cluster # 7429

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7429 cluster # 7429 Sequences # 4 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7429#0 length = 2499 sequences # 4
consensusID : consensus_7429#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 2499
fasta sequence
                              [CTTCTTCCCAGCCGCCATGGCTCCTCCTCCTCCTTCCTCCTCCGTTGCTCTTCGACGATTCAACCCAGCCGCCATGGAGAGCGGAGGGAGGTAGCTGACTAGCTGGGGCTGGGGATTTCCGGCGAACGGAGGTGAGGTTGGTGCCGCTCCGGCCGCTACTTCCGCGACCCAAAGAATCGGCAAGTCCATAGATACCGGACCTCCGCGAATGCCCCGCGGCCATAGACGCCGCCGCCGCTGCGCATGCGCCACCACCACCTCGCCGTCGCCGCCGCGAGGTCCCACGCCTCCCTCCTCAAGTCCGGCTTCGCCGCCCCCACGCCCTGGAACCAGCTCCTCACCGCCTACTCCCGCTCCTCCCCCGATGGCCTCGCCGCCGCGCGCCGGGTGTTCGACGAGGTGCCCCGCCGCGACGAGGTCTCCTGGAACGCGCTCCTCGCCGCACACGCCGCGTCCGGCGCGCACCCGGAAGCATGGCGCCTCCTCCGGGCCATGCACGCGCAGGGGCTCGCTTCCAACACGTTCGCCCTCGGCTCGGCCCTCCGCTCCGCCGCCGTAGCGCGGCGTCCTGCCATCGGCGCCCAACTGCAGTCGCTCGCTTTGAAATCCGGCCTTGCCAACAATGTGTTCGCGGCAAGTGCATTACTTGATGTGTATGCTAAATGTGGCCGCGTGAGGGATGCCCGACAGGTGTTTGATGGAATGCCAGAGCGGAACACTGTTTCTTGGAATGCACTCATTGCCGGGTATACTGAATCTGGGGACATGGCATCTGCACTGGAGCTGTTTCTTGAGATGGAAAGAGAAGGTTTGGCTCCAGATGAAGCAACATTTGCGTCGCTGCTCACAGCAGTTGAGGGCCCAAGCTGTTTCTTGATGCACCAGTTGCATGGGAAGATTGTGAAGTATGGATCTGCGTTAGGGCTGACAGTGTTGAATGCAGCAATCACTGCATATTCACAATGTGGGTCCCTGAAAGACTCTAGAAGGATCTTTGATGGAATTGGGGACATTAGGGATTTGATCTCATGGAATGCGATGCTTGGAGCTTACACTCACAATGGAATGGACGACGAGGCGATGAAATTCTTTGTTAGGATGATGCAAGAGAGTGGAGTTCATCCTGACATGTATAGTTTCACAAGTATCATAAGTTCATGTTCAGAGCATGGGCATGATGATCATCAAGGGAGAGTAATTCATGGGTTGGTGATCAAGAGTGCTCTGGAAGGAGTCACGCCTGTTTGTAATGCTCTGATTGCCATGTACACTAGGTACAATGAGAATTGCATGATGGAAGATGCATACAAGTGTTTTAACTCTTTGGTGCTTAAGGACACAGTGTCCTGGAATTCTATGCTGACTGGATATTCACAGCACGGTTTGAGTGCCGATGCCTTGAAGTTCTTCAGATGTATGTGTTCGGAAAATGTTAGAACCGATGAGTATGCATTTTCTGCGGCTCTGCGGTCCTCTTCTGAACTTGCTGTGCTTCAGTTAGGTAAACAAATACATGGTTTAGTCATCCATTCTGGTTTTGCTTCCAATGATTTTGTTTCCAGCTCGCTAATCTTCATGTACTCTAAGAGTGGCATTATTGACGATGCACGGAAATCTTTTGAGGAGGCAGATAAGAGTAGTTCAGTGCCTTGGAATGCTATGATATTTGGTTATGCACAACATGGACAAGCTGAAAACGTAGACATACTTTTCAATGAGATGCTGCAACGTAAGGCTCCTTTGGATCACATAACGTTTGTTGGCCTAATTACTTCCTGCAGTCATGCTGGTCTTGTAGATGAAGGGTCAGAGATTCTCAATACAATGGAAACTAAGTATGGAGTTCCTCTTCGAATGGAGCACTATGCATGTGGTGTTGATCTGTATGGGAGGGCTGGACAGCTTGATAAAGCAAAAAAGCTAATTGATTCTATGCCATTTGAACCAGATGCCATGGTATGGATGACCCTATTGGGTGCTTGCAGAATCCATGGGAATGTGGAACTAGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTTGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCCTTAAGTAAACATATATCACAAATATTATTTTTCTGACCATTTATTTGGTTAGAATTTTGTG-ATTTCTTTTAAGGTAGCATATTTAAATAGTACTATCAAGAGCT]

