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Oryza sativa
cluster # 7182 cluster # 7182       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7182#0 length = 4390 sequences # 4  

consensusID : consensus_7182#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 4390
fasta sequence
                              [GCGCACATAGAATTGTGCTAAACCCACCGCTGTCCGCTCTCGGCTTTTCTCATCTTACCGTAGGCCAATTCTCTTCCTTATATATAATTTTTACGCGATTTGACATCANGAGGATGGAGCAATTTGGCATCAGGCTTCCACGGCGAGGCCAATCTGCATCACCTGCCCGCTCGATCCCTGAAAATCTTCTTCCGTTTCCCTCTGGAGATTGCTGACAGCGAGGCTGCGGAAGCAGGCGAGGGGTTCAGGGCTGGTGACTGGTGAGATCGATCTCTCATCTCTCCGTCTTGCTATCTTTCTCCCTATCTCTAAGTCGATCATTCCTGTAAATTGTATTGCTGGTAGGCTTTTCTTGTTACCTTTGCTGTTAAAGCCATTTAGGATTTTTCTATTGCCTGTGACCTGTTTGTGGAAATGCCTCAAAAAGATATCACAGCTCACAGGGGCAGGATTCTAGGTTCCCAGGTGAAAAGCAACATGGAAGAGGGAGGAGGATGAATCTGAGTTTTTTTAGAGTATTTCTTTTTTTGTATTTGTAATTGGAGAATTTAGATTATTTACCACCTAATTCTCTTGTAATTGAGGCATTCATTTTCTAAATCATATTTTCTTTTGGCTAACTGCACTATGAGCACCTGCAAACACCAAAAGGTATACTATTAGAGCATGATTTTCATACATATATAACAGAAGTTTCAGTAAAGCTCTACTGTAATCAGATTCTGCTTTATTGAATTGCAATTTCTGGTTTAGTGATACAGGATTTTAGGTGACTATGCAATAAGGAAATTCGTGCCCTTGTGTGCGTTTGGGGGCTGATGTTTACAAAATAATAATCACTATGTTGAGGATGTTAAATGGAACTTGTTTGCTCTTTATATTTAGCATTGTCTTGCACTATGTCTCTTAAGGGTTATATTATACGAGTTACATCATCCAGAATTGGACTAGAAGTAGAACTTCATATTTGGAAGTGGAATTACCAGTCTAATTCGGATCATAATATAACAGTCATCATCCCCTAACAAATTTTGACCACTAGCAGCTACATGGCACAGGTAACAGGTAATTTAGTTCATAGTATATATTTGCCATAAGGCATGCAGATAGGGACTAAGCCCAGATCAATTGGTGAGAGGTGTGGATGTACACCACCATCACCAAAGTTCAGAAACCTCTTGGACTCAACTTGGGTCTCTATTTCTTCTCTATTAATTTGATACCAAGTTCCTTTTTAGTATTTGTTTTTGTGTCAATCAATTAATCTTCACAAATATAACGCAAGTGTTCTTGAATCTTATATAATATCTTTTTCTATGAAATCACCCATTTCTAACAAAAGTTCACTATTTAGCCTTAAAAGTCATGTGCTGATTCATTTTCCTTCCTTATCGAGTGGCCTATATTGTATGGCATCCACAGGTCTGTCACATATTTTACTTTTTTTCAGAAGGCTCAGTTCTTACAACTATGGCCGAAGTACTTCTGTCAAGTTTTGCCGTGTCAATTATTGGAAAAATAATTTTGTTTGTTAGTGAACACGGTTTGATGGGGATTAAATCAGACAGGAGTGTGCATCAAGAACTGGGGAAGCTACAGAATTCGTTGCAAGCTATTAGTGGAGTTCTTCTAGACGCAGAGAGGAAGCAGAGTACTTCTAGTGCACTCAAGGAATGGCTGCGAAAACTGAAAGATGTCATGTATGACATAGATGACATTTTGGACGATGCGTCAACTGAAACTTTGAAGCGCAGAGTTAGCAAAGATGTGGTTACTCAAACCAATTGTGTACATATTTCTCGATTGAAATTGAGAAGAAAATTGCTCAAAAGGAAGAAGAAATGGAGCAGCAGAATAAGAGAAGTTCATGAAAAGCTTAACGAAATAGCCGCTAGTAAAAAGGACTTTGGACTGACCGATTGGACAGTGGGTGGTCAGTGTTCTGAAGAACCAGAAAGAGAATCATATTCTTTTGTGTATCAACCTGATATAATTGGAAGGGATGATGCTAGAGATGAGATTGTTAGTAAGATACTAAGAGCAGCAGAACATCATGATATTTTTGTGCTTCCTCTGCTTGGGCTTGGAGGCATTGGGAAAACTGAACTAGCAAATATGGTGTATCATGATCAACAAATCAGGGAGAGGTTCAGCAAGATGATGTGGGCCTGTGTCTCTAATAAATTTAATCTGAAAAATATACTACAAGATATAATCGAGTCTGCCAGTGGTGAGAGTTGCAAGCATCTAAACTTGGAACATTTACAAAATAAGCTCAGGGGAATTCTGCAGAATGGAAATTATTTCCTGGTATTGGATGATCTGTGGACTCGTGATGTAAATGAATGGAGAGAGCTGAGGAATTTGTTGTCAAGTGGTGCAAGGGGTAGTGTGATAATTGTTACTACACGCGAAAATGTTGTTGCATCTATGGTTGGTACCTCAGACCCGTACAAGGTGGGTGCACTCCCTTTTCATGAGTGCATGCAAATTTTTACCAGAGTTGCATTCAGACAAGGTGAGGAAAATAAATATCCGTGGTTGTTGAAAATTGGAGAGTCCATTGTGAAGAAGTGTGCTGGAGTACCACTGGCAATAAAATCATTGGGTTCTCTACTATTTACCATGCGTGATGAAACTCAATGGCTACGTGTTAAAGAAGACCACTTGTGCAAAATTGTACAAGGTGACAGAGATATAATGCCAGTGCTAAAGTTAAGTTACAATGCTCTTCCAGCTGCCCTTAAACCATGTCTTTCCTATTTATCCATATTTCCTAAGGACTTCGAATATTACAGAAGATGCATAATCATGTTTTGGATGGCACATGGGCTACTGAACTCGAACAAATTGAGTGAAGAAATAGATGTTGGTAATCAGTACATTATTGAATTGATAGGAAGTTCCCTTTTTCAAGACTCTCTAATTACTTTTGATGGAAGCATGCCACATTGCAAGTTACATGACATTGTACATGATCTTGGTAGATATGTTTTGGACACAGACCTAGCTGTTGTGAACTGTGAAGGGCAACAAGTCTCAGAAACAGTCAGGCATCTAGTATGGGACCTTAAGGATTTCACACACGAGCAAGAATTTCCCAGGCATTTAATCAAAGCAAGAAAAGCTCGAACTTTTATTAGTTCGTGTAATCATGGTTCTTTAAGCAAAAAATTTCTGGAAGTGCTGCTGTCCAAGTTATTGCTTCTACGTGTATTGATTATATCCGGAGTTAGAATTGACGAACTCCCAGATTCAATTGGAAATTTGAAGCACTTGAGGTATCTTTACCTCACCTGGAACAAAACCATAAAATACCTTCCCAATTCCCTATGCAAGCTCATAAACCTTCAGACACTTGATCTTTATCGAAGTGACCAACTAATCGAGTTGCCGAGAGATGTAAACAAGTTAATCAGCCTCAGGTACCTGAGTTTGACATCGAAGCAAAAGCAGTTGCCAGAAGCAGGACTTCGTGGCTGGGCTTCACTAACATCCCTGCAGCTTCACTCATGTAGTGAACTAACATCACTGTCAGAAGGGATTGGCTCGTTGACTGCCCTACAGATGCTGTGGATCAGTGATTGCCCAAAGCTTCCTTCTCTCCCAGCCAGCATGACACACCTCTCCAGTCTGCGAGAGCTGTTCATCGACAATTGCCCGGAGCTGGATTTGATGCATCCAGAGGAGGCCATGGATGGGCTATGGAGTCTTCGATCATTGCAGATCATTGGACTTCCAAAGCTAGAGCGTCTTCCTGACACTCTTTGTTCTGCCTCGGGTTCTCTTCGGTATTTATTGATTGAGCAATGCCCCAATCTAAGGGAGCTTCCAAGCTTCATGCAAGATCTCACTAACCATCAGAGGCAGGGGGGTATTCATTAAGGATTTCCCGAGCATAATTATATAAAGGGATGACAATTAGTTGATTACTATCTCCCCATAAAATCTTCATGGAGGTATAGAGCTTATGCTAAAAGAAAAGCCCCACAGGAAGTGAAATAGGTATGTATGGAAGTATAGCAACCAGTGAAGCTAAGAAATCCCTTTTAGGCACCAATTCAATGGATTTCCTTTTGTTGCAGAGAGGACCAAAGTACACACTAGCTGGGATGAAAAACAATAACTGAGACTGCTCATAATTTGTTAACCGAATAGGCCACAAGTTTGAATTACGATGCTCATTAGGGTGATTGTAAGGTTGCTCTTTTTGAAATGTATAGTGATGCTCTGAATACCATGTCCCTGTTTCTAAATTGTAATGATGCATTTCAAATGTGCCATGTCTAATTCAGTTTATGTTTTTCACATGTTTAATTATTTCAGACCTTAATTGAACTTATATGGTCGTTCGAAGTCCTGTTTGTATAGAAATTNCAGTTTAATTCCA]

