cluster # 85

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Oryza sativa
cluster # 85 cluster # 85 Sequences # 2 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_85#0 length = 692 sequences # 2

consensusID : consensus_85#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 692
fasta sequence

                              [TTTTTTTTTTTTTTTAGGATTTAGTTTCTAAGGATTTTCGCCACTATAAACCCCTTTAGTTGATAGGCGAGAGGTCCAACCTCTTGAAAACTTTCCTTTGTTTAGTTTTCTCTTGTAGTATTAACAGAGCGCTTCTCTTTTCCTCTGTTTTCCATTCATGGAGGATTAGAGTAACTAATATGCCATTTCAGTTCCTACGTTTTTCCTATCCTATGTTCCAAAGGGTGTCTTGGTATGGTTTATTCTCATGCCTACATATCCTAACAAATTATACAAGTGTCATTGTAGACACTTTAAATTCAATGGCATATTGAAGTTAACATTGATAGTTTATAGCCAACTGATAAGATGCCATCGTAATCTTGATCCCATGGTTTTGAGGTACTATAGTGCCATGATTGATTATTCCTAGAATTATTGTTGTACTAGCACAATGAAATGATTCTTCTTAAGACCATGATCCTGATAATGAGATTCCCACCACATCTCAAAAGCCAAATGTCACATGATTCTCCATGAGGGAAGGATAGTTATTGTGTTTGGGTGGGGGCCGTGGTTTAGGAGTATAGGGGAGAACGAGTCATGTGGCAATATAACTGAGTAAGGCTAGCTCAAATTTAAAATCATATGTTTATCGAAGCATAAAATTTAACATCAAATTTGATCAAGGTACCTATGAGTGGAGTTTTAGT]

[+] EMBL CA761237             [TTTTTTTTTTTTTTTAGGATTTAGTTTCTAAGGATTTTCGCCACTATAAACCCCTTTAGTTGATAGGCGAGAGGTCCAACCTCTTGAAAACTTTCCTTTGTTTAGTTTTCTCTTGTAGTATTAACAGAGCGCTTCTCTTTTCCTCTGTTTTCCATTCATGGAGGATTAGAGTAACTAATATGCCATTTCAGTTCCTACGTTTTTCCTATCCTATGTTCCAAAGGGTGTCTTGGTATGGTTTATTCTCATGCCTACATATCCTAACAAATTATACAAGTGTCATTGTAGACACTTTAAATTCAATGGCATATTGAAGTTAACATTGATAGTTTATAGCCAACTGATAAGATGCCATCGTAATCTTGATCCCATGGTTTTGAGGTACTATAGTGCCATGATTGATTATTCCTAGAATTATTGTTGTACTAGCACAATGAAATGATTCTTCTTAAGACCATGATCCTGATAATGAGATTCCCACCACATCTCAAAAGCCAAATGTCACATGATTCTCCATGAGGGAAGGATAGTTATTGTGTTTGGGTGGGGGCCGTGGTTTAGGAGTATAGGGGAGAACGAGTCATGTGGCAATATAACTGAGTAAGGCTAGCTCAAATTTAAAATCATATGTTTATCGAAGCATAAAATTTAACATCAAATTTGATCAAGGTACCTATGAGTGGAGTTTTAGT]
[+] EMBL CA761216             [TTTTTTTTTTTTTTTAGGATTTAGTTTCTAAGGATTTTCGCCACTATAAACCCCTTTAGTTGATAGGCGAGAGGTCCAACCTCTTGAAAACTTTCCTTTGTTTAGTTTTCTCTTGTAGTATTAACAGAGCGCTTCTCTTTTCCTCTGTTTTCCATTCATGGAGGATTAGAGTAACTAATATGCCATTTCAGTTCCTACGTTTTTCCTATCCTATGTTCCAAAGGGTGTCTTGGTATGGTTTATTCTCATGCCTACATATCCTAACAAATTATACAAGTGTCATTGTAGACACTTTAAATTCAATGGCATATTGAAGTTAACATTGATAGTTTATAGCCAACTGATAAGATGCCATCGTAATCTTGATCCCATGGTTTTGAGGTACTATAGTGCCATGATTGATTATTCCTAGAATTATTGTTGTACTAGCACAATGAAATGATTCTTCTTAAGACCATGATCCTGATAATGAGATTCCCACCACATCTCAAAAGCCAAATGTCACATGATTCTCCATGAGGGAAGGATAGTTATTGTGTTTGGGTGGGGGCCGTGGTTTAGGAGTATAGGGGAGAACGAGTCATGTGGCAATATAACTGAGTAAGGCTAGCTCAAATTTAAAATCATATGTTTATCGAAGCATAAAATTTAACATCAAATTTGATCAAGGTACCTATGAGTGGAGTTTTAGT]




>consensus_85#0
TTTTTTTTTTTTTTTAGGATTTAGTTTCTAAGGATTTTCGCCACTATAAACCCCTTTAGT
TGATAGGCGAGAGGTCCAACCTCTTGAAAACTTTCCTTTGTTTAGTTTTCTCTTGTAGTA
TTAACAGAGCGCTTCTCTTTTCCTCTGTTTTCCATTCATGGAGGATTAGAGTAACTAATA
TGCCATTTCAGTTCCTACGTTTTTCCTATCCTATGTTCCAAAGGGTGTCTTGGTATGGTT
TATTCTCATGCCTACATATCCTAACAAATTATACAAGTGTCATTGTAGACACTTTAAATT
CAATGGCATATTGAAGTTAACATTGATAGTTTATAGCCAACTGATAAGATGCCATCGTAA
TCTTGATCCCATGGTTTTGAGGTACTATAGTGCCATGATTGATTATTCCTAGAATTATTG
TTGTACTAGCACAATGAAATGATTCTTCTTAAGACCATGATCCTGATAATGAGATTCCCA
CCACATCTCAAAAGCCAAATGTCACATGATTCTCCATGAGGGAAGGATAGTTATTGTGTT
TGGGTGGGGGCCGTGGTTTAGGAGTATAGGGGAGAACGAGTCATGTGGCAATATAACTGA
GTAAGGCTAGCTCAAATTTAAAATCATATGTTTATCGAAGCATAAAATTTAACATCAAAT
TTGATCAAGGTACCTATGAGTGGAGTTTTAGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case