These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_6812#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1684 fasta sequence [TTTCAAATCATCTCGCTTCACGGTGGTCGCTCGCAAGCCACACACGCACGCACCCCCACCACTCCTCCCATTCGAGACCCCGCGGGGCTCTGGATTGCTTGCTCGGAACCTGGGATGCACTGCCTCGCCTGCGCCGCTCCGGCCGCGCGCGCCCCGGGCAGTCGCGTCGGCGGCGGCGGCCGCCGGAGGATGGCTATCGAGTGCGCCGCCTCCTCCCCCTTCACCCGCGACGGCGAGGAAACGGCCCCGAGGTCAATGATGGAAACATATGGTGAAATGTCAAGTAAACCTGTATTGCTTGCGTCAAGGAGGAAGCTTGTTGCATTATCATCGTTTTGCTTTTGCTTACATTCTTCAAGGTACTTCTCAGCACTTGCTTTGGGTGATCCATCTGTTAAAATTGATGATGTCACTCCAAAGATTTTTCCATCTGGTCCACTGTTTCCAACTGAGAAACGGATCGCAGAGCTTTTTGAAACAAATACTTACTCTGTTGTCAACATTTTTGATGCAACTCTGCGCCCTCAGCTCAATGTAACTGGTGTTGTTGAGATTCCCGAAGGAAATGGTTCTGGCGTAGTTTGGGATGATTCCGGCCATATTGTTACAAACTACCATGTGGTTGGCAATGCCCTTTCAAAAAAACCAAAGCCTGGCGAAGTTGTTGCGCGTGTCAACATTCTTGCTGCTGATGGGATACAGAAAAATTTTGAAGGCAAATTGGTTGGTGCTGACCGTTCTAAAGATCTTGCTGTTCTCAAGGTGGATGCTCCTACAGATCTGTTGAAGCCAATTAACGTGGGACAATCTTCAGCTCTAAGAGTTGGTCAACAGTGTTTAGCAATTGGAAATCCATTTGGCTTTGACCATGCTCTAACTGTTGGTGTCATCAGTGGTTTAAATCGAGACATTTTCAGTCAAGCTGGAGTAACAATTGGAGGTGGAATTCAAACAGATGCAGCTATTAACCCTGGGAACAGTGGTGGTCCATTGCTGGATTCGAAGGGGCATATGATTGGTATTAATACAGCAATTTTCACACAGACAGGAACATCTGCTGGTGTTGGTTTTGCCATCCCGTCATCAACTGTTCTGAAAATAGCTCCTCAGTTAATTCAGTTTGGAAAAGTTCGCCGTGCTGGCTTGAATGTGGAGTTTGCTCCAGATCCAATCGCATATCAGCTTAATGTTCGCACTGGATCTCTAATATTGCAGGTTCCTGGGGGCAGTGCTGCAGCCAAAGCTGGTCTTGTTCCTACCAGTAGGGGTTTTGCTGGTAACATTGTTCTTGGTGATGTCATTG-TTGCCGTGGACGGTAAACCTATCAAAGGCAAATCTGATCTATCGAGGGTTCTGGATGATTATGGCGTTGGAGACAAGGTGAGCTTGACAATCCAAAGAGGCGCTGAAACTCTGGAGGTAACCTTGCCTTTAGAAGAGGCAAGTATCTGATGTATTTCTAGCAGTAAGTTGGCATCCCCG-ATCTATTGCTTTTGTAAATATCGCATTTGCTGAGCTGTTCATGCTTCCA-ACCTGAAGCCTTTTTCGTTTGTTTCTTAAATACTAAAACGAATCGATTCAGAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCCATAGATGGTGCCTCAATATACATCAGAGTTTCTGCTTATTATACGTCATAATCCTTTGAAGATTATGATGAAA] [+] EMBL AK065850 [TTTCAAATCATCTCGCTTCACGGTGGTCGCTCGCAAGCCACACACGCACGCACCCCCACCACTCCTCCCATTCGAGACCCCGCGGGGCTCTGGATTGCTTGCTCGGAACCTGGGATGCACTGCCTCGCCTGCGCCGCTCCGGCCGCGCGCGCCCCGGGCAGTCGCGTCGGCGGCGGCGGCCGCCGGAGGATGGCTATCGAGTGCGCCGCCTCCTCCCCCTTCACCCGCGACGGCGAGGAAACGGCCCCGAGGTCAATGATGGAAACATATGGTGAAATGTCAAGTAAACCTGTATTGCTTGCGTCAAGGAGGAAGCTTGTTGCATTATCATCGTTTTGCTTTTGCTTACATTCTTCAAGGTACTTCTCAGCACTTGCTTTGGGTGATCCATCTGTTAAAATTGATGATGTCACTCCAAAGATTTTTCCATCTGGTCCACTGTTTCCAACTGAGAAACGGATCGCAGAGCTTTTTGAAACAAATACTTACTCTGTTGTCAACATTTTTGATGCAACTCTGCGCCCTCAGCTCAATGTAACTGGTGTTGTTGAGATTCCCGAAGGAAATGGTTCTGGCGTAGTTTGGGATGATTCCGGCCATATTGTTACAAACTACCATGTGGTTGGCAATGCCCTTTCAAAAAAACCAAAGCCTGGCGAAGTTGTTGCGCGTGTCAACATTCTTGCTGCTGATGGGATACAGAAAAATTTTGAAGGCAAATTGGTTGGTGCTGACCGTTCTAAAGATCTTGCTGTTCTCAAGGTGGATGCTCCTACAGATCTGTTGAAGCCAATTAACGTGGGACAATCTTCAGCTCTAAGAGTTGGTCAACAGTGTTTAGCAATTGGAAATCCATTTGGCTTTGACCATGCTCTAACTGTTGGTGTCATCAGTGGTTTAAATCGAGACATTTTCAGTCAAGCTGGAGTAACAATTGGAGGTGGAATTCAAACAGATGCAGCTATTAACCCTGGGAACAGTGGTGGTCCATTGCTGGATTCGAAGGGGCATATGATTGGTATTAATACAGCAATTTTCACACAGACAGGAACATCTGCTGGTGTTGGTTTTGCCATCCCGTCATCAACTGTTCTGAAAATAGCTCCTCAGTTAATTCAGTTTGGAAAAGTTCGCCGTGCTGGCTTGAATGTGGAGTTTGCTCCAGATCCAATCGCATATCAGCTTAATGTTCGCACTGGATCTCTAATATTGCAGGTTCCTGGGGGCAGTGCTGCAGCCAAAGCTGGTCTTGTTCCTACCAGTAGGGGTTTTGCTGGTAACATTGTTCTTGGTGATGTCATTG TTGCCGTGGACGGTAAACCTATCAAAGGCAAATCTGATCTATCGAGGGTTCTGGATGATTATGGCGTTGGAGACAAGGTGAGCTTGACAATCCAAAGAGGCGCTGAAACTCTGGAGGTAACCTTGCCTTTAGAAGAGGCAAGTATCTGATGTATTTCTAGCAGTAAGTTGGCATCCCCG ATCTATTGCTTTTGTAAATATCGCATTTGCTGAGCTGTTCATGCCTCCA ACCTGAAGCCTTTTTCGTTTGTTTCTTAAATACTAAAACGAATCGATTCAGAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCCATAGATGGTGCCTCAATATACATCAGAGTTTCTGCTTATTATACGTCATAATCCTTTGAAGATTATGATG ] [-] EMBL CB679186 [ TCAGTCAAGCTGGAGTAACAATTGGAGGTGGAATTCAAACAGATGCAGCTATTAACCCTGGGAACAGTGGTGGTCCATTGCTGGATTCGAAGGGGCATATGATTGGTATTAATACAGCAATTTTCACACAGACAGGAACATCTGCTGGTGTTGGTTTTGCCATCCCGTCATCAACTGTTCTGAAAATAGCTCCTCAGTTAATTCAGTTTGGAAAAGTTCGCCGTGCTGGCTTGAATGTGGAGTTTGCTCCAGATCCAATCGCATATCAGCTTAATGTTCGCACTGGATCTATAATATTGCAGGTTCCTGGGGGCAGTGCTGCAGCCAAAGCTGGTCTTGTTCCTACCAGTAGGGGTTTTGCTGGTACCATTGTTCTTGGTGATGTCATTG TTGCCGTGGACGGTAAACCTATCAAAGGCAAATCTGATCTATCGAGGGTTCTGGATGCTTATGGCGTTGGAGACAAGGTGAGCTTGACAATCCAAAGAGGCGCTGAATCTCTGGAGGTAACCTTGCCTTTAGAAGAGGCAAGTATCCGATGTATTTCTAGCAGTAAGTTGGCATCCCCGCATCTATTGCTTTTGTAAATATCGCATTGGCTGAGCTGTTCATGCTTCCACACCTGAAGCCTTTTTCGTTTGTTTGTTAAATCCTAAAGCGAATGGATTCAGAACTCTCTCTCTGTGTCTGTCTCCTCTCAATGGAga ] [+] EMBL BI812220 [ aagGGTCTTGTTCCTACCAGTAGGGGTTTTGCTGGTAACATTGTTCTTGTTGATGTCATTGTTTCCCGTGGACGGTAAACCTATCAAAGGCAAATCTGATCTATCGAGGGTTCTGGATGATTATGGC TTGGAGACAAGGTGAGCTTGACAATCCAAAGAGGC CTGAAACTCTGGAGGTAACCTTGCCTTTAGAAGAGGCAAGTATCTGATGTATTTCTA CAGTAAGTTGGCATCCCCG ATCTATTGCTTTTGTAAATATCGCATTTGCTGAGCTGTTCATGCTTCCA ACCTGAAGCCTTTTTCGTTTGTTTCTTAAATACT AAACGAATCGATTCAGAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCCATAGATGGTGCCTCAATATACATCAGAGTTTCTGCTTATTATACGTCATAATCCTTTGAAGATTtaaaaaaaa] [+] EMBL CA754160 [ AAGTATCTGATGTATTTCTAGCAGTAAGTTGGCATCCCCG ATCTATTGCTTTTGTAAATATCGCATTTGCTGAGCTGTTCATGCTTCCA ACCTGAAGCCTTTTTCGTTTGTTTCTTAAATACTAAAACGAATCGATTCAGAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCCATAGATGGTGCCTCAAaaaaaaaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||