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Oryza sativa
cluster # 6779 cluster # 6779       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_6779#0 length = 3930 sequences # 4  

consensusID : consensus_6779#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 3930
fasta sequence
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[+] EMBL CB001009             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTGACAACTCGAGGTCTAGAATCGGTGATAACCTCATGGAGTGATCTGCAGAGCCTAAAAGTTGTCTCTTGTGATAAAATCAAAGATGAGGAAATCAGCCCTGCCCTCTCAGAGCTTTTCTCCACTTTCAAAGAGCTTAAGTGGAGACCTGACAACAAGTCACGTCTCGCTGCAAGCCTCGCTGGCACTGGAATGGGAAAGAAGGGCAGGGTGCTTTGCAAAAGGGTATGAAGTCTGATCACCTTGGTGCTCCATTCCCCTGAGCTGCGCTTCATCTGTCTATGGATTGAACTTTTCTTGCAGCAGATCTTACCAGGCCATCAACGAGTCAAAGGGACGATGCTGAACTATTCAACAGGTGTTGCTGCTTAGTAGGATTGCAAGTCCAGAAGCTCTGCGTGCTCCTGGAATATTCTTGATCTTAGAAGTTGTTACAAATTCTTCCAACTTAGGGCAAAAGGCGCCTTGCCAATTCCCCTATACCCACAAGTTTACAGTATGAAAACTCAATTGAGGTGCAAATTTGTCTTTGCGCCGGAGTTGTAGCAAGCTAAAAGCCACACATGGCACGGAATATTGTTTCATAAGTTATGGCAGAACTTGTTAGTTCCTGACTAACAGTAGAGCCAACAGAAAAT                                    ]
[+] EMBL CB001016             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CTGACAACTCGAGGTCTAGAATCGGTGATAACCTCATGGAGTGATCTGCAGAGCCTAAAAGTTGTCTCTTGTGATAAAATCAAAGATGAGGAAATCAGCCCTGCCCTCTCAGAGCTTTTCTCCACTTTCAAAGAGCTTAAGTGGAGACCTGACAACAAGTCACGTCTCGCTGCAAGCCTCGCTGGCACTGGAATGGGAAAGAAGGGCAGGGTGCTTTGCAAAAGGGTATGAAGTCTGATCACCTTGGTGCTCCATTCCCCTGAGCTGCGCTTCATCTGTCTATGGATTGAACTTTTCTTGCAGCAGATCTTACCAGGCCATCAACGAGTCAAAGGGACGATGCTGAACTATTCAACAGGTGTTGCTGCTTAGTAGGATTGCAAGTCCAGAAGCTCTGCGTGCTCCTGGAATATTCTTGATCTTAGAAGTTGTTACAA                                                                                                                                                                                                                                             ]


