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Oryza sativa
cluster # 7468 cluster # 7468       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7468#0 length = 4171 sequences # 4  

consensusID : consensus_7468#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 4171
fasta sequence
                              [TCAGTACGTAGAAAACAAACCCAACCCAGCCGTACGTTCTTCAACATGCGATCTGCTTACCATCTGATGCCTCTGCTAGCCATGCTACTCATCCTCGTCCTTGCTGACCATACAAGCTCCACGGAAGCAGTAGCACCGGCTGCGTGCCTCCCAGACCAGGCAGCGGCGCTGCTCCAGCTGAAACGCTCCTTCAACGCCACCATCGGTGACTACTCTGCCGCCTTCCGGTCATGGGTTGCCGTTGCCGGCGCAGACTGTTGCGGCTGGGACGGCGTCCGGTGCGGCGGCGCCGGCGGCCGTGTCACCTCGCTCGACCTGAGCCACCGTGATTTGCAAGCCGCCTCAGGTCTTGACGACGCACTCTTCAGCCTAACCTCGCTAGAATACCTTGACCTCTCTTCCAACGACTTCGGCAAGTCCCAGATGCCAGCCACAGGGTTCGAGAAGCTCACCGGGCTCACCCATCTTGACCTCTCCAACACAAACTTCGCCGGCCTGGTACCTGCCGGCATCGGCCGCCTCACCAGACTCTCCTACCTTGACCTGTCGACAACATTTTTTGTAGAGGAGTTGGACGACGAGTACAGCATCACGTACTACTACTCGGACACAATGGCACAGCTCTCGGAGTCGAGCTTGGAGACCTTGCTCGCAAACCTCACCAACCTGGAGGAGCTTCGCCTGGGCATGGTGGTGGTGAAGAACATGTCGAGCAACGGCACTGCACGGTGGTGCGACGCCATGGCCAGGTCCTCCCCGAAGCTGAGGGTCATTAGCATGCCGTACTGCTCACTCTCCGGTCCCATTTGCCACTCACTCTCAGCCTTGCGATCACTTGCAGTGATAGAGCTGCACTACAATCATTTATCTGGTCCAGTTCCTGGGTTCTTGGCTACTCTCTCCAACCTAAGTGTCCTTCAGCTTTCAAACAACAAGTTTGAGGGATGGTTCCCTCCCATCATCTTCCAGCACGAGAAATTAACAACTATTAACCTCACCAAAAATCTTGGAATCTCCGGAAATTTGCCTAATTTCTCAGGTGAGAGTGTCTTACAGAGTATATCTGTCAGCAACACCAACTTCTCCGGCACAATTCCAAGTTCTATCAGCAACCTCAAATCTCTGAAGAAGTTGGCTCTTGGAGCTAGTGGTTTCTCTGGAGTGCTGCCATCCTCCATCGGTAAGATGAAATCCTTATCTTTACTAGAGGTGTCTGGGTTAGATCTAGTAGGATCCATACCATCATGGATCTCAAACCTGACTTCTCTTAATGTTCTCAAGTTCTTCACTTGTGGATTGTCTGGACCCATACCATCGTCCATAGGGTACTTAACAAAATTGACAAAATTGGCACTGTACAATTGCCAGTTTTCAGGCGAGATACCTTCACTGATCTTAAATTTGACTAAATTGGAAACCCTCCTGCTCCATTCAAACAGTTTTGTCGGGATAGTGGAACTAACCTCATACTCAAAACTGCAAAACCTGTATGTCCTGAATCTTTCAAACAATAAACTAATTGTGATAGATGGAGAAAATAATTCTTCTCTAGTGTCATATCCCAGTATTAGCTTCTTACGTCTCGCATCTTGTAGCATATCTAGCTTTCCTAACATCTTGAGGCATCTCCCTGAGATTACTAGTCTCGACCTTTCATATAACCAACTGCAAGGTGCAATACCTCAGTGGACATGGGAGACCTGGACGATGGACTTTTCCTTGCTGAACCTATCACATAATAACCTTAGGAGCATTGGACCTGATCCTTTGCTTAATCTTTACATTGAGTTCTTAGATCTCAGTTTCAACAATTTTGAAGGCACCATACCTATACCAGAACAAGGAAGTGTCACACTTGATTACTCAAACAACCGATTCTCATCTATGCCTATGCCTCTTAATTTCTCTACTTACCTTATGAATACAGTAATTTTCAAGGTCTCCAGAAATAGCCTCTCTGGATACATTCCACCAACGATTTGTGATGCAATTAAGAGTTTACAAATTATTGATCTCTCTTATAACAACTTGACTGGATCAATACCATCATGTCTGATGGAGGATGTAGGTGCACTACAAGTCTTAAATCTAAAAGGAAATAAGCTTGATGGCGAGTTGCCTGATAATATCAAAGAAGGTTGTGCATTAAGTGCATTGGATTTTAGCGACAATCTGATTCAAGGACAGCTACCCAGATCTCTAGTTGCTTGCAGGAATCTGGAGATCCTTGACATTGGAAACAATCAGATTAGTGATTCCTTCCCTTGTTGGATGAGTAAACTTCCTGTGCTTCGAGTCCTGGTCCTCCAGTCTAACAAGTTCATTGGGCAGGTACTGGATCCTTCATATACTAGATACGGGAATAACTGTCAATTTACAAGTTTGCGGATTGCCGACATAGCCTCAAACAACTTCAGTGGCACGTTGCCAGAAGAGTGGTTTAAGATGCTTAGGTCTATGATGTCCAGCTCTGATAATGGAACTTCAGTCATGGAACATCTCTATCCCCGGGAGAGGTACAAGTTTACTGTTGCAGTCACATACAAAGGCAGTCACATGACATTTTCCAAGATTTTAACGTCACTTGTACTCATCGATGTCTCAAACAATAAATTCCATGGTAACATCCCTGCCGGCATTGAAGAACTTGTGTTACTTCATGGGCTCAACATGTCTCATAACGTCCTTACAGGACCAATTCCCACTCAATTTGGCAAATTAGACAACCTTGAGACATTAGACCTCTCCTCGAATAAGCTTTCTGGTGAGATCCCGCAGGAGCTGGCATCATTGAACTTCCTTTCAATATTGAATTTGTCTTATAATATGTTGGATGGAAAAATACCACAATCATTACACTTCTCCACATTTTCCAATGACTCTTTTGTGGGGAATATTGGGTTGTGTGGACCTCCGTTGTCTAAACAATGCGGTTATCCAACTGAACCAAACATGATGTCACACACTGCTGAGAAGAATTCCATAGATGTTCTACTCTTTCTCTTCACAGCATTGGGGTTTGGTATCTGTTTCGGAATTACAATTCTAGTGATATGGGGAGGCCACAACAGGAAACAACCTTGTGAGAGAGCAATTTTATACATTGGCAGAATAGTTTGGTAGTGACTCTTGGTCAACCCAGCAACATTTAGTAAACTAATATTAATAATGAGGCATGTATGAGCTAAATAAAGAAGTGATATGTTATCACTGATATGTGGTTGTTCTAATTTAAGCAACAAAGCAGACAGCATTGTATGCATGAAAAAGATAATTATGTCTGAGAGCTATGTAGTTCTCAATTGCAGCATATTTCACGGCCTCCAAGCACGCTTAGTATGACAAGTGGGCTGCCTAGTCAAAAACCTCAGGGTCTAATGGAGTTGCAATTCTCTGATAATTCCATTCGTTATTGTTGTAGCTAAGTGAAATGTGTCGCTAATGTTGTAGCAAGATGATAGTTGTCATTAAAATTGCAGCTTTTTCAAACTTATTCTTTACAGGTTTCATATTTTGTATATGCTGAGCTAACAAAAAAAGTCACACTGCAGTTCATTAGTTTGGGCAAATACCCTCACACGTTCTAGGCCATCCGAACTTTACATATGTGGTGTCATTATTTTGAAATAATGAATATAGAAAAAGGCATAACTACTTTTTCCTTAAAAGAAATAAATCATGCAGATGGCTCAGTCCCTTCAACACGATCGTTATATTGACCATCTGAGGTAAGACACCAACTATTTGTACATCTACAAGGTTATATGGTTATTAATGTAGGAGAACAGTACCTCTTCGGCTCTGTCATTTCGTCGAACGGTTGGCGGGCGAAATCAATCAATGTTGCAGACTACCTTTACACGCACCGAACTAATCACGGATTCTTCTCTAATAAAACTAATTACATATTCTGATGCTGGAAGATTTCTAGTCACGGGGTTAATTACTGCGATCGAACTCTAACTGGGATTGCATACGAGGAAGAGGAAAAATCTGGCGGAAGGCAGCAAGCAAAAGGAATTGAGGATTACCTGAATGGAAAAATCGCTGCCGGAATACCGGAGACAATTCGTCGAGGAGGAGACAAAAGAAGCGAAGTCCCGCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCACCGCCGGTCGCCGCCGCCGCTGGCGTTGCGTGTCTGCTCG]

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[+] EMBL CF293954             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGTGCTTCGAGTCCTGGTTCTCCAGTCTAACAAGTTCACTGGGCAGGTACTGGATCCTTCATATACTAGATACGGGAATAACTGTCAATTTACAAGTTTGCGGATTGCCGACATAGCCTCAAACAACTTCAGTGGCACGTTGCCAGAATAGTGGTTTAAGATGCTTAGGTCTATGATGTCCAGCTCTGATAATGGAACTTCAGTCATGGAACATCTCTATCCCCGGGAGAGGTACAAGTTTACTGTTGCAGTCACATACAAAGGCAGTCACATGACATTTTCCAAGATTTTAACGTCACTTGTACTCATCGATGTCTCAAACAATAAATTCCATGGTAACATCCCTGCCGGCATTGAAGAACTTGTGTTACTTCATGGGCTCAACATGTCTCATAACGTCCTTACAGGACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CF293953             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGCAGGAGCTGGCATCATTGAACTTCCTTTCAATATTGAATTTGTCTTATAATATGTTGGATGGAAAAATACCACAATCATTACACTTCTCCACATTTTCCAATGACTCTTTTGTGGGGAATATTAGGTTGTGTGGACCTCCGTTGTCTAAACAATGCGGTTATCCAACTGAACCAAACATGATGTCACACACTGCTGAGAAGAATTCCATAGATGTTCTACTCTTTCTCTTCACAGCATTGGGGTTTGGTATCTGTTTCGGAATTACAATTCTAGTGATATGGGGAGGCCACAACAGGAAACAACCTTGTGAGAGAGCAATTTTATACATTGGCAGAATAGTTTGGTAGTGACTCTTGGTCAACCCAGCAACATTTAGTAAACTAATATTAATAATGAGGCATGTATGAGCTAAATAAAGAAGTGATATGTTATCACTGATATGTGGTTGTTCTAATTTAAGCAACAAAGCGGACAGCATTGTATGCATGAAAAAGATAATTATGTCTGAGAGCTATGTAGTTCTCAATTGCAGCATATTTCACGGCCaaaaaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_7468#0 TCAGTACGTAGAAAACAAACCCAACCCAGCCGTACGTTCTTCAACATGCGATCTGCTTAC CATCTGATGCCTCTGCTAGCCATGCTACTCATCCTCGTCCTTGCTGACCATACAAGCTCC ACGGAAGCAGTAGCACCGGCTGCGTGCCTCCCAGACCAGGCAGCGGCGCTGCTCCAGCTG AAACGCTCCTTCAACGCCACCATCGGTGACTACTCTGCCGCCTTCCGGTCATGGGTTGCC