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Oryza sativa
cluster # 793 cluster # 793       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_793#0 length = 3222 sequences # 2  

consensusID : consensus_793#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 3222
fasta sequence
                              [GGCTTCTCGTCTCCTCTCCCCTTTTCACGCCATGGCCGAGCGATCTCCCGGCCGCCGGAATGGACGCGGCGGCGGCGGCAGCTGCGGCGGGAGGAGGTGGTAACGCCGCCGCGCGGAGCAGCCCCGCCGCGAAATCCTCCACCATCTCCTCTTCCCGCAGCGCTAATCTTCTTCTCCCCTTTCACGTCGTTACCGAGGCACCGAGCGATCGACCCGGCCGAAATGGCGGCGGGAGGAGGAGGTGGTGGTAGCGCCGCCGCGCGGCCAGCACTCGGGAAACTAAAGCTTGCTCTAGTTGGAAGCTAACTTGAGCTGAATTAGCCAATTAGCCATCAGAGGAATGATGCAAGGGATAATGCTTGCAGCGTTGCTTGTTCTTTGCCAGTTGATCAAAAATGCAGGCAAGATCACTGATGCTGCGTGCATCTCCAGTGAGAGGGACGCTCTGCTTGCTTTCAAAGCCGGTTTCGCTGATCCTGCTGGAGGGGCGCTGCGTTTCTGGCAAGGCCAAGACTGCTGCGCATGGAGCGGGGTGTCCTGCAGCAAAAAGATCGGCAGTGTTGTCAGCCTGGATATCGGCCATTATGATCTCACTTTCAGAGGTGAAATCAACTCATCTCTGGCTGTTCTGACACATCTAGTGTACCTTAACCTGAGTGGAAATGATTTCGGTGGGGTGGCCATCCCAGATTTCATAGGCTCCTTCGAGAAGCTGAGGTATCTTGATCTTTCGCATGCTGGTTTTGGAGGGACAGTTCCTCCTCGGCTTGGTAATTTGTCAATGCTCAGCCACCTTGATTTGAGCTCACCAAGTCATACAGTTACTGTCAAAAGCTTCAACTGGGTGTCTCGCCTCACTTCACTGGTCTATCTAGACCTTAGTTGGTTGTATCTTGCTGCTTCCTCTGATTGGTTGCAGGCTACAAATACGCTTCCTTTGCTTAAAGTCCTCTGCTTGAATCATGCGTTTCTTCCTGCCACAGACTTGAATGCTCTTTCTCATACCAACTTCACAGCCATTAGGGTACTTGATCTGAAGAGTAACAACTTCAGTTCACGAATGCCAGATTGGATTTCAAAGCTAAGTTCTCTTGCATATTTGGACTTGTCTAGCTGTGAGCTTTCAGGCTCACTTCCCAGGAACCTTGGGAACTTGACATCCCTCAGTTTTTTTCAATTACGAGCGAACAACCTTGAAGGTGAAATACCTGGATCCATGAGTAGGTTGTGCAACCTACGCCACATTGATTTATCTGGAAACCATTTCTCAGGAGATATTACAAGACTTGCTAATACCTTGTTCCCCTGCATGAACCAGTTGAAGATTCTTGACCTTGCACTCAATAATCTAACCGGGAGTCTGTCTGGTTGGGTCAGGCACATAGCAAGTGTAACTACTCTTGATCTTAGTGAGAACTCATTATCCGGACGAGTATCAGATGATATTGGCAAGTTATCAAACTTAACCTACTTAGATCTTTCAGCCAATTCATTTCAAGGCACACTGTCCGAACTCCACTTTGCTAATCTGTCCAGGCTGGATATGCTAATTTTAGAGTCCATTTATGTGAAGATTGTCACTGAAGCAGACTGGGTGCCACCATTCCAACTCCGAGTCCTAGTACTTTATGGATGTCAGGTAGGACCACACTTCCCAGCATGGCTGAAGTCACAAGCCAAAATTGAAATGATCGAGTTAAGCAGAGCACAGATCAAGAGCAAGTTACCTGATTGGCTCTGGAACTTCTCATCAACAATTAGTGCCTTGGATGTCTCAGGAAATATGATTAATGGAAAGTTGCCCAAAAGTTTAAAGCACATGAAAGCGCTGGAGTTACTTGACATGAGTTCGAACCAACTGGAGGGATGCATTCCTGATCTGCCATCTAGTGTGAAAGTATTGGATCTGTCAAGTAACCACTTATATGGACCATTGCCACAAAGACTGGGTGCCAAAGAAATATATTATCTATCACTCAAAGACAACTTCCTCAGTGGAAGCATCCCTACGTACCTATGTGAGATGGTTTGGATGGAACAGGTTCTTCTATCACTAAACAACTTCTCAGGTGTACTCCCAAATTGCTGGAGGAAAGGTTCAGCGCTGAGAGTTATAGATTTCTCAAACAATAACATTCACGGAGAAATATCTTCAACCATGGGTCATCTAACTTCCCTTGGATCATTGTTACTCCACAGGAACAAGTTATCTGGTCCACTCCCCACCTCACTGAAGCTATGCAACAGATTAATCTTTCTTGATCTTTCAGAAAATAATTTGTCCGGAACCATACCAACCTGGATAGGTGACAGCCTGCAGTCTCTGATTCTCCTCAGTTTAAGGTCCAACAACTTTTCTGGTAAAATTCCCGAGCTACTATCTCAGCTTCACGCTCTTCAAATTTTAGATATTGCTGATAACAATCTATCAGGCCCTGTACCCAAATCCTTGGGAAATTTAGCAGCCATGCAGTTAGGCAGGCACATGATACAACAGCAATTTAGCACCATTTCGGACATCCATTTCATGGTTTATGGTGCAGGTGGTGCAGTCTTGTATCGGTTGTATGCATACTTATACTTGAATAGTCTACTTGCTGGCAAGCTTCAATATAATGGAACTGCCTTCTATATTGATCTCTCTGGTAACCAATTAGCAGGGGAGATTCCTATTGAAATTGGATTTCTATCTGGACTAACGGGTTTAAATTTGTCAGGAAATCACATAAGAGGGAGCATTCCAGAGGAGTTGGGAAACTTAAGAAGTTTAGAGGTGCTTGATCTCTCCAGGAATGATCTGTCAGGCCCAATTCCACAGTGCTTCCTGTCATTGTCTGGTTTGAGCCATCTGAATTTATCATACAATGACCTTTCAGGAGCTATACCATTTGGAAATGAACTTGCAACTTTTGCAGAAAGCACATACTTTGGTAATGCACATACAACTGTCAAGAAGCTGTTTGTACCACAAAAGGAAGCATCAACTAAACTTTGACACGGGAACATACTTAAGTGCACTGCTTGGGTTTGCATTTGGATTCTGTATTATGTTCGTCATCCTGATACCCTACATGGTTGCATGAAAGACTCTTATGATAGCCTATGCTTTGGATTGGCTATTATGATATATGAAGATTTTGTTTTATAGTTAGTTGAGCATTGTAATGATTTTATCCGAACATATTTGACAGGTGGGTTAAGCGGTGTAATGCACTAAGGCTT]

[+] EMBL AK100368             [GGCTTCTCGTCTCCTCTCCCCTTTTCACGCCATGGCCGAGCGATCTCCCGGCCGCCGGAATGGACGCGGCGGCGGCGGCAGCTGCGGCGGGAGGAGGTGGTAACGCCGCCGCGCGGAGCAGCCCCGCCGCGAAATCCTCCACCATCTCCTCTTCCCGCAGCGCTAATCTTCTTCTCCCCTTTCACGTCGTTACCGAGGCACCGAGCGATCGACCCGGCCGAAATGGCGGCGGGAGGAGGAGGTGGTGGTAGCGCCGCCGCGCGGCCAGCACTCGGGAAACTAAAGCTTGCTCTAGTTGGAAGCTAACTTGAGCTGAATTAGCCAATTAGCCATCAGAGGAATGATGCAAGGGATAATGCTTGCAGCGTTGCTTGTTCTTTGCCAGTTGATCAAAAATGCAGGCAAGATCACTGATGCTGCGTGCATCTCCAGTGAGAGGGACGCTCTGCTTGCTTTCAAAGCCGGTTTCGCTGATCCTGCTGGAGGGGCGCTGCGTTTCTGGCAAGGCCAAGACTGCTGCGCATGGAGCGGGGTGTCCTGCAGCAAAAAGATCGGCAGTGTTGTCAGCCTGGATATCGGCCATTATGATCTCACTTTCAGAGGTGAAATCAACTCATCTCTGGCTGTTCTGACACATCTAGTGTACCTTAACCTGAGTGGAAATGATTTCGGTGGGGTGGCCATCCCAGATTTCATAGGCTCCTTCGAGAAGCTGAGGTATCTTGATCTTTCGCATGCTGGTTTTGGAGGGACAGTTCCTCCTCGGCTTGGTAATTTGTCAATGCTCAGCCACCTTGATTTGAGCTCACCAAGTCATACAGTTACTGTCAAAAGCTTCAACTGGGTGTCTCGCCTCACTTCACTGGTCTATCTAGACCTTAGTTGGTTGTATCTTGCTGCTTCCTCTGATTGGTTGCAGGCTACAAATACGCTTCCTTTGCTTAAAGTCCTCTGCTTGAATCATGCGTTTCTTCCTGCCACAGACTTGAATGCTCTTTCTCATACCAACTTCACAGCCATTAGGGTACTTGATCTGAAGAGTAACAACTTCAGTTCACGAATGCCAGATTGGATTTCAAAGCTAAGTTCTCTTGCATATTTGGACTTGTCTAGCTGTGAGCTTTCAGGCTCACTTCCCAGGAACCTTGGGAACTTGACATCCCTCAGTTTTTTTCAATTACGAGCGAACAACCTTGAAGGTGAAATACCTGGATCCATGAGTAGGTTGTGCAACCTACGCCACATTGATTTATCTGGAAACCATTTCTCAGGAGATATTACAAGACTTGCTAATACCTTGTTCCCCTGCATGAACCAGTTGAAGATTCTTGACCTTGCACTCAATAATCTAACCGGGAGTCTGTCTGGTTGGGTCAGGCACATAGCAAGTGTAACTACTCTTGATCTTAGTGAGAACTCATTATCCGGACGAGTATCAGATGATATTGGCAAGTTATCAAACTTAACCTACTTAGATCTTTCAGCCAATTCATTTCAAGGCACACTGTCCGAACTCCACTTTGCTAATCTGTCCAGGCTGGATATGCTAATTTTAGAGTCCATTTATGTGAAGATTGTCACTGAAGCAGACTGGGTGCCACCATTCCAACTCCGAGTCCTAGTACTTTATGGATGTCAGGTAGGACCACACTTCCCAGCATGGCTGAAGTCACAAGCCAAAATTGAAATGATCGAGTTAAGCAGAGCACAGATCAAGAGCAAGTTACCTGATTGGCTCTGGAACTTCTCATCAACAATTAGTGCCTTGGATGTCTCAGGAAATATGATTAATGGAAAGTTGCCCAAAAGTTTAAAGCACATGAAAGCGCTGGAGTTACTTGACATGAGTTCGAACCAACTGGAGGGATGCATTCCTGATCTGCCATCTAGTGTGAAAGTATTGGATCTGTCAAGTAACCACTTATATGGACCATTGCCACAAAGACTGGGTGCCAAAGAAATATATTATCTATCACTCAAAGACAACTTCCTCAGTGGAAGCATCCCTACGTACCTATGTGAGATGGTTTGGATGGAACAGGTTCTTCTATCACTAAACAACTTCTCAGGTGTACTCCCAAATTGCTGGAGGAAAGGTTCAGCGCTGAGAGTTATAGATTTCTCAAACAATAACATTCACGGAGAAATATCTTCAACCATGGGTCATCTAACTTCCCTTGGATCATTGTTACTCCACAGGAACAAGTTATCTGGTCCACTCCCCACCTCACTGAAGCTATGCAACAGATTAATCTTTCTTGATCTTTCAGAAAATAATTTGTCCGGAACCATACCAACCTGGATAGGTGACAGCCTGCAGTCTCTGATTCTCCTCAGTTTAAGGTCCAACAACTTTTCTGGTAAAATTCCCGAGCTACTATCTCAGCTTCACGCTCTTCAAATTTTAGATATTGCTGATAACAATCTATCAGGCCCTGTACCCAAATCCTTGGGAAATTTAGCAGCCATGCAGTTAGGCAGGCACATGATACAACAGCAATTTAGCACCATTTCGGACATCCATTTCATGGTTTATGGTGCAGGTGGTGCAGTCTTGTATCGGTTGTATGCATACTTATACTTGAATAGTCTACTTGCTGGCAAGCTTCAATATAATGGAACTGCCTTCTATATTGATCTCTCTGGTAACCAATTAGCAGGGGAGATTCCTATTGAAATTGGATTTCTATCTGGACTAACGGGTTTAAATTTGTCAGGAAATCACATAAGAGGGAGCATTCCAGAGGAGTTGGGAAACTTAAGAAGTTTAGAGGTGCTTGATCTCTCCAGGAATGATCTGTCAGGCCCAATTCCACAGTGCTTCCTGTCATTGTCTGGTTTGAGCCATCTGAATTTATCATACAATGACCTTTCAGGAGCTATACCATTTGGAAATGAACTTGCAACTTTTGCAGAAAGCACATACTTTGGTAATGCACATACAACTGTCAAGAAGCTGTTTGTACCACAAAAGGAAGCATCAACTAAACTTTGACACGGGAACATACTTAAGTGCACTGCTTGGGTTTGCATTTGGATTCTGTATTATGTTCGTCATCCTGATACCCTACATGGTTGCATGAAAGACTCTTATGATAGCCTATGCTTTGGATTGGCTATTATGATATATGAAGATTTTGTTTTATAGTTAGTTGAGCATTGTAATGATTTTATCCGAACATATTTGACAGGTGGGTTAAGCGGTGTAATGCACTAAGGCTT]