>consensus_6779#0 TTTCCAAATCCCAAACCCCCCCAAAAATTTTGAAAAAAAAAAAAGGAAAGTCCTCAGATC CCCTCACGGCCGCACTACCACGCCGGAATCTCTCCCGAATCGGACCGACGCCGCGCCCGG CCGCACTGCGGGGGCTTCTCCTCTCGCGGCGCGGCCGGGGCTACGCGGGGCCCTGCGCCG CCGTTCGCGGTGAATGCCTGAGCCCGAGGTCGGCGTCCTCGGTGGCCGGGGCCTGCACCG CGACGGCCTCAAGGGGTGGCCTGACCTGCGGTCGCTGTCCGGGAAGAAGATGACGACGCC GCCGCCGCCGCCGGTGGAGAAGCAGCAGCAGCAGGCGCGGCCCGCGGCGGTGGCGCCGCC GGACCAAACCCTAGAGTTCTCGGACGGGCTCCTCCTCCGCGTCCTCGCCTGCCTCCCGGA GCCCCACCTCACGGGCGCCGCGTCGCTGGTCTGCAGGAGGTGGATGCGCCTCGCGGGGCG CCTGCGCCGCCGCCTCGTCGTCAGGGACTGGGCCTTTGTGACCCACCGCCTACACCACCG CTTCCCCGAACTGGCGGACCTCGACCTGTTCCCGGCGTCCATTGTCGCTCCGGCCGTGCC GTCCCCGACCTCCCCTCTCCTCACCTGCGCCGAGGTGTCGCTAACCCTAGACACCGGCGC GGACCCGCCGCTCGTCGCCTGCCGTTTCCTCGCAGATGACGTGCTCGACAGGGGCCTTGT TGCCGTTGCCGCCAGTTTCCCCAACCTCCGCCGCCTCTCAGCCACAGCCGCCTCGGAGTC CGGGGGTCTGATGGATATCGCTGGCGGCTGCGCAACTTTGCAAGAGCTCGAGCTCCACCG ATGCACCGACCTCGCCCTCCGCCCAGTCTCCGCCTTTGCGCATCTTCAGATCCTCCGCCT TGTCGCAGCCTCCTCTGCGTTATATGGCACCAGTGAAGATGGTGGTGTCACCGACATCGG CCTCACCATCCTTGCTCATGGATGCAAGAGATTAGTGAAGCTGGAGCTTGTTGGTTGCGA GGGAAGCTATGACGGCATCGCGGCTGTGGGGCGGTGCTGTGCGATGCTTGAGGAGCTCAC CATCGCCAACCACAAGATGGACAATGGGTGGCTTGCTGCGCTCGCTTTCTGCGGCAACCT CAAAACCCTAAGGTTGCAAGGATGTTGCAGGATTGATGACGATCCTGGGCCTGCGGAGCA TCTTGGTGCGTGCCTCACGCTTGAGAGCCTGCAGCTTCAGCAGTGCCAGCTGCGTGACCG TCGTGCCCTCCATGCTCTCCTTTTGGTTTGTGAGGGTGCCCGTGAGTTATTGGTCCAGAA TTGCTGGGGCCTTGAAGATGACATGTTTGCCATGGCAGGACTGTGCAGGTATAGTAATCA CCAATCTCATTTTTCAATCTAGGTTGTTGATATATTACAATGATCGCACAATGTGGGCAG ATTGTGTATTTGAACTTTGATTGTTTAGTTATTCCTGCTTTATATTTGATCTGTCAGACT GTGATAGTGACTTGCTGCCAATTGAAGTAGTCGTAGGTAACTGATGATTGGTTGTTCTGA CCCTGGTTTAGTGTCAGGAGATATAATGCTTGCAAATTGCAATGCATGGACCCCTCCATG TTTGGAGTCAGTATGCCACTATTGCTTCTGTGGTAATTAATTAAATAACAGTTATCATGG GACTTGAGGGCGCAAAATTTATTATTCGGTAGTGTCGTAAAAACCTCACTTAGATAGCCT CCATCATTATTCCTTTTGTCTACTGATTATGTCTGTGTGAGCTTTGATAAGCTCCATAAT CTAGTCAACCTCTGTTCAGTATACTGCATGTTTGGCTAACATTGTCATTTTTGGTTGTTT TAGCATATGATTGCTTGGAAAAGATGCAATTATTTATTACAGATGTGTTCAAGTGAAAGT ATTCCATAATTGTGTATTTGCGTTATATTGTTTGTCATAATCACTTTTATTCTTCCTCTT GTGTTGAGCAAGTCACATGCTGTTTGTGTTATTCACTATATTGCCATTTTAGGATGTGCG