cluster # 8949

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Oryza sativa
cluster # 8949 cluster # 8949 Sequences # 6 consensus # 1
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consensus_8949#0 length = 3939 sequences # 6
consensusID : consensus_8949#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
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Sequences nbr = 6
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fasta sequence
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[+] EMBL CF280254             [GCGCAACCACGCGCACCGCCTCGCCCTTCTCCCTTCGCGAACACCGTCACCGCCGCATCCTCGCCCACCTACAGCCATCGTCGCCGCGCCGCCACTGCCGCCTCTTCCTCTCTTCAATCTCGGCCCCGCCAGGCTGCCACCGCCTCCCTTTCCTCGCCCACTCCGCTTCGCTCTGCCATATCCGGCTCAGTGGTTGCCAGATCCAGTAAGAGGAGCCTGGGAGGAGAAGGGAAGTTGAGAGGGACGCCATCGCCTGGAGCGAGACACGCCCCAGCCGTGGCCCCGCGTCCGTCGCTCGCTGCGAGACATGCTTTCCGCCCCGGTCGGTGCGGCGCCAAATCCGCCTCGGGGAAATCGGCTGACTCGCCGATGTATCCGGCTGCCCGGAGACGACGGACATAAGCCGCCGCCATAGTCCTCTTCTTCTCTCCCTCTTTGCGCTACTTGATGTGCTGGTTCTTGCTCAAGGTCCACCAGATCCGGTAGAAAGAGGTGGTAGGAGCAGTGGGCTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
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[+] EMBL CA765290             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TGATAAGAAATCCACGTCCCATTTT NATGGCTCAACGCGCTCAAGAGTCAAGAATCTGTGCTGGTAATGGTTGCTACACGAACTTTTCTGCAATTACAGGTTTCAATCATTTGCTCCCTTTATGTTCTGTGCACTTTTCATACAGTATTTATCAAGGTAAGAACATGGATCATGGATGGCATGTACTAATGTACATATTTGCCAAACTATCACCTTTCTAAATATGGACTTTCCTATTTCAGAATTTAGATAAGATTTAGGGCTGACACTTATATTTAGTGATTAGTACAATTTCAGAGTTTTGTCATTTTTCCTTGGTGCATCATAGGTCAATTGAGGTTCATTAATTCTTGCCAAGCTTTATTTCTGACAAT TTTTGTTTTCCCTCTACCTGTGTTTCTACCTGACAACTTACAAGCATGAATATTGGTAGAAAAAAATAGCACTATAATTTGCTCAAATAAGTAAACTAGGATAGGAGATGATTTGGTGTGGCTTGAGACAAAGCTAAATTAATCAGCAAATTGATAATCAGTTATTCTTGATAATGGCATTTTAAGAAGTTGTTTTCAGTTTTGCAAAAATAGTATAAAAAAAGAAGAAAAGNTGTTTACAATTTTTTAAGTAAACTTGTGAGCTATTATATGTGATAGTGCATCCGNTATTTGTAAGATAAATGTAAGCCGNTTACTCTCAAAAGNTTAAATGAATGAACCAATGCCCACCNTTTCGNTTTTTCTGGTCTCAATACCTTTTATCACATATAATCCTTTATGGTGGTGGCACGATATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CF313023             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTTCAATCATTTGCTCCCTTTATGTTCTGTGCGCTTTTCATACAGTATTTATCAAGGTAAGAACATGGATCATGGATGGCATGTACTAATGTACATATTTGCCAAACTATCACCTTTTTAAATATGGACTTTCCTATTTCAGAATTTAGATAAGATTTAGGGCTGACACTTGTATTTAGTGATTAGTACAATTTCAGAGTTTTGTCATTTTTCCTTGGTGCATCATAGGTCAATTGAGGTTCATTAATTCTTGCCAAGCTTTATTTCTGACAAT