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Oryza sativa
cluster # 8408 cluster # 8408       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8408#0 length = 2137 sequences # 5  

consensusID : consensus_8408#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 2137
fasta sequence
                              [CGCTGAGCAGCATTGGTGTGGAGGCCATCGACTTTGGCAGCCACAAATGCCGGTGGTGCCTGTGGCAGTGGGTGTTGGGGACTCTGCAATTATATCCGCATTGGCTTCCTGCCTGGGATTACCGAGCAATGCGAAATCTGACCTGCCGTTGTTGGATTTTTCACTATTTAGTTGCCATTTTGTTGCACATTGCCATTCCTCTTCTCCCTCTCTCTGACTGCATGAGTACGTATGTACTCTGCTTAGAGCAAGTTTAATAGTACTAGCTAAATGCTCGTGCGTTACAACAGAATTCTAAAAGAGAACTTCATTTTTCTAAAACCATTCCCCATTGTCGACTCACGAGACTATAGATGCATCAATAAAATTTTATTGGTTAACTCGCATGACAAAATGATTCCTAATCATGATCCTAACTTAAAGATGCTATTAAATTTTCTAATGGATTTTTTGCGATTTCGATAGCCTGGTTTTCTTGAATGGCTGTGATGATTTGGCTGCCCCCTCGAGATCATCTGGTATCTTCTTGGTTCCTTGGTAATATGTTCAGCTAGCTGTCATACTAGGTGGCCTTGCTCCCCAGCAAGTTACCAGTTGCAGCTATTTCTTGTCTGTACATGATGTAACGAATGATTCTACTCATTTGTTCATGTACGGAGTTACGGAGGGAGTACTATCAACATGTTGCCCAGAACCATAGGCATTTGTAACAATTGGGAATTGACAGTTGGGCTAATCTGAGCCATTCAAGTATATTTCCTTTGTTTTCAACCATGTTTTACCTCCTTACTTTCTTATGGCTGTGCTTGTAATGATCTGAGTCTGGTATTCTGGTATTGTTTCTGTTTGGTGAGAAATTAATATTACTATACAAACAATTTTTTTTTAGATTCGTTGATCTCATTTTGACTTCCATTTAGGCCACTCAGTTGTCATTTGCATGTCGCCCTGTTCATATACAGTAGCATATGCGAGATGTTGGAACTCTTTCAAGTTTTGCTTTTGCTGAGGCATTTAACTTTTTGCCACTTTTAAGATGTGGCAATTAAGAATTTGTTACTCACAATCTATGACAGACATTGTGGATCCAGTAGCAAATCCTTAATTGCCACTTGTAAATAGTTAAATATCTCTTCATTTCTATGTAGTTTATTCATTCCTTTTTTTCTTAAGGAATGGAATGTTGACTATTTATTAACTTAGCTGTAGTGTGATCATTATTATTGTCCTTTCATACTTTAAGGATATACTCCTGTTCATCCATATTTTGATGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGCTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATGATTTGACATCTTCTCGCTGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGTTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATTTGACATCTTCTCGTTCTTGGCCATGTACATCAGTCTTGGATGTAGAGGCCATGTTTTAATCCATTATCTAAAATAAATATCTTGTTGGTTCATTAGCAGTATGTTCAGTTAGCTGTCATACTAGGAGGCCTTGCTGCCCAGCAAGGTACCAGTTGCAGGCTTGCAGCCATTTCTTGATAGTACATGCTAATCTACTCATTTGTTCATGTACAGAGAGACGGAGGGAGTATTTACATTTTGCCGGAGCCACAGGCACATTAAACTGTTTGGAATTGGCAATCGGGTTAATCTGAGCCATTCAAGTCATTTCCTTTGTTTTCATCCATGCTTTGCCCCAATGGTATTTGTTCTTTACAGTTTTACCAGCAGGCGCCTTAATAAGCACGAAGTCTTGGCAAAATGTTTGTTGGTAATGGCCCCAGGGACGAACCCATCGACTTGTGTGAATTGCTTTGCGAATCTTCGGCTTCAGCTTATTACGGATGTAACTTCAACATCATCTGTTAGTCCCTCGTTAGCTTTGGCTAATTGTTTCTTTTTCTGGGGAGGGAATTTTGTGGCTAAATTTGGAGGTTTTGCTCCATGATATGCAACCAGTTTTCTGACAAATTGTTGTTGCTAATGCCACATGATGAAATCAGCAGGCATTGCCAGTGGTGCACGCTGGAATTACAGGGGGTAATTTTTATGTCATTATTATCTTGTTTTAGTTGCAAAAAAAAAAAAAAAGA]

