cluster # 7666

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 7666 cluster # 7666 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7666#0 length = 1731 sequences # 5
consensusID : consensus_7666#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1731
fasta sequence
                              [TCCTACTCAGCCTACCAATCCCATCTTTCTCTCCCACTATGCCGGATTCATCTTCATATTCAGATGATTCCGATGAACTAGCCCCATCAAACATTATGGAGCAATATGTTGCTGAGCGGGGGGGTTCTAGACTCCTTTGCTAGGAGGCTCACTATAAAGATCAAGGCTAGTCTCTCAGTTGGGGTATCTTGGAGACGGAGTGGTCCAAGGAAGTGCATTTAGAGGGATCATGCTGCTGCTCATCAGCGTCTTGTGGAGGACTACTTCGCTGCAGAACCACTCTACACTAAGAGTATGTTTCGTACAAGATTCCGTATGAATAGACGCCTCTTCCTACGCATTGTGAATGCCCTTGGTCAGTGTTCTCCCTATTTCACTTATAGGGTAGATTGTACTGGTCGAATAGGGCTTTCACCACTGCAAAAGTGTACAGCAGCCATGCGCATGCTGGCATATGGCACTCCTGCAGATGCCCTTGATGAGTACTTGAAGATTGGGAAGTGTACTTCATTAGAGTGCTTGGATAGGTTTACACGGGGGGTGATTGAGGTGTTCGGTGGGGAGTACTTGCGACGCCCCACATCCTCGGATGTTGAGCGTCTACTTCAGGTCAACGAGTCTCGTGGTTTTTCTGGAATGTTAGGAAGTATAGATTGCATGCACTGGCGTTGGGAGAAGTGTCCTTTAGCATGGAGGGGGCAATTCACCCGTGGTGATTATGGAGTACCAACAATAGTCCTAGAAGCTGTTGCTTCCCAGGACTTGCATATTTGGCATGCTTTCTTTGGAGTTGCTGGGTCAAACAATGACCTTAATGTGCTGAACCAGTCCCCATTGTTTTTTGATGCATTGAAAGGAGAAGCCCCGCAAGTTCAGTTTTCAGTCAATGGGAATGAGTATGGAACAGGTTATTACCTTGCTGATGGTATATATCCAGAATGGGCTGCCTTCATGAAGACCATACCTCTTCCCCAAACTGAGAAGCATAAGTTGTTTGCCAAGCACCAAGAAGGGGCAAGGAAAGATGTGGAGCGTGCTTTTGGGGTGTTGCAGTCCCGATTTACCATTGTCCGTCGGCCTGCACGATTGTGGAGGCGGAAGAGTGTTGGGAGGATCATGCTAGCTTGTGTGATTCTCCACAACATGATAGTCGAAGATGAGAGAGAGGAAGCTACCATTCATATTGACTTGAATGAGAATCCAGGGGCATCGTTTGCGCTGCCTCCTGAAGTGAATATAGGTGGTAATCTGTGTTTTGCTGATGTGATGCGCAAAAAAGCTACTGTCCGTTCTCGTCCACAACACACCCAACTTAAAAATGATTTGGTCGAGCACATTTGGCATAAGTTTGGAGATAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTACGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGTTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCAGTACTTTTGGTTAATGTTTTCAGAAAGACTCATGTAATGTTTTAAGCGCCGGTGTCATGGTGCTCAAATCTCATCATATCATGCGTGCAATGTTGCTTGAAAATTATTTGCTATCTGATCATTGAGATGAATATTGTTGCCTGAAAAA]

[+] EMBL CF328089             [TCCTACTCAGCCTACCAATCCCATCTTTCTCTCCCACTATGCCGGATTCATCTTCATATTCAGATGATTCCGATGAACTAGCCCCATCAAACATTATGGAGCAATATGTTGCTGAGCGGGGGGGTTCTAGACTCCTTTGCTAGGAGGCTCACTATAAAGATCAAGGCTAGTCTCTCAGTTGGGGTATCTTGGAGACGGAGTGGTCCAAGGAAGTGCATTTAGAGGGATCATGCTGCTGCTCATCAGCGTCTTGTGGAGGACTACTTCGCTGCAGAACCACTCTACACTAAGAGTATGTTTCGTACAAGATTCCGTATGAATAGACGCCTCTTCCTACGCATTGTGAATGCCCTTGGTCAGTGTTCTCCCTATTTCACTTATAGGGTAGATTGTACTGGTCGAATAGGGCTTTCACCACTGCAAAAGTGTACAGCAGCCATGCGCATGCTGGCATATGGCACTCCTGCAGATGCCCTTGATGAGTACTTGAAGATTGGGAAGTGTACTTCATTAGAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AK106574             [                                                                                                                                                                                                  ACGGAGTGGTCCAAGGAAGTGCATTTAGAGGGATCATGCTGCTGCTCATCAGCGTCTTGTGGAGGACTACTTCGCTGCAGAACCACTCTACACTAAGAGTATGTTTCGTACAAGATTCCGTATGAATAGACGCCTCTTCCTACGCATTGTGAATGCCCTTGGTCAGTGTTCTCCCTATTTCACTTATAGGGTAGATTGTACTGGTCGAATAGGGCTTTCACCACTGCAAAAGTGTACAGCAGCCATGCGCATGCTGGCATATGGCACTCCTGCAGATGCCCTTGATGAGTACTTGAAGATTGGGAAGTGTACTTCATTAGAGTGCTTGGATAGGTTTACACGGGGGGTGATTGAGGTGTTCGGTGGGGAGTACTTGCGACGCCCCACATCCTCGGATGTTGAGCGTCTACTTCAGGTCAACGAGTCTCGTGGTTTTTCTGGAATGTTAGGAAGTATAGATTGCATGCACTGGCGTTGGGAGAAGTGTCCTTTAGCATGGAGGGGGCAATTCACCCGTGGTGATTATGGAGTACCAACAATAGTCCTAGAAGCTGTTGCTTCCCAGGACTTGCATATTTGGCATGCTTTCTTTGGAGTTGCTGGGTCAAACAATGACCTTAATGTGCTGAACCAGTCCCCATTGTTTTTTGATGCATTGAAAGGAGAAGCCCCGCAAGTTCAGTTTTCAGTCAATGGGAATGAGTATGGAACAGGTTATTACCTTGCTGATGGTATATATCCAGAATGGGCTGCCTTCATGAAGACCATACCTCTTCCCCAAACTGAGAAGCATAAGTTGTTTGCCAAGCACCAAGAAGGGGCAAGGAAAGATGTGGAGCGTGCTTTTGGGGTGTTGCAGTCCCGATTTACCATTGTCCGTCGGCCTGCACGATTGTGGAGGCGGAAGAGTGTTGGGAGGATCATGCTAGCTTGTGTGATTCTCCACAACATGATAGTCGAAGATGAGAGAGAGGAAGCTACCATTCATATTGACTTGAATGAGAATCCAGGGGCATCGTTTGCGCTGCCTCCTGAAGTGAATATAGGTGGTAATCTGTGTTTTGCTGATGTGATGCGCAAAAAAGCTACTGTCCGTTCTCGTCCACAACACACCCAACTTAAAAATGATTTGGTCGAGCACATTTGGCATAAGTTTGGAGATAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTATGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGTTGTTCAGCTCAGTAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCAGTACTTTTGGTTAATGTTTTCAGAAAGACTCATGTAATGTTTTAAGCGCCGGTGTCATGGTGCTCAAATCTCATCATATCATGCGTGCA                                                           ]
[+] EMBL CF328371             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTACGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGCTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGC                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CF328372             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TAACCATCATAATTAGTCATGGATTGTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATGGTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTACGGCTTGTTGTTTCTTTCTACTGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGCTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCA                