These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7466#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 2572 fasta sequence [CCGAACCCCCGCGCCGCACGGATCCAAAACCCTAGCTCAGGTCGGCGGGGCTCGCGGCGGCGGAGATGATGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCAGCACCCGCCGCCGCCTCAGGCCGGGGGCGGCGGCGGCGGGGAGTTCTACCGGGGCCCGCCGCCGCAGCCGCCGATGCGGCAGCTCTCGGCGGCGTCCTCCACCAACATCCCCGGCGACTACGCCGCGCACCAGGGGCACCCCCCGCCGCAGCAGAACCAGCCGCCGTACGACGCTTATGGGGACAATTTCGGTGCTAAAAGGATGCGGAAGCCTGTCCAGCGGCGAACAGTGGACTACACAAGCACAGTCGTCCGTTATGTTCAAGCTCGCATGTGGCAGCGGGATGCTAGGGACAGGCCCACTGTGCAGCCGACTCCAGCTGCTGTTCTGGACATGTTACCGTCTGTTGCATACCCCGATAATCCCTCAACAAGTTTTGCTGCAAAATTTGTACATTCATCAATAAACAAGAACCGATGCTCTATTAATCGGGTCTTGGGCGTCGGCTTATTACGGGATCACAGAGTGGTGAATTCACCCTATGGGATGGCCAATCTTTTAATTTTGAAATGATCCTTCAGGCTCATGACCAAGCTGTAAGATCAATGATTTGGAGTAACAATGAGAACTGGATGGTCACTGGTGATGATGGTGGTGCAATCAAGTATTGGCAAAGTAACATGAACAATGTTAAAGTTAATAAAACAGCTCACAGAGAATCAGTTCGTGACTTGAGCTTTTGTAGAACAGACCTGAAGTTTTGCTCCTGTTCTGATGACACTACTGTGAAGGTTTGGGACTTTGCAAGATGCCAGGAAGAAAGATCCTTAACTGGCCATGGTTGGGATGTTAAGAGTGTCGATTGGCACCCTACAAAATCTTTACTGGTTTCAGGTGGTAAAGACTATCTCGTGAAACTTTGGGATGCAAAAAGTGGTAGAGAGCTACGTTCATTCCATGGTCATAAAAACATTGTACAATGTGTAAAGTGGAATCAGAATGGGAACTGGGTGTTGACTGCCTCCAAGGATCAGATTATTAAGCTATATGATATTAGATCCATGAAAGAGCTTGAATCCTTCCGTGGACACAACAAGGATGTGACTGCTTTGGCATGGCATCCATTTCATGAAGAATATTTTGTTAGCGGGAGCTATGATGGAGCGATCTTTCATTGGTTGGTTGGCCATGAAACTCCACAGATAGAGATAAATAACGCACATGACAATAGTGTGTGGGACCTTGCCTGGCATCCTGTTGGTTATCTACTTTGCAGTGGTGGCAATGATCATGCTACGCGATTTTGGTGTAGAAATAGGCCTGGTGATCTTACCCGCGATAAATACAACAGCGGACAGATGCAAGGTTACGGTGACCAACATCCTGCTTTTGCTGGCCGTGCTATGGGTGGATTCCAGATGCCTGAACCTTCAACAACACCTGGACCATTTAATACTGGATTATCACGAAATGAAGGCACAATTCCTGGCATTGGGGTCGCAATGCCTCTTGATGGATCTGATCATGGAGAGCAGAGGCCATCGATACCTGGCCTTCCACCTGGGCAACCTCCCTTGCCTCCAGGTCCCCATCCATCTCTTCTAGCCGGTGGGCAGCAACAGCAATATCAACAGATGCAGCAGCAGCATCCTCAATTTCCTCGACCACCACCTCCAAATATGCCTCAATTGCAGCCCCCAGCACACATGCTTCCACACGCGCAAGGATCTCGAGCACCACTTCCTCAGCTTCCATCAATGTCAGGTCCACCACCAGTGAATCCACCACTACCACCTATGCCTCACCCAATGGCAATGCAAGTACAAGGTTCATCAAACCAGATGATGCCTCAAATGCCACAGCACTTGATTGGCATGAATCAGACACACCAGGGCCCTCCTAGTAATATGCCTCCAATGGGTGGCTTTCCAAATGGAATGGGAAATATTCAAGGTGGATCTAGTGCTTCTGGCATGCAAAACTTTCCTATGGGAGGCATGTACAACAGGCCTCAGGGAAAAATGCCTCCACAAGCACAAGCACAGATGACATCCATCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTTCCGCCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCGCCGCAATGATCTCTTGTAACTGTGCAATGATGATTGGAAGCCTTCTATTTTCCATGCGGTAAAACATATGTAGTATGATCGTATTCGAGGAAGAGAGGAGTCTCCAGCAAACGGAGACGGATATCTTGGATAATGATAGTTAGGATTGTTCTTATCTCTTGCA-CCGTCGGCTAGGATACATTTTGCTGCCCTTGGACTGAACGGGCTGTGCTGTAACAAACCT-GTCCACCTAACAGCTTGTTTCTGCTCCCTATTTATGCTGCTCGTGTTGTATTAGTTCTTATGCTACTGAGGTTTTCAACATAGACGGAGGCTATCAAGCAGTTTTG-----AGTGAGAAAAATTTTGTCTGGCCCAGTGAATTTGATTGGTTGACGG] [+] EMBL