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Oryza sativa
cluster # 8793 cluster # 8793       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8793#0 length = 1809 sequences # 5  

consensusID : consensus_8793#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1809
fasta sequence
                              [CCTTCGAGTGCGAGCCATGTCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT-GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTTTAGGACCAAGACAAGTAGAAATCATAGTAGTACTT]

[+] EMBL AK071934             [CCTTCGAGTGCGAGCCATGTCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTC                                      ]
[+] EMBL AK107556             [                   TCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGT GGAAGGGCCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGGCTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAAGTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGGGAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGATTGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCTCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGCTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTC                                      ]
[+] EMBL CB642230             [                      ACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTTCATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCTGCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCTGTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCACGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCCGCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTCCTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCCGTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCTCTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGGCGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGCAAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGCCTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGCTGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGTGGGAAGGGCCGGGCAGCTGTGGTCGGTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CB642231             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTTGTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCATCGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCATGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGTAGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATCTGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTTTAGGACCAAGACAAGTAGAAATCATAGTAGTACTT]
[+] EMBL CF333195             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGGATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTTAGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATTGCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAACCCTCTTGTATAGTTGTATGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATATCGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGAGAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTAAATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTCTAGGA                              ]


>consensus_8793#0 CCTTCGAGTGCGAGCCATGTCCACCTCCGCACCCACCTCGTCGCCTGAGCCGCCGGAGTT CATCCGCGGGAGCCTCATCCCGGCTCTCCCCGACGACCTGGCCATCCACTGCGTCGCCCT GCTGCCGCGCGCCGCGCACCCCTCCCTCGCGCTCGTCTCCCGCGCCTTCCACACCTTGCT GTGCCGCGACCCGGGTCCCCTCCTGGCCGCGCGCCGCCGCCTCCGCCTCTCCGACCCCCA CGTCATCCTCTCCCTCCGCCCGCCGGCCTCCGCCTCGCCTCTCTTCTTCCTCCTCCTCCC GCATCCCGGATGGCCACCGCTGCCTCTCCCGTCCCCTCCCGTCCCCGTCTCCTCCTCCTC CTCGGTCGCCGTCGACGGCAACCGGGTGTTCCTCTTCGGCGGGTCCGTCTCCGGAGTGCC GTCCCCGTCGGTGCAGATCTTGGACCCCCGCACCAGATCCTGGTCAGTCGGCCCGCGCCT CTCCTCTCCGCGGGAGTTCGCCGCCGCCGTTGCCCACTCCGGCGTACTATTCGTCGCCGG CGGTTGTGTTCCTTCCTCCCCCTTCTGGGCTGAGTCCCTGAACCTCTCCTCCCCGGATGC AAAGTGGTCTCCGGTCCCCAGCCCGCCCCACTTCCGGGAGAAGTGGATGCACGGCTCCGC CTCGCTCGCCGGGAAGGTCCTCGCGGTGGCCGATCGCGGCGGCTTGGCCTACGACCCGGC TGCGCCGCCTACTGAGGCATGGGCGCCGGTTTCTCCGATCCTTGACATGGGGTGGAAGGG CCGTGCAGCTGTGGTCGGTGGAATCCTCTACTCCTACGATTACTTGGGGCAGGTCAAGGG CTATGATCCGGACACCGATTGCTGGAGCAAGGTGGAAGGGTTGGAGCAGGAGCTGCCCAA GTTCTTGTGTGGTGCCACTCTCGCCAATGTCGGTGAACTGCTCTACTTGGTTTGGGAAGG GAAGTGGAAAGGGAAAGGGAAAGCGAAAGGAAAGGGCGAAGCAAGGAGCATGGTGGTGAT TGATTGGGCTGCCATTGCGGTGACGAAAGCCGAAGAGGGCCGGCTAACGGGGAAGGTGTT GTCAAGGGACACCATTGTATTCAAGGACATGCCAAAGGGGTCAGCAATCACACATTGCAT CGCATTGGAGCTGTGACGATGGTTGCTCCAGTAGCCCAGTCATAAATCAAATGGCATCCA TGTTTTAAATGTTCTCTGCTGATTTGAGGATGGAAAAACTCAGTATTGTGGTAGGCTGGT AGCACCTCCTGCTGAGAAATGAGGATGCTTCACTACTGGGCAGCAGAGCACTGATAAATC TGGCTGGATGACAAGTTAAAGATAATTCAGAAAATTGTGTTTCAATTCCTTATCGTCTGG ATGCTGGAAGAAGGCATTTGGAATTCTACCCAGCAAAAATCATGCATTTGGATCTCTCTT AGACATTGAACATATTTGATGAAGCAGAAGTTTTGCCTTAAACACTATTTATTCTTCATT GCCGGTCAGTTGTAATTGTAAGATAACCAATGTAGCTTGTAGCCCTCTTGTATAGTTGTA TGGCCTATTGCTGAGCTTGCTGTGCCCGTGTGTGGCAGCATTAGTTGTGTTTAAACATAT CGAATTACTTTGCTAGCTTGGGCCAGTAGTGCAAATTGTTAAAACCAGTTTGGCCCAAGA GAAACAGCACCTACAGTTGTCTCATTCTGTGCAGAGTTTCTATCCATGGATGTACCCCTA AATAAACTATGAAATTAATTCATGCATTCTCTTTTAGGACCAAGACAAGTAGAAATCATA GTAGTACTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)