cluster # 7090

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Oryza sativa
cluster # 7090 cluster # 7090 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_7090#0 length = 1210 sequences # 4
consensusID : consensus_7090#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1210
fasta sequence
                              [TTCTTTTTTTTTTAGAAATCCTAATTATTCTTGATTTTGGATTGAAAAGGATGTTATGGATTGAATGTGTAAAAGAA-CAGTATATTGATAAAGAGACTGTATCCCAAAGTCAAAAGAGC-ATTGGCCTGC-AAAATAAAGGATTTGTTCTCTTTTGTAATTAGAAC-AACATAAACAAATTGGATAGAAAAGGAGCGGAAAAAGATCCGTGGATTAGACTCCTTTTCTTCCCCAGGGGTTTGTATTAAAAAATGCAACACCCTGTTCTGACCATATTGTACTATGTATCACCATTTGATAAACCGAGAAATATTTCTCTCTCTCTGATTCAAGTAGAAATACAAATGGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAACAAGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCATCCTAACCAAGATCGATTATTGGATTACAACAATTTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAAAAAAAAAACTACCAAAGTTTCAGAATTTACGATCTATTCATTCAATATTTCCTTTTTCAGAAGACAAATTTTTGCACTTACATTATCTAGCACATATAGAAATACCCTATCCTATCCATTTGGATATCTTGCTTCAACTCCTTCAATACCGGATCCAAGATGTTCCATCCTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTCAACTACTACTCGAATTGGAATAGTTTTATTACTTCAATGAAATCCATTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATAAAAGACTATTTCGGNTCCTATATAACTCTTATGTATCAGAATATGAATTTTTCTTGGTGGTTCTTCGGAAACAATCTTCTTGCTTGCGATNACTTCTTCCGGAACCTTTCTGGAACGAATCATCNTTTCTAGGAAGATGGACATTTTGGGTTAAGNACCCCTGCTTTTTCGGANACATATGGGTCGTTTGGGTNCCCTTATGCNTATGGTCGATATCAAGGAAGGCANTCTGCTCAAAGGGACT]

[+] EMBL BI801974             [TTCTTTTTTTTTTAGAAATCCTAATTATTCTTGATTTTGGATTGAAAAGGATGTTATGGATTGAATGTGTAAAAGAA CAGTATATTGATAAAGAGACTGTATCCCAAAGTCAAAAGAGC ATTGGCCTGC AAAATAAAGGATTTGTTCTCTTTTGTAATTAGAAC AACATAAACAAAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CA763499             [                                                   TGTTATGGATTGAATGTGTAAAAGAAGCAGTATATTGATAAAGAGACTGTATCCCAAAGTCAAAAGAGCAATTGGCCTGCAAAAATAAAGGATTTGTTCTCTTTTGTAATTAGAACAAACATAAACAAATTGGATAGAAAAGGAGCGGAAAAAGATCCGTGGATTAGACTCCTTTTCTTCCCCAGGGGTTTGTATTAAAAAATGCAACACCCTGTTCTGACCATATTGTACTATGTATCACCATTTGATAAACCGAGAAATATTTCTCTCTCTCTGATTCAAGTAGAAATACAAATGGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAACAAGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCATCCTAACCAAGATCGATTATTGGATTACAACAA TTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAAAAAAAAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI799271             [                                                                                                                                                                              AACAAATTGGATAGAAAAGGAGCGGAAAAAGATCCGTGGATTAGACTCCTTTTCTTCCCCAGGGGTTTGTATTAAAAAATGCAACACCCTGTTCTGACCATATTGTACTATGTATCACCATTTGATAAACCGAGAAATATTTCTCTCTCTCTGATTCAAGTAGAAATACAAATGGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAAC AGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCATCCTAACC AGATCGATTATTGGATTAC ACCATTTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CA766330             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGAAAAATTCGAGGGTTATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGTACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTGGTTCTAATAACAAGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATCAGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCGTCCTAACCAAGATCGATTATTGGATTACAACAATTTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTGTAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAGAAAAAGAAATACCAAAGTTTCAGAATTTACGATCTATTCATTCAATATTTCCTTTTTCAGAAGACAAATTTTTGCACTTACATTATCTAGCACATATAGAAATACCCTATCCTATCCATTTGGATATCTTGCTTCAACTCCTTCAATACCGGATCCAAGATGTTCCATCCTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTCAACTACTACTCGAATTGGAATAGTTTTATTACTTCAATGAAATCCATTTTTATTTTGAAAAAAGAAAATAAAAGACTATTTCGGNTCCTATATAACTCTTATGTATCAGAATATGAATTTTTCTTGGTGGTTCTTCGGAAACAATCTTCTTGCTTGCGATNACTTCTTCCGGAACCTTTCTGGAACGAATCATCNTTTCTAGGAAGATGGACATTTTGGGTTAAGNACCCCTGCTTTTTCGGANACATATGGGTCGTTTGGGTNCCCTTATGCNTATGGTCGATATCAAGGAAGGCANTCTGCTCAAAGGGACT]




