cluster # 7662

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Oryza sativa
cluster # 7662 cluster # 7662 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7662#0 length = 446 sequences # 5

consensusID : consensus_7662#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 446
fasta sequence

                              [GCCTTCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATGCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGGCTGAACTAAGGGTGGTTGGNTGGTTNCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL C22424               [GCCTTCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATGCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTNTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGGCTGAACTAAGGGNGGTT                                                   ]
[+] EMBL C22350               [    TCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTNTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATNCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGGCTGAACTAAGNGTGGTTGGNTGGTTNCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL C22461               [    TCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATNCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAATTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAAAAAAA                                                                      ]
[-] EMBL CB654211             [     CCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGATTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATGCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTGTTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGCGTGAGTGTGCACCCCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTC TTTTTTTTTTGGCTTTTTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGTTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTTTAATTTTCCCAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTTTGCCAAAACCGGCAAGGTTTAACCCCAGAAATGAAAGTTTAAAGGAAGAGTGGTTGGATGGTTgt                                         ]
[+] EMBL CF328294             [                                                                                                                                                                                                                                    TTTTTTTGGCTTTCTCCCCAGTTTATAACCTGTAAATATGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTCACGCCCTCTAATTTTCACAGTGGACTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCA                                                                                                     ]




>consensus_7662#0
GCCTTCCGAGCTACAGAGTAAACCGCAGACTAACGACGAACAGCGTCCACTGTAGGGCGA
TTCCGAACCCCAAGTGCTCCCCTGCTGTCCCAGCATGCAGGGTGAGATGAGAGTGTGCTG
TTTCAGTTGCTCCTGGAATAGGTTCAGTTGTACATTGCAAGTCTAAACCGTGGATGGTGC
GTGAGTGTGCACACCTGCGCTGTGTGCTTTTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTGGCTT
TCTCCCCAGTTTTCAACCTGTAAATTTGCTCTGCATGGTGGTGCTTGTAAGGCCCTCTAA
TTTTCACAGTGGTCTTATGTGTTGTTGACTGTGTTTGCTCTGCCAAAACCGGCAAGGTTT
AACCCCAGAAATGAAAGGCTGAACTAAGGGTGGTTGGNTGGTTNCTAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case