These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7127#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 821 fasta sequence [AGCTATAGCTAGTATATATCTGACAAATTCAGAGAAATTCAGAGAGTCACCGCGAGAGCTTAAGCTAGCTAGCTAGCCGGCCATGGCATCGCATGTGGACCCGCTGGTGGTGGGGAGGGTGATCGGCGACGTGGTGGACCTGTTCGTGCCGACGACGGCCATGTCGGTGCGGTTCGGGACCAAGGACCTCACCAACGGCTGCGAGATCAAGCCGTCCGTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCGTGCAGATCGCCGGCAGGGTC-AACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGAGCCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACTGGCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAAC-AGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGTGCCGTACATGGGGCCACGGCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCTGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCATCCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA] [+] EMBL AK107056 [AGCTATAGCTAGTATATATCTGACAAATTCAGAGAAATTCAGAGAGTCACCGCGAGAGCTTAAGCTAGCTAGCTAGCCGGCCATGGCATCGCATGTGGACCCGCTGGTGGTGGGGAGGGTGATCGGCGACGTGGTGGACCTGTTCGTGCCGACGACGGCCATGTCGGTGCGGTTCGGGACCAAGGACCTCACCAACGGCTGCGAGATCAAGCCGTCCGTCGCCGCCGCGCCGCCCGCCGTGCAGATCGCCGGCAGGGTC AACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGAGCCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACTGGCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAAC AGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGTGCCGTACATGGGGCCACGGCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCTGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCATCCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCG ] [+] EMBL BI801968 [ cGCAGGTTCAAACGAGCTCTTCGCTCTGGTCATGACTGATCCAGATGCTCCTAGCCCCAGCGA CCGACTATGAGAGAGTGGCTTCACT GCTGGTGGTTAACATACCAGGTGGAACAAGATCCTTCTCAAGGGGATGTGGTGGT CCGTACATGGGGCCAC GCCGCCGGTGGGGATCCACCGCTACGTGATGGTGCTGTTCCAGCAGAAGGCGCGCGTGGCGGCGCCGCCGCCCGACGAGGACGCCGCGCGCGCCAGGTTCAGCACGCGCGCCTTCGCCGACCGCCACGACCTCGGCCTCCCCGTCGCCGCCCTCTACTTCAACGCCCAGAAGGAGCCCGCCAACCGCCGCCGCCGCTACTAGCCTCCCTCCCCTCGCTCGGCGTCGCCCATCCATCCATCCATGGACGGCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTC CCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTAaaaaaaaaa ] [+] EMBL BI804369 [ GCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGCCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA] [+] EMBL BI803120 [ GCGACGGCGACCTAGCTAGCTAATAAGCCATCGGTCGGCCATGCTCGCCGTCCAAACTATCATGCACCATATCATGTCGTCGTTTATGTGGTTAATTAATTATTTCCGGCGTTTTATTACTGTGTGGTGATTAATTAGCTGAACTATTGTTTTGATGAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||