[+] EMBL CF305074             [CGCTGAGCAGCATTGGTGTGGAGGCCATCGACTTTGGCAGCCACAAATGCCGGTGGTGCCTGTGGCAGTGGGTGTTGGGGACTCTGCAATTATATCCGCATTGGCTTCCTGCCTGGGATTACCGAGCAATGCGAAATCTGACCTGCCGTTGTTGGATTTTTCACTATTTAGTTGCCATTTTGTTGCACATTGCCATTCCTCTTCTCCCTCTCTCTGACTGCATGAGTACGTATGTACTCTGCTTAGAGCAAGTTTAATAGTACTAGCTAAATGCTCGTGCGTTACAACAGAATTCTAAAAGAGAACTTCATTTTTCTAAAACCATTCCCCATTGTCGACTCACGAGACTATAGATGCATCAATAAAATTTTATTGGTTAACTCGCATGACAAAATGATTCCTAATCATGATCCTAACTTAAAGATGCTATTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AK105627             [                                                                                                                                                                                                                                                                        AGCTAAATGCTCGTGCGTTACAACAGAATTCTAAAAGAGAACTTCATTTTTCTAAAACCATTCCCCATTGTCGACTCACGAGACTATAGATGCATCAATAAAATTTTATTGGTTAGCTCGCATGACAAAATGATTCCTAATCATGATCCTAACTTAAAGTTGCTATTAAATTTTCTAATGGATTTTTTGCGATTTCGATAGCCTGGTTTTCTTGAATGGCTGTGATGATTTGGCTGCCCCCTCGAGATCATCTGGTATCTTCTTGGTTCCTTGGTAATATGTTCAGCTAGCTGTCATACTAGGTGGCCTTGCTCCCCAGCAAGTTACCAGTTGCAGCTATTTCTTGTCTGTACATGATGTAACGAATGATTCTACTCATTTGTTCATGTACGGAGTTACGGAGGGAGTACTATCAACATGTTGCCCAGAACCATAGGCATTTGTAACAATTGGGAATTGACAGTTGGGCTAATCTGAGCCATTCAAGTATATTTCCTTTGTTTTCAACCATGTTTTACCTCCTTACTTTCTTATGGCTGTGCTTGTAATGATCTGAGTCTGGTATTCTGGTATTGTTTCTGTTTGGTGAGAAATTAATATTACTATACAAACAATTTTTTTTTAGATTCGTTGATCTCATTTTGACTTCCATTTAGGCCACTCAGTTGTCATTTGCATGTCGCCCTGTTCATATACAGTAGCATATGCGAGATGTTGGAACTCTTTCAAGTTTTGCTTTTGCTGAGGCATTTAACTTTTTGCCACTTTTAAGATGTGGCAATTAAGAATTTGTTACTCACAATCTATGACAGACATTGTGGATCCAGTAGCAAATCCTTAATTGCCACTTGTAAATAGTTAAATATCTCTTCATTTCTATGTAGTTTATTCATTCCTTTTTTTCTTAAGGAATGGAATGTTGACTATTTATTAACTTAGCTGTAGTGTGATCATTATTATTGTCCTTTCATACTTTAAGGATATACTCCTGTTCATCCATATTTTGATGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGCTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATGATTTGACATCTTCTCGCCGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGTTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATTTGACATCTTCTCGTTCTTGGCCATGTACATCAGTCTTGGATGTAGAGGCCATGTTTTAATCCATTATCTAAAATAAATATCTTGTTGGTTCATTAGCAGTATGTTCAGTTAGCTGTCATACTAGGAGGCCTTGCTGCCCAGCAAGGTACCAGTTGCAGGCTTGCAGCCATTTCTTGATAGTACATGCTAATCTACTCATTTGTTCATGTACAGAGAGACGGAGGGAGTATTTACATTTTGCCGGAGCCACAGGCACATTAAACTGTTTGGAATTGGCAATCGGGTTAATCTGAGCCATTCAAGTCATTTCCTTTGTTTTCATCCATGCTTTGCCCCAATGGTATTTGTTCTTTACAGTTTTACCAGCAGGCGCCTTAATAAGCACGAAGTCTTGGCAAAATGTTTGTTGGTAATGGCCCCAGGGACGAACCCATCGACTTGTGTGAATTGCTTTGCGAATCTTCGGCTTCAGCTTATTACGGATGTAACTTCAACATCATCTGTTAGTCCCTCGTTAGCTTTGGCTAATTGTTTCTTTTTCTGGGGAGGGAATTTTGTGGCTAAATTTGGAGGTTTTGCTCCATGATATGCAACCAGTTTTCTGACAAATTGTTGTTGCTAATGCCACATGATGAAATCAGCAGGCATTGCCAGTGGTGCACGCTGGAAT                                                             ]