TTTTGTTTTCCCTCTACCTGTGTTTTTACCTGACAACTTACAAGCATGAATATTGGTAGAAAAAAATAGTACTATAATTTGCTCAAATAAGTAAACTAGGATAGGAGATGATTTGGTGTGGCTTGAGACAAAGCTAAATTAATCAGCAAATTGATAATCAGTTATTCTTGATAATAGCATTTTAAGAAGTTGTTTTCAGTTTTGCAAAAATAGTAT AAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI802411             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATCAAGGTAAGAACATGGATCATGGATGGCATGTACTAATGTACATATTTGCCAAACTATCACCTTTCTAAATATGGACTTTCCTATTTCAGAATTTAGATAAGATTTAGGGCTGACACTTACATTTAGTGATTAGTACAATTTCAGAGTTTTGTCATTTTTCCTTGGTGCATCATAGGTCAATTGAGGTTCATTAATTCTTGCCAAGCTTTATTTCTGACAATATTTTGTTTTCCCTCTACCTGTGTTTCTACCTGACAACTTACAAGCATGAATATTGGTAG AAAAAATAGTACTATAATTTGCTCAAATAAGTAAACTAGGATAGGAGATGATTTGGTGTGGCTTGAGAC AAGCTAAATTAATC  CCAATTGATAA C GTTATTC TGATAAT GCCTTTTAAGAAGTTGTTTTCAGTTT  CCAAAATAGTAT AA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CF280255             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTAGCAATGAAAATTCCTAGGGGTACTCACACATTTGCATGGGAAAACTCATATGTGATTCCAAAACTAATGTTGCATCACATATCTGTTATGTAAATCAAAGTTACCAGTACAGCGAGCTTGATGTTGCAAATGTATTGTTTTACACGATTTGTCTATT                         ]




>consensus_8949#0
GCGCAACCACGCGCACCGCCTCGCCCTTCTCCCTTCGCGAACACCGTCACCGCCGCATCC
TCGCCCACCTACAGCCATCGTCGCCGCGCCGCCACTGCCGCCTCTTCCTCTCTTCAATCT
CGGCCCCGCCAGGCTGCCACCGCCTCCCTTTCCTCGCCCACTCCGCTTCGCTCTGCCATA
TCCGGCTCAGTGGTTGCCAGATCCAGTAAGAGGAGCCTGGGAGGAGAAGGGAAGTTGAGA
GGGACGCCATCGCCTGGAGCGAGACACGCCCCAGCCGTGGCCCCGCGTCCGTCGCTCGCT
GCGAGACATGCTTTCCGCCCCGGTCGGTGCGGCGCCAAATCCGCCTCGGGGAAATCGGCT
GACTCGCCGATGTATCCGGCTGCCCGGAGACGACGGACATAAGCCGCCGCCATAGTCCTC
TTCTTCTCTCCCTCTTTGCGCTACTTGATGTGCTGGTTCTTGCTCAAGGTCCACCAGATC
CGGTAGAAAGAGGTGGTAGGAGCAGTGGGCTCAGTGACGAGGTCAGGGAAGAGAAGGAAG
GAGAAGGGCAGCTCAGTCATGGCTGCCACGAGGACAGATGTGGGTCGGCAGCTACTACGG
CAAGGCCAGCGCCCAGTGCCACATGTGCCGTTGTACATGGCGCCTCGCCGCCCTCGCTTC
CTCCAGTTGAATCTCTTCTCCGTACTCTTCAGGTGAGTTTGAGAGCCACTAACCTGACCT
TGCCATAACTAAGTTTAGGCTAGTTGAGACATGGTGGCATAAGTGTGGCTTAGAAATAGT
TGGCCACAAGTGTGGCAAGCTTAGCTTCAAATTTGAGAGTATGACATGTGGGTCCTAAGG
CTATGAAAGTGTGGCATGACACAATTGCCGTAACGAACCAAACACATATCTAAAAAATTA
TGGCATACTTCCTCCGTTTCACAATATAAGTCATTCTAACATTTTCCACATTCATTTTGA
TGTTAATGAATCTAAATAGATATATATGTCTAGATTCATTAACATCAATATGAATATGGG
AAATGCTAGAATGACTCACATTGTGAAACGGAGGGAATAACTAAAGTGTGGTGTGGCAAA
GTGTGGCAACCAACCAAACAACCCCTAAGCCATGCTTCTTCTCCTAGCTATGCTAACGGT
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clustalw multiple alignements is not computed in this case