These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7852#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1507 fasta sequence [CCGCAGGTTTCCTCTCTCCCCTAGTTCGCCGGCGGCGTCAAACCCTAGCGCCGCCGCCGCCGCCATGAACCACCTTCGAAACCAAATCCTTCTTCTCCGCGTCCGCTCCTCCAGCACCTCGCTCTCTCCCCTCTCCCCTCTCCACCGCCTCTTCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCATCCATCGCCGCAGAACCCTTCGCCGTCGAGGACTACCTGGTCACCACCTGCGGCCTCACCGGGGACCAAGCGCGGAAGGCGGCCAAGACTCTCTCCCGCCTCAGGTCCCCCTCCAAGCCCGACGCCGCCGTCGCCTTCCTCTCCGGCCTCGGCCTCTCGCGCTCCGGCATCGCCGCCGCCGTGGCCGCCGACCCGAGGTTGCTGTGCGCCGACGTGGAGAAGAACCTGGCCAAGCGCGTCGCCGAGCTCGGTGAGCTGGGCATCTCGCGCTCCCAGATCGCGCGCCTCATCCCGCTCGCCCGTCAGTCCTTCCGCAGCAGCTCGCTCGCCACGAACCTTGGCTTCTGGCTCCCGGTCTTGGGCTCTTTCGAGAATGTGCTCATGGCGCTCAAGGCGAACGGAGCGATTCTTGGCTCCGACGTCGAGAAGGTGGTCAAGCCCAACCTGGCCCTCCTCCAGCAATGTGGGATACATGTCTGCGATTTCCCCCATACACGCCTGCCCACTGTGCTCTGCAGGCCACCCAACCATGTTCAAGAAGCTGTGGCACGCATCGGTGAGTTTGGCGTGCCACAGTACTCACCGGTGTTCCGCAATGCGCTTGTGCCATTTGCTTACCAAAACAAGGAGAAGCTCGCTGCCAAAATTGGAGTCCTTGAAATGTTTGGGTGGTCAGA-GGACGATCTCTCGATGACTATGAGGAAGGGTCCTGTCGTCATGAACATGTCT-GTGGAAAGGCTGAGGAAAAATGTGGAGTTCTTGACAAGGGATGTTAAGCTCGAGACGCGTTACATTGCTCGAAGGCCAATCATGATCAGTTATAGCCTTGAGCGTCGGTTGTTACCCCGGCATCGCTTGCTCAGGTTTCTCAGTGCAAAGGGATTGCTTGATGGTGAATTGGACTTCTATTCAGCGGTTGCATTGACTGAGAAGAAGTTTCTTGACAAGTTTGTGCATTCTTGCAAGTGTAGCATTGCAGATCCTGCTAATGCTTATGCTTCTAGCTTTGTTGGGGATGTTCTGTGAATTTATTGTCTGAGAGGACAACAGGAAAATGGGCTCATTCTTGTGCTGGGAGGGTACTGACAGGATTGTTGTGTTGGAAAGATCAAGGGTTTAGACTTATACTTTTGCTATCTCCTTCGTGCTCATTAAGGTTTGCTATCTCCTTCGTCCATTGTTGCAAAATTTCTTATAACTTTGCTCTAGGTTATCTTGTGTTGGCTAGTATCACTATTCACTGATTGATAAACAGGAACACTACAGCCTGTGGTCACCCTCTAGGTTGATGGAATGTTGAATAACATTTCCAGGAGTTAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK105790 [CCGCAGGTTTCCTCTCTCCCCTAGTTCGCCGGCGGCGTCAAACCCTAGCGCCGCCGCCGCCGCCATGAACCACCTTCGAAACCAAATCCTTCTTCTCCGCGTCCGCTCCTCCAGCACCTCGCTCTCTCCCCTCTCCCCTCTCCACCGCCTCTTCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCATCCATCGCCGCAGAACCCTTCGCCGTCGAGGACTACCTGGTCACCACCTGCGGCCTCACCGGGGACCAAGCGCGGAAGGCGGCCAAGACTCTCTCCCGCCTCAGGTCCCCCTCCAAGCCCGACGCCGCCGTCGCCTTCCTCTCCGGCCTCGGCCTCTCGCGCTCCGGCATCGCCGCCGCCGTGGCCGCCGACCCGAGGTTGCTGTGCGCCGACGTGGAGAAGAACCTGGCCAAGCGCGTCGCCGAGCTCGGTGAGCTGGGCATCTCGCGCTCCCAGATCGCGCGCCTCATCCCGCTCGCCCGTCAGTCCTTCCGCAGCAGCTCGCTCGCCACGAACCTTGGCTTCTGGCTCCCGGTCTTGGGCTCTTTCGAGAATGTGCTCATGGCGCTCAAGGCGAACGGAGCGATTCTTGGCTCCGACGTCGAGAAGGTGGTCAAGCCCAACCTGGCCCTCCTCCAGCAATGTGGGATACATGTCTGCGATTTCCCCCATACACGCCTGCCCACTGTGCTCTGCAGGCCACCCAACCATGTTCAAGAAGCTGTGGCACGCATCGGTGAGTTTGGCGTGCCACAGTACTCACCGGTGTTCCGCAATGCGCTTGTGCCATTTGCTTACCAAAACAAGGAGAAGCTCGCTGCCAAAATTGGAGTCCTTGAAATGTTTGGGTGGTCAGA GGACGATCTCTCGATGACTATGAGGAAGGGTCCTGTCGTCATGAACATGTCT GTGGAAAGGCTGAGGAAAAATGTGGAGTTCTTGACAAGGGATGTTAAGCTCGAGACGCGTTACATTGCTCGAAGGCCAATCATGATCAGTTATAGCCTTGAGCGTCGGTTGTTACCCCGGCATCGCTTGCTCAGGTTTCTCAGTGCAAAGGGATTGCTTGATGGTGAATTGGACTTCTATTCAGCGGTTGCATTGACTGAGAAGAAGTTTCTTGACAAGTTTGTGCATTCTTGCAAGTGTAGCATTGCAGATCCTGCTAATGCTTATGCTTCTAGCTTTGTTGGGGATGTTCTGTGAATTTATTGTCTGAGAGGACAACAGGAAAATGGGCTCATTCTTGTGCTGGGAGGGTACTGACAGGATTGTTGTGTTGGAAAGATCAAGGGT ] [+] EMBL AK065678 [ GGCGGCGTCAAACCCTAGCGCCGCCGCCGCCGCCATGAACCACCTTCGAAACCAAATCCTTCTTCTCCGCGTCCGCTCCTCCAGCACCTCGCTCTCTCCCCTCTCCCCTCTCCACCGCCTCTTCTCCTCCTCCACCGCCGCCGCATCCATCGCCGCAGAACCCTTCGCCGTCGAGGACTACCTGGTCACCACCTGCGGCCTCACCGGGGACCAAGCGCGGAAGGCGGCCAAGACTCTCTCCCGCCTCAGGTCCCCCTCCAAGCCCGACGCCGCCGTCGCCTTCCTCTCCGGCCTCGGCCTCTCGCGCTCCGGCATCGCCGCCGCCGTGGCCGCCGACCCGAGGTTGCTGTGCGCCGACGTGGAGAAGAACCTGGCCAAGCGCGTCGCCGAGCTCGGTGAGCTGGGCATCTCGCGCTCCCAGATCGCGCGCCTCATCCCGCTCGCCCGTCAGTCCTTCCGCAGCAGCTCGCTCGCCACGAACCTTGGCTTCTGGCTCCCGGTCTTGGGCTCTTTCGAGAATGTGCTCATGGCGCTCAAGGCGAACGGAGCGATTCTTGGCTCCGACGTCGAGAAGGTGGTCAAGCCCAACCTGGCCCTCCTCCAGCAATGTGGGATACATGTCTGCGATTTCCCCCATACACGCCTGCCCACTGTGCTCTGCAGGCCACCCAACCATGTTCAAGAAGCTGTGGCACGCATCGGTGAGTTTGGCGTGCCACAGTACTCACCGGTGTTCCGCAATGCGCTTGTGCCATTTGCTTACCAAAACAAGGAGAAGCTCGCTGCCAAAATTGGAGTCCTTGAAATGTTTGGGTGGTCAGA GGACGATCTCTCGATGACTATGAGGAAGGGTCCTGTCGTCATGAACATGTCT