[+] EMBL CB661662             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGCTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATGATTTGACATCTTCTCGCTGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGTTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATTTGACATCTTCTCGTTCTTGGCCATGTACATCAGTCTTGGATGTAGAGGCCATGTTTTAATCCATTATCTAAAATAAATATCTTGTTGGTTCATTAGCAGTATGTTCAGTTAGCTGTCATACTAGGAGGCCTTGCTGCCCAGCAAGGTACCAGTTGCAGGCTTGCAGCCATTTCTTGATAGTACATGCTAATCTACTCATTTGTTCATGTACAGAGAGACGGAGGGAGTATTTACATTTTGCCGGAGCCACAGGCACATTAAACTGTTTGGAATTGGCAATCGGGTTAATCTGAGCCATTCAAGTCATTTCCTTTGTTTTCATCCATGCTTTGCCCCAATGGTATTTGTTCTTTACAGTTTTACCAGCAGGCGCCTTAATAAGCACGAAGTCTTGGCAAAATGTTTGTTGGTAATGGCCCCAGGGACGAACCCATCGACTTGTGTGAATTGCTTTGCGAATCTTCGGCTTCAGCTTATTACGGATGTAACTTCAACATCATCTGTTAGTCCCTCGTTAGCTTTGGCTAATTGTTTCTTTTTCTGGGGAGGGAATTTTGTGGCTAAATTTGGAGGTTTTGCTCCATGATATGCAACCAGTTTTCTGACAAATTGTTGTTGCTAATGCCACATGATGAAATCAGCAGGCATTGCCAGTGGTGC                                                                       ]
[-] EMBL CB673660             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTCTTGAATGGCTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATGATTTGACATCTTCTCGCTGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGTTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATTTGACATCTTCTCGTTCTTGGCCATGTACATCAGTCTTGGATGTAGAGGCCATGTTTTAATCCATTATCTAAAATAAATATCTTGTTGGTTCATTAGCAGTATGTTCAGTTAGCTGTCATACTAGGAGGCCTTGCTGCCCAGCAAGGTACCAGTTGCAGGCTTGCAGCCATTTCTTGATAGTACATGCTAATCTACTCATTTGTTCATGTACAGAGAGACGGAGGGAGTATTTACATTTTGCCGGAGCCACAGGCACATTAAACTGTTTGGAATTGGCAATCGGGTTAATCTGAGCCATTCAAGTCATTTCCTTTGTTTTCATCCATGCTTTGCCCCAATGGTATTTGTTCTTTACAGTTTTACCAGCAGGCGCCTTAATAAGCACGAAGTCTTGGCAAAATGTTTGTTGGTAATGGCCCCAGGGACGAACCCATCGACTTGTGTGAATTGCTTTGCGAATCTTCGGCTTCAGCTTATTACGGATGTAACTTCAACATCATCTGTTAGTCCCTCGTTAGCTTTGGCTAATTGTTTCTTTTTCTGGGGAGGGAATTTTGTGGCTAAATTTGGAGGTTTTGCTCCATGATATGCAACCAGTTTTCTGACAAATTGTTGTTGCTAATGCCACATGATGAAATCAGCAGGCATTGCCAGTGGTGCACGCTGGAATTACAGGGGGTAATTTTTATGTCATTAT                                  ]
[-] EMBL CB661663             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTCTTGAATGGTTGTGATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATTTGACATCTTCTCGTTCTTGGCCATGTACATCAGTCTTGGATGTAGAGGCCATGTTTTAATCCATTATCTAAAATAAATATCTTGTTGGTTCATTAGCAGTATGTTCAGTTAGCTGTCATACTAGGAGGCCTTGCTGCCCAGCAAGGTACCAGTTGCAGGCTTGCAGCCATTTCTTGATAGTACATGCTAATCTACTCATTTGTTCATGTACAGAGAGACGGAGGGAGTATTTACATTTTGCCGGAGCCACAGGCACATTAAACTGTTTGGAATTGGCAATCGGGTTAATCTGAGCCATTCAAGTCATTTCCTTTGTTTTCATCCATGCTTTGCCCCAATGGTATTTGTTCTTTACAGTTTTACCAGCAGGCGCCTTAATAAGCACGAAGTCTTGGCAAAATGTTTGTTGGTAATGGCCCCAGGGACGAACCCATCGACTTGTGTGAATTGCTTTGGGAATCTTCGGCTTCAGCTTATTACGGATGTAACTTCAACATCATCTGTTAGTCCCTCGTTAGCTTTGGCTAATTGTTTCTTTTTCTGGGGAGGGAATTTTGTGGCTAAATTTGGAGGTTTTGCTCCATGATATGCAACCAGTTTTCTGACAAATTGTTGTTGCTAATGCCACATGATGAAATCAGCAGGCATTGCCAGTGGTGCACGCTGGAATGAACGGTTGTAATTTTTATGTCATTATTATCTTGTTTTAGTTGCAAAAAAAAAAAAAAAGA]