GTTGCCGGCGCAGACTGTTGCGGCTGGGACGGCGTCCGGTGCGGCGGCGCCGGCGGCCGT GTCACCTCGCTCGACCTGAGCCACCGTGATTTGCAAGCCGCCTCAGGTCTTGACGACGCA CTCTTCAGCCTAACCTCGCTAGAATACCTTGACCTCTCTTCCAACGACTTCGGCAAGTCC CAGATGCCAGCCACAGGGTTCGAGAAGCTCACCGGGCTCACCCATCTTGACCTCTCCAAC ACAAACTTCGCCGGCCTGGTACCTGCCGGCATCGGCCGCCTCACCAGACTCTCCTACCTT GACCTGTCGACAACATTTTTTGTAGAGGAGTTGGACGACGAGTACAGCATCACGTACTAC TACTCGGACACAATGGCACAGCTCTCGGAGTCGAGCTTGGAGACCTTGCTCGCAAACCTC ACCAACCTGGAGGAGCTTCGCCTGGGCATGGTGGTGGTGAAGAACATGTCGAGCAACGGC ACTGCACGGTGGTGCGACGCCATGGCCAGGTCCTCCCCGAAGCTGAGGGTCATTAGCATG CCGTACTGCTCACTCTCCGGTCCCATTTGCCACTCACTCTCAGCCTTGCGATCACTTGCA GTGATAGAGCTGCACTACAATCATTTATCTGGTCCAGTTCCTGGGTTCTTGGCTACTCTC TCCAACCTAAGTGTCCTTCAGCTTTCAAACAACAAGTTTGAGGGATGGTTCCCTCCCATC ATCTTCCAGCACGAGAAATTAACAACTATTAACCTCACCAAAAATCTTGGAATCTCCGGA AATTTGCCTAATTTCTCAGGTGAGAGTGTCTTACAGAGTATATCTGTCAGCAACACCAAC TTCTCCGGCACAATTCCAAGTTCTATCAGCAACCTCAAATCTCTGAAGAAGTTGGCTCTT GGAGCTAGTGGTTTCTCTGGAGTGCTGCCATCCTCCATCGGTAAGATGAAATCCTTATCT TTACTAGAGGTGTCTGGGTTAGATCTAGTAGGATCCATACCATCATGGATCTCAAACCTG ACTTCTCTTAATGTTCTCAAGTTCTTCACTTGTGGATTGTCTGGACCCATACCATCGTCC ATAGGGTACTTAACAAAATTGACAAAATTGGCACTGTACAATTGCCAGTTTTCAGGCGAG ATACCTTCACTGATCTTAAATTTGACTAAATTGGAAACCCTCCTGCTCCATTCAAACAGT TTTGTCGGGATAGTGGAACTAACCTCATACTCAAAACTGCAAAACCTGTATGTCCTGAAT CTTTCAAACAATAAACTAATTGTGATAGATGGAGAAAATAATTCTTCTCTAGTGTCATAT CCCAGTATTAGCTTCTTACGTCTCGCATCTTGTAGCATATCTAGCTTTCCTAACATCTTG AGGCATCTCCCTGAGATTACTAGTCTCGACCTTTCATATAACCAACTGCAAGGTGCAATA CCTCAGTGGACATGGGAGACCTGGACGATGGACTTTTCCTTGCTGAACCTATCACATAAT AACCTTAGGAGCATTGGACCTGATCCTTTGCTTAATCTTTACATTGAGTTCTTAGATCTC AGTTTCAACAATTTTGAAGGCACCATACCTATACCAGAACAAGGAAGTGTCACACTTGAT TACTCAAACAACCGATTCTCATCTATGCCTATGCCTCTTAATTTCTCTACTTACCTTATG AATACAGTAATTTTCAAGGTCTCCAGAAATAGCCTCTCTGGATACATTCCACCAACGATT TGTGATGCAATTAAGAGTTTACAAATTATTGATCTCTCTTATAACAACTTGACTGGATCA ATACCATCATGTCTGATGGAGGATGTAGGTGCACTACAAGTCTTAAATCTAAAAGGAAAT AAGCTTGATGGCGAGTTGCCTGATAATATCAAAGAAGGTTGTGCATTAAGTGCATTGGAT TTTAGCGACAATCTGATTCAAGGACAGCTACCCAGATCTCTAGTTGCTTGCAGGAATCTG GAGATCCTTGACATTGGAAACAATCAGATTAGTGATTCCTTCCCTTGTTGGATGAGTAAA