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Oryza sativa
cluster # 7223 cluster # 7223       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7223#0 length = 1604 sequences # 4  

consensusID : consensus_7223#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1604
fasta sequence
                              [GACACGCACGAAAGAAATAGGCAGCGTCTTCCCCTTCCCTTTGTGGCGTAAAAGAAAAGAAAATCTCCCGTCTCTTCGTCTCCTCCGCTCCTTGCGCCGCCAAGAAGACGAGTCGGGGGCGGCGATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAGGGGAGGGGAGGGGATCCTGGCTCAGTCTTGCGACTTTCTTGCTGTATAATGAGATCATATCTTTGAGTGCTCAATGATGTCAACACTAATTGATGGTCTCCCTAATGAAGTTGCTCTTCAGTGCCTTGCACGGGTGCCATTTTTGTCCCATCCTGTTCTTCAAATGGTCTGCCATTCTTGGAGAGCATCTGTTCGAAATGGTGAGCTTTCCAAAGTTAGGAATCAGATTAGTGCGACTGAAGACCTGTTATGTGTGTTAGCATTTGAACCTGAAAACATGTGGCAGCTTTATGACCCTCTTCGAGATAAGTGGATAACCCTTCCTGTCATGCCATCTCAGATTAGGAATATTGCTCGTTTTGGAGTGGCCTCGGTTGCAGGCAAGCTCTATGTAATTGGTGGTGGCAGTGATCGAGTTGACCCACTTACTGGAGACCATGACAGGATCTTTGCAAGCAATGAGGTTTGGTCTTATGATCCTCTCTGTCGTTTATGGGTCCAGAGGGCTCCAATGCTTGTAGCTCGCGCAATGTTTGCCTGTTGTGCACTGGATGGGAACATAATTGTTGCTGGGGGCTTCACAAATTGCCGCAAATCAATATCAAAGGCTGAGATTTATAACCCTGAAGCTGACACGTGGGAGCCTCTCCCTGACCTACGTCAAGCACACAGCTCTGCATGCTCTGGACTTGTCATAAAGGGTAAGATGCATGTATTGCACAAAGGCCTACCAACAGTGCAGATTCTTGAAGATGGCAATGCTTGGGCTGTTGAGGACTACTCTTGGCTGCAAGGTCCGATGGCAATGGTTCGTGGGGAGCTTTATGTGCTGAGCAATAGTTGCATTATGAAGCAGCGTGGTGTGAATTTCCCTGATAAGATGGTGTCGTGTGCATCTGAATTCCAAAGCAGGATAGGTTTTGGGATGATTGGTTTGGGAGACAACATATATCTGGTTGGTGGAGTAATTGGACCTGGGCCAAGAAATCAGTGCATCAAGCCACTATCTGATGTTGATATCTTGAATGTTACTAGTGAGAGACCAACCTGGCTACCAGGATCACCAATGACACATTGTCGAGGGAGCATTTCTGGTTGTGCTTTGCTGAGGATTTAGCCTCATTCAACGTTGCTCCCATGCTGGTATCTTACTGTTGCTGAAGGGAAAGATTGCAGATAGCTTTTAATGGTTCTGCCTTTCGTTTTATTTGAAAAGAAGTCTGTTAATTATTGTTCAATTTTGAATTGCCTGTTGTATTGAGGACATATATGTTGGTCATGGTTCAATGCTAGATTACCAGTCATATCCTGTATTTATCTTGAATTTGGATCTGGATCCAAACGTAGTACTTTATGTGCATTTGTAATTGTATCATCCTTGCAACTCTGTCCTGGATGTGAAGTTTTTCATGTATTCCTAAAAGAAATTCAGATAAAAAAAGAGAAAAGGTTAGGA]

