cluster # 8758

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Oryza sativa
cluster # 8758 cluster # 8758 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8758#0 length = 2662 sequences # 5
consensusID : consensus_8758#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 2662
fasta sequence
                              [TTAACCACCGGACACCACAGCGAGCAGAGCGCCGCTGTTCTCTTCCGCTTCTCTCCCTGAGCTCGGCCTCGTGTCACTGACGTCGTGTATGAGAGGAAGGTGGTGAGCTCAGCAGCTCAGGCTCAGCTCGCAGTAGGGAGCAGACGCCGGCCGCATCGCCCCCCTTCGCGTTTCGCTGCTCCGAGGTGAAACGGCAATGCATGATTGGTGCTGTGTCAGCCTCAGTCCTTGATTATTTCCACAGAGAAAACGCATAATGCGCCTTGTTTCTAGGAAGACCTATCAGGTTAAGAATTCGGGAGAAATATTTGGAAATTCTCAGGCATGATATGTCCCAAAATTTCTTTGGCATGCGTTCTTCTGCTCCTATGGTTTACCTCAACGGGAGATGCAGCATACATGAAGTACCTGGATCCAAAGCAACCCACCAACACTAGAATCAAGGACCTTATCAGTAGGATGACTCTTGCAGAAAAAATTGGCCAAATGACACAGATTGAACGTGGGGTTGCATCTGCAGATGTCATGAAAAACTACTTCATAGGTAGTGTATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTCCCTGCTCCCCAGGCTACTCCTGCAGTTTGGGTGAACATGGTAAATGAATTCCAGAAAGGCGCCTTGTCAACACGTCTAGGAATACCTATGATCTACGGCATTGATGCAGTTCATGGTAATAACAATGTCTACAATGCCACCCTATTTCCTCACAACATTGGGCTTGGAGCTACAAGGGATCCTGACCTCGTAAGGAGGATCGGCGAAGCAACTGCTCTTGAAGTACGGGCAACAGGCATTCCGTACACCTTTGCTCCATGTATTGCAGTTTGTCGAGATCCACGATGGGGCCGATGTTATGAGAGCTACAGTGAAGACCACAGGGTAGTCCAGCAGATGACAGACATTATACTTGGTCTACAAGGAGATATCCCAATAAATCATACCAAGGGAGTTCCTTATATTGCTGGGAAGGATAAAGTTGCTGCTTGTGCTAAGCACTTTGTTGGTGATGGTGGAACTCATAATGGAATCAATGAGAACAACACGATCACTGATGAACATGGGCTTCTAGGCATTCACATGCCCCCATATTATGACTCTATTATAAAGGGTGTTGCTACTGTTATGGTTTCCTATTCAAGCTTGAATGGTGTCAAAATGCATGCCAATCATGATCTGGTTACTGGCTACCTGAAATCCAAATTGCATTTTAGAGGATTTGTGATATCAGATTGGCTAGGAATAGACAGGATAACGTCACCACCTGATGCAAATTATACTTACTCTGTGCAAGCTGGAATAAATGCTGGTATTGATATGGTCATGGTGCCATTCAATTACACCCAATACATTGATGATGTGACACCTCTTGTTAAGAAGGGTATTATCAATATGAGCAGAATTGATGATGCTGTCAGGCGTATCCTTCGAGTCAAATTTATAATGGGCCTATTCGAGAACCCTTTAGCTGATCTTAGCTTCGCAGATCAGCTTGGAAAGAAGGAGCACAGAGATTTGGCTAGAGAAGCCGTCAGGAAATCACTTGTTCTATTAAAAAACGGCAACTCTCCCAATCAACAATTCCTGCCTCTACCAAAGAAAGCTAGAAGTATCCTTGTAGCTGGAAGCCATGCTAGCAATTTGGGCTACCAATGTGGCGGGTGGTCAATTGAATGGATCGGAGGTAGTGGAGATATTACTGTAGGTACAACAATTCTTGAGGCCATAAAGTCCACTGTCGCTGATTCAACACATGTTGTCTACTCTGAGAACCCTGATGAAAGCTTCATGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGTCAGTGGGTGATAAGCAGATTTGTTCTTTCACGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAATAGAGCATTTTTATCTAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGGCCTACAGCACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATTGATGGGTTTGA]

[+] EMBL AK066300             [TTAACCACCGGACACCACAGCGAGCAGAGCGCCGCTGTTCTCTTCCGCTTCTCTCCCTGAGCTCGGCCTCGTGTCACTGACGTCGTGTATGAGAGGAAGGTGGTGAGCTCAGCAGCTCAGGCTCAGCTCGCAGTAGGGAGCAGACGCCGGCCGCATCGCCCCCCTTCGCGTTTCGCTGCTCCGAGGTGAAACGGCAATGCATGATTGGTGCTGTGTCAGCCTCAGTCCTTGATTATTTCCACAGAGAAAACGCATAATGCGCCTTGTTTCTAGGAAGACCTATCAGGTTAAGAATTCGGGAGAAATATTTGGAAATTCTCAGGCATGATATGTCCCAAAATTTCTTTGGCATGCGTTCTTCTGCTCCTATGGTTTACCTCAACGGGAGATGCAGCATACATGAAGTACCTGGATCCAAAGCAACCCACCAACACTAGAATCAAGGACCTTATCAGTAGGATGACTCTTGCAGAAAAAATTGGCCAAATGACACAGATTGAACGTGGGGTTGCATCTGCAGATGTCATGAAAAACTACTTCATAGGTAGTGTATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTCCCTGCTCCCCAGGCTACTCCTGCAGTTTGGGTGAACATGGTAAATGAATTCCAGAAAGGCGCCTTGTCAACACGTCTAGGAATACCTATGATCTACGGCATTGATGCAGTTCATGGTAATAACAATGTCTACAATGCCACCCTATTTCCTCACAACATTGGGCTTGGAGCTACAAGGGATCCTGACCTCGTAAGGAGGATCGGCGAAGCAACTGCTCTTGAAGTACGGGCAACAGGCATTCCGTACACCTTTGCTCCATGTATTGCAGTTTGTCGAGATCCACGATGGGGCCGATGTTATGAGAGCTACAGTGAAGACCACAGGGTAGTCCAGCAGATGACAGACATTATACTTGGTCTACAAGGAGATATCCCAATAAATCATACCAAGGGAGTTCCTTATATTGCTGGGAAGGATAAAGTTGCTGCTTGTGCTAAGCACTTTGTTGGTGATGGTGGAACTCATAATGGAATCAATGAGAACAACACGATCACTGATGAACATGGGCTTCTAGGCATTCACATGCCCCCATATTATGACTCTATTATAAAGGGTGTTGCTACTGTTATGGTTTCCTATTCAAGCTTGAATGGTGTCAAAATGCATGCCAATCATGATCTGGTTACTGGCTACCTGAAATCCAAATTGCATTTTAGAGGATTTGTGATATCAGATTGGCTAGGAATAGACAGGATAACGTCACCACCTGATGCAAATTATACTTACTCTGTGCAAGCTGGAATAAATGCTGGTATTGATATGGTCATGGTGCCATTCAATTACACCCAATACATTGATGATGTGACACCTCTTGTTAAGAAGGGTATTATCAATATGAGCAGAATTGATGATGCTGTCAGGCGTATCCTTCGAGTCAAATTTATAATGGGCCTATTCGAGAACCCTTTAGCTGATCTTAGCTTCGCAGATCAGCTTGGAAAGAAGGAGCACAGAGATTTGGCTAGAGAAGCCGTCAGGAAATCACTTGTTCTATTAAAAAACGGCAACTCTCCCAATCAACAATTCCTGCCTCTACCAAAGAAAGCTAGAAGTATCCTTGTAGCTGGAAGCCATGCTAGCAATTTGGGCTACCAATGTGGCGGGTGGTCAATTGAATGGATCGGAGGTAGTGGAGATATTACTGTAGGTACAACAATTCTTGAGGCCATAAAGTCCACTGTCGCTGATTCAACACATGTTGTCTACTCTGAGAACCCTGATGAAAGCTTCATGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTTCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCGCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGTCAGTGGGTGATAAGCAGATTTGTTCTTTCACGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAATAGAGCATTTTTATCTAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGGCCTACAGCACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATT           ]
[+] EMBL CA764163             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aggggGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCTGAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACGGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCCTTTGGTTTTGGTTTGACGATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGGTATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCAT                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CB097006             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGAACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATTGAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACACACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACGATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGGTATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCAT                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CF306152             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGTCAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACTTGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTCTTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGACAGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTAATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGTAGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTCTATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGTCAGTGGGTGATAAGCAGATTTGTTCTATAAAGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAATAGAGCATTTTAAAATAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGGCCTACAGCACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATTGATGGGTTTGA]
