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Oryza sativa
cluster # 7127 cluster # 7127       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7127#0 length = 821 sequences # 4  

consensusID : consensus_7127#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 821
fasta sequence
                              [AGCTATAGCTAGTATATATCTGACAAATTCAGAGAAATTCAGAGAGTCACCGCGAGAGCTTAAGCTAGCTAGCTAGCCGGCCATGGCATCGCATGTGGACCCGCTGGTGGTGGGGAGGGTGATCGGCGACGTGGTGGACCTGTTCGTGCCGACGACGGCCATGTCGGTGCGGTTCGGGACCAAGGACCTCACCAACGGCTGCGAGATCAAGCCGTCCGTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCGTGCAGATCGCCGGCAGGGTC-AACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGAGCCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACTGGCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAAC-AGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGTGCCGTACATGGGGCCACGGCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCTGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCATCCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA]

[+] EMBL AK107056             [AGCTATAGCTAGTATATATCTGACAAATTCAGAGAAATTCAGAGAGTCACCGCGAGAGCTTAAGCTAGCTAGCTAGCCGGCCATGGCATCGCATGTGGACCCGCTGGTGGTGGGGAGGGTGATCGGCGACGTGGTGGACCTGTTCGTGCCGACGACGGCCATGTCGGTGCGGTTCGGGACCAAGGACCTCACCAACGGCTGCGAGATCAAGCCGTCCGTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCGTGCAGATCGCCGGCAGGGTC AACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGAGCCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACTGGCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAAC AGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGTGCCGTACATGGGGCCACGGCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCTGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCATCCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCG                                                      ]
[+] EMBL BI801968             [                                                                                                                                                                                                                                                          cGCAGGTTCAAACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGA CCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACT GCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAACAAGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGT CCGTACATGGGGCCAC GCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCGGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCAACCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTC CCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTAaaaaaaaaa                                     ]
[+] EMBL BI804369             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGCCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA]
[+] EMBL BI803120             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA]


>consensus_7127#0 AGCTATAGCTAGTATATATCTGACAAATTCAGAGAAATTCAGAGAGTCACCGCGAGAGCT TAAGCTAGCTAGCTAGCCGGCCATGGCATCGCATGTGGACCCGCTGGTGGTGGGGAGGGT GATCGGCGACGTGGTGGACCTGTTCGTGCCGACGACGGCCATGTCGGTGCGGTTCGGGAC CAAGGACCTCACCAACGGCTGCGAGATCAAGCCGTCCGTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCGT GCAGATCGCCGGCAGGGTCAACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCC TAGCCCCAGCGAGCCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACTGGCTGGTGGTTAACATACCAGG TGGAACAGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGTGCCGTACATGGGGCCACGGCCGCCGGT GGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCTGCGCCGCC GCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGA CCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCATCCGCCG CCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGG CGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATC ATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACT GTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)