[+] EMBL AK065918             [GACACGCACGAAAGAAATAGGCAGCGTCTTCCCCTTCCCTTTGTGGCGTAAAAGAAAAGAAAATCTCCCGTCTCTTCGTCTCCTCCGCTCCTTGCGCCGCCAAGAAGACGAGTCGGGGGCGGCGATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAGGGGAGGGGAGGGGATCCTGGCTCAGTCTTGCGACTTTCTTGCTGTATAATGAGATCATATCTTTGAGTGCTCAATGATGTCAACACTAATTGATGGTCTCCCTAATGAAGTTGCTCTTCAGTGCCTTGCACGGGTGCCATTTTTGTCCCATCCTGTTCTTCAAATGGTCTGCCATTCTTGGAGAGCATCTGTTCGAAATGGTGAGCTTTCCAAAGTTAGGAATCAGATTAGTGCGACTGAAGACCTGTTATGTGTGTTAGCATTTGAACCTGAAAACATGTGGCAGCTTTATGACCCTCTTCGAGATAAGTGGATAACCCTTCCTGTCATGCCATCTCAGATTAGGAATATTGCTCGTTTTGGAGTGGCCTCGGTTGCAGGCAAGCTCTATGTAATTGGTGGTGGCAGTGATCGAGTTGACCCACTTACTGGAGACCATGACAGGATCTTTGCAAGCAATGAGGTTTGGTCTTATGATCCTCTCTGTCGTTTATGGGTCCAGAGGGCTCCAATGCTTGTAGCTCGCGCAATGTTTGCCTGTTGTGCACTGGATGGGAACATAATTGTTGCTGGGGGCTTCACAAATTGCCGCAAATCAATATCAAAGGCTGAGATTTATAACCCTGAAGCTGACACGTGGGAGCCTCTCCCTGACCTACGTCAAGCACACAGCTCTGCATGCTCTGGACTTGTCATAAAGGGTAAGATGCATGTATTGCACAAAGGCCTACCAACAGTGCAGATTCTTGAAGATGGCAATGCTTGGGCTGTTGAGGACTACTCTTGGCTGCAAGGTCCGATGGCAATGGTTCGTGGGGAGCTTTATGTGCTGAGCAATAGTTGCATTATGAAGCAGCGTGGTGTGAATTTCCCTGATAAGATGGTGTCGTGTGCATCTGAATTCCAAAGCAGGATAGGTTTTGGGATGATTGGTTTGGGAGACAACATATATCTGGTTGGTGGAGTAATTGGACCTGGGCCAAGAAATCAGTGCATCAAGCCACTATCTGATGTTGATATCTTGAATGTTACTAGTGAGAGACCAACCTGGCTACCAGGATCACCAATGACACATTGTCGAGGGAGCATTTCTGGTTGTGCTTTGCTGAGGATTTAGCCTCATTCAACGTTGCTCCCATGCTGGTATCTTACTGTTGCTGAAGGGAAAGATTGCAGATAGCTTTTAATGGTTCTGCCTTTCGTTTTATTTGAAAAGAAGTCTGTTAATTATTGTTCAATTTTGAATTGCCTGTTGTATTGAGGACATATATGTTGGTCATGGTTCAATGCTAGATTACCAGTCATATCCTGTATTTATCTTGAATTTGGATCTGGATCCAAACGTAGTACTTTATGTGCATTTGTAATTGTATCATCCTTGCAACTCTGTCCTGGATGTGAAGTTTTTCATGTATTCCTA                                    ]
[+] EMBL CA766804             [                                                 AAAAG AAAGAAAATCTCCCGTCTCTTCGTCTCCTCCGCTCCTTGCGCCGCCAAGAAGACGAGTCGGGGGCGGCGATCTCCATCTGGCGAGCAGAGC     