCGTATTGCTTGTACATACATATACATATGCCTGAGATAGCTAAGCAAAAGCATACTTACATGTGGACAAATTTGAGTGGATGGAGAATTT]

[+] EMBL AK068831             [CTCGCGGCGGAGGAGGAAGAAGGAAGAAGAAGGCGAGGCGATGCCGCGGGAGGGGACGCGGATGGCGGGGCTGTGGGAGCGCGAGGTCGGCTGCCTCCCGCCCAAGCTCTTCGCCAACTCCGTCATGGCCTCCCAGGACTTTGTGCGGTCTCTCGGTGTCCAGAAGAGGCTGCGGAAGCACAGGGGCTGTGTGAATACCATCAGCTTTAACGAGGATGGGAGCTTGCTCCTGTCCGGTTCGGACGATCGGGCCGCTGTACTGTGGAATTGGCAAGAGGGGACGCCTACCTTCGCGTTCCACACTGGCCACAGCGACAATGTGTTCCATGCTCTGTTCATGCCCTTCTCAGGTGACCGGAGCATCATCACATGCGCTGCTGATGGACAGGTGAGGCATTCGCAAATACAAGAAGGTGGTCGTGTAATTACAAATGAGCTAGTTGATACAGAGGTAGCAGTGCACAAACTAGCTATTGAGCCTGGAAATCCTCACACATTCTTTAGCTGCGGAGATAATGGCTCCGTTTTTCTTTTTGACCTAAGGGAGAAATATGTTGCTGAACTCTTTAAATGCGCAGAAGTTGATCATTTTGGTGGTGATACCATTGAACTCTATGCTATTGCCATAGACCCGAGAAAGCCTAGTTGTTTTGCAGTTGCTGGATCTGATGAGTATGTGAGAATATATGATAGCCGCAAGATTGATGTGAATGGGAATTCTAGTTTTGGTCGGCCAATTGAATACTTTTGCCCTCCACATATGATGGGCGAAAACAAAGATGGAATATCTGGTTTGGCATTCTCGCAGACCAGCGAACTATTGGCATCCTATAGTTATGATAACATCTACCTTTTCTCGAGAGAACATGGCTTACACTTCAACAATATTGAGGTAGGAAAACGACTCCTGATGGATGAGATTGAAGGAGACTGCCATATAAATACAGCTCCATTACCCTTTTGTAGAGATAAGTTGCCTACACCTCAAATATTCAAGGGACATCGTAACAAGCACACCATGAAGGGTGTTAATTTCCTTGGGCCCAACTGTGACTATGTTACCACTGGATCAGACTGTGGCCGTGTATTTATTTGGAGGAAGAAGGATGGGGAGCTTATGCGGGTTATGAAAGGGGATAAACAGATTGTGAACTGTGTTGAGCAGCACCCTTATGGGATTGTTATTGCAAACTGTGGCATTGATAAAGATATCAAGATTTGGGCTCCTGGTGGAAGTGAGAACCCTGACGAGGTTGAGAC AGATTCTTGTTGCTCTGATATCA GTGAGTCCTATGACTCGGTTTACTTTGATGATTACATATTTTCCTCGGATTTTGATTCATCTGAAGAGGACGACGAAGACGACGACGACGATGATGATGATGATGACGATGACGAAGAAGATGGCCTTAGTGTTAGTATCAACGAAGACATGAGCTATGAAGAGAAAGATGCAGCCAGCGACCATGACAGCGATGTTTAAAGGTTGCATTCAGCTATTATGAGACCGTAGGATGGTTCAGTCTTAGAACATGGTCAGTTAGGGGATCATCGACAGTTTTGTATGATGTATGCCTTAGGTTGTTTTATCATGTGTTCCTTTCTCAGTCCTCGGCCGTATTGCTTGTACATACATATACATATGCCTGAGATAGCTAAGCAAAAGCATACTTACATGTGGACAAATTTGAGTGGATGGAGAATTT]