[+] EMBL CA766718             [GCGCACATAGAATTGTGCTAAACCCACCGCTGTCCGCTCTCGGCTTTTCTCATCTTACCGTAGGCCAATTCTCTTCCTTATATATAATTTTTACGCGATTTGACATCANGAGGATGGAGCAATTTGGCATCAGGCTTCCACGGCGAGGCCAATCTGCATCACCTGCCCGCTCGATCCCTGAAAATCTTCTTCCGTTTCCCTCTGGAGATTGCTGACAGCGAGGCTGCGGAAGCAGGCGAGGGGTTCAGGGCTGGTGACTGGTGAGATCGATCTCTCATCTCTCCGTCTTGCTATCTTTCTCCCTATCTCTAAGTCGATCATTCCTGTAAATTGTATTGCTGGTAGGCTTTTCTTGTTACCTTTGCTGTTAAAGCCATTTAGGATTTTTCTATTGCCTGTGACCTGTTTGTGGAAATGCCTCAAAAAGATATCACAGCTCACAGGGGCAGGATTCTAGGTTCCCAGGTGAAAAGCAACATGGAAGAGGGAGGAGGATGAATCTGAGTTTTTTTAGAGTATTTCTTTTTTTGTATTTGTAATTGGAGAATTTAGATTATTTACCACCTAATTCTCTTGTAATTGAGGCATTCATTTTCTAAATCATATTTTCTTTTGGCTAACTGCACTATGAGCACCTGCAAACACCAAAAGGTATACTATTAGAGCATGATTTTCATACATATATAACAGAAGTTTCAGTAAAGCTCTACTGTAATCAGATTCTGCTTTATTGAATTGCAATTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
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[+] EMBL CA764622             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATGCCCCAATCTAAGGGAGCTTCCAAGCTTCATGCAAGATCTCACTAACCATCAGAGGCAGGGGGGTATTCATTAAGGATTTCCCGAGCATAATTATATAAAGGGATGACAATTAGTTGATTACTATCTCCCCATAAAATCTTCATGGAGGTATAGAGCTTATGCTAAAAGAAAAGCCCCACAGGAAGTGAAATAGGTATGTATGGAAGTATAGCAACCAGTGAAGCTAAGAAATCCCTTTTAGGCACCAATTCAACGGATTTCCTTTTGTTGCAGAGAGGACCAAAGTACACACTAGCTGGGATGAAAAACAATAACTGAGACTGCTCATAATTTGTTAACCGAATAGGCCACAAGTTTGAATTACGATGCTCATTAGGGTGATTGTAAGGTTGCTCTTTTTGAAATGTATAGTGATGCTCTGAATACCATGTCCCTGTTTCTAAATTGTAATGATGCATTTCAAATGTGCCATGTCTAATTCAGTTTATGTTTTTCACATGTTTAATTATTTCAGACCTTAATTGAACTTATA                                              ]
[+] EMBL AU069289             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GGCCACAAGTTTGAATTACGATGCTCATTAGGGTGATTGTAAGGTTGCTCTTTTTGAAATGTATAGTGATGCTCTGAATACCATGTCCCTGTTTCTAAATTGTAATGATGCATTTCAAATGTGCCATGTCTAATTCAGTTTATGTTTTTCACATGTTTAATTATTTCAGACCTTAATTGAACTTATATGGTCGTTCGAAGTCCTGTTTGTATAGAAATTNCAGTTTAATTCCA]


