These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8651#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1341 fasta sequence [TCTGGAACACTAGATGTAAGAGAATTCAGAGAACTGGTGAACCTCTATATCCGAAGGAGTTTAATCATTTTAAGTTGACAGATCTGGAAGTGATGAACTGTGAAAGCCCTGATGAATCACGTGCCAAGAAACGAACAAATGAGGTTTTACAGGGAAATGGTCAAAGTTACAAAGAGGTTTTTTTCGATAATTTAGACTATAGTAGACCAGAAAATTATATTCGGCCAAATTGTGTGACTCCAAATTCTCTTCCAGTTGATGCCACAAGTCCATTTGGTAGTGCCATTGCCACACAAGATCAGTCAGTACCTTTTGGTAGTGCCATTGTCAGTGGACATCCAATTCTTGATGGCAACTTCTCTACTTCTGGGACCATACAGAGGCCCATGAATGTAGAGCTCCCTTCACTCCAATATCCCAACTATGACTTTAACAATAATAATGCATGGTCATATCACGACCCCTTAGGACATCCTATTGACCAGGTTGACTTTGGCTCCCTGAGATCAGAATATCTCTCTCCAAACAACAATGGTCTGCTGGATGCATTGGTTCATGGAGGACATGGACAAGGGGAACTTGCAAATTCCCAAGGATCTTTTGATGCTTGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTCTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTG-ATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCAACAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAACCTCCACCCTTGGTGGACCCTACTTTCTGGAGGCACGATGTATCACTAGAACCGAATTTGCCAGTTTATTGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGGGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGGACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC-TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGGCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAGAATATGCTGAAATTGTATATTCGATTCATTGGTTTTGATTAATCAAAGACTATTGTCGTCAAAAAA] [+] EMBL AK106613 [TCTGGAACACTAGATGTAAGAGAATTCAGAGAACTGGTGAACCTCTATATCCGAAGGAGTTTAATCATTTTAAGTTGACAGATCTGGAAGTGATGAACTGTGAAAGCCCTGATGAATCACGTGCCAAGAAACGAACAAATGAGGTTTTACAGGGAAATGGTCAAAGTTACAAAGAGGTTTTTTTCGATAATTTAGACTATAGTAGACCAGAAAATTATATTCGGCCAAATTGTGTGACTCCAAATTCTCTTCCAGTTGATGCCACAAGTCCATTTGGTAGTGCCATTGCCACACAAGATCAGTCAGTACCTTTTGGTAGTGCCATTGTCAGTGGACATCCAATTCTTGATGGCAACTTCTCTACTTCTGGGACCATACAGAGGCCCATGAATGTAGAGCTCCCTTCACTCCAATATCCCAACTATGACTTTAACAATAATAATGCATGGTCATATCACGACCCCTTAGGACATCCTATTGACCAGGTTGACTTTGGCTCCCTGAGATCAGAATATCTCTCTCCAAACAACAATGGTCTGCTGGATGCATTGGTTCATGGAGGACATGGACAAGGGGAACTTGCAAATTCCCAAGGATCTTTTGATGCTTGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTCTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTG ATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCAACAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAACCTCCACCCTTGGTGGACCCTACTTTCTGGAGGCACGATGTATCACTAGAACCGAATTTGCCAGTTTATTGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGGGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGGACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGGCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAGAATATGCTGAAATTGTATATTCGATTCATTGGTT ] [+] EMBL BP184344 [ GTGCCATTGTCAGTGGACATCCAATTCTTGATGGCAACTTCTCTACTTCTGGGACCATACAGAGGCCCATGAATGTAGAGCTCCCTTCACTCCAATATCCCAACTATGACTTTAACAATAATAATGCATGGTCATATCACGACCCCTTAGGACATCCTATTGACCAGGTTGACTTTGGCTCCCTGAGATCAGAATATCTCTCTCCAAACAACAATGGTCTGCTGGATGCATTGGTTCATGGAGGACATGGACAAGGGGAACTTGCAAATTCCCAAGGATCTTTTGATGCTTGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTCTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTGAATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCAACAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAA ] [-] EMBL CA761254 [ AATCCCCAAGGATCTTTTGATGC TGTTTTCCTCGTGTTCAATGCAATCAAGTGATTCAATCGAATGCTTTCTCTNTGAGTTCTTCCTTTCCAATCATTGGTG ATGATCTCCTCGAGAACAGTTGTCATGCTTTTGTTGGCATCACCAATAATGCAAGCAGCCTATTCCTTGACAGCCAACCTCCACCCTTGGTGGACCCTACTTTCTGGAGGCACGATGTATCACTAGAACCAAATTTGCCAGTTTATCGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGTGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGAACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGTCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAAAAaaaa ] [+] EMBL BP184345 [ CACGATGTATCAC AGAACCGAATTTGCCAGTTTATTGCCAGTTTAACGAAGAATTGCCGCCCTCAAATGAGCAGTTTGCCAAAGATGCAGATGACGCTTTCGGTCATGGGGGTCTTTCTGATGAGACCAATCTAGCTGCTGCAGGTCAAGGCGATGAACATGACCTTGAGGACCCCTGGGCGAGCATGCCCGGTGCCTGTGACATACCTGATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATC TCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATGCTATTACTATCTTACCGTGGAGTTGTGTGCTATATGCTTTGCTCCCCGAGGAAATGTGGCCCTTGAACTGAATGTTGCCATTGTTTGTGTCGGCTACTTATTCGATTCATTAATGTTACATTGTTTGCTAGAATATGCTGAAATTGTATATTCGATTCATTGGTTTTGATTAATCAAAGACTATTGTCGTCAAAAAA] [+] EMBL AA750200 [ GATTTTCCAAGTGAATGACTTGCATAGAGTTTGTGCGTGTTATTGATTTTGATCTTCAACCAGTGAGAGAACCAAGAAGATCCTTTTTGCAATAACCATGCCTTTCAAGATCGTCCAATAAGTTTGTGGCTGCGTATCGTATTACTATCTTA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||