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Oryza sativa
cluster # 9108 cluster # 9108       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9108#0 length = 4519 sequences # 6  

consensusID : consensus_9108#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 4519
fasta sequence
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[+] EMBL CB675513             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CAGATCCATTGGTTTAGGGTAATATTAGATGAAGGACACACATTAGGTTCCAGTCTCGCCCTCACAAACAAATTGCAGATGGCTGTTTCATTGGTTGCTTCTAATAGATGGATTCTAACTGGTACCCCTACGCCAAACACACCAACTAGTCAAGTTGCTCACCTTCATCCCATGCTTAAGTTTCTTCATGAGGAAGTTTACGGTCAAAACTACCAGTCATGGGACACTGGAATTCATAGGCCTTTTGAGGCACAAATGGAAGACGGACGCAGTCGTCTCCTGCAGCTACTTCAGAGGACTATGATTAGTGCAAGGAAACAAGACCTGAAAAACATTCCTCCTTGCATAAAAAAGATAACTTTCCTGGACTTCAGTGAGGGGCATGCGAAAAGTTACAATGAACTGGCTGTTACTATCCGCAGAAATATATTGATGGCTGATTGGAATGACCCTTCTCACGTGGAATCACTTCTGAACCCCAAGCAATGGAAATTCCGTACTACAACTATTAAGAATGTGCGCTTGTCTTGTTGTGTTGCGGGGCATATCAAAGTAGCAGAGGCTGGTCAAGATATACAGGAAACAATGGATGCATTAATGCAGCTGGGCCTTGATCCTTCTTCGGGGGAGTATCAGTCCATAAGATATGCTCTTTTAAATGGTGCCAGCTGTTTCAGGTGCAGAGATTGGTGCCGCTTGCCTGTTGTCACGCCCTGTCGGCATCTGTTGTGCCTTGATTGTGTAGCTCTTGATAGTGAGAAATGCACGTTACCTGGCTGTGGCAACCATTATGAGATGCAGACTCCCTG AACTCGTGCACGGCCAGAAAATCAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AA750919             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACCTGGCTGTGGCAACCATTATGAGATGCAGACT CCTGAAACTCGTGCATGGCCAGAAAATCCAAACCCAAAATGGCCAGTGCCCAAAGACCTAATTGAGTTGCAGCCTTCATATAAGCAGGATGACTGGGATCCAGACTGGCAGTCGACAACAAGCAGCAAAGTTGCTTATTTGGTTAATAAGTTGAGAAGTTTGAAGGCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CB675514             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATGACTGGGATCCAGACTGGCAGTCGACAACAAGCAGCAAAGTTGCTTATTTGGTTAATAAGTTGAGAAGTTTGAAGGCAGAAAACATAAAACATGGGTACTCTAGGAACATGGCCAATGGTGCTTGCCTTTCTAGTCAATCTTCTTGTCAAGACCATAATAATGTGGAGGGCAGGTTACCACACACAATGCCTGACAAAGTAATAATATTCTCTCAGTTTCTGGAGCATATCCATGTGATTGAGCAGCAGCTGACGATTGGGGGCATAACATATGCTGGAATGTACAGTCCCATGCCATTAGGCAGTAAGAGAAGTTCACTGACGAAGTTCAAAGATGATCCAGCATGCATGGCCTTAGTCATGGATGGAACTGCAGCACTGGGCCTTGATTTGAGTTTTGTCTCTTATGTTTTTCTGATGGAACCAATATGGGATAGGAGTATGGAGGAGCAAGTTATTAGTCGTGCACATCGTATGGGTGCTACTCGTCCCATATTTGTTGAGACTTTGGCCATGCGTGGTACCATCGAAGAGCAAATGTTAAAACTTTTACAGGATTCCAATGCTTGCAGACAAATGGTGAATAAAGGAACAAGCAGCACTGATAATGAAGGTGCTCGGCCTCACCGGAGCCTGCATGATTTTGCGGAAAGCAGTTATCTGGCGCAACTCAGCTTTGTGAAAGGATCTGACGCGGCGGAAAAATTATAGTTGCTAACACTAACAAAAATTTCTTTCTTGATTACCTCTGTTTCCTTCAATATTGAGGCCCTTCAATTCTTTTGATATAGAAATGAGTCCTTTTGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AU225325             