TTATCTAGCCCCTCGTGCACTTTCTCCTTTTGTGTCCAGATAATTGTGACTGGTAAAAAT GCAAACCATGACTTAGATGTCTGAGCGATGGATTTCATAAAGATGTAGGTCGCTTCAATT CTTCGAACACAAACCGTGCACCACTACCTGAGCAAATGGATTCAGTAAAGACTAGCTGAG TGCCCATACTTTGTTATGGAATTAAAAAAAAAAATTGCAATGTATGTAGTAGAAATAAAT TATTGTTGACATATCCTTTTGCCCCATGCCATGCTCTCTACGTTTTTTTTCTTCACAGAC AATAGGCAGTGGTGGGGTGGTGTCAGATTCACCATAAACCACTACCACCTATTGCCATGC CGATTCTTCCATCACAAACCGTGGATTGATGTTATGGAATATTCGTTGGAGGATATTTGC ATTTTTGCTCATGGATCTTCTGCCAAACTATGCAGTAAAGGATTACTTGTTCTAAAAGGG CCAACAAATTGACAGTGTCTCGGTAGAGTCTTTTGATGTAGTTCTTTGGGCTACTAAATG TAGTTATTTATGATGCGTAAATGTTATCCGCCTACACTTCCCTGTATTTGTTTTTCCCTG GACTAGAGTCTTATAACTGTTACTAGTACTGATCAATGCCAAGATTTGCATTGGAAGTGC CAGGGCTAACTAGGGTAGGTAGTTTCTTTATATACGTGGAATAATTTTCAGTTTCTTCTG ACCCATTATTTGCTTATATGCCATCGATTGTGGCATATTATCATTTTTTGTGTGAATATG GCAGCAATCTACTGCAATGAATTAGTGGAATAAAATGAACGAATAACCTCTAAAGCTCTA AATCAGATGCATTCGTGTAACTGGAATTCTTAGAGTTGACATCAGATTACCTACAGGCTA AAACCATGTTTTACCTTCATCCACACTTCCACAGTAGCACGACGACCATCTCAAATTTTC ATCTGAATATTTCAATAGTTTCCTCTCAAAACGCTTTAGCAAATACTTACTATATATTTT CACTGGCAATAGTATTGTAATAATGTTTTGTTCTTCTGGAAATGGTGAGCCATTTTACAT ACCTAGATATGGTCCACAACCTACATTTTTCGTGGAAAGTGTTTCTTGGCTTAATTCAGG ATCTTGACTTATGTCTGCTGCGTTCTCTTTGTTTTTCAGGAGAGTTAAGTTCCTCTCCTT AGAAGGTTGCTCACAACTGACAACTCGAGGTCTAGAATCGGTGATAACCTCATGGAGTGA TCTGCAGAGCCTAAAAGTTGTCTCTTGTGATAAAATCAAAGATGAGGAAATCAGCCCTGC CCTCTCAGAGCTTTTCTCCACTTTCAAAGAGCTTAAGTGGAGACCTGACAACAAGTCACG TCTCGCTGCAAGCCTCGCTGGCACTGGAATGGGAAAGAAGGGCAGGGTGCTTTGCAAAAG GGTATGAAGTCTGATCACCTTGGTGCTCCATTCCCCTGAGCTGCGCTTCATCTGTCTATG GATTGAACTTTTCTTGCAGCAGATCTTACCAGGCCATCAACGAGTCAAAGGGACGATGCT GAACTATTCAACAGGTGTTGCTGCTTAGTAGGATTGCAAGTCCAGAAGCTCTGCGTGCTC CTGGAATATTCTTGATCTTAGAAGTTGTTACAAATTCTTCCAACTTAGGGCAAAAGGCGC CTTGCCAATTCCCCTATACCCACAAGTTTACAGTATGAAAACTCAATTGAGGTGCAAATT TGTCTTTGCGCCGGAGTTGTAGCAAGCTAAAAGCCACACATGGCACGGAATATTGTTTCA TAAGTTATGGCAGAACTTGTTAGTTCCTGACTAACAGTAGAGCCAACAGAAAATTTGTGT TCGCTGCACATACCATCGCAAATGATGTAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)