[+] EMBL CB680239             [  CGCGGCCGTGGAGGAAGAAGGAAGAAGAAGGCGAGGCGATGCCGCGGGAGGGGACGCGGATGGCGGGGCTGTGGGAGCGCGAGGTCGGCTGCCTCCCGCCCAAGCTCTTCGCCAACTCCGTCATGGCCTCCCAGGACTTTGTGCGGTCTCTCGGTGTCCAGAAGAGGCTGCGGAAGCACAGGGGCTGTGTGAATACCATCAGCTTTAACGAGGATGGGAGCTTGCTCCTGTCCGGTTCGGACGATCGGGCCGCTGTACTGTGGAATTGGCAAGAGGGGACGCCTACCTTCGCGTTCCACACTGGCCACAGCGACAATGTGTTCCATGCTCTGTTCATGCCCTTCTCAGGTGACCGGAGCATCATCACATGCGCTGCTGATGGACAGGTGAGGCATTCGCAAATACAAGAAGGTGGTCGTGTAATTACAAATGAGCTAGTTGATACAGAGGTAGCAGTGCACAAACTAGCTATTGAGCCTGGAAATCCTCACACATTCTTTAGCTGCGGAGATAATGGCTCCGTTTTTCTTTTTGACCTAAGGGAGAAATATGTTGCTGAACTCTTTAAATGCGCAGAAGTTGATCATTTTGGTGGTGATACCATTGAACTCTATGCTATTGCCATAGACCCGAGAAAGCCTAGTTGTTTTGCAGTTGCTGGATCTGATGAGTATGTGAGAATATATGATAGCCGCAAGATTGATGTGAATGGGAATTCTAGTTTTGGTCGGCCAATTGAATACTTTTGCCCTCCACATATGATGGGCG AAACAAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CB678906             [  CGCGGCGGAGGAGGAATAAGGAAGAAGAAGGCGAGGCGATGCCGCGGGAGGGGACGCGGATGGCGGGGCTGTGGGAGCGCGAGGTCGGCTGCCTCCCGCCCAAGCTCTTCACCAACTCCGTCATGGCCTCCCAGGACTTTGTGCGGTCTCTCGGTGTCCACAAGAGGCTGCGGAAGCACAGGGGCTGTGTGAATACCATCAGCTTTAACGAGGATGGGAGCTTGCTCCTGTCCGGTTCGGACGATCGGGCCGCTGTACTGTGGAATTGGCAAGAGGGGACGCCTACCTTCGCGTTCCACACTGGCCACAGCGACAATGTGTTCCATGCTCTGTTCATGCCCTTCTCAGGTGACCGGAGCATCATCACATGCGCTGCTGATGGACAGGTGAGGCATTCGCACATACAAGAAGGTGGTCGTGTAATTACAAATGAGCTACTTGATACAGAGGTAGCAGTGCACAAACTAACTATTGAGCCTGGAAATCCTCACACCTTCTTTAGCTGCGGAGATAATGGCTCCGTTTTTCTTTTTGACCTAAGGGAGAAATATGTTGCTGAACTCTTTAAATGCGCAGAAGTTGATCATTTTGGTGGTGATACCATTGAACTCTATGCTATTGCCATAGACCCGATAAAGCCTATTTGTTTTGCAGTTGCTGGATCTGATGAGTATGTGAGAATATATGATCGCCGCAAGATTGATGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BM418925             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCTGGTGGAAGTGAGAACCCTGACGA GTTGAGACAAGATTCTTGTTGCTCTGATATCACGTGAGTCCTATGACTCGGTTTACTTTGATGATTACATATTTTCCTCGGATTTTGATTCATCTGAAGAGGACGACGAAGACGACGACGACGATGATGATGATGATGACGATGACGAAGAAGAT GCCTTAGTGTTAGTATCAACCAAGACATGAGCTATGAAGAGAAAGATGCAGCCAGCGACCATGACAGCGATGTTTAAAGGTTGCATTCAGCTATTATGAGACCGTAGGATGGTTCAGTCTTAGAACATGGTCAGTTAGGGGATCATCGACAGTTTTGTATGATGTAT CCTTA GTTGTTTTATCATGTGTTCCTTTCTCAGTCCTC GCCGTATTGCTTGTACATACATATACATATGCCTGAGATAGCTAA C AAAGCATACTTACAaaa                           ]




