These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7197#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2480 fasta sequence [GCCCTCTGACTCATTTGCGCTCGATCTCGTCGTCCCCTCGGCCTCGAAGCGACCCCGTCTCTCGCGAGTTCTCCCGTCGTCTGCGCCGATCTCGCGAGCAGTGGGTGCCGACGTCGTGCTGCTTCCGCCGCATCCTCGCCGATTTTAGGTCAACTTTCCCAGGATTTGCTAGTCATGGCCAAAGGCAGGATATTCTCTGCCTTGTTAATGGTGTTTCTAGTTTTGGCTCCCCACTGCGAGGCGTTCTATTTGCCAGGCAGTTACATGCACACGTACCGGCAAGGCGAGGAAATATGGGCAAAGGTGAACTCACTCACTTCCATTGAGACTGAACTGCCATTCAGCTACTACAGTCTCCCATACTGCCATCCCCAAGGTGGGATAAAGAAGAGTGCTGAGAATCTAGGGGAGCTCCTGATGGGTGACCAGATTGACAATTCCCCATACCGGTTTCGTGTGAATGTCAATGAATCACTGTATCTGTGTACCACAAACCCACTTGACGAGGCTGATGTGAAGCTCCTCAAGCAGCGAAGCCGAGACCTCTACCAGGTGAACATGATTCTCGACAATCTTCCTGTGAGGAGATTTACTGAACAGAATGGAGTGACCATTCAGTGGACAGGCTATCCAGTTGGTTATACCCCGGAAGGAAGCAATGAGGTCTACATCATTAATCACCTGAAATTTAAGGTCTTGGTCCATAGGTACGAAGGAGGTAAAGTCAAGGTAGTTGGAACTGGGGAAGGAATGGAAGTGATCTCAGAGACAGAGACAGATGCCAAGTCTGGCTATGAGATTGTGGGATTTGAGGTTGTCCCATGCAGCATGAAGCGTGATCTTGAAGCTATGTCAAAGCTTAAGATGTATGAAAAAGTTGATCCTACAAGCTGCCCTGTGGAGATGGAGAAATCTCAATTGATTAGGGAAAAAGAGCAGATTACTTTTACGTATGAGGTTGAATTTGTAAACAGTGATATCAGATGGCCATCACGGTGGGATGCATACCTGAAGATGGAGGGTGCTAAAATTCACTGGTTCTCAATCATGAACTCATTGATGGTAATACTATTTTTGGCTGGAATTGTGTTTGTCATATTCTTGCGGACGGTGAGGAGAGACTTGACTAGATATGAGGAATTGGATAAGGAGGCCCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCCGGGTGGAAGCTTGTTGTTGGTGATGTCTTCAGAGAACCAACATCATCAAAGCTTCTCTGCGTCATGATTGGTGATGGGGTTCAAATTCTGGGTATGGCAATTGTTACCATCTTCTTTGCTGCCTTTGGGTTCATGTCTCCTGCATCAAGAGGAATGCTTCTCACAGGGATGATATTTCTTTATATGTTGCTTGGAATTGTGGCTGGATATGCTGCCGTTAGGCTCTGGAGGACTTTAAAAGGAACTTCTGAGGGATGGAGATCTGTCTCCTGGTCAACAGCCTGTTTCTTCCCTGGTATTGTCTTTGTTGTCCTCACTGTGTTAAATTTCATGCTGTGGTCAAGGAATAGTACAGGAGCTCTTCCCATCTCACTCTTCTTCACACTTCTGTCCTTGTGGTTCTGCATCTCTGTGCCACTTACCCTCCTCGGTGGTTTCTTTGGCACAAGGGCTGAGCCAATAGAATTCCCAGTTCGAACCAATCAAATACCAAGAGAAATCCCTGCAAAAAATTACTCTTGGCTCCTTGTGCTTGGTGCTGGGACTCTGCCTTTTGGAACACTATTCATTGAGTTGTTCTTTATTCTTTCAAGTATTTGGCTCGGAAGGTTCTACTATGTGTTTGGGTTCCTCCTTGTTGTCCTCCTCTTGCTGGTTGTGGTCTGTGCTGAGGTATCTGTTGTTCTTACCTACATGCATCTTTGTGCGGAAGATTGGCGT-TGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGGTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCATCTGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTTTTAAGCTTGCATTCATCATCTTTTATTTGTTAAAATTTTGTTGATTGTGCAAATGCTTTCTGAAAAGACCATGAATTTTACTTAGCATATCAGTGGTACATTATGGAGTGATTGCTTTGTTATGTAAGTGGGCTTTGCAATCAACCAGTTATTATCTTGAGGT] [+] EMBL