[+] EMBL CB620241             [CTTCTTCCCAGCCGCCATGGCTCCTCCTCCTCCTTCCTCCTCCGTTGCTCTTCGACGATTCAACCCAGCCGCCATGGAGAGCGGAGGGAGGTAGCTGACTAGCTGGGGCTGGGGATTTCCGGCGAACGGAGGTGAGGTTGGTGCCGCTCCGGCCGCTACTTCCGCGACCCAAAGAATCGGCAAGTCCATAGATACCGGACCTCCGCGAATGCCCCGCGGCCATAGACGCCGCCGCCGCTGCGCATGCGCCACCACCACCTCGCCGTCGCCGCCGCGAGGTCCCACGCCTCCCTCCTCAAGTCCGGCTTCGCCGCCCCCACGCCCTGGAACCAGCTCCTCACCGCCTACTCCCGCTCCTCCCCCGATGGCCTCGCCGCCGCGCGCCGGGTGTTCGACGAGGTGCCCCGCCGCGACGAGGTCTCCTGGAACGCGCTCCTCGCCGCACACGCCGCGTCCGGCGCGCACCCGGAAGCATGGCGCCTCCTCCGGGCCATGCACGCGCAGGGGCTCGCTTCCAACACGTTCGCCCTCGGCTCGGCCCTCCGCTCCGCCGCCGTAGCGCGGCGTCCTGCCATCGGCGCCCAACTGCAGTCGCTCGCTTTGAAATCCGGCCTTGCCAACAATGTGTTCGCGGCAAGTGCATTACTTGATGTGTATGCTAAATGTGGCCGCGTGAGGGATGCCCGACAGGTGTTTGATGGAATGCCAGAGCGGAACACTGTTTCTTGGAATGCACTCATTGCCGGGTATACTGAATCTGGGGACATGGCATCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AK101199             [                                     TCCTCCGTTGCTCTTCGACGATTCAACCCAGCCGCCATGGAGAGCGGAGGGAGGTAGCTGACTAGCTGGGGCTGGGGATTTCCGGCGAACGGAGGTGAGGTTGGTGCCGCTCCGGCCGCTACTTCCGCGACCCAAAGAATCGGCAAGTCCATAGATACCGGACCTCCGCGAATGCCCCGCGGCCATAGACGCCGCCGCCGCTGCGCATGCGCCACCACCACCTCGCCGTCGCCGCCGCGAGGTCCCACGCCTCCCTCCTCAAGTCCGGCGTCGCCGCCCCCACGCCCTGGAACCAGCTCCTCACCGCCTACTCCCGCTCCTCCCCCGATGGCCTCGCCGCCGCGCGCCGGGTGTTCGACGAGGTGCCCCGCCGCGACGAGGTCTCCTGGAACGCGCTCCTCGCCGCGCAAGCCGCGTCCGGCGCGCACCCGGAAGCATGGCGCCTCCTCCGGGCCATGCACGCGCAGGGGCTCGCTTCCAACACGTTCGCCCTCGGCTCGGCCCTCCGCTCCGCCGCCGTAGCGCGGCGTCCTGCCATCGGCGCCCAACTGCAGTCGCTCGCTTTGAAATCCGGCCTTGCCAACAATGTGTTCGCGGCAAGTGCATTACTTGATGTGTATGCTAAATGTGGCCGCGTGAGGGATGCCCGACAGGTGTTTGATGGAATGCCAGAGCGGAACACTGTTTCTTGGAATGCACTCATTGCCGGGTATACTGAATCTGGGGACATGGCATCTGCACTGGAGCTGTTTCTTGAGATGGAAAGAGAAGGTTTGGCTCCAGATGAAGCAACATTTGCGTCGCTGCTCACAGCAGTTGAGGGCCCAAGCTGTTTCTTGATGCACCAGTTGCATGGGAAGATTGTGAAGTATGGATCTGCGTTAGGGCTGACAGTGTTGAATGCAGCAATCACTGCATATTCACAATGTGGGTCCCTGAAAGACTCTAGAAGGATCTTTGATGGAATTGGGGACATTAGGGATTTGATCTCATGGAATGCGATGCTTGGAGCTTACACTCACAATGGAATGGACGACGAGGCGATGAAATTCTTTGTTAGGATGATGCAAGAGAGTGGAGTTCATCCTGACATGTATAGTTTCACAAGTATCATAAGTTCATGTTCAGAGCATGGGCATGATGATCATCAAGGGAGAGTAATTCATGGGTTGGTGATCAAGAGTGCTCTGGAAGGAGTCACGCCTGTTTGTAATGCTCTGATTGCCATGTACACTAGGTACAATGAGAATTGCATGATGGAAGATGCATACAAGTGTTTTAACTCTTTGGTGCTTAAGGACACAGTGTCCTGGAATTCTATGCTGACTGGATATTCACAGCACGGTTTGAGTGCCGATGCCTTGAAGTTCTTCAGATGTATGTGTTCGGAAAATGTTAGAACCGATGAGTATGCATTTTCTGCGGCTCTGCGGTCCTCTTCTGAACTTGCTGTGCTTCAGTTAGGTAAACAAATACATGGTTTAGTCATCCATTCTGGTTTTGCTTCCAATGATTTTGTTTCCAGCTCGCTAATCTTCATGTACTCTAAGAGTGGCATTATTGACGATGCACGGAAATCTTTTGAGGAGGCAGATAAGAGTAGTTCAGTGCCTTGGAATGCTATGATATTTGGTTATGCACAACATGGACAAGCTGAAAACGTAGACATACTTTTCAATGAGATGCTGCAACGTAAGGCTCCTTTGGATCACATAACGTTTGTTGGCCTAATTACTTCCTGCAGTCATGCTGGTCTTGTAGATGAAGGGTCAGAGATTCTCAATACAATGGAAACTAAGTATGGAGTTCCTCTTCGAATGGAGCACTATGCATGTGGTGTTGATCTGTATGGGAGGGCTGGACAGCTTGATAAAGCAAAAAAGCTAATTGATTCTATGCCATTTGAACCAGATGCCATGGTATGGATGACCCTATTGGGTGCTTGCAGAATCCATGGGAATGTGGAACTAGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTGGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCCTTAAGTAAACATATATCACAAATATTAT                                                                             ]
[-] EMBL CB620242             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAATGAGATGCTGCAACGTAAGGCTCCTTTGGATCACATAACGTTTGTTGGCCTAATTACTTCCTGCAGTCATGCTGGTCTTGTAGATGAAGGGTCAGAGATTCTCAATACAATGGAAACTAAGTATGGAGTTCCTCTTCGAATGGAGCACTATGCATGTGGTGTTGATCTGTATGGGAGGGCTGGACAGCTTGATAAAGCAAAAAAGCTAATTGATTCTATGCCATTTGAACCAGATGCCATGGTATGGATGACCCTATTGGGTGCTTGCAGAATCCATGGGAATGTGGAACTAGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTTGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCGGTAAGTAAACATATATCACAAATATTATTTTTCTGACCATTTATTTGGTTAGAATTTTGTG ATTTCTTTTAAGGTAGCATATTTAAA                 ]
[+] EMBL CA765212             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TGGGTGCTTGCAGAATTCATGGGAATGTGGAACTNGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCAGAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATGTGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCTGGGTGGAGCTTGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCACACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATGCTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGAATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCCTTAAGTAAACATATATCACAAATATTATTTTTCTGACCATTTATTTGGTTAGAATTTTGTGTATTTCTTTGCACCTAGCATATTTAAATAGTACTATCAAGAGCT]




>consensus_7429#0
CTTCTTCCCAGCCGCCATGGCTCCTCCTCCTCCTTCCTCCTCCGTTGCTCTTCGACGATT
CAACCCAGCCGCCATGGAGAGCGGAGGGAGGTAGCTGACTAGCTGGGGCTGGGGATTTCC
GGCGAACGGAGGTGAGGTTGGTGCCGCTCCGGCCGCTACTTCCGCGACCCAAAGAATCGG
CAAGTCCATAGATACCGGACCTCCGCGAATGCCCCGCGGCCATAGACGCCGCCGCCGCTG