>consensus_8408#0 CGCTGAGCAGCATTGGTGTGGAGGCCATCGACTTTGGCAGCCACAAATGCCGGTGGTGCC TGTGGCAGTGGGTGTTGGGGACTCTGCAATTATATCCGCATTGGCTTCCTGCCTGGGATT ACCGAGCAATGCGAAATCTGACCTGCCGTTGTTGGATTTTTCACTATTTAGTTGCCATTT TGTTGCACATTGCCATTCCTCTTCTCCCTCTCTCTGACTGCATGAGTACGTATGTACTCT GCTTAGAGCAAGTTTAATAGTACTAGCTAAATGCTCGTGCGTTACAACAGAATTCTAAAA GAGAACTTCATTTTTCTAAAACCATTCCCCATTGTCGACTCACGAGACTATAGATGCATC AATAAAATTTTATTGGTTAACTCGCATGACAAAATGATTCCTAATCATGATCCTAACTTA AAGATGCTATTAAATTTTCTAATGGATTTTTTGCGATTTCGATAGCCTGGTTTTCTTGAA TGGCTGTGATGATTTGGCTGCCCCCTCGAGATCATCTGGTATCTTCTTGGTTCCTTGGTA ATATGTTCAGCTAGCTGTCATACTAGGTGGCCTTGCTCCCCAGCAAGTTACCAGTTGCAG CTATTTCTTGTCTGTACATGATGTAACGAATGATTCTACTCATTTGTTCATGTACGGAGT TACGGAGGGAGTACTATCAACATGTTGCCCAGAACCATAGGCATTTGTAACAATTGGGAA TTGACAGTTGGGCTAATCTGAGCCATTCAAGTATATTTCCTTTGTTTTCAACCATGTTTT ACCTCCTTACTTTCTTATGGCTGTGCTTGTAATGATCTGAGTCTGGTATTCTGGTATTGT TTCTGTTTGGTGAGAAATTAATATTACTATACAAACAATTTTTTTTTAGATTCGTTGATC TCATTTTGACTTCCATTTAGGCCACTCAGTTGTCATTTGCATGTCGCCCTGTTCATATAC AGTAGCATATGCGAGATGTTGGAACTCTTTCAAGTTTTGCTTTTGCTGAGGCATTTAACT TTTTGCCACTTTTAAGATGTGGCAATTAAGAATTTGTTACTCACAATCTATGACAGACAT TGTGGATCCAGTAGCAAATCCTTAATTGCCACTTGTAAATAGTTAAATATCTCTTCATTT CTATGTAGTTTATTCATTCCTTTTTTTCTTAAGGAATGGAATGTTGACTATTTATTAACT TAGCTGTAGTGTGATCATTATTATTGTCCTTTCATACTTTAAGGATATACTCCTGTTCAT CCATATTTTGATGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGCTGTGATGATTTGGCTACCC CTTGAAGATGATTTGACATCTTCTCGCTGTTTGTTACTTCTTTAGTTCTTGAATGGTTGT GATGATTTGGCTACCCCTTGAAGATTTGACATCTTCTCGTTCTTGGCCATGTACATCAGT CTTGGATGTAGAGGCCATGTTTTAATCCATTATCTAAAATAAATATCTTGTTGGTTCATT AGCAGTATGTTCAGTTAGCTGTCATACTAGGAGGCCTTGCTGCCCAGCAAGGTACCAGTT GCAGGCTTGCAGCCATTTCTTGATAGTACATGCTAATCTACTCATTTGTTCATGTACAGA GAGACGGAGGGAGTATTTACATTTTGCCGGAGCCACAGGCACATTAAACTGTTTGGAATT GGCAATCGGGTTAATCTGAGCCATTCAAGTCATTTCCTTTGTTTTCATCCATGCTTTGCC CCAATGGTATTTGTTCTTTACAGTTTTACCAGCAGGCGCCTTAATAAGCACGAAGTCTTG GCAAAATGTTTGTTGGTAATGGCCCCAGGGACGAACCCATCGACTTGTGTGAATTGCTTT GCGAATCTTCGGCTTCAGCTTATTACGGATGTAACTTCAACATCATCTGTTAGTCCCTCG TTAGCTTTGGCTAATTGTTTCTTTTTCTGGGGAGGGAATTTTGTGGCTAAATTTGGAGGT TTTGCTCCATGATATGCAACCAGTTTTCTGACAAATTGTTGTTGCTAATGCCACATGATG AAATCAGCAGGCATTGCCAGTGGTGCACGCTGGAATTACAGGGGGTAATTTTTATGTCAT TATTATCTTGTTTTAGTTGCAAAAAAAAAAAAAAAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)