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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8633#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1609 fasta sequence
[ACCAAATGCTAAGGATGGTAAATGGTTAACCAGCGGAGCACTTTTTCCTGTTGGTAAGCACTGGTGGTCATGGTGCTATTTGGAAACTTGCATGTGATAGAGGTATATTCCAATGGCTTTACCAAAATGGCAGAAAAGGCGCAACTGTACGTCAAGTCAGCAATGTTGTGGCTGCAACTGATTTAACACTGATGGCATTGGCAGGAATAGGCCTGCGTCACGATAAGAAATTAGGTTTTGCGTCTTGTGAACGAAGACCAGGTGCTACTGAAGGGGTAAATGTACTAATCGAAAAAGAAAACCAGGATGGACAATGGGCATATGGTATCACTTGCATTGAATACACTGAGTTTGAAAAATATGGCATCCCAGAACCAACAGTAACAAATGGCAGTTTGCAGGCTAACTATCCAGCAAATACAAATATACTATATGTTGATCTGCAAGCAGCAGAGGAAGTTGGTTCGCGCAAAAATGCTAGCTGTTTACCCGGAATGGTGCTAAATTTGAAAAAAGCTGTGTCATACTTGGATCATCTGGGCTTTGAGTGTAGTGCTGCTGGAGGCAGGTTACAATGCACGATGCAAAACATAGCGGATAATTTTATGAACACATATAACTACAGGTGCAGTAAAGGAATAGAAAGTGAGCTAGACACATTCATTGTGTACAACGAAAGGAAAAAAGTCACTTCGTCAGCTAAAAGGAAGCTGAAATCAGAAGATAAGTCATTGCACCAGGTCAAAGACAACTGTGAATACTTGCGTTCTGGACCACCTTTTTCTATATTTCTTCATCCTGCTTTAGGTCCATTTTGGGATATCACAAGGCAGAAGTTTGTAGGTGGCTCGGTCTCTCAAGGTTCAGAATTGCAAATAGAGGTGGCAGAATTTCTATGGCAAGATGTTGAGCTCGATGGAAGCCTAATCGTTTTAGCTGACAATATTATGGGTTCAACCAACAAGAATAATACTGGAGAACAAATAATGCACTATGGTGCCAGGTGTGGGAGATGCAAACTGCGAAGTGTTAAAATTGTGAATAAAGGGATCAACTGGAGTTCTGCCAATAATGTCTACTGGAAGCATGATGTCGAGAGATCAGAATCTGTGAAGAT-CATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACGGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAAGGGCATTATCAACACT-AATTCTTGATTCATTGATTTCCAGCTAGCTTAATCATATCGAGGGCACACGTGACTAATGAATTTTGTTGACTAAAGTCCATCCTGTAGTTGCTGTTGTAAA-GGTTTTAGGTCTAAATAGATTGATGTACAGTGCACTT-GAATATTAAGGCATGCTGTCAGCCTATTCTCTTACTCATTCAATAAGTGATGTACGGACAGAGATATTTATAAAGGTTGAGGAGAATTCTCATTCTCTGAAATTCCCCCAAAAA]
[+] EMBL CB686021 [ACCAAATGCTAAGGATGGTAAATGGTTAACCAGCGGAGCACTTTTTCCTGTTGGTAAGCACTGGTGGTCATGGTGCTATTTGGAAACTTGCATGTGATAGAGGTATATTCCAATGGCTTTACCAAAATGGCAGAAAAGGCGCAACTGTACGTCAAGTCAGCAATGTTGTGGCTGCAACTGATTTAACACTGATGGCATTGGCAGGAATAGGCCTGCGTCACGATAAGAAATTAGGTTTTGCGTCTTGTGAACGAAGACCAGGTGCTACTGAAGGGGTAAATGTACTAATCGAAAAAGAAAACCAGGATGGACAATGGGCATATGGTATCACTTGCATTGAATACACTGAGTTTGAAAAATATGGCATCCCAGAACCAACAGTAACAAATGGCAGTTTGCAGGCTAACTATCCAGCAAATACAAATATACTATATGTTGATCTGCAAGCAGCAGAGGAAGTTGGTTCGCGCAAAAATGCTAGCTGTTTACCCGGAATGGTGCTAAATTTGAAAAAAGCTGTGTCATACTTGGATCATCTGGGCTTTGAGTGTAGTGCTGCTGGAGGCAGGTTACAATGCACGATGCAAAACATAGCGGATAATTTTATGAACACATATAACTACAGGTGCAGTAAAGGAATAGAAAGTGAGCTAGACACATTCATTGTGTACAACGAAAGGAAAAAAGTCACTTCGTCAGCTAAAAGGAAGCTGAAATCAGAAGATAAGTCATTGCACCAGGTCAAAGACAACTGTGAATACTTGCGTTCTGGACCACCTTTTTCTATATTTCTTCATCCTGCTTTAGGTCC ]
