These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6766#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 910 fasta sequence [GCTTCGTCATTTGTGACACTCCGAAATGATGGTGAACGTGAATTTATGTTTTATCGCAATCCAAGTGCAGATATGCTGCTTGAAGAAAAGGAACTTGACCTTGATCTTATCAGAAAGGCAAAAATCTTCCACCATGGCTCGATAAGTCTTATAACTGAACCATGTAAAACTGCACATATTGCAGCTGCCAAAGCTGCTAAAGATGCTGGGGTGCTAATTTCGTATGATCCGAATTTGAGGCTCCCACTGTGGTCATCAGCTGATGATGCTAGAGATGGTATACTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCGCAGCACCACGTTGTTAGAATAGGTTTATTTGTTCGTGCAATTTGGTGTGAATACTCATGGCGCCTTGGTGATGTGTCAACTGTCAACCGTGGCTTCCAGCCAACCAAAATAATCAGGTGCAAGAGGCTATGAAAAAAAAAAGGGGAGCTAAAA] [+] EMBL CB682266 [GCTTCGTCATTTGTGACACTCCGAAATGATGGTGAACGTGAATTTATGTTTTATCGCAATCCAAGTGCAGATATGCTGCTTGAAGAAAAGGAACTTGACCTTGATCTTATCAGAAAGGCAAAAATCTTCCACCATGGCTCGATAAGTCTTATAACTGAACCATGTAAAACTGCACATATTGCAGCTGCCAAAGCTGCTAAAGATGCTGGGGTGCTAATTTCGTATGATCCGAATTTGAGGCTCCCACTGTGGTCATCAGCTGATGATGCTAGAGATGGTATACTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGC ] [-] EMBL CB682267 [ TGCACATATTGCAGCTGCCAAAGCTGCTAAAGATGCTGGGGTGCTAATTTCGTATGATCCGAATTTGAGGCTCCCACTGTGGTCATCAGCTGATGATGCTAGAGATGGTATTCTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTTTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCCCTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTTTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCCCTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCGCAGCACCACGTTGTTAGAATAGGTTTATTTGTTCGTGCAATTTGGTGTGAATACTCATGGCGCCTTGGTGATGTGTCAACTGTCAACCGTGGCTTCCAGCCAACCAAAATAATCAGGTGCAAGAGGCTATGAAAAAAAAAAGGG ] [-] EMBL CB637927 [ AGCTGATGATGCTAGAGATGGTATACTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCGCAGCACCACGTTGTTAGAATAGGTTTATTTGTTCGTGCAATTTGGTGTGAATACTCATGGCGCCTTGGTGATGTGTCAACTGTCAACCGTGGCTTCCAGCCAACCAAAATAATCAGGTGCAAGAGGCTATGAAAATTGGATTTTGAGCTAAAA] [+] EMBL CA763796 [ TATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||