AK064958 [GCCCTCTGACTCATTTGCGCTCGATCTCGTCGTCCCCTCGGCCTCGAAGCGACCCCGTCTCTCGCGAGTTCTCCCGTCGTCTGCGCCGATCTCGCGAGCAGTGGGTGCCGACGTCGTGCTGCTTCCGCCGCATCCTCGCCGATTTTAGGTCAACTTTCCCAGGATTTGCTAGTCATGGCCAAAGGCAGGATATTCTCTGCCTTGTTAATGGTGTTTCTAGTTTTGGCTCCCCACTGCGAGGCGTTCTATTTGCCAGGCAGTTACATGCACACGTACCGGCAAGGCGAGGAAATATGGGCAAAGGTGAACTCACTCACTTCCATTGAGACTGAACTGCCATTCAGCTACTACAGTCTCCCATACTGCCATCCCCAAGGTGGGATAAAGAAGAGTGCTGAGAATCTAGGGGAGCTCCTGATGGGTGACCAGATTGACAATTCCCCATACCGGTTTCGTGTGAATGTCAATGAATCACTGTATCTGTGTACCACAAACCCACTTGACGAGGCTGATGTGAAGCTCCTCAAGCAGCGAAGCCGAGACCTCTACCAGGTGAACATGATTCTCGACAATCTTCCTGTGAGGAGATTTACTGAACAGAATGGAGTGACCATTCAGTGGACAGGCTATCCAGTTGGTTATACCCCGGAAGGAAGCAATGAGGTCTACATCATTAATCACCTGAAATTTAAGGTCTTGGTCCATAGGTACGAAGGAGGTAAAGTCAAGGTAGTTGGAACTGGGGAAGGAATGGAAGTGATCTCAGAGACAGAGACAGATGCCAAGTCTGGCTATGAGATTGTGGGATTTGAGGTTGTCCCATGCAGCATGAAGCGTGATCTTGAAGCTATGTCAAAGCTTAAGATGTATGAAAAAGTTGATCCTACAAGCTGCCCTGTGGAGATGGAGAAATCTCAATTGATTAGGGAAAAAGAGCAGATTACTTTTACGTATGAGGTTGAATTTGTAAACAGTGATATCAGATGGCCATCACGGTGGGATGCATACCTGAAGATGGAGGGTGCTAAAATTCACTGGTTCTCAATCATGAACTCATTGATGGTAATACTATTTTTGGCTGGAATTGTGTTTGTCATATTCTTGCGGACGGTGAGGAGAGACTTGACTAGATATGAGGAATTGGATAAGGAGGCCCAAGCTCAGATGAATGAGGAGCTCTCCGGGTGGAAGCTTGTTGTTGGTGATGTCTTCAGAGAACCAACATCATCAAAGCTTCTCTGCGTCATGATTGGTGATGGGGTTCAAATTCTGGGTATGGCAATTGTTACCATCTTCTTTGCTGCCTTTGGGTTCATGTCTCCTGCATCAAGAGGAATGCTTCTCACAGGGATGATATTTCTTTATATGTTGCTTGGAATTGTGGCTGGATATGCTGCCGTTAGGCTCTGGAGGACTTTAAAAGGAACTTCTGAGGGATGGAGATCTGTCTCCTGGTCAACAGCCTGTTTCTTCCCTGGTATTGTCTTTGTTGTCCTCACTGTGTTAAATTTCATGCTGTGGTCAAGGAATAGTACAGGAGCTCTTCCCATCTCACTCTTCTTCACACTTCTGTCCTTGTGGTTCTGCATCTCTGTGCCACTTACCCTCCTCGGTGGTTTCTTTGGCACAAGGGCTGAGCCAATAGAATTCCCAGTTCGAACCAATCAAATACCAAGAGAAATCCCTGCAAAAAATTACTCTTGGCTCCTTGTGCTTGGTGCTGGGACTCTGCCTTTTGGAACACTATTCATTGAGTTGTTCTTTATTCTTTCAAGTATTTGGCTCGGAAGGTTCTACTATGTGTTTGGGTTCCTCCTTGTTGTCCTCCTCTTGCTGGTTGTGGTCTGTGCTGAGGTATCTGTTGTTCTTACCTACATGCATCTTTGTGCGGAAGATTGGCGT TGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGGTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCA TGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTTTTAAGCT ] [+] EMBL CB629165 [ TCCCACCATTTGCTAGTCATGGCCAAAGGCAGGATATTCTCTGCCTTGTTAATGGTGTTTCTAGTTTTGGCTCCCCACTGCGAGGCGTTCTATTTGCCAGGCAGTTACATGCACACGTACCGGCAAGGCGAGGAAATATGGGCAAAGGTGAACTCACTCACTTCCATTGAGACTGAACTGCCATTCAGCTACTACAGTCTCCCATACTGCCATCCCCAAGGTGGGATAAAGAAGAGTGCTGAGAATCTAGGGGAGCTCCTGATGGGTGACCAGATTGACAATTCCCCATACCGGTTTCGTGTGAATGTCAATGAATCACTGTATCTGTGTACCACAAACCCACTTGACGAGGCTGATGTGAAGCTCCTCAAGCAGCGAAGCCGAGACCTCTACCAGGTGAACATGATTCTCGACAATCTTCCTGTGAGGAGATTTACTGAACAGAATGGAGTGACCATTCAGTGGACAGGCTATCCAGTTGGTTATACCCCGGAAGGAAGCAATGAGGTCTACATCATTAATCACCTGAAATTTAAGGTCTTGGTCCATAGGTACGAAGGAGGTAAAGTCAAGGTAGTTGGAACTGGGGAAGGAATGGAAGTGATCTCAGAGACGGAGACAGATGCCAAGTCTGGCTATGAGATTGTGGGATTTGAGGTTGTCCCATGCAGCGTGAAGCGTGATCTTGAAGCTATGTCAAAGCTTAAGATGTATGAAAGAGTTGAT ] [-] EMBL CB629166 [ CCCTGCAAAAAATTACTCTTGGCTCCTTGTGCTTGGTGCTGGGACTCTGCCTTTTGGAACACTATTCATTGAGTTGTTCTTTATTCTTTCAAGTATTTGGCTCGGAAGGTTCTACTATGTGTTTGGGTTCCTCCTTGTTGTCCTCCTCTTGCTGGTTGTGGTCTGTGCTGAGGTATCTGTTGTTCTTACCTACATGCATCTTTGTGCGGAAGATTGGCGT TGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGGTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCATCTGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTTTTAAGCTTGCATTCATCATCTTTTATTTGTTAAAATTTTGTTGATTGTGCAAATGCTTTCTGAAAAGACCATGAATTTTACTTAGCATATCAGTGGTACATTATGGAGTGATTGCTTTGTTATGTAAGTGGGCTTTGCAATCAACCAGTTATTATCTTGAGGT] [+] EMBL CB632029 [ GCGTCTGGTGGTGGAAAGCTTTCTTTGCCTCTGGAGCAGTAGCGCTTTATGTGTTCCTGTACTCTATCAACTACTTGCTGTTTGATCTCAGAAGCTTGAGTGGCCCAGTTTCTGCTACGCTCTACATTGGATATGCTTTCGTTGTCTCTCTTGCAATTATGCTGGCTACTGGGACTGTTGGGTTCCTGACATCATTCTCTTTCGTCCACTACCTTTTCTCATCAGTTAAGATTGATTGAAGACCATACCTTACAAATCTCCAAGGATGACTGTACACTGAATCACTCTAAAGCGGCAATGATTTGATCATGGCATCTGAAGGCCCTTTACACAATTGTGATGTCTTCCTTATGTAGCTAATTACCGGGACTATTGTACCACGATGAATATGGTGATAGTAATGTACCAGCATATATGCTT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||