[+] EMBL CF307323             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGATCCATGAGTAGGTTGTGCAACCTACGCCACATTGATTTATCTGGAAACCATTTCTCAGGAGATATTACAAGACTTGCTAATACCTTGTTCCCCTGCATGAACCAGTTGAAGATTCTTGACCTTGCACTCAATAATCTAACCGGGAGTCTGTCTGGTTGGGTCAGGCACATAGCAAGTGTAACTACTCTTGATCTTAGTGAGAACTCATTATCCGGACGAGTATCAGATGATATTGGCAAGTTATCAAACTTAACCTACTTAGATCTTTCAGCCAATTCATTTCAAGGCACACTGTCCGAACTCCACTTTGCTAATCTGTCCAGGCTGGATATGCTAATTTTAGAGTCCATTTATGTGAAGATTGTCACTGAAGCAGACTGGGTGCCACCATTCCAACTCCGAGTCCTAGTACTTTATGGATGTCAGGTAGGACCACACTTCCCAGCATGGCTGAAGTCACAAGCCAAAATTGAAATGATCGAGTTAAGCAGAGCACAGATCAAGAGCAAGTTACCTGATTGGCTCTGGAACTTCTCATCAACAATTAGTGCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]


>consensus_793#0 GGCTTCTCGTCTCCTCTCCCCTTTTCACGCCATGGCCGAGCGATCTCCCGGCCGCCGGAA TGGACGCGGCGGCGGCGGCAGCTGCGGCGGGAGGAGGTGGTAACGCCGCCGCGCGGAGCA GCCCCGCCGCGAAATCCTCCACCATCTCCTCTTCCCGCAGCGCTAATCTTCTTCTCCCCT TTCACGTCGTTACCGAGGCACCGAGCGATCGACCCGGCCGAAATGGCGGCGGGAGGAGGA GGTGGTGGTAGCGCCGCCGCGCGGCCAGCACTCGGGAAACTAAAGCTTGCTCTAGTTGGA AGCTAACTTGAGCTGAATTAGCCAATTAGCCATCAGAGGAATGATGCAAGGGATAATGCT TGCAGCGTTGCTTGTTCTTTGCCAGTTGATCAAAAATGCAGGCAAGATCACTGATGCTGC GTGCATCTCCAGTGAGAGGGACGCTCTGCTTGCTTTCAAAGCCGGTTTCGCTGATCCTGC TGGAGGGGCGCTGCGTTTCTGGCAAGGCCAAGACTGCTGCGCATGGAGCGGGGTGTCCTG CAGCAAAAAGATCGGCAGTGTTGTCAGCCTGGATATCGGCCATTATGATCTCACTTTCAG AGGTGAAATCAACTCATCTCTGGCTGTTCTGACACATCTAGTGTACCTTAACCTGAGTGG AAATGATTTCGGTGGGGTGGCCATCCCAGATTTCATAGGCTCCTTCGAGAAGCTGAGGTA TCTTGATCTTTCGCATGCTGGTTTTGGAGGGACAGTTCCTCCTCGGCTTGGTAATTTGTC AATGCTCAGCCACCTTGATTTGAGCTCACCAAGTCATACAGTTACTGTCAAAAGCTTCAA CTGGGTGTCTCGCCTCACTTCACTGGTCTATCTAGACCTTAGTTGGTTGTATCTTGCTGC TTCCTCTGATTGGTTGCAGGCTACAAATACGCTTCCTTTGCTTAAAGTCCTCTGCTTGAA TCATGCGTTTCTTCCTGCCACAGACTTGAATGCTCTTTCTCATACCAACTTCACAGCCAT TAGGGTACTTGATCTGAAGAGTAACAACTTCAGTTCACGAATGCCAGATTGGATTTCAAA GCTAAGTTCTCTTGCATATTTGGACTTGTCTAGCTGTGAGCTTTCAGGCTCACTTCCCAG