>consensus_7182#0 GCGCACATAGAATTGTGCTAAACCCACCGCTGTCCGCTCTCGGCTTTTCTCATCTTACCG TAGGCCAATTCTCTTCCTTATATATAATTTTTACGCGATTTGACATCANGAGGATGGAGC AATTTGGCATCAGGCTTCCACGGCGAGGCCAATCTGCATCACCTGCCCGCTCGATCCCTG AAAATCTTCTTCCGTTTCCCTCTGGAGATTGCTGACAGCGAGGCTGCGGAAGCAGGCGAG GGGTTCAGGGCTGGTGACTGGTGAGATCGATCTCTCATCTCTCCGTCTTGCTATCTTTCT CCCTATCTCTAAGTCGATCATTCCTGTAAATTGTATTGCTGGTAGGCTTTTCTTGTTACC TTTGCTGTTAAAGCCATTTAGGATTTTTCTATTGCCTGTGACCTGTTTGTGGAAATGCCT CAAAAAGATATCACAGCTCACAGGGGCAGGATTCTAGGTTCCCAGGTGAAAAGCAACATG GAAGAGGGAGGAGGATGAATCTGAGTTTTTTTAGAGTATTTCTTTTTTTGTATTTGTAAT TGGAGAATTTAGATTATTTACCACCTAATTCTCTTGTAATTGAGGCATTCATTTTCTAAA TCATATTTTCTTTTGGCTAACTGCACTATGAGCACCTGCAAACACCAAAAGGTATACTAT TAGAGCATGATTTTCATACATATATAACAGAAGTTTCAGTAAAGCTCTACTGTAATCAGA TTCTGCTTTATTGAATTGCAATTTCTGGTTTAGTGATACAGGATTTTAGGTGACTATGCA ATAAGGAAATTCGTGCCCTTGTGTGCGTTTGGGGGCTGATGTTTACAAAATAATAATCAC TATGTTGAGGATGTTAAATGGAACTTGTTTGCTCTTTATATTTAGCATTGTCTTGCACTA TGTCTCTTAAGGGTTATATTATACGAGTTACATCATCCAGAATTGGACTAGAAGTAGAAC TTCATATTTGGAAGTGGAATTACCAGTCTAATTCGGATCATAATATAACAGTCATCATCC CCTAACAAATTTTGACCACTAGCAGCTACATGGCACAGGTAACAGGTAATTTAGTTCATA GTATATATTTGCCATAAGGCATGCAGATAGGGACTAAGCCCAGATCAATTGGTGAGAGGT GTGGATGTACACCACCATCACCAAAGTTCAGAAACCTCTTGGACTCAACTTGGGTCTCTA TTTCTTCTCTATTAATTTGATACCAAGTTCCTTTTTAGTATTTGTTTTTGTGTCAATCAA TTAATCTTCACAAATATAACGCAAGTGTTCTTGAATCTTATATAATATCTTTTTCTATGA AATCACCCATTTCTAACAAAAGTTCACTATTTAGCCTTAAAAGTCATGTGCTGATTCATT TTCCTTCCTTATCGAGTGGCCTATATTGTATGGCATCCACAGGTCTGTCACATATTTTAC TTTTTTTCAGAAGGCTCAGTTCTTACAACTATGGCCGAAGTACTTCTGTCAAGTTTTGCC GTGTCAATTATTGGAAAAATAATTTTGTTTGTTAGTGAACACGGTTTGATGGGGATTAAA TCAGACAGGAGTGTGCATCAAGAACTGGGGAAGCTACAGAATTCGTTGCAAGCTATTAGT GGAGTTCTTCTAGACGCAGAGAGGAAGCAGAGTACTTCTAGTGCACTCAAGGAATGGCTG CGAAAACTGAAAGATGTCATGTATGACATAGATGACATTTTGGACGATGCGTCAACTGAA ACTTTGAAGCGCAGAGTTAGCAAAGATGTGGTTACTCAAACCAATTGTGTACATATTTCT CGATTGAAATTGAGAAGAAAATTGCTCAAAAGGAAGAAGAAATGGAGCAGCAGAATAAGA GAAGTTCATGAAAAGCTTAACGAAATAGCCGCTAGTAAAAAGGACTTTGGACTGACCGAT TGGACAGTGGGTGGTCAGTGTTCTGAAGAACCAGAAAGAGAATCATATTCTTTTGTGTAT CAACCTGATATAATTGGAAGGGATGATGCTAGAGATGAGATTGTTAGTAAGATACTAAGA GCAGCAGAACATCATGATATTTTTGTGCTTCCTCTGCTTGGGCTTGGAGGCATTGGGAAA ACTGAACTAGCAAATATGGTGTATCATGATCAACAAATCAGGGAGAGGTTCAGCAAGATG ATGTGGGCCTGTGTCTCTAATAAATTTAATCTGAAAAATATACTACAAGATATAATCGAG TCTGCCAGTGGTGAGAGTTGCAAGCATCTAAACTTGGAACATTTACAAAATAAGCTCAGG