GTGGAAAGGCTGAGGAAAAATGTGGAGTTCTTGACAAGGGATGTTAAGCTCGAGACGCGTTACATTGCTCGAAGGCCAATCATGATCAGTTATAGCCTTGAGCGTCGGTTGTTACCCCGGCATCGCTTGCTCAGGTTTCTCAGTGCAAAGGGATTGCTTGATGGTGAATTGGACTTCTATTCAGCGGTTGCATTGACTGAGAAGAAGTTTCTTGACAAGTTTGTGCATTCTTGCAAGTGTAGCATTGCAGATCCTGCTAATGCTTATGCTTCTAGCTTTGTTGGGGATGTTCTGTGAATTTATTGTCTGAGAGGACAACAGGAAAATGGGCTCATTCTTGTGCTGGGAGGGTACTGACAGGATTGTTGTGTTGGAAAGATCAAGGGTTTAGACTTATACTTTTGCTATCTCCTTCGTGCTCATTAAGGTTTGCTATCTCCTTCGTCCATTGTTGCAAAATTTCTTATAACTTTGCTCTAGGTTATCTTGTGTTGGCTAGTATCACTATTCACTGATTGATAAACAGGAACACTACAGCCTGTGGTCACCCTCTAGGTTGATGGAATGTTGAATAACATT ] [+] EMBL BQ907945 [ ACC AAACAA GAGAAGCTC CT CGCAAATTGGAGT CGTGAA GGTTGGGT GTCAGAGGGACGATCTCTNGGGGACTATGAGGAAGGGTCCTGTCGTCATGAACATGTCTGGTGGAAAGGCTGAGGAAAAATGTGGAGTTCTTGACAAGGGATGTTAAGCTCGAGACGCGTTACATTGCTCGAA GCC ATCATGATCAGTTATA CCTTGAGCGTCGGTTGTTACCCCGGCATCGCTTGCTCAGGTTTCTCAGTGCAAAGGGATTGCTTGATGGTGAATTGGACTTCTATTCAGCGGTTGCATTGACTGAGAAGAAGTTTCTTGACAAGTTTGTGCATTCTTGCAAGTGTAGCATTGCAGATCCTGCTAATGCTTATGCTTCTAGCTTTGTTGGGGATGTTCTGTGAATTTATTGTCTGAGAGGACAACAGGAAAATGGGCTCATTCTTGTGCTGGGAGGGTACTGACAGGATTGTTGTGTTGGAAAGATCAAGGGTTTAGACTTATACTTTTGCTATCTCCTTCGTGCTCATTAAG TTGCTATCTCCCTCGTCCA TGT C AATTTCTTATAA ] [+] EMBL AU095277 [ AAGGCCAATCATGATCAGTTATAGCCTTGAGCGTCGGTTGTTACCCCGGCATCGCTTGCTCAGGTTTCTCAGTGCAAAGGGATTGCTTGATGGTGAATTGGACTTCTATTCAGCGGTTGCATTGACTGAGAAGAAGTTTCTTGACAAGTTTGTGCATTCTTGCAAGTGTAGCATTGCAGATCCTGCTAATGCTTATGCTTCTAGCTTTGTTGGGGATGTTCTGTGAATTTATTGTCTGAGAGGACAACAGGAAAATGGGCTCATTCTTGTGCTGGGAGGGTACTGACAGGATTGTTGTGTTGGAAAGATCAAGGGTTTAGACTTATACTTTTGCTATCTCCTTCGTGCTCATTAAGGTTTGCTATCTCCTTCGTCCATTGTTGCAAAATTTCTTATAACTTTGCTCTAGGTTATCTTGTGTTGGCTAGTATCACTATTCACTG ] [+] EMBL AU095278 [ GGTGAATTGGACTTCTATTCAGCGGTTGCATTGACTGAGAAGAAGTTTCTTGACAAGTTTGTGCATTCTTGCAAGTGTAGCATTGCAGATCCTGCTAATGCTTATGCTTCTAGCTTTGTTGGGGATGTTCTGTGAATTTATTGTCTGAGAGGACAACAGGAAAATGGGCTCATTCTTGTGCTGGGAGGGTACTGACAGGATTGTTGTGTTGGAAAGATCAAGGGTTTAGACTTATACTTTTGCTATCTCCTTCGTGCTCATTAAGGTTTGCTATCTCCTTCGTCCATTGTTGCAAAATTTCTTATAACTTTGCTCTAGGTTATCTTGTGTTGGCTAGTATCACTATTCACTGATTGATAAACAGGAACACTACAGCCTGTGGTCACCCTCTAGGTTGATGGAATGTTGAATAACATTTCCAGGAGTTAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||