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Oryza sativa
cluster # 7060 cluster # 7060       Sequences # 4       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7060#0 length = 805 sequences # 4  
consensusID : consensus_7060#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 805
fasta sequence 
                              [TCTGTCGGGAGGGCGCTAACTCAAAAGCTAAAAGAGCTTATACCTCGGCAAATGTTTAGAGTCCCTATTCAAGCATGTATAGGTGCAAAGGTCATTGCAAGTGAAGCACTATCA-CCATCAGGAAGGATGTCTTGTCAAAATGCTATGGGGGTGATATATCGAGGAAAAAGAAATTGCTGAAGAAACAGGCTGAGGGAAAGAAGAGAATGAAAGCAATAGGAAGGGTTGATGTTCCTCAAGAGGCATTTATGGCTGTGTTGAAACTAGAAAAGGAGGTGCTATGAAACAGCTTTGCAATCAGCACAAGTCTATCGTTTGTGTAAAGACCTCTGTTTGGCCTCAACTGAATCTAATTCATTTGAGAGGAAGCATAGTTTGTTTTCAGCTGGGCCAGAGGAACCAATTGACAACATATCCATGTCGGAAAGTAAGGAGCTAATCTGACATGCACTAATTTTGTTCCATATGTCAGGCTACGAAGCCCCAAAAATGATGTGGTCACACAGCTCTGCCAGACATTTCTGCGATCTTCTTATACCAAATAGAGTAGTACGCATTTTGTTTGGTTATCGTTAATTCCCGTCACTGAGTTTGTATCAGAAAAGGTTATTCTGTAATTTAATTACTTGTAATGCTAAGTACTCTTAAATTGTATGTGATATGGACAAGGAACAAGAGTGTAGTACACAAGAGAAAAGAAATGGTCAGCTTAATCAGAAAAAGGTATTGTAAAATGGAATAAAATTAAGGTCAAGTTACTGAATATAATATA-C-GCAGATGAGT--ACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[-] EMBL CB635644             [TCTGTCGGGAGGGCGCTAACTCAAAAGCTAAAAGAGCTTATACCTCGGCAAATGTTTAGAGTCCCTATTCAAGCATGTATAGGTGCAAAGGTCATTGCAAGTGAAGCACTATCAGCCATCAGGAAGGATGTCTTGTCAAAATGCTATGGGGGTGATATATCGAGGAAAAAGAAATTGCTGAAGAAACAGGCTGAGGGAAAGAAGAGAATGAAAGCAATAGGAAGGGTTGATGTTCCTCAAGAGGCATTTATGGCTGTGTTGAAACTAGAAAAGGAGGTGCTATGAAACAGCTTTGCAATCAGCACAAGTCTATCGTTTGTGTAAAGACCTCTGTTTGCCAAAAAATGAATCTAATTCATTTGAGAGAAAGCATAGTTTGTTTTCAGCTGGGCCAGAGGAACCAATTGACAACATATCCATGTCGGAAAGTAAGGAGCTAATCTGACATGCACTAATTTTGTTCCATATGTCAGGCTATGAAGCCCCAAAAATGATGTGGTCACACAGCTCTGCCAGACATTTCTGCGATCTTCTTATACCAAATAGAGTAGTACGCATTTTGTTAAAATATCGTTAATTCCTTTCAgaaaaattt                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CB671436             [                                                                                               TGCAAGGGAGGCACTATCACCCATCAGGAAGGATGTCTTGTCAAAATGTTATGGGGGTGATATATCGAGGAAAAAGAAATTGCTGAAGAAACAGGGTGAGGGAAAGAAGAGAATGAAAGCAATAGGAAGGGTTGATGTTCCTCAAGAGGCATTTATGGCTGTGTTGAAACTAGAAAAGGAGGTGCTATGAAACAGCTTTGCAATCAGCACAAGTCTATCGTTTGTGTAAAGACCTCTGTTTGGCCTCAACTGAATCTAATTCATTTGAGAGGAAGCATAGTTTGTTTTCAGCTGGGCCAGAGGAACCAATTGACAACATATCCATGTCGGAAAGTAAGGAGCTAATCTGACATGCACTAATTTTGTTCCATATGTCAGGCTAGGAAGCCCCAAAAATGATGTGGTCACACAGCTCTGCCAGACATTTTTGCGATCTTCTTATACCAAATAGAGTAGTACGCATTTTGTTTGGTTATCGTTAATTCCCGTCACTGAGTTTGTATCAGAAAAGGTTATTCTGTAATTTAATTACTTGTAATGCTAAGTACTCTTAAATTGTATGTGATATGGACAAGGAACAAGAGTGTAGTACACAAGAGAAAAGAAATGGTCAGCTTAATCAGAAAAAGGTATTGTAAAATGGAATAAAATTAAGGTCAATTTAagga                                               ]