AGGGGAGGGGATCCTGGCTCAGTCTTGCGACTTTCTTGCTGTATAATGAGATCATATCTTTGAGTGCTCAATGATGTCAACACTAATTGATGGTCTCCCTAATGAAGTTGCTCTTCAGTGCCTTGCACGGGTGCCATTTTTGTCCCATCCTGTTCTTCAAATGGTCTGCCATTCTTGGAGAGCATCTGTTCGAAATGGTGAGCTTTCCAAAGTTAGGAATCAGATTAGTGCGACTGAAGACCTGTTATGTGTGTTAGCATTTGAACCTGAAAACATGTGGCAGCTTTATGACCCTCTTCGAGATAAGTGGATAACCCTTCCTGTCATGCCATCTCAGATTAGGAATATTGCTCGTTTTGGAGTGGCCTCGGTTGCAGGCAAGCTCTATGTAATTGGTGGTGGCAGTGATCGAGTTGACCCACTTACTGGAGACCATGACAGGATCTTTGCAAGCAATGAGGTTTGGTCTTATGATCCTCTCTGTCGTTTATGGGTCCAGAGGGCTCCAATGCTTGTAGCTCGCGCAATGTTTGCCTGTTGTGCACTGGATGGGAACATAATTGTTGCTGGGGGCTTCACAAATTGCCGCAAATCAATATCAAAGGCTGAGATTTATAACCCTGAAGCTGACACGTGGGAGCCTCTCCCTGACCTACGTCAAGCACACAGCTCTGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB670247             [                                                            AAATCTCCCCTTTTCGCGTCTCCTCCGCTCCTTGCGCCGCCAAGAAGACGAGTCGGGGGCGGCGATCTCCATCTGGCGAGCACACCAGGGGAGGGGAGGGGATCCTGGCTCAGTCTTGCGACTTTCTTGCTGTATAATGAGATCATATCTTTGAGTGCTCAATGATGTCAACACTAATTGATGGTCTCCCTAATGAAGTTGCTCTTCAGTGCCTTGCACGGGTGCCATTTTTGTCCCATCCTGTTCTTCAAATGGTCTGCCATTCTTGGAGAGCATCTGTTCGAAATGGTGAGCTTTCCAAAGTTAGGAATCAGATTAGTGCGACTGAAGACCTGTTATGTGTGTTAGCATTTGAACCTGAAAACATGTGGCAGCTTTATGACCCTCTTCGAGATAAGTGGATAACCCTTCCTGTCATGCCATCTCAGATTAGGAATATTGCTCGTTTTGGAGTGGCCTCGGTTGCAGGCAAGCTCTATGTAATTGGTGGTGGCAGTGATCGAGTTGACCCACTTACTGGAGACCATGACAGGATCTTTGCAAGCAATGAGGTTTGGTCTTATGATCCTCTCTGTCGTTTATGGGTCCAGAGGGCTCCAATGCTTGTAGCTCGCGCAATGTTTGCCTGTTGTGCACTGGATGGGAACATAATTGTTGCTGGGGGCTTCACAAATTGCCGCAAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CB670248             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATGTATTGCACAAAGGCCTACCAACAGTGCAGATTCTTGAAGATGGCAATGCTTGGGCTGTTGAGGACTACTCTTGGCTGCAAGGTCCGATGGCAATGGTTCGTGGGGAGCTTTATGTGCTGAGCAATAGTTGCATTATGAAGCAGCGTGGTGTGAATTTCCCTGATAAGATGGTGTCGTGTGCATCTGAATTCCAAAGCAGGATAGGTTTTGGGATGATTGGTTTGGGAGACAACATATATCTGGTTGGTGGAGTAATTGGACCTGGGCCAAGAAATCAGTGCATCAAGCCACTATCTGATGTTGATATCTTGAATGTTACTAGTGAGAGACCAACCTGGCTACCAGGATCACCAATGACACATTGTCGAGGGAGCATTTCTGGTTGTGCTTTGCTGAGGATTTAGCCTCATTCAACGTTGCTCCCATGCTGGTATCTTACTGTTGCTGAAGGGAAAGATTGCAGATAGCTTTTAATGGTTCTGCCTTTCGTTTTATTTGAAAAGAAGTCTGTTAATTATTGTTCAATTTTGAATTGCCTGTTGTATTGAGGACATATATGTTGGTCATGGTTCAATGCTAGATTACCAGTCATATCCTGTATTTATCTTGAATTTGGATCTGGATCCAAACGTAGTACTTTATGTGCATTTGTAATTGTATCATCCTTGCAACTCTGTCCTGGATGTGAAGTTTTTCATGTATTCCTAAAAGAAATTCAGATAAAAAAAGAGAAAAGGTTAGGA]