CTTCCTGTGCTTCGAGTCCTGGTCCTCCAGTCTAACAAGTTCATTGGGCAGGTACTGGAT CCTTCATATACTAGATACGGGAATAACTGTCAATTTACAAGTTTGCGGATTGCCGACATA GCCTCAAACAACTTCAGTGGCACGTTGCCAGAAGAGTGGTTTAAGATGCTTAGGTCTATG ATGTCCAGCTCTGATAATGGAACTTCAGTCATGGAACATCTCTATCCCCGGGAGAGGTAC AAGTTTACTGTTGCAGTCACATACAAAGGCAGTCACATGACATTTTCCAAGATTTTAACG TCACTTGTACTCATCGATGTCTCAAACAATAAATTCCATGGTAACATCCCTGCCGGCATT GAAGAACTTGTGTTACTTCATGGGCTCAACATGTCTCATAACGTCCTTACAGGACCAATT CCCACTCAATTTGGCAAATTAGACAACCTTGAGACATTAGACCTCTCCTCGAATAAGCTT TCTGGTGAGATCCCGCAGGAGCTGGCATCATTGAACTTCCTTTCAATATTGAATTTGTCT TATAATATGTTGGATGGAAAAATACCACAATCATTACACTTCTCCACATTTTCCAATGAC TCTTTTGTGGGGAATATTGGGTTGTGTGGACCTCCGTTGTCTAAACAATGCGGTTATCCA ACTGAACCAAACATGATGTCACACACTGCTGAGAAGAATTCCATAGATGTTCTACTCTTT CTCTTCACAGCATTGGGGTTTGGTATCTGTTTCGGAATTACAATTCTAGTGATATGGGGA GGCCACAACAGGAAACAACCTTGTGAGAGAGCAATTTTATACATTGGCAGAATAGTTTGG TAGTGACTCTTGGTCAACCCAGCAACATTTAGTAAACTAATATTAATAATGAGGCATGTA TGAGCTAAATAAAGAAGTGATATGTTATCACTGATATGTGGTTGTTCTAATTTAAGCAAC AAAGCAGACAGCATTGTATGCATGAAAAAGATAATTATGTCTGAGAGCTATGTAGTTCTC AATTGCAGCATATTTCACGGCCTCCAAGCACGCTTAGTATGACAAGTGGGCTGCCTAGTC AAAAACCTCAGGGTCTAATGGAGTTGCAATTCTCTGATAATTCCATTCGTTATTGTTGTA GCTAAGTGAAATGTGTCGCTAATGTTGTAGCAAGATGATAGTTGTCATTAAAATTGCAGC TTTTTCAAACTTATTCTTTACAGGTTTCATATTTTGTATATGCTGAGCTAACAAAAAAAG TCACACTGCAGTTCATTAGTTTGGGCAAATACCCTCACACGTTCTAGGCCATCCGAACTT TACATATGTGGTGTCATTATTTTGAAATAATGAATATAGAAAAAGGCATAACTACTTTTT CCTTAAAAGAAATAAATCATGCAGATGGCTCAGTCCCTTCAACACGATCGTTATATTGAC CATCTGAGGTAAGACACCAACTATTTGTACATCTACAAGGTTATATGGTTATTAATGTAG GAGAACAGTACCTCTTCGGCTCTGTCATTTCGTCGAACGGTTGGCGGGCGAAATCAATCA ATGTTGCAGACTACCTTTACACGCACCGAACTAATCACGGATTCTTCTCTAATAAAACTA ATTACATATTCTGATGCTGGAAGATTTCTAGTCACGGGGTTAATTACTGCGATCGAACTC TAACTGGGATTGCATACGAGGAAGAGGAAAAATCTGGCGGAAGGCAGCAAGCAAAAGGAA TTGAGGATTACCTGAATGGAAAAATCGCTGCCGGAATACCGGAGACAATTCGTCGAGGAG GAGACAAAAGAAGCGAAGTCCCGCCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCACCGCCGGTC GCCGCCGCCGCTGGCGTTGCGTGTCTGCTCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)