[+] EMBL AU094035 [ TTTAACACTGATGGCATTGGCAGGAATAGGCCTGCGTCACGATAAGAAATTAGGTTTTGCGTCTTGTGAACGAAGACCAGGTGCTACTGAAGGGGTAAATGTACTAATCGAAAAAGAAAACCAGGATGGACAATGGGCATATGGTATCACTTGCATTGAATACACTGAGTTTGAAAAATATGGCATCCCAGAACCAACAGTAACAAATGGCAGTTTGCAGGCTAACTATCCAGCAAATACAAATATACTATATGTTGATCTGCAAGCAGCAGAGGAAGTTGGTTCGCGCAAAAATGCTAGCTGTTTACCCGGAATGGTGCTAAATTTGAAAAAAGCTGTGTCATACTTGGATCATCTGGGCTTTGAGTGTAGTGCTGCT ]
[+] EMBL CA765265 [ CAACTGTGAATACTTGCGTTCTGGACCACCTTTTCTTATATTTCTTCATCCTGCTTTAGGTCCATTTTGGGATATCACAAGGCAGAAGTTTGTAGGTGGCTCGGTCTCTCAAGGTTCAGAATTGCAAATAGAGGTGGCAGAATTTCTATGGCAAGATGTTGAGCTCGATGGAAGCCTAATCGTTTTAGCTGACAATATTATGGGTTCAACCAACAAGAATAATACTGGAGAACAAATAATGCACTATGGTGCCAGGTGTGGGAGATGCAAACTGCGAAGTGTTAAAATTGTGAATAAAGGGATCAACTGGAGTTCTGCCAATAATGTCTACTGGAAGCATGATGTCGAGAGATCAGAATCTGTGAAGAT CATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACGGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAAGGGCATTATCAACACT AATTCTTGATTCATTGATTTCCAGCTAGCTTAATCATATCGAGGGCACACGTGACTAATGAATTTTGNTGACTAAAGTCCATCCTGTAGTTGCTGGTGTAAAGGGTTTTAGGTCTAAATAGATTGATGTACAGTGCACTTGGAATATTAA ]
[-] EMBL CB628433 [ ATTTTGGGATATCACAAGGCAGAAGTTTGTAGGTGGCTCGGTCTCTCAAGGTTCAGAATTGCAAATAGAGGTGGCAGAATTTCTATGGCAAGATGTTGAGCTCGATGGAAGCCTAATCGTTTTAGCTGACAATATTATGGGTTCAACCAACAAGAATAATACTGGAGAACAAATAATGCACTATGGTGCCAGGTGTGGGAGATGCAAACTGCGAAGTGTTAAAATTGTGAATAAAGGGATCAACTGGAGTTCTGCCAATAATGTCTACTGGAAGCATGATGTCGAGAGATCAGAATCTGTGAAGAT CATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACGGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAAGGGCATTATCAACACTAAATTCTTGATTCATTGATTTCCAGCTAGCTTAATCATATCGAGGGCACACGTGACTAATGAATTTTGTTGACTAAAGTCCATCCTGTAGTTGCTGTTGTAAA GGTTTTAGGTCTAAATAGATTGATGTACAGTGCACTT GAATATTAAGGCATGCTGTCAGCCTATTCTCTTACTCATTCAATAAGTGATGTACGGACAGAGATATTTATAAAGGTTGAGGAGAATTCTCATTCTCTGA ]
[+] EMBL AU094036 [ TACTGGAAGCATGATGTCGAGAGATCAGAATCTGTGAAGATCCATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACAGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAAGGGCATTATCAACACTAAATTCTTGATTCATTGATTTCCAGCTAGCTTAATCATATCGAGGGCACACGTGACTAATGAATTTTGTTGACTAAAGTCCATCCTGTAGTTGCTGTTGTAAA GGTTTTAGGTCTAAATAGATTGATGTACAGTGCACTT GAATATTAAGGCATGCTGTCAGCCTATTCTCTTACTCATTCAATAAGTGATGTACGGACAGAGATATTTATAAATGTTGAGGAGAATTCTCATTCTCCGAAATTCCCCCAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||