cluster # 6961

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Oryza sativa
cluster # 6961 cluster # 6961 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_6961#0 length = 693 sequences # 4

consensusID : consensus_6961#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 693
fasta sequence

                              [AGTCCATCGTCGCATCCTCCGTGCAAGCAGCAGCCG-GCTCGCCGC-CTCTGCCCCTACCTTCTCCACTCCTCTTTCTCTCATCTTCCGCCCCAAGCTTGCACTCTCATCCTGCCCGTCGTGGTGCGCCCGCGGTGCATTTTGCCTCATGTGCACTCCGAGACACTGCAACGACGGTGAAGAGGAGGAGAAGGCGGCTACAGTGACCATGGAGATGGTAGATCTGGCGGTGGGCGGCTAGCAAGGTGAAGGCTAGCTATGGGTCGAGGGCAGCAGCCAGCAAGCAAGGCGGAGGTCCGATTTGTCGGAGCCAGCAAGGTGGAGTCTCAAACTCTTAGGTCCGATTTGTCGATTACTTCCTCTTGCAATGCTAATTTTGTTTTTATTGGGATGGGTTTGATTTCTTCCATGGATCCCTCTGCTTTGACTATAATTGAATTGGTGTGGATTAGAGTCCAATTTGTGTGGATTAGAGTCTAATTTGACAATTCAGTGTTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCGTGTATGAACTGGGAATTGGAAATTTAGAGACGATCTAGTTGTGTAGGAAATTTTGGGGTCCAAATTGACAAACTTAATGTTCTCGCTTCAATTTCGTGTACGAGTTGGGAATTGAGAATTTGGAAACGATCTAGCTACGTGGGAATTTTTGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL C97992               [AGTCCATCGTCGCATCCTCCGTGCAAGCAGCAGCCG GCTCGCCGC CTCTGCCCCTACCTTCTCCACTCCTCTTTCTCTCATCTTCCGCCCCAAGCTTGCACTCTCATCCTGCCCGTCGTGGTGCGCCCGCGGTGCATTTTGCCTCATGTGCACTCCGAGACACTGCAACGACGGTGAAGAGGAGGAGAAGGCGGCTACAGTGACCATGGAGATGGTAGATCTGGCGGTGGGCGGCTAGCAAGGTGAAGGCTAGCTATGGGTCGAGGGCAGCAGCCAGCAAGCAAGGCGGAGGTCCGATTTGTCGGAGCCAGCAAGGTGGAGTCTCAAACTCTTAGGTCCGATTTGTCGATTACTTCCTCTTGCAATGCTAATTTTGTTTTTATTGGGATGGGTTTGATTTCTTCCATGGATCCCTCTGCTTTGACTATAATTGAATTGGTGTGGATTAGAGTCCAATTTGTGTGGATTAGAGTCTAATTTGACAATTCAGTGTTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCGTGTATGAACTGGGAATTGGAAATTTAGAGACGATCTAGTTGTGTAGGAAATTTTGGGGTCCAAATTGACAAACTTAATGTTCTCGCTTCAATTTCGTGTACGAGTTGGGAATTGAGAATTTGGAAACGATCTAGCTACGTGGGAATTTTTGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL OSC03362A            [   CCATCGTCGCATCCTCCGTGCAAGCAGCAGCCG GCTCGCCGC CTCTNCCCCTACCTTCTCCACTCCTCTTTCTCTCATCTTCCGCCCCAAGCTTGCACTCTCATCCTGCCCGTCGTGGTGCGCCCGCGGTGCATTTTGCCTCATGTGCACTCCGAGACACTTCAACGACGGTNAAGAGGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CB678680             [                 TCCGCGTTAGCAGCAGCCGAGCTCGCCGCACTCTGCCCCTACCTTCTCCACTCCTCTTTCTCTCATCTTCCGCCCCAAGCTTGCACTCTCATCCTGCCCGTCGTGGTGCGCCCGCGGTGCATTTTGCCTCATGTGCACTCCGAGACACTGCAACGACGGTGAAGAGGAGGAGAAGGCGGCTACAGTGACCATGGAGATGGTAGATCTGGCGGTGGGCGGCTAGCAAGGTGAAGGCTAGCTATGGGTCGAGGGCAGCAGCCAGCAAGCAAGGCGGAGGTCCGATTTGTCGGAGCCAGCAAGGTGGAGTCTCAAACTCTTAGGTCCGATTTGTCGATTACTTCCTCTTGCAATGCTAATTTTGTTTTTATTGGGATGGGTTTGATTTCTTCCATGGATCCCTCTGCTTTGACTATAATTGAATTGGTGTGGATTAGAGTCCAATTTGTGTGGATTAGAGTCTAATTTGACAATTCAGTGTTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCGTGTATGAAC                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI795780             [                                                                                                                                                                                                                       GGTAGATCTGCCGGT GGCGGCTAGCAAGGTGAAGGCTAGCTATGGGTCGAGGGCAGCAGCCAGCAAGCAAGGCGGAGGTCCGATTTGTCGGAGCCAGCAAGGTAGAGTCTCAAACTCTTAGGTCCGATTTGTCGATTACTTCCTCTTGCAATGCTAATTTTATTTTTATTGGGATGGGTTTGATTTCTTCCATGGATCCCTCTGCTTTGACTATAATTGAATTGGTGTGGATTAGAGTCC ATTTGTGTGGATTAGAGTCTAATTTGACAATTCAGTGTTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCGTGTATGAACTGGGAATTGGAAATTTAGAGACGATCTAGTTGTGTAGGAAATTTTGGGGTCC AATTGACAAACTCAATGTTCTCGCTTCAATTTCGTGTACGAGTTGGGAATTGAGAATTTGGAAACGATCTAaaaaaaa                                       ]




>consensus_6961#0
AGTCCATCGTCGCATCCTCCGTGCAAGCAGCAGCCGGCTCGCCGCCTCTGCCCCTACCTT
CTCCACTCCTCTTTCTCTCATCTTCCGCCCCAAGCTTGCACTCTCATCCTGCCCGTCGTG
GTGCGCCCGCGGTGCATTTTGCCTCATGTGCACTCCGAGACACTGCAACGACGGTGAAGA
GGAGGAGAAGGCGGCTACAGTGACCATGGAGATGGTAGATCTGGCGGTGGGCGGCTAGCA
AGGTGAAGGCTAGCTATGGGTCGAGGGCAGCAGCCAGCAAGCAAGGCGGAGGTCCGATTT
GTCGGAGCCAGCAAGGTGGAGTCTCAAACTCTTAGGTCCGATTTGTCGATTACTTCCTCT
TGCAATGCTAATTTTGTTTTTATTGGGATGGGTTTGATTTCTTCCATGGATCCCTCTGCT
TTGACTATAATTGAATTGGTGTGGATTAGAGTCCAATTTGTGTGGATTAGAGTCTAATTT
GACAATTCAGTGTTCTCTTTTCTTTTCAGTTTCGTGTATGAACTGGGAATTGGAAATTTA
GAGACGATCTAGTTGTGTAGGAAATTTTGGGGTCCAAATTGACAAACTTAATGTTCTCGC
TTCAATTTCGTGTACGAGTTGGGAATTGAGAATTTGGAAACGATCTAGCTACGTGGGAAT
TTTTGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case