>consensus_6691#0
CTCGCGGCGGAGGAGGAAGAAGGAAGAAGAAGGCGAGGCGATGCCGCGGGAGGGGACGCG
GATGGCGGGGCTGTGGGAGCGCGAGGTCGGCTGCCTCCCGCCCAAGCTCTTCGCCAACTC
CGTCATGGCCTCCCAGGACTTTGTGCGGTCTCTCGGTGTCCAGAAGAGGCTGCGGAAGCA
CAGGGGCTGTGTGAATACCATCAGCTTTAACGAGGATGGGAGCTTGCTCCTGTCCGGTTC
GGACGATCGGGCCGCTGTACTGTGGAATTGGCAAGAGGGGACGCCTACCTTCGCGTTCCA
CACTGGCCACAGCGACAATGTGTTCCATGCTCTGTTCATGCCCTTCTCAGGTGACCGGAG
CATCATCACATGCGCTGCTGATGGACAGGTGAGGCATTCGCAAATACAAGAAGGTGGTCG
TGTAATTACAAATGAGCTAGTTGATACAGAGGTAGCAGTGCACAAACTAGCTATTGAGCC
TGGAAATCCTCACACATTCTTTAGCTGCGGAGATAATGGCTCCGTTTTTCTTTTTGACCT
AAGGGAGAAATATGTTGCTGAACTCTTTAAATGCGCAGAAGTTGATCATTTTGGTGGTGA
TACCATTGAACTCTATGCTATTGCCATAGACCCGAGAAAGCCTAGTTGTTTTGCAGTTGC
TGGATCTGATGAGTATGTGAGAATATATGATAGCCGCAAGATTGATGTGAATGGGAATTC
TAGTTTTGGTCGGCCAATTGAATACTTTTGCCCTCCACATATGATGGGCGAAAACAAAGA
TGGAATATCTGGTTTGGCATTCTCGCAGACCAGCGAACTATTGGCATCCTATAGTTATGA
TAACATCTACCTTTTCTCGAGAGAACATGGCTTACACTTCAACAATATTGAGGTAGGAAA
ACGACTCCTGATGGATGAGATTGAAGGAGACTGCCATATAAATACAGCTCCATTACCCTT
TTGTAGAGATAAGTTGCCTACACCTCAAATATTCAAGGGACATCGTAACAAGCACACCAT
GAAGGGTGTTAATTTCCTTGGGCCCAACTGTGACTATGTTACCACTGGATCAGACTGTGG
CCGTGTATTTATTTGGAGGAAGAAGGATGGGGAGCTTATGCGGGTTATGAAAGGGGATAA
ACAGATTGTGAACTGTGTTGAGCAGCACCCTTATGGGATTGTTATTGCAAACTGTGGCAT
TGATAAAGATATCAAGATTTGGGCTCCTGGTGGAAGTGAGAACCCTGACGAGGTTGAGAC
AGATTCTTGTTGCTCTGATATCAGTGAGTCCTATGACTCGGTTTACTTTGATGATTACAT
ATTTTCCTCGGATTTTGATTCATCTGAAGAGGACGACGAAGACGACGACGACGATGATGA
TGATGATGACGATGACGAAGAAGATGGCCTTAGTGTTAGTATCAACGAAGACATGAGCTA
TGAAGAGAAAGATGCAGCCAGCGACCATGACAGCGATGTTTAAAGGTTGCATTCAGCTAT
TATGAGACCGTAGGATGGTTCAGTCTTAGAACATGGTCAGTTAGGGGATCATCGACAGTT
TTGTATGATGTATGCCTTAGGTTGTTTTATCATGTGTTCCTTTCTCAGTCCTCGGCCGTA
TTGCTTGTACATACATATACATATGCCTGAGATAGCTAAGCAAAAGCATACTTACATGTG
GACAAATTTGAGTGGATGGAGAATTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case