These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8024#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 2149 fasta sequence [ATCATAATAATCATGATTTCTTCTCCTGCGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCAGGCCGCCCCTCCATCGCCGCGCCGCCGCTCCCCTCCTCGCCGGCGCCTCCCCTCCGCGGCATCTCCATCTCCCCCGTCGCCGCCCGCCCCATCTCCTCCCTCCGCTCCTCCTCCTCCATCAGGATCATCTCGCCGCCGCACGCCCTCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTCCCGTCCATGGACCCCCAAGAGGTGCCCGATCTGCTGCCCCCGCGCCCACCGGAGCGCGACTTCGCCGGAACGCCATACGTCCCCGTCTATGTCATGCTCCCGCTTGGAGTGGTCAATGGTAATGGCGAGGTGGTCGACGCCGACGTCTTGGTGGGCCAGCTTCGGGTACTCAAGGCTGCCGGCGTCGATGGGGTCATGGTCGATTGCTGGTGGGGGAATGTCGAGGCCCACAGGCCGCAGGAGTACAATTGGACCGGTTACAAGCGACTCTTCCATATGATCAGGGAGCTCAAGCTCAAGCTGCAGGTGGTCATGTCATTCCATGAGTGTGGAGGCAATGTTGGAGATGATGTGTCTATTCCTCTCCCACATTGGGTAACAGAGATCGGAAGAAGCAATCCAGATATCTACTTCACCGACAGGGCTGGCAGGCGTAACACGGAGTGCCTTTCATGGGGCATTGATAAAGAAAGGGTTCTTCAAGGACGGACAGGGGTCGAGGTATTTTGACTACATGAGAAGCTTCCGAGTAGAATTTGATGAATATTTTGAGGATGGTATCATTTCAGAAATTGAGATTGGGCTAGGGGCTTGTGGAGAGTTGAGGTATCCATCTTATCCAGCAAAACATGGGTGGAAATACCCTGGCATTGGAGAATTTCAGTGCTACGACAGATACTTACAGAAAAGTTTAAGAAGAGCTGCAGAAGCACGAGGACATACCATATGGGCAAGAGCGCCAGACAGTGCAGGCCATTATAATTCTGAGCCAAATCTGACTGGATTTTTCTCTGACGGAGGAGATTATGATAGCTACTATGGTCGTTTTTTCCTCAATTGGTATTCCCAGGTGTTGGTGGATCATGCTGACCGTGTATTGATGTTAGCCAGGTTGGCTTTTGAAGGTTCAGATATTGCTGTTAAGGTTTCAGGTGTACACTGGTGGTACAAAACTGCCAGTCATGCTGCTGAATTGACTGCTGGGTTTTATAACCCATGCAACCGTGATGGTTATGCCTCAATTGCTGCTGTCCTGAAAAAACATGGTGCAGCTTTGAACTTTACATGTGTTGAACTGCGCACTATGGATCAGCATGAGGTATTTCCTGAGGCCTTTGCAGATCCAGAGGGCCTTGTATGGCAGGTGCTAAATGCTGCATGGGATGCTGGCATACCAGTAGCTAGTGAGAATGCTCTGCCTTGCTACGATAGAGATGGCTTTAACAAAATTTTGGAGAATGCAAAGCCACTGAATGATCCAGATGGGAGGCATTTACTAGGATTCACGTACCTGAGGCTCACCAAAGTCCTCTTCGAGAGAGCTAATTTTTTGGAATTTGAGCGTTTCGTTAAGAGAATGCATGGTGAAGCAGTTCTCGATCTACAGGTATAAGTTGTGTTCAGGGTTCTTACATACATACATATATATACATGCCATTGTAATTGGCATAGGCCTTATGGCTTATGATGGGGGAACAGAGATGCCATTTTTGTTTCGTAGGTTGTTGTAGTATACCATCAGCAGATTTTTGAACTATAGAGGGTTTGGCTCCATGGTGTAAAGCATACCCTTGGCAAAGAGTTGTCATGCAGAAAATTGATGG--TTT-CAT-TC-GGAAT-GAGGTTGGAAG-CAGGTGTATTTCT-TTCGATG-CGGCAGA-CATA-TTTGA-TTTGTCATGAGATGAGGATT-GGGTGAGCA-GGTGGTATCC-TTCTGAAAGATTTGAGGCTGTATTGA-AGAGAAT-GTGCTGATGCATGTTTATCAT-GGAGCAAGCGACATTAATGGAGTTAGCAAAGGTTCTCGCGGTGTATGTGTTTGTATTTGTTGGTGGAATGTCACTCGAGGATCTTGGCTGTATACAATACATACATGTGCTTTTTTTTGGGTCTTTTCTACAGTGTATGAGAAATGCATGTTTCTTACTGTCAAAAAAAAAAA] [+] EMBL