>consensus_7090#0
TTCTTTTTTTTTTAGAAATCCTAATTATTCTTGATTTTGGATTGAAAAGGATGTTATGGA
TTGAATGTGTAAAAGAACAGTATATTGATAAAGAGACTGTATCCCAAAGTCAAAAGAGCA
TTGGCCTGCAAAATAAAGGATTTGTTCTCTTTTGTAATTAGAACAACATAAACAAATTGG
ATAGAAAAGGAGCGGAAAAAGATCCGTGGATTAGACTCCTTTTCTTCCCCAGGGGTTTGT
ATTAAAAAATGCAACACCCTGTTCTGACCATATTGTACTATGTATCACCATTTGATAAAC
CGAGAAATATTTCTCTCTCTCTGATTCAAGTAGAAATACAAATGGAAAAATTCGAGGGTT
ATTCAGAAAAACTTAAATTTCCTAGACAATATTTCGTCTACCCACTACTCTTTCAGGAGT
ACATTTATGTGTTTGCCCATGATTATGGATTAAATGGTTCCGAACTTGTCGAAATTATTG
GTTCTAATAACAAGAAATTTAGTTCACTACTTGTGAAACGGTTAATGATTCGAATGTATC
AGCAGAATTTTTGGATTAATTTGGTTAATCATCCTAACCAAGATCGATTATTGGATTACA
ACAATTTTTTTTATTCTGAGTTTTATTCTCAGATTCTATCTGAGGGGTTTGCGATCGTTG
TAGAAATCCCATTCTCGCTACGAGAACAGTCTTGTCCGGAAAAAAAAAAACTACCAAAGT
TTCAGAATTTACGATCTATTCATTCAATATTTCCTTTTTCAGAAGACAAATTTTTGCACT
TACATTATCTAGCACATATAGAAATACCCTATCCTATCCATTTGGATATCTTGCTTCAAC
TCCTTCAATACCGGATCCAAGATGTTCCATCCTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTCAACT
ACTACTCGAATTGGAATAGTTTTATTACTTCAATGAAATCCATTTTTATTTTGAAAAAAG
AAAATAAAAGACTATTTCGGNTCCTATATAACTCTTATGTATCAGAATATGAATTTTTCT
TGGTGGTTCTTCGGAAACAATCTTCTTGCTTGCGATNACTTCTTCCGGAACCTTTCTGGA
ACGAATCATCNTTTCTAGGAAGATGGACATTTTGGGTTAAGNACCCCTGCTTTTTCGGAN
ACATATGGGTCGTTTGGGTNCCCTTATGCNTATGGTCGATATCAAGGAAGGCANTCTGCT
CAAAGGGACT
clustalw multiple alignements is not computed in this case