>consensus_7223#0 GACACGCACGAAAGAAATAGGCAGCGTCTTCCCCTTCCCTTTGTGGCGTAAAAGAAAAGA AAATCTCCCGTCTCTTCGTCTCCTCCGCTCCTTGCGCCGCCAAGAAGACGAGTCGGGGGC GGCGATCTCCATCTGGCGAGCAGAGCAGGGGAGGGGAGGGGATCCTGGCTCAGTCTTGCG ACTTTCTTGCTGTATAATGAGATCATATCTTTGAGTGCTCAATGATGTCAACACTAATTG ATGGTCTCCCTAATGAAGTTGCTCTTCAGTGCCTTGCACGGGTGCCATTTTTGTCCCATC CTGTTCTTCAAATGGTCTGCCATTCTTGGAGAGCATCTGTTCGAAATGGTGAGCTTTCCA AAGTTAGGAATCAGATTAGTGCGACTGAAGACCTGTTATGTGTGTTAGCATTTGAACCTG AAAACATGTGGCAGCTTTATGACCCTCTTCGAGATAAGTGGATAACCCTTCCTGTCATGC CATCTCAGATTAGGAATATTGCTCGTTTTGGAGTGGCCTCGGTTGCAGGCAAGCTCTATG TAATTGGTGGTGGCAGTGATCGAGTTGACCCACTTACTGGAGACCATGACAGGATCTTTG CAAGCAATGAGGTTTGGTCTTATGATCCTCTCTGTCGTTTATGGGTCCAGAGGGCTCCAA TGCTTGTAGCTCGCGCAATGTTTGCCTGTTGTGCACTGGATGGGAACATAATTGTTGCTG GGGGCTTCACAAATTGCCGCAAATCAATATCAAAGGCTGAGATTTATAACCCTGAAGCTG ACACGTGGGAGCCTCTCCCTGACCTACGTCAAGCACACAGCTCTGCATGCTCTGGACTTG TCATAAAGGGTAAGATGCATGTATTGCACAAAGGCCTACCAACAGTGCAGATTCTTGAAG ATGGCAATGCTTGGGCTGTTGAGGACTACTCTTGGCTGCAAGGTCCGATGGCAATGGTTC GTGGGGAGCTTTATGTGCTGAGCAATAGTTGCATTATGAAGCAGCGTGGTGTGAATTTCC CTGATAAGATGGTGTCGTGTGCATCTGAATTCCAAAGCAGGATAGGTTTTGGGATGATTG GTTTGGGAGACAACATATATCTGGTTGGTGGAGTAATTGGACCTGGGCCAAGAAATCAGT GCATCAAGCCACTATCTGATGTTGATATCTTGAATGTTACTAGTGAGAGACCAACCTGGC TACCAGGATCACCAATGACACATTGTCGAGGGAGCATTTCTGGTTGTGCTTTGCTGAGGA TTTAGCCTCATTCAACGTTGCTCCCATGCTGGTATCTTACTGTTGCTGAAGGGAAAGATT GCAGATAGCTTTTAATGGTTCTGCCTTTCGTTTTATTTGAAAAGAAGTCTGTTAATTATT GTTCAATTTTGAATTGCCTGTTGTATTGAGGACATATATGTTGGTCATGGTTCAATGCTA GATTACCAGTCATATCCTGTATTTATCTTGAATTTGGATCTGGATCCAAACGTAGTACTT TATGTGCATTTGTAATTGTATCATCCTTGCAACTCTGTCCTGGATGTGAAGTTTTTCATG TATTCCTAAAAGAAATTCAGATAAAAAAAGAGAAAAGGTTAGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)