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                gccgcTGGCCGATCCGGGCTGTAATGTAGCTCGGGCTCGTTTGGAGTTGCCTGCTGCCTTGTGGGATGACGCCACGTCGCCCGGTCCATTGCCGGTCAGAACTGAAGGGCAGGCAAGGCTATTCCAAGGCTCTGATTATAAAAACAGCCGGTGAGAATTTAGAAAAGTCAAGTTTCTTAGCTTGTTTCTGGTTTAATGTTTGATTGTGAATAGGGTGGGTGAAAATTTGAACCGTTTGAGGGAGCTAGTGAGAATTTAAAAgcgg               ]


>consensus_9108#0 TTACTCCCCCATCATAGCCTCTCGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCGCCGAATCCTCCGCTTC CGAGGTGAAATCCATCCGAATTTGGCCTCCGGAATCGCCGCCGCGTGATCCTCGCCTGCG ACGAGGGGTGGCTAGGTCGGGGGCTCGACATGCGCGGGCGGCGGCGGTGAACGTGAACGT GCCCGGGTGAGGTGAGTTGGCCTCAACGGCATGGGCGGCGACGAGGAGGAGGTTGCCGGT GACGTGCGCCGCAAGTTGGGGGGCTACCTCCGCGCCGTCGTCTCCGTTTCATCCGATGTG GGCGTGGAGGCGCTCGCGCCGCTTTCCCCGTGCTCGCTCTTCGCCTGCGGGGGCGTCTCC CTCGCGCCGATCCCCGACGGCGGTGGCGCGACGCCGCGGTCCAAGGGGAGGGCGTGCGGC GGAGGGGGCGTCGTGCGGCAGCTGAGGGCGCTGGTGTCGAGCCGGTGCGTGGAGGTGGAG GGGAGGGTGCTGAGGGCGGTGGCGAGGAGGGGGAGGGAGGGAGGAGGAGGGGATGGGGAG GTGGAGGCGAGGGCGGTGGTGCTGTTCGACGTGTACCTCCCCGTCTCCGTCTGGTCGGGG TGGCAGTTCCCGCGGTCCCGCGCGGCCGCGGCCGCCGCGGTCTTCAAACACGTCAGTTGC AATTGGGATGCCAGGGATGCTTTGCTTGCTTTTAACTGGACCTCTCCTGACAATCCACAC TGTGATGACCAGTATATTTGGACCTGCACCGATTGCCACGTCCTTGGTTGTGAGGTACAT CAGATACCATCTGTATTGAATAATGATAAGTCGTTTGACCTGCATGAAATCTTCAAAACT CTACCTAGTGTTATGGTGGAGAAGAGGATGCAGATAACAAGAATAACACCAGATGAGGCA GCATCGGGAGTGGGTATTTGGTCTGTCCCTGATGATGTCTTGTATAAGGTGCTGGTTCGA CTGAAACCCAGAGATTTGATTAGAGTTGCAGCTGCTTGTCATCATCTAAGGAATCTTTCT GCTTCTATCATGCCTTGCATGAAACTTAAGCTTTTTCCTCATCAAGAGGCAGCTGTTGAA TGGATGCTAAGGAGGGAGCAGAACTTGCAGGTCCTAGAACATCCTCTATACAAGGGTTTG TGCACCATGGATGGTTTCCCTTATTACATAAATGTTACCTCTGGTGAAATATCCACTGGT AGTGCTCCAACTGTACATGATTTTTGTGGAGGTATGTTTTGTGATGAACCTGGGTTAGGG AAGACAGTGACTGCACTGTCTCTTATTCTGAAGACACATGGGACTCTGGCAGTCCCTCCA CCAGGGATGAATGTTATGTGGTGCATGCATAAACCAGATAAAAAATATGGATACTACGAG CTTAGTGCTAGCAACTCTTCTAATGGAAACATCTTTTTGTCGGGATCAAAAAAGTTGCGA AAGGACGTGATTAGAGAAGATACATGTTCAAGTGAGTCACTGAATAATGGTGGTTCAGTT GTTAGTACAAGGTCATCAAGAAAGAGAGGCAGGTTAGTAAACCCTGATTTGAATATGATC GCTGCACATCCGAGTGGGAAGTCGCCAATGTCAGCACCAACTGGTGCTCATTCAACTCCA GCTACTCATGTGCTAAAGATTACCAAAAACTTGAAACATGTTAGGAAAAACCTCATGGAG GCATATAGCGATGGTTCAGTTGGCAATAAAAGGAAGAGAGATGCCACCTCTGAGTTAAGT GAAACCTGGGTTCAATGCGATGCTTGCAGAAAGTGGCGGAGATTATTGGACGGAACTGCA CTTGATTCCAGTACAGCATGGTTTTGCAGCATGAACCCTGATTCTGCACGTCAGAAGTGC AGCATCCCAGAGGAATCTTGGGATTTAAAGCGAAAGATAACTTATTTGCCCGGATTTCAC AAGAAAGGTACACCACCAGGAAACGAGCAAAATGCATCTTTTTTTACAAACATATTGAAA GAGCATGCTGCTTTGATCGATTCAGAAACCATGAAGGCTTTGTTGTGGTTGGCGAAACTT