AK111493 [CCGAACCCCCGCGCCGCACGGATCCAAAACCCTAGCTCAGGTCGGCGGGGCTCGCGGCGGCGGAGATGATGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGCCGCAGCACCCGCCGCCGCCTCAGGCCGGGGGCGGCGGCGGCGGGGAGTTCTACCGGGGCCCGCCGCCGCAGCCGCCGATGCGGCAGCTCTCGGCGGCGTCCTCCACCAACATCCCCGGCGACTACGCCGCGCACCAGGGGCACCCCCCGCCGCAGCAGAACCAGCCGCCGTACGACGCTTATGGGGACAATTTCGGTGCTAAAAGGATGCGGAAGCCTGTCCAGCGGCGAACAGTGGACTACACAAGCACAGTCGTCCGTTATGTTCAAGCTCGCATGTGGCAGCGGGATGCTAGGGACAGGCCCACTGTGCAGCCGACTCCAGCTGCTGTTCTGGACATGTTACCGTCTGTTGCATACCCCGATAATCCCTCAACAAGTTTTGCTGCAAAATTTGTACATTCATCAATAAACAAGAACCGATGCTCTATTAATCGGGTCTTGGGCGTCGGCTTATTACGGGATCACAGAGTGGTGAATTCACCCTATGGGATGGCCAATCTTTTAATTTTGAAATGATCCTTCAGGCTCATGACCAAGCTGTAAGATCAATGATTTGGAGTAACAATGAGAACTGGATGGTCACTGGTGATGATGGTGGTGCAATCAAGTATTGGCAAAGTAACATGAACAATGTTAAAGTTAATAAAACAGCTCACAGAGAATCAGTTCGTGACTTGAGCTTTTGTAGAACAGACCTGAAGTTTTGCTCCTGTTCTGATGACACTACTGTGAAGGTTTGGGACTTTGCAAGATGCCAGGAAGAAAGATCCTTAACTGGCCATGGTTGGGATGTTAAGAGTGTCGATTGGCACCCTACAAAATCTTTACTGGTTTCAGGTGGTAAAGACTATCTCGTGAAACTTTGGGATGCAAAAAGTGGTAGAGAGCTACGTTCATTCCATGGTCATAAAAACATTGTACAATGTGTAAAGTGGAATCAGAATGGGAACTGGGTGTTGACTGCCTCCAAGGATCAGATTATTAAGCTATATGATATTAGATCCATGAAAGAGCTTGAATCCTTCCGTGGACACAACAAGGATGTGACTGCTTTGGCATGGCATCCATTTCATGAAGAATATTTTGTTAGCGGGAGCTATGATGGAGCGATCTTTCATTGGTTGGTTGGCCATGAAACTCCACAGATAGAGATAAATAACGCACATGACAATAGTGTGTGGGACCTTGCCTGGCATCCTGTTGGTTATCTACTTTGCAGTGGTGGCAATGATCATGCTACGCGATTTTGGTGTAGAAATAGGCCTGGTGATCTTACCCGCGATAAATACAACAGCGGACAGATGCAAGGTTACGGTGACCAACATCCTGCTTTTGCTGGCCGTGCTATGGGTGGATTCCAGATGCCTGAACCTTCAACAACACCTGGACCATTTAATACTGGATTATCACGAAATGAAGGCACAATTCCTGGCATTGGGGTCGCAATGCCTCTTGATGGATCTGATCATGGAGAGCAGAGGCCATCGATACCTGGCCTTCCACCTGGGCAACCTCCCTTGCCTCCAGGTCCCCATCCATCTCTTCTAGCCGGTGGGCAGCAACAGCAATATCAACAGATGCAGCAGCAGCATCCTCAATTTCCTCGACCACCACCTCCAAATATGCCTCAATTGCAGCCCCCAGCACACATGCTTCCACACGCGCAAGGATCTCGAGCACCACTTCCTCAGCTTCCATCAATGTCAGGTCCACCACCAGTGAATCCACCACTACCACCTATGCCTCACCCAATGGCAATGCAAGTACAAGGTTCATCAAACCAGATGATGCCTCAAATGCCACAGCACTTGATTGGCATGAATCAGACACACCAGGGCCCTCCTAGTAATATGCCTCCAATGGGTGGCTTTCCAAATGGAATGGGAAATATTCAAGGTGGATCTAGTGCTTCTGGCATGCAAAACTTTCCTATGGGAGGCATGTACAACAGGCCTCAGGGAAAAATGCCTCCACAAGCACAAGCACAGATGACATCCATCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTTCCGCCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCGCCGCAATGATCTCTTGTAACTGTGCAATGATGATTGGAAGCCTTCTATTTTCCATGCGGTAAAACATATGTAGTATGATCGTATTCGAGGAAGAGAGGAGTCTCCAGCAAACGGAGACGGATATCTTGGATAATGATAGTTAGGATTGTTCTTATCTCTTGCA