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CF328090             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGTTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTGTCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCAGTACTTTTGGTTAATGTTTTCAGAAAGACTCATGTAATGTTTTAAGCGCCGGTGTCATGGTGCTCAAATCTCATCATATCATGCGTGCAATGTTGCTTGAAAATTATTTGCTATCTGATCATTGAGATGAATATTGTTGCCTGAAAAA]




>consensus_7666#0
TCCTACTCAGCCTACCAATCCCATCTTTCTCTCCCACTATGCCGGATTCATCTTCATATT
CAGATGATTCCGATGAACTAGCCCCATCAAACATTATGGAGCAATATGTTGCTGAGCGGG
GGGGTTCTAGACTCCTTTGCTAGGAGGCTCACTATAAAGATCAAGGCTAGTCTCTCAGTT
GGGGTATCTTGGAGACGGAGTGGTCCAAGGAAGTGCATTTAGAGGGATCATGCTGCTGCT
CATCAGCGTCTTGTGGAGGACTACTTCGCTGCAGAACCACTCTACACTAAGAGTATGTTT
CGTACAAGATTCCGTATGAATAGACGCCTCTTCCTACGCATTGTGAATGCCCTTGGTCAG
TGTTCTCCCTATTTCACTTATAGGGTAGATTGTACTGGTCGAATAGGGCTTTCACCACTG
CAAAAGTGTACAGCAGCCATGCGCATGCTGGCATATGGCACTCCTGCAGATGCCCTTGAT
GAGTACTTGAAGATTGGGAAGTGTACTTCATTAGAGTGCTTGGATAGGTTTACACGGGGG
GTGATTGAGGTGTTCGGTGGGGAGTACTTGCGACGCCCCACATCCTCGGATGTTGAGCGT
CTACTTCAGGTCAACGAGTCTCGTGGTTTTTCTGGAATGTTAGGAAGTATAGATTGCATG
CACTGGCGTTGGGAGAAGTGTCCTTTAGCATGGAGGGGGCAATTCACCCGTGGTGATTAT
GGAGTACCAACAATAGTCCTAGAAGCTGTTGCTTCCCAGGACTTGCATATTTGGCATGCT
TTCTTTGGAGTTGCTGGGTCAAACAATGACCTTAATGTGCTGAACCAGTCCCCATTGTTT
TTTGATGCATTGAAAGGAGAAGCCCCGCAAGTTCAGTTTTCAGTCAATGGGAATGAGTAT
GGAACAGGTTATTACCTTGCTGATGGTATATATCCAGAATGGGCTGCCTTCATGAAGACC
ATACCTCTTCCCCAAACTGAGAAGCATAAGTTGTTTGCCAAGCACCAAGAAGGGGCAAGG
AAAGATGTGGAGCGTGCTTTTGGGGTGTTGCAGTCCCGATTTACCATTGTCCGTCGGCCT
GCACGATTGTGGAGGCGGAAGAGTGTTGGGAGGATCATGCTAGCTTGTGTGATTCTCCAC
AACATGATAGTCGAAGATGAGAGAGAGGAAGCTACCATTCATATTGACTTGAATGAGAAT
CCAGGGGCATCGTTTGCGCTGCCTCCTGAAGTGAATATAGGTGGTAATCTGTGTTTTGCT
GATGTGATGCGCAAAAAAGCTACTGTCCGTTCTCGTCCACAACACACCCAACTTAAAAAT
GATTTGGTCGAGCACATTTGGCATAAGTTTGGAGATAACCATCATAATTAGTCATGGATT
GTGCTGTTGCTGGTTGTCGTGGGTGCTACTTACAATGAATGAAGGCTTTTGAGGCAAATG
GTTTGGATGTTGCTTTCTACTGAAGTTTCAACTAAACTACGGCTTGTTGTTTCTTTCTAC
TGAAGTTCCAACTAAGGCTCTATGCCATTATCGTTGTTCAGCTCAATAACTAATGGTTTG
TCTGCCAGAGAGCTTATTTAGCAGTACTTTTGGTTAATGTTTTCAGAAAGACTCATGTAA
TGTTTTAAGCGCCGGTGTCATGGTGCTCAAATCTCATCATATCATGCGTGCAATGTTGCT
TGAAAATTATTTGCTATCTGATCATTGAGATGAATATTGTTGCCTGAAAAA
clustalw multiple alignements is not computed in this case