These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7036#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1137 fasta sequence [CTGCAGGACTTGGTCCCCAACACAAACAAGACAGACAGGGCAGCTATGCTAGACGAAATCCTTGATTATGTGAAGTTTCTTCGGCTTCAAGTAAAGGTTCTGAGTATGAGCAGGCTGGGTGGTGCTGGTGCAGTTGCGCAGCTGGTTGCTGATATTCCAATCTCAGTTAAGGGGGAGGCAAGTGACAGTGGGAGCAAACAACAGATTTGGGAAAAGTGGTCAACCGATGGCACAGAAAAGCAGGTAGCGAAGCTGA-TGGAAGAAGACATCGGAGCAGCAATGCAATTCCTCCAATCCAAAGCACTATGCATGATGCCAATCTCTCTTGCGATGGCGATCTATGACACACAGCATTCGCAGGACGGACACTCAGTGAAGCCTGAACCCAACACTCCTTCATAGTATAGTAACAATAACACTAGCATGCACACCTACTACTACTAGGCGTCGACCTATCCAAAGTGTAGGATATACTGGACATTTTGATTTGCTAACTGGAAAAGGCCTAAGGATCCTCTCCTCAAAGTAGTACCCATGGTATATGATGTCGTCTCCTCTTTTCTTCTTTTCTTCAAAGGTGCTTTGATTGCAAAGATATGGTAAGCGATGTTCTCATGCTCCTACATCTTTCAATGCCCCTATCGAGTGTGAGTGATGGGTAGAGCTACCAAAGAGTCTGGCATGCGCTCATATCATTTCCTTTTGGGTCTGTAGTGCACTAGCCATACACTTTGTGGTGGGGTCGGTCAGTCTTTTGGTAGTGGACGTTTGGACTAATGAAAAGAAGCTGATGTATGTGTGTTAAGTCTGCACAAATGGTTGACACAATTTAAAAGAATGTTCAGATGGAAGATGATGTTGACGGTGAATGGTGGTGCTATTTCTTGTCTATTTTTCCAAAGCGGCAACGGATGTTTTAGTCAATGGAGGCGAAGCGTGTATTAATCTGGTTGCTAGTGGGAGCGTGCTCCTTATGTGCTTTACTTTTCTGTCTGCAAGTCATAGTCTTGATAAGAACCTGCCCTCTTAAAGTTTTTAGCCTCTTGTATTATTGGTTCACTCATGAAACTATATATATCATCTGTGCTGACTTAACATGTGTTAAGGATTTGTACTGCCAAAAAAAAAAAAAAGGAA] [+] EMBL AK066623 [CTGCAGGACTTGGTCCCCAACACAAACAAGACAGACAGGGCAGCTATGCTAGACGAAATCCTTGATTATGTGAAGTTTCTTCGGCTTCAAGTAAAGGTTCTGAGTATGAGCAGGCTGGGTGGTGCTGGTGCAGTTGCGCAGCTGGTTGCTGATATTCCAATCTCAGTTAAGGGGGAGGCAAGTGACAGTGGGAGCAAACAACAGATTTGGGAAAAGTGGTCAACCGATGGCACAGAAAAGCAGGTAGCGAAGCTGA TGGAAGAAGACATCGGAGCAGCAATGCAATTCCTCCAATCCAAAGCACTATGCATGATGCCAATCTCTCTTGCGATGGCGATCTATGACACACAGCATTCGCAGGACGGACACTCAGTGAAGCCTGAACCCAACACTCCTTCATAGTATAGTAACAATAACACTAGCATGCACACCTACTACTACTAGGCGTCGACCTATCCAAAGTGTAGGATATACTGGACATTTTGATTTGCTAACTGGAAAAGGCCTAAGGATCCTCTCCTCAAAGTAGTACCCATGGTATATGATGTCGTCTCCTCTTTTCTTCTTTTCTTCAAAGGTGCTTTGATTGCAAAGATATGGTAAGCGATGTTCTCATGCTCCTACATCTTTCAATGCCCCTATCGAGTGTGAGTGATGGGTAGAGCTACCAAAGAGTCTGGCATGCGCTCATATCATTTCCTTTTGGGTCTGTAGTGCACTAGCCATACACTTTGTGGTGGGGTCGGTCAGTCTTTTGGTAGTGGACGTTTGGACTAATGAAAAGAAGCTGATGTATGTGTGTTAAGTCTGCACAAATGGTTGACACAATTTAAAAGAATGTTCAGATGGAAGATGATGTTGACGGTGAATGGTGGTGCTATTTCTTGTCTATTTTTCCAAAGCGGCAACGGATGTTTTAGTCAATGGAGGCGAAGCGTGTATTAATCTGGTTGCTAGTGGGAGCGTGCTCCTTATGTGCTTTACTTTTCTGTCTGCAAGTCATAGTCTTGATAAGAACCTGCCCTCTTAAAGTTTTTAGCCTCTTGTATTATTGGTTCACTCATGAAACTATATATATCATCT ] [+] EMBL OSR02291A [ TCAACCGATGGCACAGAAAAGCAGGTAGCGAAG TGANTGGAAGAAGACATCGGAGCAGCAATGCAATTCCTCCAATCCAAAGCACTATGCATGATGCCAATCTCTCTTGCGATGGCGATCTATGACACACAGCATTCGCAGGACGGACACTCAGTGAAGCCTGAACCCAACACTCCTTCATAGTATAGTAACAATAACACTAGCATGCACACCTACTACTACTAGGCGTCGACCTATCCAAAGTGTAGGATATACTGGACATTTTGATTTGCTAACTGGAAAAGGCCTAAGGATCCTCTCCTCAAAGTAGTACCCATGGTATATGATGTCGTCTCCTCTTTTCTTCTTTTCTTCAAA ] [-] EMBL CB670934 [ GTAACAATAACACTAGCATGCACACCTATTACTATTAGGCGTCGACCTATCCAAAGTGTAGGATATACTGGACATTTTGATTTGCTAACTGGAAAAGGCCTAAGGATCCTCTCCTCAAAGTAGTACCCATGGTATATGAGGTCGTCTCCTCTTTTCTTCTTTTCTTCAAAGGTGCTTTGATTGCAAAGATATGGTAAGGGATGTTTTCATGCTCCTACATCTTTCAATGCCCCTATCGAGTGTGAGTGATGGGTAGAGCTACCAAAGAGTTTGGCATGCGCTCATATCATTTCCTTTTGGGTCTGTAGTGCACTAGCCATACACTTTGTGGTGGGGTCGGTCAGTCTTTTGGTAGTGGACGTTTGGACTAATGAAAAGAAGCTGATGTATGTGTGTTAAGTCTGCACAAATGGTTGACACAATTTAAAAGAATGTTCAGATGGAAGATGATGTTGACGGTGAATGGTGGTGCTATTTCTTGTTTATTTTTCCAAAGCGGCAACGGATGTTTTAGTCAATGGAGGGGAAGCGTGTATTAATTTGGTTGCTAGTGGGAGCGTGCTCCTTATGTGCTTTACTTTTCTGTCTGCAAGTCATAGTCTTGATAAGAACCTGCCCTCTTAAAGTTTTTAGCCTCTTGTATTATTGGTTCACTCATGAAACTATATATATCATCTGTGCTGACTTAACATGTGTTAAGGATTTGTACTGCCAAAAAAAAAAAAAAGGAA] [+] EMBL AU095418 [ AGGCNTAAGGATCCTCTCCTCAAAGTAG ACCCATGGTATATGATGTCGTCTCCTCTTTTCTTCTTTTCTTCAAAGGTGCTTTGATTGCAAAGATATGGTAAGCGATGTTCTCATGCTCCTACATCTTTCAATGCCCCTATCGAGTGTGAGTGATGGGTAGAGCTACCAAAGAGTCTGGCATGCGCTCATATCATTTCCTTTTGGGTCTGTAGTGCACTAGCCATACACTTTGTGGTGGGGTCGGTCAGTCTTTTGGTAGTGGACGTTTGGACTAATGAAAAGAAGCTGATGTATGTGTGTTAAGTCTGCACAAATGGTTGACACAATTTAAAAGAATGTTCAGATGGAAGATGATGTTGACGGTGAATGGTGGTGCTATTTCTTGTCTATTTTTCCAAAGCGGCAACGGATGTTTTAGTCAATGGAGGCGAAGCGTGTATTAATCTGGTTGCTAGTGGGAGCGTGCTCCTTATGTGCTTTACTTTTCTGTCTGCAAGTCATAGTCTTGATAAGAACCTGCCCTCTTAAAGTTTTTAGCCTCTTGTATTATTGGTTCACTCATGAAACTATATATATCATCTGTGCTGACTTAACATGTGTTAAGGATTTGTACTGCCAAAAAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||