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Oryza sativa
cluster # 782 cluster # 782       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_782#0 length = 470 sequences # 2  

consensusID : consensus_782#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 470
fasta sequence
                              [TCATGTTTTGTGCTTTTGTATGGAAACTGTATTCTGGAACTTGCTTTTGTATGGGGCTGGAAAATTAATTATAGCTAGAATGTGATTGTAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTTTTTTTCCCCTTCCTTAAAAAAGGGGAAATTCCGGCCCCAAAAAAAAAATCCCCCCTAAAAGGAGGCTAAAAAAAAATAACGGGCCCGTTTTTAAAAACCGGGAAAAGGGAAAAACCCGGGGGTAACCAAAAAAAAACCCTTTGAAAAAAAACCCCTTTTCCCAAAGGGGGAAAAAAAAAAAAAAGCCCCCCCCAAACCCCCTTCCAAAAAATGGCCCCCCTTAAACCTCCGGGGTTTAAAGGTTCCCCCCTAAAAAAAAAAAACCCCTTTTCCC]

[+] EMBL CF337645             [TCATGTTTTGTGCTTTTGTATGGAAACTGTATTCTGGAACTTGCTTTTGTATGGGGCTGGAAAATTAATTATAGCTAGAATGTGATTGTAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCCTTTTTTTCCCCTTCCTTAAAAAAGGGGAAATTCCGGCCCCAAAAAAAAAATCCCCCCTAAAAGGAGGCTAAAAAAAAATAACGGGCCCGTTTTTAAAAACCGGGAAAAGGGAAAAACCCGGGGGTAACCAAAAAAAAACCCTTTGAAAAAAAACCCCTTTTCCCAAAGGGGGAAAAAAAAAAAAAAGCCCCCCCCAAACCCCCTTCCAAAAAATGGCCCCCCTTAAACCTCCGGGGTTTAAAGGTTCCCCCCTAAAAAAAAAAAACCCCTTTTCCC]
[+] EMBL CF336506             [TCATGTTTTGTGCTTTTGTATGGAAACTGTATTCTGGAACTTGCTTTTGTATGGGGCTGGAAAATTAATTATAGCTAGAATGTGATTGTAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]


>consensus_782#0 TCATGTTTTGTGCTTTTGTATGGAAACTGTATTCTGGAACTTGCTTTTGTATGGGGCTGG AAAATTAATTATAGCTAGAATGTGATTGTAATATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAAAACCCTTTTTTTCCCCTTCCTTAAAAAAGGGGAAATTCCGGCCCCAAAAAA AAAATCCCCCCTAAAAGGAGGCTAAAAAAAAATAACGGGCCCGTTTTTAAAAACCGGGAA AAGGGAAAAACCCGGGGGTAACCAAAAAAAAACCCTTTGAAAAAAAACCCCTTTTCCCAA AGGGGGAAAAAAAAAAAAAAGCCCCCCCCAAACCCCCTTCCAAAAAATGGCCCCCCTTAA ACCTCCGGGGTTTAAAGGTTCCCCCCTAAAAAAAAAAAACCCCTTTTCCC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)