GAACCTTGGGAACTTGACATCCCTCAGTTTTTTTCAATTACGAGCGAACAACCTTGAAGG TGAAATACCTGGATCCATGAGTAGGTTGTGCAACCTACGCCACATTGATTTATCTGGAAA CCATTTCTCAGGAGATATTACAAGACTTGCTAATACCTTGTTCCCCTGCATGAACCAGTT GAAGATTCTTGACCTTGCACTCAATAATCTAACCGGGAGTCTGTCTGGTTGGGTCAGGCA CATAGCAAGTGTAACTACTCTTGATCTTAGTGAGAACTCATTATCCGGACGAGTATCAGA TGATATTGGCAAGTTATCAAACTTAACCTACTTAGATCTTTCAGCCAATTCATTTCAAGG CACACTGTCCGAACTCCACTTTGCTAATCTGTCCAGGCTGGATATGCTAATTTTAGAGTC CATTTATGTGAAGATTGTCACTGAAGCAGACTGGGTGCCACCATTCCAACTCCGAGTCCT AGTACTTTATGGATGTCAGGTAGGACCACACTTCCCAGCATGGCTGAAGTCACAAGCCAA AATTGAAATGATCGAGTTAAGCAGAGCACAGATCAAGAGCAAGTTACCTGATTGGCTCTG GAACTTCTCATCAACAATTAGTGCCTTGGATGTCTCAGGAAATATGATTAATGGAAAGTT GCCCAAAAGTTTAAAGCACATGAAAGCGCTGGAGTTACTTGACATGAGTTCGAACCAACT GGAGGGATGCATTCCTGATCTGCCATCTAGTGTGAAAGTATTGGATCTGTCAAGTAACCA CTTATATGGACCATTGCCACAAAGACTGGGTGCCAAAGAAATATATTATCTATCACTCAA AGACAACTTCCTCAGTGGAAGCATCCCTACGTACCTATGTGAGATGGTTTGGATGGAACA GGTTCTTCTATCACTAAACAACTTCTCAGGTGTACTCCCAAATTGCTGGAGGAAAGGTTC AGCGCTGAGAGTTATAGATTTCTCAAACAATAACATTCACGGAGAAATATCTTCAACCAT GGGTCATCTAACTTCCCTTGGATCATTGTTACTCCACAGGAACAAGTTATCTGGTCCACT CCCCACCTCACTGAAGCTATGCAACAGATTAATCTTTCTTGATCTTTCAGAAAATAATTT GTCCGGAACCATACCAACCTGGATAGGTGACAGCCTGCAGTCTCTGATTCTCCTCAGTTT AAGGTCCAACAACTTTTCTGGTAAAATTCCCGAGCTACTATCTCAGCTTCACGCTCTTCA AATTTTAGATATTGCTGATAACAATCTATCAGGCCCTGTACCCAAATCCTTGGGAAATTT AGCAGCCATGCAGTTAGGCAGGCACATGATACAACAGCAATTTAGCACCATTTCGGACAT CCATTTCATGGTTTATGGTGCAGGTGGTGCAGTCTTGTATCGGTTGTATGCATACTTATA CTTGAATAGTCTACTTGCTGGCAAGCTTCAATATAATGGAACTGCCTTCTATATTGATCT CTCTGGTAACCAATTAGCAGGGGAGATTCCTATTGAAATTGGATTTCTATCTGGACTAAC GGGTTTAAATTTGTCAGGAAATCACATAAGAGGGAGCATTCCAGAGGAGTTGGGAAACTT AAGAAGTTTAGAGGTGCTTGATCTCTCCAGGAATGATCTGTCAGGCCCAATTCCACAGTG CTTCCTGTCATTGTCTGGTTTGAGCCATCTGAATTTATCATACAATGACCTTTCAGGAGC TATACCATTTGGAAATGAACTTGCAACTTTTGCAGAAAGCACATACTTTGGTAATGCACA TACAACTGTCAAGAAGCTGTTTGTACCACAAAAGGAAGCATCAACTAAACTTTGACACGG GAACATACTTAAGTGCACTGCTTGGGTTTGCATTTGGATTCTGTATTATGTTCGTCATCC TGATACCCTACATGGTTGCATGAAAGACTCTTATGATAGCCTATGCTTTGGATTGGCTAT TATGATATATGAAGATTTTGTTTTATAGTTAGTTGAGCATTGTAATGATTTTATCCGAAC ATATTTGACAGGTGGGTTAAGCGGTGTAATGCACTAAGGCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)