cluster # 6870

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Oryza sativa
cluster # 6870 cluster # 6870 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6870#0 length = 695 sequences # 4

consensusID : consensus_6870#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 695
fasta sequence

                              [TTTGGCATCAGGCNAAAATCAGTGGTGCCATTTCATCCGTTAACCAACTGTTTCCGTGTTTTCTGCAATCGATGTTCCTGTGCCCTGTAGCACACTGAGATGCAATGGCCGATCCAGGATCAAAATCCCAACCTGCGGAGAATGTATCAAAAGATTATATATTTCAGTTTCAATGCAAATATGAGAAATTATGGGGTTAGTTGACCCCGCAGGTCATAAACGTGGCTCTGCCACTGCTCCTATCCACAAAAATATAACTATGTATAAAACAA-TCTATATTTGCCACCA---TAAAAACTC-TTGGGCTAGAAAGCTCTACGCACTCCA-TTGAGGGTAAAGGTGTTAACACTTACTT-TTTTTAACCATGTCGTATAACTAACTTCATTTCTTACTTGTGTAGATGTTTTCGGAAGTTAAAACTTCCTATTT-TTAT-CCGTT-GGATCCTAACATTACCTGACTATGTACCATCCTCTGGG-GTTAGTCGAGGGTAGT-GTAGTCACGT-GGGTTGTTAAGAAAATTACACCGGCATGGATATATGGATACATACAAGCTGGTTTGATGTAAATGTGTATAATCATTTGGAGCACTGTTGATTGGATCATTCCTTATGTGGTGTACTGGTCGTTGGAGTGATAAAAACTTCCCATGAGGGGTCTTTTATGAAATATAAGCGTTGAAAATTTTCACTTCAAAAAAAA]

[+] EMBL AU096050             [TTTGGCATCAGGCNAAAATCAGTGGTGCCATTTCATCCGTTAACCAACTGTTTCCGTGTTTTCTGCAATCGATGTTCCTGTGCCCTGTAGCACACTGAGATGCAATGGCCGATCCAGGATCAAAATCCCAACCTGCGGAGAATGTATCAAAAGATTATATATTTCAGTTTCAATGCAAATATGAGAAATTATGGGGTTAGTTGACCCCGCAGGTCATAAACGTGGCTCTGCCACTGCTCCTATCCACAAAAATATAACTATGTATAAAACAA TCTATATTTGCCACCA   TAAAAACTC TTGGGCTAGAAAGCTCTACGCACTCCA TTGAGGGTAAAGGTGTTAACACTTACTT TTTTTAACCATGTCGTATAACTAACTTCATTTCTTACTTGTGTAGATGTTTTCGGAAGTTAAAACTTCCTATTT TTAT CCGTT GGATCCTAACATTACCTGACTATGTACCATCCTCTGGG GTTAGTCGAGGGTAGT GTAGTCACGT GGGTTGTTAAGAAAATTACACCGGCATGGATATATGGATACATACAAGCTGGTTTGATGTAAATGTGTATAATCATTTGGAGCACTGTTGATTGGATCATTCCTTATGTGGTGTACTGGTCGTTGGAGTGATAAAAACTTCCCATGAGGGGTCTTTTATGAAATATAAGCGTTGAAAATTTTCACTTCAAAAAAAA]
[+] EMBL AU096056             [                                                                                                                                                                                                                                                                      aacagccCAATTCTATATTTGCCACCATTNTAAAACCTCATTGGGCTAGAAAGCTCTACGCACTCCATTTGAGGGTAAAGGTGTTAACACTTACTTCTTTTTAACCATGTCGTATAACTAACTTCATTTCTTACTTGTGTAGATGTTTTCGGAAGTTAAAACTTCCTATTT TTAT CCGTT GGATCCTAACATTACCTGACTATGTACCATCCTCTGGG GTTAGTCGAGGGTAGT GTAGTCACGT GGGTTGTTAAGAAAATTACACCGGCATGGATATATGGATACATACAAGCTGGTTTGATGTAAATGTGTATAATCATTTGGAGCACTGTTGATTGGATCATTCCTTATGTGGTGTACTGGTCGTTGGAGTGATAAAAACTTCCCATGAGGGGTCTTTTATGAAATATAAGCGTTGAAAATTTTCACTTCAAAAAA  ]
[+] EMBL AU057856             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTAAAACTTCCTATTT TTAT CCGTT GGATCCTAACATTACCTGACTATGTACCATCCTCTGGG GTTAGTCGAGGGTAGT GTAGTCACGT GGGTTGTTAAGAAAATTACACCGGCATGGATATATGGATACATACAAGCTGGTTTGATGTAAATGTGTATAATCATTTGGAGCACTGTTGATTGGATCATTCCTTATGTGGTGTACTGGTCGTTGGAGTGATAAAAACTTCCCATGAGGGGTCTTTTATGAAATATAAGCGTTGAAAATTTTCAAAAAAAAAAAA ]
[+] EMBL AU096065             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TCCTATTTNTTATCCCGTTAGAANCCTAACATTACCTGACTATGTACCATCCTCTGGGNGTTAGTCGAGGGTAGTCGTAGTCACGTAGGGTTGTTAAGAAAATTACACCGGCATGGATATATGGATACATACAAGCTGGTTTGATGTAAATGTGTATAATCATTTGGAGCACTGTTGATTGGATCATTCCTTATGTGGTGTACTGGTCGTTGGAGTGATAAAAACTTCCCATGAGGGGTCTTTTATGAAATATAAGCGTTGAAAATTTTCACTTCAAAAAAA ]




>consensus_6870#0
TTTGGCATCAGGCNAAAATCAGTGGTGCCATTTCATCCGTTAACCAACTGTTTCCGTGTT
TTCTGCAATCGATGTTCCTGTGCCCTGTAGCACACTGAGATGCAATGGCCGATCCAGGAT
CAAAATCCCAACCTGCGGAGAATGTATCAAAAGATTATATATTTCAGTTTCAATGCAAAT
ATGAGAAATTATGGGGTTAGTTGACCCCGCAGGTCATAAACGTGGCTCTGCCACTGCTCC
TATCCACAAAAATATAACTATGTATAAAACAATCTATATTTGCCACCATAAAAACTCTTG
GGCTAGAAAGCTCTACGCACTCCATTGAGGGTAAAGGTGTTAACACTTACTTTTTTTAAC
CATGTCGTATAACTAACTTCATTTCTTACTTGTGTAGATGTTTTCGGAAGTTAAAACTTC
CTATTTTTATCCGTTGGATCCTAACATTACCTGACTATGTACCATCCTCTGGGGTTAGTC
GAGGGTAGTGTAGTCACGTGGGTTGTTAAGAAAATTACACCGGCATGGATATATGGATAC
ATACAAGCTGGTTTGATGTAAATGTGTATAATCATTTGGAGCACTGTTGATTGGATCATT
CCTTATGTGGTGTACTGGTCGTTGGAGTGATAAAAACTTCCCATGAGGGGTCTTTTATGA
AATATAAGCGTTGAAAATTTTCACTTCAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case