These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7290#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 914 fasta sequence [GCGGCGCCTTCGGCCGCCGGCGGTGGCTGCTGGGTCATGCACGAGTACAGCCTCGCCCTGCCGATGCACAAGAAGGTGAGAAACCACTACTAATCAATCATATGAGCATATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC-AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGCTCTCTGCTCATCAGATCGAATCGTCTCATCAAGTTGTGCAGCTCCACTACTACCAGTATCTGCTAGTACTAGTACTACTAGCCACTCTCTTGCATATATGCAAGAACCAACCAAACCAACC] [+] EMBL CB634462 [GCGGCGCCTTCGGCCGCCGGCGGTGGCTGCTGGGTCATGCACGAGTACAGCCTCGCCCTGCCGATGCACAAGAAGGTGAGAAACCACTACTAATCAATCATATGAGCATATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTATCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAACAAAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGC ] [+] EMBL CB672392 [ GAGCATCTTATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGCTCTCTGCTCATCAGATCGAATCGTCTCATCAAGTTGTGCAGCTCCACTACTACCAGTATCTGCTAGTACTAGTACTACTAGCCACTCTCTTGCATATATGCAAGAACCAACCAAACCAACC] [+] EMBL CB671993 [ GAGCATATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAACAACAACAATAACTCGCAGTTTTAAATTGCTTCTGATGGTGGTTGCAATTCATCCTGACATGGAGAGGTGGCTGTACTAGATGCTCTCTGCTCATCAGATCGAATCGTCTCATCAAGTTGTGCAGCTCCACTACTACCAGTATCTGCTAGTACTAGTACTACTAGCCACTCTCTTGCATATATGCAAGAAACAACCAAACCAACC] [+] EMBL CF304374 [ ggATGATTTCCTCCTTAATGATTGATTAATCACTCTCTTGATGACTAGTTGACTGCCAATTTGCCCATTTCTTCATGCAAGAACTGATTGTGTTTGTTGATTGATTTGTTTTCTTTCTTGATAAATCTTCTTGTGTTTCTGCATGCATGCAACTCAAGTGAGCAAGCTTGATAAATCTTCTTGAGCATTAATTTGGGATCCAATATTAAGCTCAAGCTAGCTTAGCTTAGCTTCTCAAAGTGCTACTACTAGCTAACTTGATCATATGTTTGCTTATCACTATTTTTATTAGTTATTTTTAAAATTACTAGCTATATGGCTTTCAAGATCATGTCACATGCTCTCCATTAGCTTAAAGCTGTATATTTGTCTTAAATTACTAATTAGATAATTCTGATAGCCACAGCATAGGTACAAATCAGTTAACCAGTCAAGTACTATGCTAGAATTTGCCAATAAATAAAAC AAAAAAAACCCAGTTCAACACAAACTTCTCAGCCATAACTAATTAACCGAGGAGCATCATACAAATTAACACATACAGGCAGGGTACAGTCTGCACATCAAACTGTCACAACATGCTCATTAATAGTCATGATCAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||