CCGTCGGCTAGGATACATTTTGCTGCCCTTGGACTGAACGGGCTGTGCTGTAACAAACCT GTCCACCTAACAGCTTGTTTCTGCTCCCTATTTATGCTGCTCGTGTTGTATTAGTTCTTATGCTACTGAGGTTTTCAACATAGACGGAGGCTATCAAGCAGTTTTGTAACAAGTGAGAATCATTTTGTCTGGCCCAGTGAATTTGATTGGTTGACGG] [+] EMBL AK101794 [ TAGAAATAGGCCTGGTGATCTTACCCGCGATAAATACAACAGCGGACAGATGCAAGGTTACGGTGACCAACATCCTGCTTTTGCTGGCCGTGCTATGGGTGGATTCCAGATGCCTGAACCTTCAACAACACCTGGACCATTTAATACTGGATTATCACGAAATGAAGGCACAATTCCTGGCATTGGGGTCGCAATGCCTCTTGATGGATCTGATCATGGAGAGCAGAGGCCATCGATACCTGGCCTTCCACCTGGGCAACCTCCCTTGCCTCCAGGTCCCCATCCATCTCTTCTAGCCGGTGGGCAGCAACAGCAATATCAACAGATGCAGCAGCAGCATCCTCAATTTCCTCGACCACCACCTCCAAATATGCCTCAATTGCAGCCCCCAGCACACATGCTTCCACACGCGCAAGGATCTCGAGCACCACTTCCTCAGCTTCCATCAATGTCAGGTCCACCACCAGTGAATCCACCACTACCACCTATGCCTCACCCAATGGCAATGCAAGTACAAGGTTCATCAAACCAGATGATGCCTCAAATGCCACAGCACTTGATTGGCATGAATCAGACACACCAGGGCCCTCCTAGTAATATGCCTCCAATGGGTGGCTTTCCAAATGGAATGGGAAATATTCAAGGTGGATCTAGTGCTTCTGGCATGCAAAACTTTCCTATGGGAGGCATGTACAACAGGCCTCAGGGAAAAATGCCTCCACAAGCACAAGCACAGATGACATCCATCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTTCCGCCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCGCCGCAATGATCTCTTGTAACTGTGCAATGATGATTGGAAGCCTTCTATTTTCCATGCGGTAAAACATATGTAGTATGATCGTATTCGAGGAAGAGAGGACTCTCCAGCAAACGGAGACGGATATCTTGGATAATGATAGTTAGGATTGTTCTTATCTCTTGCA CCGTCGGCTAGGATACATTTTGCTGCCCTTGGACTGAACGGGCTGTGCTGTAACAAACCT GTCCACCTAACAGCTTGTTTCTGCTCCCTATTTATGCTGCTCGTGTTGTATTAGTTCTTATGCTACTGAGGTTTTCAACATAGACGGAGGCTATCAA ] [+] EMBL BI801095 [ GGCATGTACAACA GCCTCAGGGACAAATGCCTCCACAAGCACAAGCACAGATGACATCCATCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTTCCGCCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCGCCGCAATGATCTCTTGTAACTGTGCAATGATGATTGGAAGCCTTCTATTTTCCATGCGGTAAAACATATGTAGTATGATCGTATTCGAGGAAGAGACGAGTCTCCAGCAAACGGAGACGGATATCTTGGATAATGATAGTTAGGATTGTTCTTATCTCTTGCA CCGTCGGCTAGGATACATTTTGCTGCCCTTGGACTGAACGGGCTGTGCTGTAACAAACCT GTCCACCTAACAGCTTGTTTCTGCTCCCTATTTATGCTGCTCATGTTGTATTAGTTCTTATGCTACTGAGGTTTTCAACATAGACGGAGGCTATCAAGCAGTTTTG AGTGAGAAAAA ] [+] EMBL BM419200 [ ccgCCCTGGTCTGAGCTCATATCAGCCGGGTATGGGCAATGTGGGCCTTCCGCCGCCACCCCCACAGCATCCACCGCCTCGCGGTTCAGCGCCGCAATGATCTCTTGTAACTGTGCAATGATGATTGGAANCCTTCTATTTTCCATGCGGTAAAACATATGTAGTATGATCGTATTCGAGGAAGAGACGAGTCTCCAGCAAACGGAGACGGATATCTTGGATAATGATAGTTAGGATTGTTCTTATCTCTTGCACCCGTCGGCTAGGATACATTTTGCTGCCCTTGGACTGAACGGGCTGTGCTGTAACCAACCTCGTCCACCTAACAGCTTGTTTCTGCTCCCTATTTATGCTGCTCATGTTGTATTAGTTNTTATGCTACTGAGGTTTTCAACATAGACGGAGGCTATCAANCAGTTTTG AGTGAGAAAAAaaaaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||