cluster # 7478

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Oryza sativa
cluster # 7478 cluster # 7478 Sequences # 4 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7478#0 length = 603 sequences # 4

consensusID : consensus_7478#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 603
fasta sequence

                              [ANNCNGNANCNG-ANCGANCGACGACGACGACGACCACCGCGCGAACAGAGACTGCTGCCGGTGNTGAAGGAGGTGGAGCCGNCGTGCGTGTGCGACGGCTGCTCCGCCTTCCGCCATTCCTCGTGAAGCCGCAGCACAAGTACACCGTCAAGGTCGGCGACANTGCAAGTACACCTACCACTGCGGCGGCTACTAGCTAATTAAGCTAGCGAATGTACCATGCATTACTGAGCTTAAGCTGCGTGTTTTCTTCAGGATTAGCACTGGTAAGTGTGATTAAGAAGAGCAGTATTATGGTATTTTGCTGTGTGTTAATTAATTACCACCAGTCGCTTAACACTTCGTTTTTATAGTATATATA-GAGA-GATATATACATATTGTAATAC-TGGTGTGT-ATGTTCTTG-TGTTTGCTTGGTCTGATCTTGGGCTAGCTATGGAAGTTTGTGTACTAGTTCCTTGTAATGTTTAATTTCTAANAACACTGTGTACTCAAGCGTACGTGTGCATGCATTGGGGTTGGAGAACTAACCATTGCATTGCAAACTGGAGCTTNTGTACCACGTGCCATATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA]

[+] EMBL C73630               [ANNCNGNANCNG ANCGANCGACGACGACGACGACCACCGCGCGAACAGAGACTGCTGCCGGTGNTGAAGGAGGTGGAGCCGNCGTGCGTGTGCGACGGCTGCTCCGCCTTCCGCCATTCCTCGTGAAGCCGCAGCACAAGTACACCGTCAAGGTCGGCGACANTGCAAGTACACCTACCACTGCGGCGGCTACTAGCTAATTAAGCTAGCGAATGTACCATGCATTACTGAGCTTAAGCTGCGTGTTTTCTTCAGGATTAGCACTGGTAAGTGTGATTAAGAAGAGCAGTATTATGGTATTTTGCTGTGTGTTAATTAATTACCACCAGTCGCTTAACACTTCGTTTTTATAGTATATATA GAGAGGNTATATACATATTGTAATACTTGGTGTGTAATG TCTTGTTGTTTGCTTGGCTTNATCTTGGGCTAGCTATGGA                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL C73631               [ANNCNGNANCTGNACNGACGGACGACGACGACGACCACCGCGCGAACAGAGACTGCTGCCGGTGNTGAAGGAGGTGGAGCCGNCGTGCCTGTGCGACGGCTGCTCCGCCTTCCGCCATTCCTCGTGAAGCCGCAGCACAAGTACACCGTCAAGGTCGGCGACANTGCAAGTACACCTACCACTGCGGCGGCTACTAGCTAATTAAGCTAGCGAATGTACCATGCATTACTGAGCTTAAGNTGCGTGTTTTCTTCAGGATTAGCACTGGTAAGTGTGATTAAGAAGAGCAGTATTATGGTATTTTGCTGTGTGTTAATTAATTACCACCAGTCGCTTAACACTTCGTTTTTATAGTATATATAGGAGA GATATATACATATTGTAATAC TGGTGTGT ATGTTCTTG TGTTTGCTTGG NTGATCTTGGGCTAGCTATGGAAG                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL AU182660             [                                                                                                                                                                                  CCACTGCGGCGGCTACTAGCTAATTAAGCTAGCGAATGTACCATGCATTACTGAGCTTAAGCTGCGTGTTTTNTTCAGGATTAGCNCTGGTAAGTGTGATTAAGAAGAGCAGTATTATGGTATTTTGCTGTGTGTTAATTAATTACCNCCAGTCGCTTAACACTTCGTTTTTATAGTATATATA GAGA GATATATACATATTGTAANAC TGGTGTGT ATGTTCTTG TGTTTGC TGGTCTGATCTTGGGCTAGCTATGGAAGTTTGTGTACTAGTTCCTTGTAATGTTTAATTTCTAANAACACTGTGTACTCAAGCGTACGTGTGCATGCATTGGGGTTGGAGAACTAACCATTGCATTGCAAACTGGAGCTTNTGTACCACGTGCCATATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA]
[+] EMBL C99434               [                                                                                                                                                                                                                                                                      CACTGGTAAGTGTGATTAAGAAGAGCNGTATTATGGTATTTTGCTGTGTGTTAATTAATTACCACCAGTCGCTTAACACTTCGTTTTTATAGTATATATA GAGA GATATATACATATTGTAATAC TGGTGTGT ATGTTCTTG TGTTTGC TGGTCTGATCTTGGGCTAGCTATGGAAGTTTGTGTACTAGTTCCTTGTAATGTTTAATTTCTAAGAACACTGTGTACTCAAGCGTACGTGTGCATGCATTGGGGTTGGAGAACTAACCATTGCATTGCAAACTGGAGCTTCTGTACCACGTGCCATATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAA]




>consensus_7478#0
ANNCNGNANCNGANCGANCGACGACGACGACGACCACCGCGCGAACAGAGACTGCTGCCG
GTGNTGAAGGAGGTGGAGCCGNCGTGCGTGTGCGACGGCTGCTCCGCCTTCCGCCATTCC
TCGTGAAGCCGCAGCACAAGTACACCGTCAAGGTCGGCGACANTGCAAGTACACCTACCA
CTGCGGCGGCTACTAGCTAATTAAGCTAGCGAATGTACCATGCATTACTGAGCTTAAGCT
GCGTGTTTTCTTCAGGATTAGCACTGGTAAGTGTGATTAAGAAGAGCAGTATTATGGTAT
TTTGCTGTGTGTTAATTAATTACCACCAGTCGCTTAACACTTCGTTTTTATAGTATATAT
AGAGAGATATATACATATTGTAATACTGGTGTGTATGTTCTTGTGTTTGCTTGGTCTGAT
CTTGGGCTAGCTATGGAAGTTTGTGTACTAGTTCCTTGTAATGTTTAATTTCTAANAACA
CTGTGTACTCAAGCGTACGTGTGCATGCATTGGGGTTGGAGAACTAACCATTGCATTGCA
AACTGGAGCTTNTGTACCACGTGCCATATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAA
AAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case