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Oryza sativa
cluster # 80 cluster # 80       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_80#0 length = 1507 sequences # 2  

consensusID : consensus_80#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1507
fasta sequence
                              [AGAGCAGGTAAGTAATCTCCTAATATCGTTTAGGGGTAATTTTGGCATGGGATGTTTTCTTCTGTTCGCATCGTATCAGGTCTGAACTCCGTTGCACGCAGTCACCTCGCTATTCCTCCCCCGGCCTAGCCGCCTTGTCCGCCCCCTCCGTCGCCATCCGTATTCCCCGCCGTCGCCGCCTTGTCCGCTTCCTCAGTCGCATCGTCCGTCTGGGAGCGGACGAGTGTGGTGGCGTCCGAGCAAGTGACGATCTTGAGCAGGAGTTCTGGCGGTAGTAAAAATTCCAGCCTAGGCTTCGGCGGCAGCGTCACGCACGCACGCAATGTCATTTGCTTGGCAGCGTCGTCTCGGCTCATTCGTCTTCTTGCCGTTTCCGATCACTGTGTTGTTTCATGGATTACATGGATCGATTAAGATCTTGCACGACCAACTCCGACGAGGATGACATGGTGATCGATCTATGGATCGGAAAACAATAATACCCCTTCGCGAATTATTTTTCCTAGACAAAAACACCCCTCCACATTTCACTTCCACTAATTCTGGTAGGAGTAAAACTAGATCTTAACCCTACAATTAAATATGATCAAGGGCCTAGATTACTTTTTACTCCGAGTAGAAAGCACCAGAGTAGGACTCTATTCTTCATTCATGGTCAAATCATGACAAGGGTTTGAGATCAGCAGAGCAGATATATCTTTATTAATTTTTGGTGGTAACTATATATAATTTCAGCTAAACCGGCCAAGTAGTTAATTACTGTGCCTTTTTTTTTTCTCTTCTGTTTACTTTATGATCCAGTAGCTACCATAAATGCTGTAGAAAGAATATACTGCAAAGGGCACGTAGATTTTTACCTTCTAATAAATGAAATGGAACTGCGGGAAACTATTCTAAACT-CTCGAGTGGATGTCTTCTCGTTGTGCATATATACGAGATCATGATCTTACCAAACAATAACAAGTTCATATATAAGATGTGCATTTCTATGACAATATATATACTACATATTGATTTTTTATATTAATTTGCAAGCTACATTCATGCTGATCATGATGATGAGATTTAATTTTGTTCATTCAATTCTTAGAACACTAATCAAAAGTAAACATCGGACTTTTGATTAATCTGAAAACTTAAATATTATCGATATAGCTACAGTATATGTTTGTCAGGGCACTAGCTAGCTGATTCTCGATCAGCTAGCTGCAGGGGAGTATATTTGACACCAGTGCATTGGTGTTGGTGTAAACCTTGTTGTTATGTATCAACTCTGAGTTGTTTCCTGTTTGAAGCCTTGAGCTCTAGCTTCCCCATACAGTACTACACCCATTATTTTTTGTGTCGAGATGCTCATACATTGAGTTATGTAGTGCGTGCTGCATGTACAAAATGGTGTTTCCAGTGATCCCAAATCCCTAAAGATTCTCTTGTTATGTTGTACATTGTCTTTGATTGCTATAGTAGCTCTTAAGTTTTAATTACTCCTTTTTAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AK108610             [AGAGCAGGTAAGTAATCTCCTAATATCGTTTAGGGGTAATTTTGGCATGGGATGTTTTCTTCTGTTCGCATCGTATCAGGTCTGAACTCCGTTGCACGCAGTCACCTCGCTATTCCTCCCCCGGCCTAGCCGCCTTGTCCGCCCCCTCCGTCGCCATCCGTATTCCCCGCCGTCGCCGCCTTGTCCGCTTCCTCAGTCGCATCGTCCGTCTGGGAGCGGACGAGTGTGGTGGCGTCCGAGCAAGTGACGATCTTGAGCAGGAGTTCTGGCGGTAGTAAAAATTCCAGCCTAGGCTTCGGCGGCAGCGTCACGCACGCACGCAATGTCATTTGCTTGGCAGCGTCGTCTCGGCTCATTCGTCTTCTTGCCGTTTCCGATCACTGTGTTGTTTCATGGATTACATGGATCGATTAAGATCTTGCACGACCAACTCCGACGAGGATGACATGGTGATCGATCTATGGATCGGAAAACAATAATACCCCTTCGCGAATTATTTTTCCTAGACAAAAACACCCCTCCACATTTCACTTCCACTAATTCTGGTAGGAGTAAAACTAGATCTTAACCCTACAATTAAATATGATCAAGGGCCTAGATTACTTTTTACTCCGAGTAGAAAGCACCAGAGTAGGACTCTATTCTTCATTCATGGTCAAATCATGACAAGGGTTTGAGATCAGCAGAGCAGATATATCTTTATTAATTTTTGGTGGTAACTATATATAATTTCAGCTAAACCGGCCAAGTAGTTAATTACTGTGCCTTTTTTTTTTCTCTTCTGTTTACTTTATGATCCAGTAGCTACCATAAATGCTGTAGAAAGAATATACTGCAAAGGGCACGTAGATTTTTACCTTCTAATAAATGAAATGGAACTGCGGGAAACTATTCTAAACT