AK070300 [ATCATAATAATCATGATTTCTTCTCCTGCGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCAGGCCGCCCCTCCATCGCCGCGCCGCCGCTCCCCTCCTCGCCGGCGCCTCCCCTCCGCGGCATCTCCATCTCCCCCGTCGCCGCCCGCCCCATCTCCTCCCTCCGCTCCTCCTCCTCCATCAGGATCATCTCGCCGCCGCACGCCCTCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTCCCGTCCATGGACCCCCAAGAGGTGCCCGATCTGCTGCCCCCGCGCCCACCGGAGCGCGACTTCGCCGGAACGCCATACGTCCCCGTCTATGTCATGCTCCCGCTTGGAGTGGTCAATGGTAATGGCGAGGTGGTCGACGCCGACGTCTTGGTGGGCCAGCTTCGGGTACTCAAGGCTGCCGGCGTCGATGGGGTCATGGTCGATTGCTGGTGGGGGAATGTCGAGGCCCACAGGCCGCAGGAGTACAATTGGACCGGTTACAAGCGACTCTTCCATATGATCAGGGAGCTCAAGCTCAAGCTGCAGGTGGTCATGTCATTCCATGAGTGTGGAGGCAATGTTGGAGATGATGTGTCTATTCCTCTCCCACATTGGGTAACAGAGATCGGAAGAAGCAATCCAGATATCTACTTCACCGACAGGGCTGGCAGGCGTAACACGGAGTGCCTTTCATGGGGCATTGATAAAGAAAGGGTTCTTCAAGGACGGACAGGGGTCGAGGTATTTTGACTACATGAGAAGCTTCCGAGTAGAATTTGATGAATATTTTGAGGATGGTATCATTTCAGAAATTGAGATTGGGCTAGGGGCTTGTGGAGAGTTGAGGTATCCATCTTATCCAGCAAAACATGGGTGGAAATACCCTGGCATTGGAGAATTTCAGTGCTACGACAGATACTTACAGAAAAGTTTAAGAAGAGCTGCAGAAGCACGAGGACATACCATATGGGCAAGAGCGCCAGACAGTGCAGGCCATTATAATTCTGAGCCAAATCTGACTGGATTTTTCTCTGACGGAGGAGATTATGATAGCTACTATGGTCGTTTTTTCCTCAATTGGTATTCCCAGGTGTTGGTGGATCATGCTGACCGTGTATTGATGTTAGCCAGGTTGGCTTTTGAAGGTTCAGATATTGCTGTTAAGGTTTCAGGTGTACACTGGTGGTACAAAACTGCCAGTCATGCTGCTGAATTGACTGCTGGGTTTTATAACCCATGCAACCGTGATGGTTATGCCTCAATTGCTGCTGTCCTGAAAAAACATGGTGCAGCTTTGAACTTTACATGTGTTGAACTGCGCACTATGGATCAGCATGAGGTATTTCCTGAGGCCTTTGCAGATCCAGAGGGCCTTGTATGGCAGGTGCTAAATGCTGCATGGGATGCTGGCATACCAGTAGCTAGTGAGAATGCTCTGCCTTGCTACGATAGAGATGGCTTTAACAAAATTTTGGAGAATGCAAAGCCACTGAATGATCCAGATGGGAGGCATTTACTAGGATTCACGTACCTGAGGCTCACCAAAGTCCTCTTCGAGAGAGCTAATTTTTTGGAATTTGAGCGTTTCGTTAAGAGAATGCATGGTGAAGCAGTTCTCGATCTACAGGTATAAGTTGTGTTCAGGGTTCTTACATACATACATATATATACATGCCATTGTAATTGGCATAGGCCTTATGGCTTATGATGGGGGAACAGAGATGCCATTTTTGTTTCGTAGGTTGTTGTAGTATACCATCAGCAGATTTTTGAACTATAGAGGGTTTGGCTCCATGGTGTAAAGCATACCCTTGGCAAAGAGTTGTCATGCAGAAAATTGATGG