[-] EMBL CF306173             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTGGGTAAGAAATTGATGGGTTTGA]




>consensus_8758#0
TTAACCACCGGACACCACAGCGAGCAGAGCGCCGCTGTTCTCTTCCGCTTCTCTCCCTGA
GCTCGGCCTCGTGTCACTGACGTCGTGTATGAGAGGAAGGTGGTGAGCTCAGCAGCTCAG
GCTCAGCTCGCAGTAGGGAGCAGACGCCGGCCGCATCGCCCCCCTTCGCGTTTCGCTGCT
CCGAGGTGAAACGGCAATGCATGATTGGTGCTGTGTCAGCCTCAGTCCTTGATTATTTCC
ACAGAGAAAACGCATAATGCGCCTTGTTTCTAGGAAGACCTATCAGGTTAAGAATTCGGG
AGAAATATTTGGAAATTCTCAGGCATGATATGTCCCAAAATTTCTTTGGCATGCGTTCTT
CTGCTCCTATGGTTTACCTCAACGGGAGATGCAGCATACATGAAGTACCTGGATCCAAAG
CAACCCACCAACACTAGAATCAAGGACCTTATCAGTAGGATGACTCTTGCAGAAAAAATT
GGCCAAATGACACAGATTGAACGTGGGGTTGCATCTGCAGATGTCATGAAAAACTACTTC
ATAGGTAGTGTATTGAGTGGTGGTGGAAGTGTCCCTGCTCCCCAGGCTACTCCTGCAGTT
TGGGTGAACATGGTAAATGAATTCCAGAAAGGCGCCTTGTCAACACGTCTAGGAATACCT
ATGATCTACGGCATTGATGCAGTTCATGGTAATAACAATGTCTACAATGCCACCCTATTT
CCTCACAACATTGGGCTTGGAGCTACAAGGGATCCTGACCTCGTAAGGAGGATCGGCGAA
GCAACTGCTCTTGAAGTACGGGCAACAGGCATTCCGTACACCTTTGCTCCATGTATTGCA
GTTTGTCGAGATCCACGATGGGGCCGATGTTATGAGAGCTACAGTGAAGACCACAGGGTA
GTCCAGCAGATGACAGACATTATACTTGGTCTACAAGGAGATATCCCAATAAATCATACC
AAGGGAGTTCCTTATATTGCTGGGAAGGATAAAGTTGCTGCTTGTGCTAAGCACTTTGTT
GGTGATGGTGGAACTCATAATGGAATCAATGAGAACAACACGATCACTGATGAACATGGG
CTTCTAGGCATTCACATGCCCCCATATTATGACTCTATTATAAAGGGTGTTGCTACTGTT
ATGGTTTCCTATTCAAGCTTGAATGGTGTCAAAATGCATGCCAATCATGATCTGGTTACT
GGCTACCTGAAATCCAAATTGCATTTTAGAGGATTTGTGATATCAGATTGGCTAGGAATA
GACAGGATAACGTCACCACCTGATGCAAATTATACTTACTCTGTGCAAGCTGGAATAAAT
GCTGGTATTGATATGGTCATGGTGCCATTCAATTACACCCAATACATTGATGATGTGACA
CCTCTTGTTAAGAAGGGTATTATCAATATGAGCAGAATTGATGATGCTGTCAGGCGTATC
CTTCGAGTCAAATTTATAATGGGCCTATTCGAGAACCCTTTAGCTGATCTTAGCTTCGCA
GATCAGCTTGGAAAGAAGGAGCACAGAGATTTGGCTAGAGAAGCCGTCAGGAAATCACTT
GTTCTATTAAAAAACGGCAACTCTCCCAATCAACAATTCCTGCCTCTACCAAAGAAAGCT
AGAAGTATCCTTGTAGCTGGAAGCCATGCTAGCAATTTGGGCTACCAATGTGGCGGGTGG
TCAATTGAATGGATCGGAGGTAGTGGAGATATTACTGTAGGTACAACAATTCTTGAGGCC
ATAAAGTCCACTGTCGCTGATTCAACACATGTTGTCTACTCTGAGAACCCTGATGAAAGC
TTCATGAAAAACAATGACTTCTCATTCGCTATTGTTGTTGTTGGTGAGCGAACATATGCT
GAAACAACAGGTGATGACCCAGAACTCACCATCCTAGACCCTGGTACAGACACAATCCGA
ACAGTGTGTTCCACAGCTAAGTGTGCAGTGGTTATCATCTCTGGTCGGCCTGTTGTCATT
GAACCATATCTTCCAATGATGGAAGCGCTCGTCGCAGCTTGGCTTCCTGGAACAGAAGGT
CAGGGTGTTGCGGATGTACTGTTTGGGGACTATGGCTTCACCGGGAAGCTCCCACGCACT
TGGTTCAAGTCTGTTGACCAGCTGCCCATGAATGTTGGTGACCTACACTATGATCCACTC
TTCCCTTTTGGTTTTGGTTTGACAATAAATTCATCGCAGCCAGGGTTCTCTGGTGCTGAC
AGACTGAGAGATAGGAATGGGGGGATGATATACGTTGTGTTGAGTTTGGTACTGTCAGTA
ATACTGATGCATGCTTCGGGCATAGGTATATTTTAACTCGAGTTGCCCTTTCCTAGTCGT
AGTATGGTTCCACATCAAGTGCTCCATGCCTCCATCGTTATACGTTGTATGTACTAGCTC
TATGGAGATTTTTTGATTGCAAAGATGCATTTATCCCTAAAGCTAGGTGGGTCAGTGGGT
GATAAGCAGATTTGTTCTTTCACGGTTTTACCAAATTATGTGTGGTTATAATAGAGCATT
TTTATCTAGGGAGGACAAAGTAGATGGATTATGCTCTGCAAATACTGATGGGCCTACAGC
ACTTCTTTACTCTCCGTACCATGTGACACTCCACAGAAAGTAAAGGAATATTAAAATGTG
GGTAAGAAATTGATGGGTTTGA
clustalw multiple alignements is not computed in this case