CTCGAGTGGATGTCTTCTCGTTGTGCATATATACGAGATCATGATCTTACCAAACAATAACAAGTTCATATATAAGATGTGCATTTCTATGACAATATATATACTACATATTGATTTTTTATATTAATTTGCAAGCTACATTCATGCTGATCATGATGATGAGATTTAATTTTGTTCATTCAATTCTTAGAACACTAATCAAAAGTAAACATCGGACTTTTGATTAATCTGAAAACTTAAATATTATCGATATAGCTACAGTATATGTTTGTCAGGGCACTAGCTAGCTGATTCTCGATCAGCTAGCTGCAGGGGAGTATATTTGACACCAGTGCATTGGTGTTGGTGTAAACCTTGTTGTTATGTATCAACTCTGAGTTGTTTCCTGTTTGAAGCCTTGAGCTCTAGCTTCCCCATACAGTACTACACCCATTATTTTTTGTGTCGAGATGCTCATACATTGAGTTATGTAGTGCGTGCTGCATGTACAAAATGGTGTTTCCAGTGATCCCAAATCCCTAAAGA                                                                                  ]
[-] EMBL CA761231             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTACCTTCTAATAAATGAAATGGAACTGTGGGAAACTATTCTAAACTCCTCTAGTGGATGTCTTCTCGTTGTGCATATATACGAGATCATGATCTTACCAAACAATAACAAGTTCATATATAAGATGTGCATTTCTATGACAATATATATACTACATATTGACTTTTTATATTAATTTGCAAGCTACATTCATGCTGATCATGATGATGAGATTTAATTTTGTTCATTCAATTCTTAGAACACTAATCAAAAGTAAACATCGGACTTTTGATTAATCTGAAAACTTAAATATTATCGATATAGCTACAGTATATGTTTGTCAGGGCACTAGCTAGCTGATTCTCGATTAGCTAGCTGCAGGGGAGTATATTTGACACCAGTGCATTGGTGTTGGTGTAAACCTTGTTGTTATGTATCAACTCTGAGTTATTTCCTGTTTGAAGCCTTGAGCTCTAGCTTCCCCATACAGTACTACACCCATTATTTTTTGTGTCGAGATGCTCATACATTGAGTTATGTAGTGCGTGCTGCATGTACAAAATGGTGTTTCCAATGATCCCAAATCCCTAAAGATTCTCTTGTTATGTTGTACATTGTCTTTGATTGCTATAGTAGCTCTTAAGTTTTAATTACTCCTTTTTAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_80#0 AGAGCAGGTAAGTAATCTCCTAATATCGTTTAGGGGTAATTTTGGCATGGGATGTTTTCT TCTGTTCGCATCGTATCAGGTCTGAACTCCGTTGCACGCAGTCACCTCGCTATTCCTCCC CCGGCCTAGCCGCCTTGTCCGCCCCCTCCGTCGCCATCCGTATTCCCCGCCGTCGCCGCC TTGTCCGCTTCCTCAGTCGCATCGTCCGTCTGGGAGCGGACGAGTGTGGTGGCGTCCGAG CAAGTGACGATCTTGAGCAGGAGTTCTGGCGGTAGTAAAAATTCCAGCCTAGGCTTCGGC GGCAGCGTCACGCACGCACGCAATGTCATTTGCTTGGCAGCGTCGTCTCGGCTCATTCGT CTTCTTGCCGTTTCCGATCACTGTGTTGTTTCATGGATTACATGGATCGATTAAGATCTT GCACGACCAACTCCGACGAGGATGACATGGTGATCGATCTATGGATCGGAAAACAATAAT ACCCCTTCGCGAATTATTTTTCCTAGACAAAAACACCCCTCCACATTTCACTTCCACTAA TTCTGGTAGGAGTAAAACTAGATCTTAACCCTACAATTAAATATGATCAAGGGCCTAGAT TACTTTTTACTCCGAGTAGAAAGCACCAGAGTAGGACTCTATTCTTCATTCATGGTCAAA TCATGACAAGGGTTTGAGATCAGCAGAGCAGATATATCTTTATTAATTTTTGGTGGTAAC TATATATAATTTCAGCTAAACCGGCCAAGTAGTTAATTACTGTGCCTTTTTTTTTTCTCT TCTGTTTACTTTATGATCCAGTAGCTACCATAAATGCTGTAGAAAGAATATACTGCAAAG GGCACGTAGATTTTTACCTTCTAATAAATGAAATGGAACTGCGGGAAACTATTCTAAACT CTCGAGTGGATGTCTTCTCGTTGTGCATATATACGAGATCATGATCTTACCAAACAATAA CAAGTTCATATATAAGATGTGCATTTCTATGACAATATATATACTACATATTGATTTTTT ATATTAATTTGCAAGCTACATTCATGCTGATCATGATGATGAGATTTAATTTTGTTCATT CAATTCTTAGAACACTAATCAAAAGTAAACATCGGACTTTTGATTAATCTGAAAACTTAA ATATTATCGATATAGCTACAGTATATGTTTGTCAGGGCACTAGCTAGCTGATTCTCGATC AGCTAGCTGCAGGGGAGTATATTTGACACCAGTGCATTGGTGTTGGTGTAAACCTTGTTG TTATGTATCAACTCTGAGTTGTTTCCTGTTTGAAGCCTTGAGCTCTAGCTTCCCCATACA GTACTACACCCATTATTTTTTGTGTCGAGATGCTCATACATTGAGTTATGTAGTGCGTGC TGCATGTACAAAATGGTGTTTCCAGTGATCCCAAATCCCTAAAGATTCTCTTGTTATGTT GTACATTGTCTTTGATTGCTATAGTAGCTCTTAAGTTTTAATTACTCCTTTTTAAAAAAA AAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)