TTT CAT TC GGAAT GAGGTTGGAAG CAGGTGTATTTCT TTCGATG CGGCAGA CATA TTTGA TTTGTCATGAGATGAGGATT GGGTGAGCA GGTGGTATCC TTCTGAAAGATTTGAGGCTGTATTGA AGAGAAT GTGCTGATGCATGTTTATCAT GGAGCAAGCGACATTAATGGAGTTAGCAAAGGTTCTCGCGGTGTATGTGTTTGTATTTGTTGGTGGAATGTCACTCGAGGATCTTGGCTGTATACAATACATACATGTGCTTTTTTTTGGGTCTTTTCTACAGTGTATGAGAAATGCATGTT ] [+] EMBL AU163556 [ ATGATTTCTTCTCCTGCGCTCTTCTTCCTCCTCCAGCCAGGCCGCCCCTCCATCGCCGCGCCGCCGCTCCCCTCCTCGCCGGCGCCTCCCCTCCGCGGCATCTCCATCTCCCCCGTCGCCGCCCGCCCCATCTCCTCCCTCCGCTCCTCCTCCTCCATCAGGATCATCTCGCCGCCGCACGCCCTCCCCGACCCGCTCCTCTCCCTCCCGTCCATGGACCCCCAAGAGGTGCCCGATCTGCTGCCCCCGCGCCCACCGGAGCGCGACTTCGCCGGAACGCCATACGTCCCCGTCTATGTCATGCTCCCG TTGGAGTGGTCAATGGTAATGGCGANGTGGTCGACG CGACGTCTTGGTGGGGCAG TTCGGGTACT AAGGTTG CGGCGT NATGGGGT ATGGTC ATT CTGG ] [+] EMBL OSS11302A [ ccgATACCATATGGGCAAGAGCNCCAGACAGTGCAGGCCATTATAATTCTGAGCCAAATCTNACTGGATTNNACTCTGACGGAGGAGATTATGATAGCTACTATGGTCGTNTTTNCCTCAATTGGTATTCCCAGGTGTTGGTGGATCATGCTGACCGTGTATTGATGTTAGCCAGGTTGGCTTTTNAAGGTTCAGATATTGCTGTTAAGGTTTCAGGTGTACACTGGTGGTACAAAACTGCCAGTCATGCTGCTGAATTGACTGCTGGGTTTTATAACCCATGCAACCGTGATGGTTATGCCTCAATTGCTGCTGTCCTGNAAAAACATGGTGCAGCTTTGAACTTTACATGTGTTG ACTG ] [+] EMBL AU172514 [ GCAGATCCAGAGGGCCTTGTATGGCAGGTGCTAAATGCTGCATGGGATGCTGGCATACCAGTAGCTAGTGAGAATGCTCTGCCTTGCTACGATAGAGATGGCTTTAACAAAATTTTGGAGAATGCAAAGCCACTGAATGATCCAGATGGGAGGCATTTACTAGGATTCACGTACCTGAGGCTCACCAAAGTCCTCTTCGAGAGAGCTAATTTTTTGGAATTTGAGCGTTTCGTTAAGAGAATGCATGGTGAAGCAGTTCTCGATCTACAGGTATAAGTTGTGTTCAGGGTTCTTACATACATACATATATATACATGCCATTGTAATTGGCATAGGCCTTATGGCTTATGATGGGGGAACAGAGATGCCATTTTTGTTTCGTAGGTTGTTGTAGTATACCATCAGCAGATTTTTGAACTATAGAGGGTTTGGCTCaaaaaaaaa ] [+] EMBL AU032604 [ ttgGATGGGTTTTCCATCTCNGGAATGGAGGTTGGANGCCAGGTGTATTTCTNTTCGATGCCGGCAGACCATATTTTGATTTTCTCATGAGATGAGGATTNGGGTGAGCANGGTGGTATCCTTTCTGAAAGATTTGAGGCTNTATTGANAGAGAATGGTGCTGATGCATGTTTATCATGGGAGCAAGCGACATTAATGGNGTTAGCAAAGGTTCTCGCGGTGTATGTGTTTGTATTTGTTGGTGGAATGTCACTCGAGGATCTTGGCTGTATACAATACATACATGTGCTTTTTTTTGGGTCTTTTCTACAGTGTATGAGAAATGCATGTTTCTTACTGTCAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||