GGAATTCTGCAGAATGGAAATTATTTCCTGGTATTGGATGATCTGTGGACTCGTGATGTA AATGAATGGAGAGAGCTGAGGAATTTGTTGTCAAGTGGTGCAAGGGGTAGTGTGATAATT GTTACTACACGCGAAAATGTTGTTGCATCTATGGTTGGTACCTCAGACCCGTACAAGGTG GGTGCACTCCCTTTTCATGAGTGCATGCAAATTTTTACCAGAGTTGCATTCAGACAAGGT GAGGAAAATAAATATCCGTGGTTGTTGAAAATTGGAGAGTCCATTGTGAAGAAGTGTGCT GGAGTACCACTGGCAATAAAATCATTGGGTTCTCTACTATTTACCATGCGTGATGAAACT CAATGGCTACGTGTTAAAGAAGACCACTTGTGCAAAATTGTACAAGGTGACAGAGATATA ATGCCAGTGCTAAAGTTAAGTTACAATGCTCTTCCAGCTGCCCTTAAACCATGTCTTTCC TATTTATCCATATTTCCTAAGGACTTCGAATATTACAGAAGATGCATAATCATGTTTTGG ATGGCACATGGGCTACTGAACTCGAACAAATTGAGTGAAGAAATAGATGTTGGTAATCAG TACATTATTGAATTGATAGGAAGTTCCCTTTTTCAAGACTCTCTAATTACTTTTGATGGA AGCATGCCACATTGCAAGTTACATGACATTGTACATGATCTTGGTAGATATGTTTTGGAC ACAGACCTAGCTGTTGTGAACTGTGAAGGGCAACAAGTCTCAGAAACAGTCAGGCATCTA GTATGGGACCTTAAGGATTTCACACACGAGCAAGAATTTCCCAGGCATTTAATCAAAGCA AGAAAAGCTCGAACTTTTATTAGTTCGTGTAATCATGGTTCTTTAAGCAAAAAATTTCTG GAAGTGCTGCTGTCCAAGTTATTGCTTCTACGTGTATTGATTATATCCGGAGTTAGAATT GACGAACTCCCAGATTCAATTGGAAATTTGAAGCACTTGAGGTATCTTTACCTCACCTGG AACAAAACCATAAAATACCTTCCCAATTCCCTATGCAAGCTCATAAACCTTCAGACACTT GATCTTTATCGAAGTGACCAACTAATCGAGTTGCCGAGAGATGTAAACAAGTTAATCAGC CTCAGGTACCTGAGTTTGACATCGAAGCAAAAGCAGTTGCCAGAAGCAGGACTTCGTGGC TGGGCTTCACTAACATCCCTGCAGCTTCACTCATGTAGTGAACTAACATCACTGTCAGAA GGGATTGGCTCGTTGACTGCCCTACAGATGCTGTGGATCAGTGATTGCCCAAAGCTTCCT TCTCTCCCAGCCAGCATGACACACCTCTCCAGTCTGCGAGAGCTGTTCATCGACAATTGC CCGGAGCTGGATTTGATGCATCCAGAGGAGGCCATGGATGGGCTATGGAGTCTTCGATCA TTGCAGATCATTGGACTTCCAAAGCTAGAGCGTCTTCCTGACACTCTTTGTTCTGCCTCG GGTTCTCTTCGGTATTTATTGATTGAGCAATGCCCCAATCTAAGGGAGCTTCCAAGCTTC ATGCAAGATCTCACTAACCATCAGAGGCAGGGGGGTATTCATTAAGGATTTCCCGAGCAT AATTATATAAAGGGATGACAATTAGTTGATTACTATCTCCCCATAAAATCTTCATGGAGG TATAGAGCTTATGCTAAAAGAAAAGCCCCACAGGAAGTGAAATAGGTATGTATGGAAGTA TAGCAACCAGTGAAGCTAAGAAATCCCTTTTAGGCACCAATTCAATGGATTTCCTTTTGT TGCAGAGAGGACCAAAGTACACACTAGCTGGGATGAAAAACAATAACTGAGACTGCTCAT AATTTGTTAACCGAATAGGCCACAAGTTTGAATTACGATGCTCATTAGGGTGATTGTAAG GTTGCTCTTTTTGAAATGTATAGTGATGCTCTGAATACCATGTCCCTGTTTCTAAATTGT AATGATGCATTTCAAATGTGCCATGTCTAATTCAGTTTATGTTTTTCACATGTTTAATTA TTTCAGACCTTAATTGAACTTATATGGTCGTTCGAAGTCCTGTTTGTATAGAAATTNCAG TTTAATTCCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)