CGCATGCGCCACCACCACCTCGCCGTCGCCGCCGCGAGGTCCCACGCCTCCCTCCTCAAG
TCCGGCTTCGCCGCCCCCACGCCCTGGAACCAGCTCCTCACCGCCTACTCCCGCTCCTCC
CCCGATGGCCTCGCCGCCGCGCGCCGGGTGTTCGACGAGGTGCCCCGCCGCGACGAGGTC
TCCTGGAACGCGCTCCTCGCCGCACACGCCGCGTCCGGCGCGCACCCGGAAGCATGGCGC
CTCCTCCGGGCCATGCACGCGCAGGGGCTCGCTTCCAACACGTTCGCCCTCGGCTCGGCC
CTCCGCTCCGCCGCCGTAGCGCGGCGTCCTGCCATCGGCGCCCAACTGCAGTCGCTCGCT
TTGAAATCCGGCCTTGCCAACAATGTGTTCGCGGCAAGTGCATTACTTGATGTGTATGCT
AAATGTGGCCGCGTGAGGGATGCCCGACAGGTGTTTGATGGAATGCCAGAGCGGAACACT
GTTTCTTGGAATGCACTCATTGCCGGGTATACTGAATCTGGGGACATGGCATCTGCACTG
GAGCTGTTTCTTGAGATGGAAAGAGAAGGTTTGGCTCCAGATGAAGCAACATTTGCGTCG
CTGCTCACAGCAGTTGAGGGCCCAAGCTGTTTCTTGATGCACCAGTTGCATGGGAAGATT
GTGAAGTATGGATCTGCGTTAGGGCTGACAGTGTTGAATGCAGCAATCACTGCATATTCA
CAATGTGGGTCCCTGAAAGACTCTAGAAGGATCTTTGATGGAATTGGGGACATTAGGGAT
TTGATCTCATGGAATGCGATGCTTGGAGCTTACACTCACAATGGAATGGACGACGAGGCG
ATGAAATTCTTTGTTAGGATGATGCAAGAGAGTGGAGTTCATCCTGACATGTATAGTTTC
ACAAGTATCATAAGTTCATGTTCAGAGCATGGGCATGATGATCATCAAGGGAGAGTAATT
CATGGGTTGGTGATCAAGAGTGCTCTGGAAGGAGTCACGCCTGTTTGTAATGCTCTGATT
GCCATGTACACTAGGTACAATGAGAATTGCATGATGGAAGATGCATACAAGTGTTTTAAC
TCTTTGGTGCTTAAGGACACAGTGTCCTGGAATTCTATGCTGACTGGATATTCACAGCAC
GGTTTGAGTGCCGATGCCTTGAAGTTCTTCAGATGTATGTGTTCGGAAAATGTTAGAACC
GATGAGTATGCATTTTCTGCGGCTCTGCGGTCCTCTTCTGAACTTGCTGTGCTTCAGTTA
GGTAAACAAATACATGGTTTAGTCATCCATTCTGGTTTTGCTTCCAATGATTTTGTTTCC
AGCTCGCTAATCTTCATGTACTCTAAGAGTGGCATTATTGACGATGCACGGAAATCTTTT
GAGGAGGCAGATAAGAGTAGTTCAGTGCCTTGGAATGCTATGATATTTGGTTATGCACAA
CATGGACAAGCTGAAAACGTAGACATACTTTTCAATGAGATGCTGCAACGTAAGGCTCCT
TTGGATCACATAACGTTTGTTGGCCTAATTACTTCCTGCAGTCATGCTGGTCTTGTAGAT
GAAGGGTCAGAGATTCTCAATACAATGGAAACTAAGTATGGAGTTCCTCTTCGAATGGAG
CACTATGCATGTGGTGTTGATCTGTATGGGAGGGCTGGACAGCTTGATAAAGCAAAAAAG
CTAATTGATTCTATGCCATTTGAACCAGATGCCATGGTATGGATGACCCTATTGGGTGCT
TGCAGAATCCATGGGAATGTGGAACTAGCAAGCGATGTGGCCAGCCATCTATTTGTGGCA
GAACCTAGACAGCACTCTACCTATGTTCTCCTGTCCAGCATGTATTCTGGTCTTGGGATG
TGGAGTGATAGGGCAACAGTGCAGAGGGTAATGAAGAAACGAGGATTAAGCAAAGTCCCT
GGGTGGAGCTTGATTGAGGTGAAGAATGAGGTGCATTCTTTCAATGCAGAGGATAAATCA
CACCCAAAGATGGATGAGATCTATGAGATGTTAAGGGTGTTGCTTCAAGTAGAGCAGATG
CTTTCTAATTGTGAAGATGAAGATATTCTCATGATAACTTCCAGTGGCATATGAACTTGA
ATTTTGATAGTCCACTATTGTGTACGATATGTTCTCATCCAGATAGTGTTATTCCTTAAG
TAAACATATATCACAAATATTATTTTTCTGACCATTTATTTGGTTAGAATTTTGTGATTT
CTTTTAAGGTAGCATATTTAAATAGTACTATCAAGAGCT
clustalw multiple alignements is not computed in this case