TCTCCCAAGAAACATATCGAGATGGAAGCAGTTGGTTTGACACGGCCAGTTCTAGATGCA CGTGCTAACATAGGAAAGGGTGCCCGCCCGTATTACAAGATTTTTCAAGCATTTGGCCTT GTGAGGAAGGTTGAGAAAGGCATAACTCGATGGTATTATCCATCTATGCTTGATGATTTG GCATTTGATTCGGCTGCACTTGGAATTGCCCTTGAAAAGCCGCTGGATTTGGTGAGGCTT TATTTGTCTAGGGCAACCTTGATAGTGGTACCTGCTAACTTAATTGATCACTGGACAACA CAGATACAGCGGCATGTTTCCTCGGACACACTTAATGTTTACGTATGGGGAGATCACAAG AAACCATCTGCTCACAACCTTGCATGGGACTATGACATTGTCATAACCACATTTAGTAGA TTAAGTGCAGAATGGGGTCCAAAGAAGAGAAGTGTTTTAAAGCAGATCCATTGGTTTAGG GTAATATTAGATGAAGGACACACATTAGGTTCCAGTCTCGCCCTCACAAACAAATTGCAG ATGGCTGTTTCATTGGTTGCTTCTAATAGATGGATTCTAACTGGTACCCCTACGCCAAAC ACACCAACTAGTCAAGTTGCTCACCTTCATCCCATGCTTAAGTTTCTTCATGAGGAAGTT TACGGTCAAAACTACCAGTCATGGGACACTGGAATTCATAGGCCTTTTGAGGCACAAATG GAAGACGGACGCAGTCGTCTCCTGCAGCTACTTCAGAGGACTATGATTAGTGCAAGGAAA CAAGACCTGAAAAACATTCCTCCTTGCATAAAAAAGATAACTTTCCTGGACTTCAGTGAG GGGCATGCGAAAAGTTACAATGAACTGGCTGTTACTATCCGCAGAAATATATTGATGGCT GATTGGAATGACCCTTCTCACGTGGAATCACTTCTGAACCCCAAGCAATGGAAATTCCGT ACTACAACTATTAAGAATGTGCGCTTGTCTTGTTGTGTTGCGGGGCATATCAAAGTAGCA GAGGCTGGTCAAGATATACAGGAAACAATGGATGCATTAATGCAGCTGGGCCTTGATCCT TCTTCGGGGGAGTATCAGTCCATAAGATATGCTCTTTTAAATGGTGCCAGCTGTTTCAGG TGCAGAGATTGGTGCCGCTTGCCTGTTGTCACGCCCTGTCGGCATCTGTTGTGCCTTGAT TGTGTAGCTCTTGATAGTGAGAAATGCACGTTACCTGGCTGTGGCAACCATTATGAGATG CAGACTCCTGAAACTCGTGCACGGCCAGAAAATCCAAACCCAAAATGGCCAGTGCCCAAA GACCTAATTGAGTTGCAGCCTTCATATAAGCAGGATGACTGGGATCCAGACTGGCAGTCG ACAACAAGCAGCAAAGTTGCTTATTTGGTTAATAAGTTGAGAAGTTTGAAGGCAGAAAAC ATAAAACATGGGTACTCTAGGAACATGGCCAATGGTGCTTGCCTTTCTAGTCAATCTTCT TGTCAAGACCATAATAATGTGGAGGGCAGGTTACCACACACAATGCCTGACAAAGTAATA ATATTCTCTCAGTTTCTGGAGCATATCCATGTGATTGAGCAGCAGCTGACGATTGGGGGC ATAACATATGCTGGAATGTACAGTCCCATGCCATTAGGCAGTAAGAGAAGTTCACTGACG AAGTTCAAAGATGATCCAGCATGCATGGCCTTAGTCATGGATGGAACTGCAGCACTGGGC CTTGATTTGAGTTTTGTCTCTTATGTTTTTCTGATGGAACCAATATGGGATAGGAGTATG GAGGAGCAAGTTATTAGTCGTGCACATCGTATGGGTGCTACTCGTCCCATATTTGTTGAG ACTTTGGCCATGCGTGGTACCATCGAAGAGCAAATGTTAAAACTTTTACAGGATTCCAAT GCTTGCAGACAAATGGTGAATAAAGGAACAAGCAGCACTGATAATGAAGGTGCTCGGCCT CACCGGAGCCTGCATGATTTTGCGGAAAGCAGTTATCTGGCGCAACTCAGCTTTGTGAAA GGATCTGACGCGGCGGAAAAATTATAGTTGCTAACACTAACAAAAATTTCTTTCTTGATT ACCTCTGTTTCCTTCAATATTGAGGCCCTTCAATTCTTTTGATATAGAAATGAGTCCTTT TGTTTCCTGCCTTTTTTTGTTTTATTTTTATGGGGAGCTTATCGTGGCCGATCCGGGCTG TAATGTAGCTCGGGCTCGTTTGGAGTTGCCTGCTGCCTTGTGGGATGACGCCACGTCGCC CGGTCCATTGCCGGTCAGAACTGAAGGGCAGGCAAGGCTATTCCAAGGCTCTGATTATAA AAACAGCCGGTGAGAATTTAGAAAAGTCAAGTTTCTTAGCTTGTTTCTGGTTTAATGTTT GATTGTGAATAGGGTGGGTGAAAATTTGAACCGTTTGAGGGAGCTAGTGAGAATTTAAAA AAAGACGAGCTTCATATCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)