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Oryza sativa
cluster # 6766 cluster # 6766       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6766#0 length = 910 sequences # 4  

consensusID : consensus_6766#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 910
fasta sequence
                              [GCTTCGTCATTTGTGACACTCCGAAATGATGGTGAACGTGAATTTATGTTTTATCGCAATCCAAGTGCAGATATGCTGCTTGAAGAAAAGGAACTTGACCTTGATCTTATCAGAAAGGCAAAAATCTTCCACCATGGCTCGATAAGTCTTATAACTGAACCATGTAAAACTGCACATATTGCAGCTGCCAAAGCTGCTAAAGATGCTGGGGTGCTAATTTCGTATGATCCGAATTTGAGGCTCCCACTGTGGTCATCAGCTGATGATGCTAGAGATGGTATACTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCGCAGCACCACGTTGTTAGAATAGGTTTATTTGTTCGTGCAATTTGGTGTGAATACTCATGGCGCCTTGGTGATGTGTCAACTGTCAACCGTGGCTTCCAGCCAACCAAAATAATCAGGTGCAAGAGGCTATGAAAAAAAAAAGGGGAGCTAAAA]

[+] EMBL CB682266             [GCTTCGTCATTTGTGACACTCCGAAATGATGGTGAACGTGAATTTATGTTTTATCGCAATCCAAGTGCAGATATGCTGCTTGAAGAAAAGGAACTTGACCTTGATCTTATCAGAAAGGCAAAAATCTTCCACCATGGCTCGATAAGTCTTATAACTGAACCATGTAAAACTGCACATATTGCAGCTGCCAAAGCTGCTAAAGATGCTGGGGTGCTAATTTCGTATGATCCGAATTTGAGGCTCCCACTGTGGTCATCAGCTGATGATGCTAGAGATGGTATACTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGC                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CB682267             [                                                                                                                                                                          TGCACATATTGCAGCTGCCAAAGCTGCTAAAGATGCTGGGGTGCTAATTTCGTATGATCCGAATTTGAGGCTCCCACTGTGGTCATCAGCTGATGATGCTAGAGATGGTATTCTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTTTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCCCTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTTTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCCCTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCGCAGCACCACGTTGTTAGAATAGGTTTATTTGTTCGTGCAATTTGGTGTGAATACTCATGGCGCCTTGGTGATGTGTCAACTGTCAACCGTGGCTTCCAGCCAACCAAAATAATCAGGTGCAAGAGGCTATGAAAAAAAAAAGGG         ]
[-] EMBL CB637927             [                                                                                                                                                                                                                                                                 AGCTGATGATGCTAGAGATGGTATACTGAGCATATGGGAAACTGCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCATATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCGCAGCACCACGTTGTTAGAATAGGTTTATTTGTTCGTGCAATTTGGTGTGAATACTCATGGCGCCTTGGTGATGTGTCAACTGTCAACCGTGGCTTCCAGCCAACCAAAATAATCAGGTGCAAGAGGCTATGAAAATTGGATTTTGAGCTAAAA]
[+] EMBL CA763796             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACTGAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTTAAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCCCAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAGTTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCCACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCTTATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCG                                                                                                                                                         ]


>consensus_6766#0 GCTTCGTCATTTGTGACACTCCGAAATGATGGTGAACGTGAATTTATGTTTTATCGCAAT CCAAGTGCAGATATGCTGCTTGAAGAAAAGGAACTTGACCTTGATCTTATCAGAAAGGCA AAAATCTTCCACCATGGCTCGATAAGTCTTATAACTGAACCATGTAAAACTGCACATATT GCAGCTGCCAAAGCTGCTAAAGATGCTGGGGTGCTAATTTCGTATGATCCGAATTTGAGG CTCCCACTGTGGTCATCAGCTGATGATGCTAGAGATGGTATACTGAGCATATGGGAAACT GCTGATGTTATCAAGATTAGTGAAGAGGAGGTTTCCTTTTTGACGAAAGGGGAGGATCCA TATGATGATTCTGTAATAAAAAAACTCATGCACCCAAATCTGAAACTGCTTCTTGTCACT GAAGGTCCAGAAGGTTGTAGATATTATTCTAAGGAATTTAATGGGAGAGTTGGTGGACTT AAGGTGAATGCTGTTGACACCACTGGTGCTGGAGATGCCTTTGTTGCTGGAATACTATCC CAGCTATCTGTTGATTTTTCACTGCTGCAGGATGAAGGCCGATTGAAAGAAGCTCTAAAG TTTGCAAATGTCTGTGGGGCTCTCACTGTGACAGAGAGAGGAGCCATCCCGGCATTGCCC ACTCGACAGCAAGTGGTTGATGCCCTAACAAAGGTTGTTGCTTAAAAATGTAACTTATCT TATTTCTCGTGTAAATCAAATTGTGAAAAAGGCCTCGCAGCACCACGTTGTTAGAATAGG TTTATTTGTTCGTGCAATTTGGTGTGAATACTCATGGCGCCTTGGTGATGTGTCAACTGT CAACCGTGGCTTCCAGCCAACCAAAATAATCAGGTGCAAGAGGCTATGAAAAAAAAAAGG GGAGCTAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)