Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 735 cluster # 735       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_735#0 length = 593 sequences # 2  

consensusID : consensus_735#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 593
fasta sequence
                              [ATCCACACTATATCGAAATCAACCGATTCTTAGTCATGAACGCTTCAAGTGTTTTAAAAACTATTTTCTTTGGGTTAGTTATTTTATGTATAACCAACTTCATCAATGGAGTTGTTGGTGATAACGATGGTTGGAATGGTTTAGCATCTGATCCATGGTCTAACCGTTTAGCCAAACGTTCAGTAGCACCTGGTGGATTCCATGGTGAACACGCAGGAAAATTTAAACCACGTGTACCATTTCGTCCAAGTTTTGGCAAAAGTGGTCCTCATGGTCACCACAAAGGTCATCCTCATGTTCATCACACAGGTCTTCCTCATGGTAAAGGTGTGAAAGTACCACCACGTCCAGGTCATCTTATGGCTGGCAAACGTATTTAATTTAATTCTTACAAATATTATTAAACAAAATATTCATATNANACCACAAACTCAATCCGATCTTTAAGTTATATGAATTTTCTCAACAATTATTCTTTATATTTTTATGTGCGATTATNTTTCTATGATTTCAATTAATTTTCCATAATAGAAATAAATATACTTACGTAGGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGGGGGGACGGGGGGGAAGAG]

[+] EMBL CA755097             [ATCCACACTATATCGAAATCAACCGATTCTTAGTCATGAACGCTTCAAGTGTTTTAAAAACTATTTTCTTTGGGTTAGTTATTTTATGTATAACCAACTTCATCAATGGAGTTGTTGGTGATAACGATGGTTGGAATGGTTTAGCATCTGATCCATGGTCTAACCGTTTAGCCAAACGTTCAGTAGCACCTGGTGGATTCCATGGTGAACACGCAGGAAAATTTAAACCACGTGTACCATTTCGTCCAAGTTTTGGCAAAAGTGGTCCTCATGGTCACCACAAAGGTCATCCTCATGTTCATCACACAGGTCTTCCTCATGGTAAAGGTGTGAAAGTACCACCACGTCCAGGTCATCTTATGGCTGGCAAACGTATTTAATTTAATTCTTACAAATATTATTAAACAAAATATTCATATNANACCACAAACTCAATCCGATCTTTAAGTTATATGAATTTTCTCAACAATTATTCTTTATATTTTTATGTGCGATTATNTTTCTATGATTTCAATTAATTTTCCATAATAGAAATAAATATACTTACGTAGGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGGGGGGACGGGGGGGAAGAG]
[+] EMBL CA755165             [    ACACTATATCGAAATCAACCGATTCTTAGTCATGAACGCTTCAAGTGTTTTAAAAACTATTTTCTTTGGGTTAGTTATTTTATGTATTACCAACTTCATCAATGGAGTTGTTGGTGATAACGATGGTTGGAATGGTTTAGCATCTGATCCATGGTCTAACCGTTTAGCCAAACGTTCAGTAGCACCTGGTGGATTCCATGGTGAACACACAGGAAAATTTAAACCACGTGTACCATTTCGTCCAAGTTTTGGCAAAAGTGGTCCTCATGGTCACCACAAAGGTCATCCTCATGTTCATCACACAGGTCTTCCTCATGGTAAAGGTTTGATACTACCACCACGTCCAGGTCATCTTACGGTTGGCAAACGTATTTAATTTAATTCTTACAAATATTATTAAACAAAATATTCATATNANACCACAAACTCAATCCGATCTTTAAGTTATATGAATTTTCTCAACAATTATTCTTTATATTTTTATGTGCGATTATTTTTCTATGATTTCAATTAATTTTCCATAATAAAAATAAATATACTTACGTA  AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                     ]


>consensus_735#0 ATCCACACTATATCGAAATCAACCGATTCTTAGTCATGAACGCTTCAAGTGTTTTAAAAA CTATTTTCTTTGGGTTAGTTATTTTATGTATAACCAACTTCATCAATGGAGTTGTTGGTG ATAACGATGGTTGGAATGGTTTAGCATCTGATCCATGGTCTAACCGTTTAGCCAAACGTT CAGTAGCACCTGGTGGATTCCATGGTGAACACGCAGGAAAATTTAAACCACGTGTACCAT TTCGTCCAAGTTTTGGCAAAAGTGGTCCTCATGGTCACCACAAAGGTCATCCTCATGTTC ATCACACAGGTCTTCCTCATGGTAAAGGTGTGAAAGTACCACCACGTCCAGGTCATCTTA TGGCTGGCAAACGTATTTAATTTAATTCTTACAAATATTATTAAACAAAATATTCATATN ANACCACAAACTCAATCCGATCTTTAAGTTATATGAATTTTCTCAACAATTATTCTTTAT ATTTTTATGTGCGATTATNTTTCTATGATTTCAATTAATTTTCCATAATAGAAATAAATA TACTTACGTAGGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGGGGGGACGGGGGGGAAGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)