[+] EMBL BI805581             [                                                                                                               TCA CCATCA GAA GATGTCTTGTCCAAATGCTATGGGGGTGATATATCGAGG AAAAG AATTGCTGAAGAAACAGCCTGAGGGAAAGAAGAGAATGAAA CCATAGGAAGGGTTGATGTTCCTCAAGAGCCATTTAT GCTGTGTTGAAACTAGAAAAGGAGGTGCTATGAAACAGCTTTGCCATCAGCACAAGTCTATCGTTTGTGTAAAGACCTCTGTTTGGCCTCAACTGAATCTAATTCATTTGAGAGGAAGCATAGTTTGTTTTCAGCTGGGCCAGAGGAACC ATTGAC ACATATCCATGTCGGAAAGTAAGGAGCTAATCTGACATGCACTAATTTTGTTCCATATGTCAGGCTACGAAGCCCC AAAATGATGTGGTCACACAGCTCTGCCAGACATTTCTGCGATCTTCTTATACC AATAGAGTAGTACGCATTTTGTTTGGTTATCGTTAATTCCCGTCACTGAGTTTGTATCAGAAAAGGTTATTCTGTAATTTAATTACTTGTAATGCTAAGTACTCTTAAATTGTATGTGATATGGACAAGGAAC AGAGTGTAGTACAC AGAGAAAAGAAATGGTCAGCTTAATCAGAAAAAGGTATTGTAAAATGGAATAAAATTAAGGTCAAGTTACTGAATATAATATA C GCAGATGAGT  ACAAAAAAAAAA          ]
[-] EMBL CA760043             [                                                                                                                                           AATGCTATGGGGGTGATATATCGAGGAAAAAGAAATTGCTGAAGAAACAGGCTGAGGGAAAGAAGAGAATGAAAGCAATTGGAAGGGTTGATGTTCCTCAAGAGGCATTTATGGCTGTGTTGAGACTAGAAAAGGAGGTGCTATGAAACAGCTTTGCAATCAGCACAAGTCTATCGTTTGTGTAAAGACCTCTGTTTGGCCTCAACTGAATCTAATTCATTTGAGAGGAAGCATAGTTTGTTTTCAGCTGGGCCAGAGGAACCAATTGACAACATATCCATGTCGGAAAGTAAGGAGCTAATCTGACATGCCCTAATTTTGTTCCATATGTCAGGCTACGAAGCCCCAAAAATGATGTGGTCACACAGCTCTGCCAGACATTTTTGCGATCTTTTTATACCAAATAGAGTAGTACGCATTTTGTTTGGTTATCGTTAATTCCCGTCCCTGAGTTTGTATCAGAAAAGGTTATTCTGTAATTTAATTACTTGTAATGCTAAGTACTCTTAAATTGTATGTGATATGGCCAAGGAACAAGAGTGTAGTACCCAAGAGAAAAGAAATGGTCAGCTTAATCAG AAAAGGTATTGTAAAATGGAATAAAATTAAGGTCAAGTTACTGAATATAATATAGCGGCAGATGAGTTCACCAGAAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_7060#0
TCTGTCGGGAGGGCGCTAACTCAAAAGCTAAAAGAGCTTATACCTCGGCAAATGTTTAGA
GTCCCTATTCAAGCATGTATAGGTGCAAAGGTCATTGCAAGTGAAGCACTATCACCATCA
GGAAGGATGTCTTGTCAAAATGCTATGGGGGTGATATATCGAGGAAAAAGAAATTGCTGA
AGAAACAGGCTGAGGGAAAGAAGAGAATGAAAGCAATAGGAAGGGTTGATGTTCCTCAAG
AGGCATTTATGGCTGTGTTGAAACTAGAAAAGGAGGTGCTATGAAACAGCTTTGCAATCA
GCACAAGTCTATCGTTTGTGTAAAGACCTCTGTTTGGCCTCAACTGAATCTAATTCATTT
GAGAGGAAGCATAGTTTGTTTTCAGCTGGGCCAGAGGAACCAATTGACAACATATCCATG
TCGGAAAGTAAGGAGCTAATCTGACATGCACTAATTTTGTTCCATATGTCAGGCTACGAA
GCCCCAAAAATGATGTGGTCACACAGCTCTGCCAGACATTTCTGCGATCTTCTTATACCA
AATAGAGTAGTACGCATTTTGTTTGGTTATCGTTAATTCCCGTCACTGAGTTTGTATCAG
AAAAGGTTATTCTGTAATTTAATTACTTGTAATGCTAAGTACTCTTAAATTGTATGTGAT
ATGGACAAGGAACAAGAGTGTAGTACACAAGAGAAAAGAAATGGTCAGCTTAATCAGAAA
AAGGTATTGTAAAATGGAATAAAATTAAGGTCAAGTTACTGAATATAATATACGCAGATG
AGTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)